RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000378546.8

FAAP20-202, Transcript of FA core complex associated protein 20, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene FAAP20, Length 729 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP20-202ENST00000378546 METTL27Q8N6F8 245 aaPredicted RBP24.42■■□□□ 1.5
FAAP20-202ENST00000378546 HMGCLL1Q8TB92 370 aa24.42■■□□□ 1.5
FAAP20-202ENST00000378546 CPT1CQ8TCG5 803 aa24.42■■□□□ 1.5
FAAP20-202ENST00000378546 ACAT2Q9BWD1 397 aa24.42■■□□□ 1.5
FAAP20-202ENST00000378546 MFRPQ9BY79 579 aa24.42■■□□□ 1.5
FAAP20-202ENST00000378546 FBXO6Q9NRD1 293 aaPredicted RBP24.42■■□□□ 1.5
FAAP20-202ENST00000378546 C20orf96Q9NUD7 363 aaPredicted RBP24.42■■□□□ 1.5
FAAP20-202ENST00000378546 P4HTMQ9NXG6 502 aa24.42■■□□□ 1.5
FAAP20-202ENST00000378546 LUZP4Q9P127 313 aa24.42■■□□□ 1.5
FAAP20-202ENST00000378546 MAP10Q9P2G4 905 aa24.42■■□□□ 1.5
FAAP20-202ENST00000378546 A0A0J9YVX5 310 aa24.41■■□□□ 1.5
FAAP20-202ENST00000378546 ZSCAN12O43309 604 aa24.41■■□□□ 1.5
FAAP20-202ENST00000378546 VPS4BO75351 444 aa24.41■■□□□ 1.5
FAAP20-202ENST00000378546 MATN4O95460 622 aa24.41■■□□□ 1.5
FAAP20-202ENST00000378546 ERVK-10P10266 1014 aa24.41■■□□□ 1.5
FAAP20-202ENST00000378546 RPA3P35244 121 aaPredicted RBP24.41■■□□□ 1.5
FAAP20-202ENST00000378546 CYP1B1Q16678 543 aa24.41■■□□□ 1.5
FAAP20-202ENST00000378546 MRPL14Q6P1L8 145 aaKnown RBP24.41■■□□□ 1.5
FAAP20-202ENST00000378546 HPS6Q86YV9 775 aa24.41■■□□□ 1.5
FAAP20-202ENST00000378546 DENND6AQ8IWF6 608 aa24.41■■□□□ 1.5
FAAP20-202ENST00000378546 OR9A1PQ8NGU1 263 aa24.41■■□□□ 1.5
FAAP20-202ENST00000378546 COG1Q8WTW3 980 aa24.41■■□□□ 1.5
FAAP20-202ENST00000378546 FKBP10Q96AY3 582 aa24.41■■□□□ 1.5
FAAP20-202ENST00000378546 OSBPL9Q96SU4 736 aa24.41■■□□□ 1.5
FAAP20-202ENST00000378546 GALPQ9UBC7 116 aa24.41■■□□□ 1.5
FAAP20-202ENST00000378546 CDC23Q9UJX2 597 aa24.41■■□□□ 1.5
FAAP20-202ENST00000378546 VPS4AQ9UN37 437 aa24.41■■□□□ 1.5
FAAP20-202ENST00000378546 PCSK5Q92824 1860 aa24.41■■□□□ 1.5
FAAP20-202ENST00000378546 ARHGEF33A8MVX0 844 aa24.4■■□□□ 1.5
FAAP20-202ENST00000378546 PRICKLE3O43900 615 aaPredicted RBP24.4■■□□□ 1.5
FAAP20-202ENST00000378546 KIF5CO60282 957 aa24.4■■□□□ 1.5
