RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429940.6

LINC00839-202, long intergenic non-protein coding RNA 839, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene LINC00839, Length 2,253 nt, Biotype lincRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00839-202ENST00000429940 VWA8A3KMH1 1905 aa14.64□□□□□ -0.07
LINC00839-202ENST00000429940 OR6C75A6NL08 312 aa14.63□□□□□ -0.07
LINC00839-202ENST00000429940 CCNDBP1O95273 360 aa14.63□□□□□ -0.07
LINC00839-202ENST00000429940 SEC24AO95486 1093 aa14.63□□□□□ -0.07
LINC00839-202ENST00000429940 PRAMEF1O95521 474 aa14.63□□□□□ -0.07
LINC00839-202ENST00000429940 B3GALT4O96024 378 aa14.63□□□□□ -0.07
LINC00839-202ENST00000429940 ALPIP09923 528 aa14.63□□□□□ -0.07
LINC00839-202ENST00000429940 CDKN2CP42773 168 aa14.63□□□□□ -0.07
LINC00839-202ENST00000429940 CLDN8P56748 225 aa14.63□□□□□ -0.07
LINC00839-202ENST00000429940 MBTPS1Q14703 1052 aa14.63□□□□□ -0.07
LINC00839-202ENST00000429940 MAPK11Q15759 364 aa14.63□□□□□ -0.07
LINC00839-202ENST00000429940 KDM4DQ6B0I6 523 aa14.63□□□□□ -0.07
LINC00839-202ENST00000429940 C16orf59Q7L2K0 433 aa14.63□□□□□ -0.07
LINC00839-202ENST00000429940 TTC29Q8NA56 475 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
LINC00839-202ENST00000429940 SLC43A3Q8NBI5 491 aa14.63□□□□□ -0.07
LINC00839-202ENST00000429940 TBC1D20Q96BZ9 403 aa14.63□□□□□ -0.07
LINC00839-202ENST00000429940 ACPTQ9BZG2 426 aa14.63□□□□□ -0.07
LINC00839-202ENST00000429940 TM9SF3Q9HD45 589 aa14.63□□□□□ -0.07
LINC00839-202ENST00000429940 POLE4Q9NR33 117 aa14.63□□□□□ -0.07
LINC00839-202ENST00000429940 OGDHLQ9ULD0 1010 aa14.63□□□□□ -0.07
LINC00839-202ENST00000429940 PRSS21Q9Y6M0 314 aa14.63□□□□□ -0.07
LINC00839-202ENST00000429940 TTC34A8MYJ7 566 aa14.63□□□□□ -0.07
LINC00839-202ENST00000429940 PARNO95453 639 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
LINC00839-202ENST00000429940 RPS3P23396 243 aaKnown RBP eCLIP14.63□□□□□ -0.07
LINC00839-202ENST00000429940 CA5AP35218 305 aa14.63□□□□□ -0.07
LINC00839-202ENST00000429940 HMGCLP35914 325 aa14.63□□□□□ -0.07
LINC00839-202ENST00000429940 MVKQ03426 396 aa14.63□□□□□ -0.07
LINC00839-202ENST00000429940 TMEM53Q6P2H8 277 aa14.63□□□□□ -0.07
LINC00839-202ENST00000429940 DOK6Q6PKX4 331 aa14.63□□□□□ -0.07
LINC00839-202ENST00000429940 NEK10Q6ZWH5 1172 aa14.63□□□□□ -0.07
LINC00839-202ENST00000429940 PAGE2Q7Z2X7 111 aa14.63□□□□□ -0.07
LINC00839-202ENST00000429940 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
LINC00839-202ENST00000429940 SLC22A16Q86VW1 577 aa14.63□□□□□ -0.07
LINC00839-202ENST00000429940 PLD3Q8IV08 490 aa14.63□□□□□ -0.07
LINC00839-202ENST00000429940 RBFAQ8N0V3 343 aa14.63□□□□□ -0.07
LINC00839-202ENST00000429940 TET1Q8NFU7 2136 aa14.63□□□□□ -0.07
LINC00839-202ENST00000429940 UBTD2Q8WUN7 234 aa14.63□□□□□ -0.07
LINC00839-202ENST00000429940 RPL3LQ92901 407 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
LINC00839-202ENST00000429940 LGALS12Q96DT0 336 aa14.63□□□□□ -0.07
LINC00839-202ENST00000429940 SLIRPQ9GZT3 109 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
LINC00839-202ENST00000429940 KLHL25Q9H0H3 589 aa14.63□□□□□ -0.07
LINC00839-202ENST00000429940 CCNB1IP1Q9NPC3 277 aa14.63□□□□□ -0.07
LINC00839-202ENST00000429940 IL1RAPQ9NPH3 570 aa14.63□□□□□ -0.07
LINC00839-202ENST00000429940 hCG_2039718K7EN88 272 aa14.62□□□□□ -0.07
LINC00839-202ENST00000429940 CLDN9O95484 217 aa14.62□□□□□ -0.07
LINC00839-202ENST00000429940 VNN2O95498 520 aa14.62□□□□□ -0.07
LINC00839-202ENST00000429940 PDYNP01213 254 aa14.62□□□□□ -0.07
LINC00839-202ENST00000429940 KRT6AP02538 564 aa14.62□□□□□ -0.07
LINC00839-202ENST00000429940 KRT6BP04259 564 aa14.62□□□□□ -0.07
