RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362817.1

RNU1-38P-201, Transcript of RNA, U1 small nuclear 38, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU1-38P, Length 144 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU1-38P-201ENST00000362817 D6RAR5 112 aa7.28□□□□□ -1.24
RNU1-38P-201ENST00000362817 KIR2DS3K7RE56 304 aa7.28□□□□□ -1.24
RNU1-38P-201ENST00000362817 TAF4O00268 1085 aa7.28□□□□□ -1.24
RNU1-38P-201ENST00000362817 KCNJ13O60928 360 aa7.28□□□□□ -1.24
RNU1-38P-201ENST00000362817 GOT2P00505 430 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
RNU1-38P-201ENST00000362817 CELA3BP08861 270 aa7.28□□□□□ -1.24
RNU1-38P-201ENST00000362817 SLC2A4P14672 509 aa7.28□□□□□ -1.24
RNU1-38P-201ENST00000362817 NMBRP28336 390 aa7.28□□□□□ -1.24
RNU1-38P-201ENST00000362817 CD1CP29017 333 aa7.28□□□□□ -1.24
RNU1-38P-201ENST00000362817 ALDH4A1P30038 563 aa7.28□□□□□ -1.24
RNU1-38P-201ENST00000362817 PBLDP30039 288 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
RNU1-38P-201ENST00000362817 GPR3P46089 330 aa7.28□□□□□ -1.24
RNU1-38P-201ENST00000362817 PRLHRP49683 370 aa7.28□□□□□ -1.24
RNU1-38P-201ENST00000362817 HHEXQ03014 270 aa7.28□□□□□ -1.24
RNU1-38P-201ENST00000362817 CFHR1Q03591 330 aa7.28□□□□□ -1.24
RNU1-38P-201ENST00000362817 PTK6Q13882 451 aa7.28□□□□□ -1.24
RNU1-38P-201ENST00000362817 SPIDRQ14159 915 aa7.28□□□□□ -1.24
RNU1-38P-201ENST00000362817 NFE2L1Q14494 772 aa7.28□□□□□ -1.24
RNU1-38P-201ENST00000362817 SEMA3AQ14563 771 aa7.28□□□□□ -1.24
RNU1-38P-201ENST00000362817 KIR2DS5Q14953 304 aa7.28□□□□□ -1.24
RNU1-38P-201ENST00000362817 RTP5Q14D33 572 aa7.28□□□□□ -1.24
RNU1-38P-201ENST00000362817 ZNF658BQ4V348 819 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
RNU1-38P-201ENST00000362817 RNASEH2BQ5TBB1 312 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
RNU1-38P-201ENST00000362817 AGAP9Q5VTM2 703 aa7.28□□□□□ -1.24
RNU1-38P-201ENST00000362817 NKAIN2Q5VXU1 208 aa7.28□□□□□ -1.24
RNU1-38P-201ENST00000362817 AFTPHQ6ULP2 937 aa7.28□□□□□ -1.24
RNU1-38P-201ENST00000362817 ABRAXAS1Q6UWZ7 409 aa7.28□□□□□ -1.24
RNU1-38P-201ENST00000362817 WASH2PQ6VEQ5 465 aa7.28□□□□□ -1.24
RNU1-38P-201ENST00000362817 TAS2R42Q7RTR8 314 aa7.28□□□□□ -1.24
RNU1-38P-201ENST00000362817 SLC9B2Q86UD5 537 aa7.28□□□□□ -1.24
RNU1-38P-201ENST00000362817 AMZ2Q86W34 360 aa7.28□□□□□ -1.24
RNU1-38P-201ENST00000362817 MPP5Q8N3R9 675 aa7.28□□□□□ -1.24
RNU1-38P-201ENST00000362817 NAT8LQ8N9F0 302 aa7.28□□□□□ -1.24
RNU1-38P-201ENST00000362817 OR2L2Q8NH16 312 aa7.28□□□□□ -1.24
RNU1-38P-201ENST00000362817 MDM1Q8TC05 714 aa7.28□□□□□ -1.24
RNU1-38P-201ENST00000362817 HEXDCQ8WVB3 486 aa7.28□□□□□ -1.24
RNU1-38P-201ENST00000362817 PEX13Q92968 403 aa7.28□□□□□ -1.24
RNU1-38P-201ENST00000362817 MFSD3Q96ES6 412 aa7.28□□□□□ -1.24
RNU1-38P-201ENST00000362817 DCUN1D1Q96GG9 259 aa7.28□□□□□ -1.24
RNU1-38P-201ENST00000362817 ATXN7L3BQ96GX2 97 aa7.28□□□□□ -1.24
RNU1-38P-201ENST00000362817 ZNF514Q96K75 400 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
RNU1-38P-201ENST00000362817 SERPINB12Q96P63 405 aa7.28□□□□□ -1.24
RNU1-38P-201ENST00000362817 GFM1Q96RP9 751 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
RNU1-38P-201ENST00000362817 KIFC1Q9BW19 673 aa7.28□□□□□ -1.24
RNU1-38P-201ENST00000362817 IL22Q9GZX6 179 aa7.28□□□□□ -1.24
RNU1-38P-201ENST00000362817 MRM3Q9HC36 420 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
RNU1-38P-201ENST00000362817 SARS2Q9NP81 518 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