FAAP20-202ENST00000378546 CTSVO60911 334 aa24.4■■□□□ 1.5
FAAP20-202ENST00000378546 CNOT3O75175 753 aaKnown RBP24.4■■□□□ 1.5
FAAP20-202ENST00000378546 SYF2O95926 243 aaKnown RBP24.4■■□□□ 1.5
FAAP20-202ENST00000378546 ALPPP05187 535 aa24.4■■□□□ 1.5
FAAP20-202ENST00000378546 EIF2S1P05198 315 aaKnown RBP24.4■■□□□ 1.5
FAAP20-202ENST00000378546 CTBP1Q13363 440 aa24.4■■□□□ 1.5
FAAP20-202ENST00000378546 CUL1Q13616 776 aa24.4■■□□□ 1.5
FAAP20-202ENST00000378546 FASTKQ14296 549 aaKnown RBP24.4■■□□□ 1.5
FAAP20-202ENST00000378546 GBX1Q14549 363 aa24.4■■□□□ 1.5
FAAP20-202ENST00000378546 LONRF1Q17RB8 773 aa24.4■■□□□ 1.5
FAAP20-202ENST00000378546 FAM214AQ32MH5 1076 aa24.4■■□□□ 1.5
FAAP20-202ENST00000378546 EEF1AKMT2Q5JPI9 291 aaKnown RBP24.4■■□□□ 1.5
FAAP20-202ENST00000378546 DCAF10Q5QP82 559 aa24.4■■□□□ 1.5
FAAP20-202ENST00000378546 VWA5B1Q5TIE3 1220 aa24.4■■□□□ 1.5
FAAP20-202ENST00000378546 CALML6Q8TD86 181 aa24.4■■□□□ 1.5
FAAP20-202ENST00000378546 SLAMF7Q9NQ25 335 aa24.4■■□□□ 1.5
FAAP20-202ENST00000378546 SLC1A2P43004 574 aa24.39■■□□□ 1.49
FAAP20-202ENST00000378546 FNTAP49354 379 aa24.39■■□□□ 1.49
FAAP20-202ENST00000378546 WASHC2DQ5SRD0 308 aa24.39■■□□□ 1.49
FAAP20-202ENST00000378546 SUSD1Q6UWL2 747 aa24.39■■□□□ 1.49
FAAP20-202ENST00000378546 PPP1R32Q7Z5V6 425 aa24.39■■□□□ 1.49
FAAP20-202ENST00000378546 PPIL6Q8IXY8 311 aa24.39■■□□□ 1.49
FAAP20-202ENST00000378546 OR2A1Q8NGT9 310 aa24.39■■□□□ 1.49
FAAP20-202ENST00000378546 SMPDL3AQ92484 453 aa24.39■■□□□ 1.49
FAAP20-202ENST00000378546 DPH7Q9BTV6 452 aa24.39■■□□□ 1.49
FAAP20-202ENST00000378546 MRPS30Q9NP92 439 aaKnown RBP24.39■■□□□ 1.49
FAAP20-202ENST00000378546 ABCF3Q9NUQ8 709 aa24.39■■□□□ 1.49
FAAP20-202ENST00000378546 A0A1W2PPV9 198 aa24.38■■□□□ 1.49
FAAP20-202ENST00000378546 ZNF839A8K0R7 811 aa24.38■■□□□ 1.49
FAAP20-202ENST00000378546 NRP2O60462 931 aa24.38■■□□□ 1.49
FAAP20-202ENST00000378546 SRPX2O60687 465 aaPredicted RBP24.38■■□□□ 1.49
FAAP20-202ENST00000378546 UMODP07911 640 aa24.38■■□□□ 1.49
FAAP20-202ENST00000378546 GCGRP47871 477 aa24.38■■□□□ 1.49
FAAP20-202ENST00000378546 OR1D4P47884 311 aa24.38■■□□□ 1.49
FAAP20-202ENST00000378546 UBAP2LQ14157 1087 aaKnown RBP24.38■■□□□ 1.49