LINC00839-202ENST00000429940 HOXB9P17482 250 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
LINC00839-202ENST00000429940 PTPN6P29350 595 aa14.62□□□□□ -0.07
LINC00839-202ENST00000429940 KRT6CP48668 564 aa14.62□□□□□ -0.07
LINC00839-202ENST00000429940 FPGSQ05932 587 aa14.62□□□□□ -0.07
LINC00839-202ENST00000429940 DUSP4Q13115 394 aa14.62□□□□□ -0.07
LINC00839-202ENST00000429940 SLC14A1Q13336 389 aa14.62□□□□□ -0.07
LINC00839-202ENST00000429940 MRPL58Q14197 206 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
LINC00839-202ENST00000429940 MAD2L1BPQ15013 274 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
LINC00839-202ENST00000429940 CPSF6Q16630 551 aaKnown RBP eCLIP14.62□□□□□ -0.07
LINC00839-202ENST00000429940 MBOAT1Q6ZNC8 495 aa14.62□□□□□ -0.07
LINC00839-202ENST00000429940 ZBTB2Q8N680 514 aa14.62□□□□□ -0.07
LINC00839-202ENST00000429940 DACH2Q96NX9 599 aa14.62□□□□□ -0.07
LINC00839-202ENST00000429940 TSSK3Q96PN8 268 aa14.62□□□□□ -0.07
LINC00839-202ENST00000429940 MYOCQ99972 504 aa14.62□□□□□ -0.07
LINC00839-202ENST00000429940 SLC29A3Q9BZD2 475 aa14.62□□□□□ -0.07
LINC00839-202ENST00000429940 ASB8Q9H765 288 aa14.62□□□□□ -0.07
LINC00839-202ENST00000429940 PDP1Q9P0J1 537 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
LINC00839-202ENST00000429940 KIF17Q9P2E2 1029 aa14.62□□□□□ -0.07
LINC00839-202ENST00000429940 PNMA8BQ9ULN7 279 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
LINC00839-202ENST00000429940 A0A1B0GVM2 712 aa14.62□□□□□ -0.07
LINC00839-202ENST00000429940 SLC38A8A6NNN8 435 aa14.62□□□□□ -0.07
LINC00839-202ENST00000429940 DIRAS1O95057 198 aa14.62□□□□□ -0.07
LINC00839-202ENST00000429940 GJB5O95377 273 aa14.62□□□□□ -0.07
LINC00839-202ENST00000429940 EOMESO95936 686 aa14.62□□□□□ -0.07
LINC00839-202ENST00000429940 CD160O95971 181 aa14.62□□□□□ -0.07
LINC00839-202ENST00000429940 DNAJA1P31689 397 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
LINC00839-202ENST00000429940 TGFBR1P36897 503 aa14.62□□□□□ -0.07
LINC00839-202ENST00000429940 ARHGEF7Q14155 803 aa14.62□□□□□ -0.07
LINC00839-202ENST00000429940 CATSPEREQ5SY80 951 aa14.62□□□□□ -0.07
LINC00839-202ENST00000429940 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
LINC00839-202ENST00000429940 PRSS48Q7RTY5 328 aa14.62□□□□□ -0.07
LINC00839-202ENST00000429940 ZNF551Q7Z340 670 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
LINC00839-202ENST00000429940 HORMAD1Q86X24 394 aa14.62□□□□□ -0.07
LINC00839-202ENST00000429940 DSN1Q9H410 356 aa14.62□□□□□ -0.07
LINC00839-202ENST00000429940 LATS2Q9NRM7 1088 aa14.62□□□□□ -0.07
LINC00839-202ENST00000429940 RASSF1Q9NS23 344 aa14.62□□□□□ -0.07
LINC00839-202ENST00000429940 GPRC5BQ9NZH0 403 aa14.62□□□□□ -0.07
LINC00839-202ENST00000429940 SCHIP1Q9P0W5 487 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
LINC00839-202ENST00000429940 NDRG4Q9ULP0 352 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
LINC00839-202ENST00000429940 PPT2Q9UMR5 302 aa14.62□□□□□ -0.07
LINC00839-202ENST00000429940 RFXANKO14593 260 aa14.61□□□□□ -0.07
LINC00839-202ENST00000429940 STK16O75716 305 aa14.61□□□□□ -0.07
LINC00839-202ENST00000429940 LRATO95237 230 aa14.61□□□□□ -0.07
LINC00839-202ENST00000429940 FABP3P05413 133 aa14.61□□□□□ -0.07
LINC00839-202ENST00000429940 CD36P16671 472 aa14.61□□□□□ -0.07
LINC00839-202ENST00000429940 FPR1P21462 350 aa14.61□□□□□ -0.07
LINC00839-202ENST00000429940 CD40LGP29965 261 aa14.61□□□□□ -0.07
LINC00839-202ENST00000429940 KRT20P35900 424 aa14.61□□□□□ -0.07
LINC00839-202ENST00000429940 PLEKHG6Q3KR16 790 aa14.61□□□□□ -0.07
LINC00839-202ENST00000429940 TRAF7Q6Q0C0 670 aa14.61□□□□□ -0.07
LINC00839-202ENST00000429940 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.4 ms