RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366686.1

CCSAP-202, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CCSAP, Length 4,399 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-202ENST00000366686 USH1GQ495M9 461 aa2.43□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 GLE1Q53GS7 698 aaKnown RBP2.43□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa2.43□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 ETV3LQ6ZN32 361 aa2.43□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 QSOX2Q6ZRP7 698 aa2.43□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 CENPVQ7Z7K6 275 aaPredicted RBP2.43□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 RHPN2Q8IUC4 686 aa2.43□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 SERPINA12Q8IW75 414 aa2.43□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 PARP8Q8N3A8 854 aa2.43□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 CCNYQ8ND76 341 aa2.43□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 CCDC26Q8TAB7 109 aa2.43□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 MBD6Q96DN6 1003 aa2.43□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 DTD2Q96FN9 168 aa2.43□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 FAM210AQ96ND0 272 aa2.43□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 HIST1H2AAQ96QV6 131 aa2.43□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP2.43□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 BBS2Q9BXC9 721 aa2.43□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 NPLQ9BXD5 320 aaPredicted RBP2.43□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 HDHD5Q9BXW7 423 aa2.43□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP2.43□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 WDR55Q9H6Y2 383 aaPredicted RBP2.43□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 SH2D4AQ9H788 454 aa2.43□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 FANCEQ9HB96 536 aa2.43□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 ZNF304Q9HCX3 659 aa2.43□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 OLFML3Q9NRN5 406 aa2.43□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 ARHGEF38Q9NXL2 777 aa2.43□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 STMN3Q9NZ72 180 aa2.43□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 BCAP29Q9UHQ4 241 aa2.43□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 CCPG1Q9ULG6 757 aa2.43□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 CHKBQ9Y259 395 aa2.43□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 DNAJC13O75165 2243 aa2.43□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 DRGXA6NNA5 263 aa2.43□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 TLR4O00206 839 aa2.43□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 HAS3O00219 553 aa2.43□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 ZNF213O14771 459 aa2.43□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 PRNPP04156 253 aa2.43□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 RFPL3SP0C7P2 107 aa2.43□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 UBTFL6P0CB48 400 aaPredicted RBP2.43□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 THRBP10828 461 aa2.43□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 PEPDP12955 493 aa2.43□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 ACO1P21399 889 aaKnown RBP2.43□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 GALP22466 123 aa2.43□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 PPP2R1AP30153 589 aa2.43□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 CORO1AP31146 461 aaKnown RBP2.43□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 MAGEA2P43356 314 aa2.43□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 MAGEA6P43360 314 aa2.43□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 SLCO1A2P46721 670 aa2.43□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 PLCD1P51178 756 aa2.43□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 CLRN1P58418 232 aa2.43□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 DSTNP60981 165 aa2.43□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 CHRNEQ04844 493 aa2.43□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 ABRQ12979 859 aa2.43□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 ARHGAP19Q14CB8 494 aa2.43□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 DLG2Q15700 870 aa2.43□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 HADHQ16836 314 aaKnown RBP2.43□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 C1QL3Q5VWW1 255 aa2.43□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 NAIF1Q69YI7 327 aaPredicted RBP2.43□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 LAYNQ6UX15 382 aa2.43□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 NLRP9Q7RTR0 991 aa2.43□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 TADA2BQ86TJ2 420 aa2.43□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 LDB1Q86U70 411 aaPredicted RBP2.43□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 IGFN1Q86VF2 1251 aa2.43□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 FAM219AQ8IW50 185 aa2.43□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 MYOCDQ8IZQ8 938 aa2.43□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 FITM2Q8N6M3 262 aa2.43□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 SLC24A4Q8NFF2 622 aa2.43□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 OR4N2Q8NGD1 307 aa2.43□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 REXO5Q96IC2 774 aaKnown RBP2.43□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 USP28Q96RU2 1077 aa2.43□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 CYTH2Q99418 400 aa2.43□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 RAD9AQ99638 391 aa2.43□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 COQ7Q99807 217 aa2.43□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 SIKE1Q9BRV8 207 aa2.43□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 TRMOQ9BU70 441 aa2.43□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 KCNN2Q9H2S1 579 aa2.43□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 PARVAQ9NVD7 372 aa2.43□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 NLKQ9UBE8 527 aa2.43□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 KLQ9UEF7 1012 aa2.43□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 TMEM59LQ9UK28 342 aa2.43□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 RCOR1Q9UKL0 485 aa2.43□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 RAB21Q9UL25 225 aa2.43□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 ZNF148Q9UQR1 794 aa2.43□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 RUVBL1Q9Y265 456 aaKnown RBP2.43□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 USP16Q9Y5T5 823 aa2.43□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 UTYO14607 1347 aa2.43□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 TEX13CA0A0J9YWL9 993 aa2.43□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 A0A1W2PRX2 142 aa2.43□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 ESYT2A0FGR8 921 aa2.43□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 PRR23AA6NEV1 266 aa2.43□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 GRXCR1A8MXD5 290 aa2.43□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 C2orf74A8MZ97 194 aa2.43□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 EXTL3O43909 919 aa2.43□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 TOM1L1O75674 476 aa2.43□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 IGHEP01854 428 aa2.43□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 CSN3P07498 182 aa2.43□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 ZNF28P17035 718 aa2.43□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 CAPN2P17655 700 aa2.43□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 MGAT1P26572 445 aa2.43□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 SFNP31947 248 aa2.43□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 VIPR1P32241 457 aa2.43□□□□□ -2.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.2 ms