FAAP20-202ENST00000378546 FRMPD2BQ6IN97 320 aa24.38■■□□□ 1.49
FAAP20-202ENST00000378546 JMJD6Q6NYC1 403 aaPredicted RBP24.38■■□□□ 1.49
FAAP20-202ENST00000378546 OVCH1Q7RTY7 1134 aa24.38■■□□□ 1.49
FAAP20-202ENST00000378546 GALNT16Q8N428 558 aa24.38■■□□□ 1.49
FAAP20-202ENST00000378546 ACTRT1Q8TDG2 376 aa24.38■■□□□ 1.49
FAAP20-202ENST00000378546 ZDHHC19Q8WVZ1 309 aaPredicted RBP24.38■■□□□ 1.49
FAAP20-202ENST00000378546 SLC22A11Q9NSA0 550 aa24.38■■□□□ 1.49
FAAP20-202ENST00000378546 ZC3H7BQ9UGR2 993 aaKnown RBP24.38■■□□□ 1.49
FAAP20-202ENST00000378546 ASIC3Q9UHC3 531 aa24.38■■□□□ 1.49
FAAP20-202ENST00000378546 MAU2Q9Y6X3 613 aa24.38■■□□□ 1.49
FAAP20-202ENST00000378546 NUP210LQ5VU65 1888 aa24.37■■□□□ 1.49
FAAP20-202ENST00000378546 ZCWPW2A0A1B0GU75 182 aa24.37■■□□□ 1.49
FAAP20-202ENST00000378546 HYKKA2RU49 373 aa24.37■■□□□ 1.49
FAAP20-202ENST00000378546 MYO1CO00159 1063 aa24.37■■□□□ 1.49
FAAP20-202ENST00000378546 KLHL41O60662 606 aa24.37■■□□□ 1.49
FAAP20-202ENST00000378546 VPS26AO75436 327 aa24.37■■□□□ 1.49
FAAP20-202ENST00000378546 PSIP1O75475 530 aaKnown RBP24.37■■□□□ 1.49
FAAP20-202ENST00000378546 ITGAXP20702 1163 aa24.37■■□□□ 1.49
FAAP20-202ENST00000378546 CD97P48960 835 aa24.37■■□□□ 1.49
FAAP20-202ENST00000378546 CLCN7P51798 805 aa24.37■■□□□ 1.49
FAAP20-202ENST00000378546 SHISA6Q6ZSJ9 500 aa24.37■■□□□ 1.49
FAAP20-202ENST00000378546 RNF44Q7L0R7 432 aa24.37■■□□□ 1.49
FAAP20-202ENST00000378546 REXO1L1PQ8IX06 675 aa24.37■■□□□ 1.49
FAAP20-202ENST00000378546 LMNTD2Q8IXW0 634 aa24.37■■□□□ 1.49
FAAP20-202ENST00000378546 NAT8LQ8N9F0 302 aa24.37■■□□□ 1.49
FAAP20-202ENST00000378546 SERBP1Q8NC51 408 aaKnown RBP eCLIP24.37■■□□□ 1.49
FAAP20-202ENST00000378546 KCNJ9Q92806 393 aa24.37■■□□□ 1.49
FAAP20-202ENST00000378546 COL26A1Q96A83 441 aa24.37■■□□□ 1.49
FAAP20-202ENST00000378546 PKP4Q99569 1192 aa24.37■■□□□ 1.49
FAAP20-202ENST00000378546 SMAD5Q99717 465 aaKnown RBP24.37■■□□□ 1.49
FAAP20-202ENST00000378546 ZFYVE21Q9BQ24 234 aa24.37■■□□□ 1.49
FAAP20-202ENST00000378546 FAM167BQ9BTA0 163 aa24.37■■□□□ 1.49
FAAP20-202ENST00000378546 SOX17Q9H6I2 414 aaPredicted RBP24.37■■□□□ 1.49
FAAP20-202ENST00000378546 WDR54Q9H977 334 aa24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.2 ms