RNU1-38P-201ENST00000362817 WASH6PQ9NQA3 447 aa7.28□□□□□ -1.24
RNU1-38P-201ENST00000362817 BFARQ9NZS9 450 aa7.28□□□□□ -1.24
RNU1-38P-201ENST00000362817 CPNE7Q9UBL6 633 aa7.28□□□□□ -1.24
RNU1-38P-201ENST00000362817 PCYOX1Q9UHG3 505 aa7.28□□□□□ -1.24
RNU1-38P-201ENST00000362817 PRSS21Q9Y6M0 314 aa7.28□□□□□ -1.24
RNU1-38P-201ENST00000362817 DMXL2Q8TDJ6 3036 aa7.28□□□□□ -1.24
RNU1-38P-201ENST00000362817 CELSR3Q9NYQ7 3312 aa7.28□□□□□ -1.24
RNU1-38P-201ENST00000362817 PRAMEF33A0A0G2JMD5 474 aa7.27□□□□□ -1.25
RNU1-38P-201ENST00000362817 PMS2P1A4D2B8 440 aa7.27□□□□□ -1.25
RNU1-38P-201ENST00000362817 TMEM8BA6NDV4 472 aa7.27□□□□□ -1.25
RNU1-38P-201ENST00000362817 OR52A4PA6NMU1 304 aa7.27□□□□□ -1.25
RNU1-38P-201ENST00000362817 PDZK1P1A8MUH7 402 aa7.27□□□□□ -1.25
RNU1-38P-201ENST00000362817 GOLGA8MH3BSY2 632 aa7.27□□□□□ -1.25
RNU1-38P-201ENST00000362817 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa7.27□□□□□ -1.25
RNU1-38P-201ENST00000362817 AP3B1O00203 1094 aa7.27□□□□□ -1.25
RNU1-38P-201ENST00000362817 OR1I1O60431 355 aa7.27□□□□□ -1.25
RNU1-38P-201ENST00000362817 RALBP11234 206 aa7.27□□□□□ -1.25
RNU1-38P-201ENST00000362817 MLNP12872 115 aa7.27□□□□□ -1.25
RNU1-38P-201ENST00000362817 VCLP18206 1134 aa7.27□□□□□ -1.25
RNU1-38P-201ENST00000362817 XRCC1P18887 633 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
RNU1-38P-201ENST00000362817 IDSP22304 550 aa7.27□□□□□ -1.25
RNU1-38P-201ENST00000362817 CASQ1P31415 396 aa7.27□□□□□ -1.25
RNU1-38P-201ENST00000362817 CCKBRP32239 447 aa7.27□□□□□ -1.25
RNU1-38P-201ENST00000362817 CSF2RBP32927 897 aa7.27□□□□□ -1.25
RNU1-38P-201ENST00000362817 MAGEA3P43357 314 aa7.27□□□□□ -1.25
RNU1-38P-201ENST00000362817 PRAMEP78395 509 aa7.27□□□□□ -1.25
RNU1-38P-201ENST00000362817 ZFP36L1Q07352 338 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
RNU1-38P-201ENST00000362817 BIRC2Q13490 618 aa7.27□□□□□ -1.25
RNU1-38P-201ENST00000362817 SQSTM1Q13501 440 aa7.27□□□□□ -1.25
RNU1-38P-201ENST00000362817 ITIH4Q14624 930 aa7.27□□□□□ -1.25
RNU1-38P-201ENST00000362817 PPP1R7Q15435 360 aa7.27□□□□□ -1.25
RNU1-38P-201ENST00000362817 AMZ1Q400G9 498 aa7.27□□□□□ -1.25
RNU1-38P-201ENST00000362817 METRNLQ641Q3 311 aa7.27□□□□□ -1.25
RNU1-38P-201ENST00000362817 TRMT10BQ6PF06 316 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
RNU1-38P-201ENST00000362817 CES3Q6UWW8 571 aa7.27□□□□□ -1.25
RNU1-38P-201ENST00000362817 PACS1Q6VY07 963 aa7.27□□□□□ -1.25
RNU1-38P-201ENST00000362817 SYT10Q6XYQ8 523 aa7.27□□□□□ -1.25
RNU1-38P-201ENST00000362817 LDB1Q86U70 411 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
RNU1-38P-201ENST00000362817 KLHL7Q8IXQ5 586 aa7.27□□□□□ -1.25
RNU1-38P-201ENST00000362817 LILRB2Q8N423 598 aa7.27□□□□□ -1.25
RNU1-38P-201ENST00000362817 LILRA3Q8N6C8 439 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
RNU1-38P-201ENST00000362817 CLDN19Q8N6F1 224 aa7.27□□□□□ -1.25
RNU1-38P-201ENST00000362817 MCUQ8NE86 351 aa7.27□□□□□ -1.25
RNU1-38P-201ENST00000362817 OR4L1Q8NH43 312 aa7.27□□□□□ -1.25
RNU1-38P-201ENST00000362817 ZCCHC14Q8WYQ9 949 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
RNU1-38P-201ENST00000362817 GRAMD1AQ96CP6 724 aa7.27□□□□□ -1.25
RNU1-38P-201ENST00000362817 NXPE2Q96DL1 559 aa7.27□□□□□ -1.25
RNU1-38P-201ENST00000362817 PRR11Q96HE9 360 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
RNU1-38P-201ENST00000362817 NUDT22Q9BRQ3 303 aa7.27□□□□□ -1.25
RNU1-38P-201ENST00000362817 CCM2Q9BSQ5 444 aa7.27□□□□□ -1.25
RNU1-38P-201ENST00000362817 TBC1D10AQ9BXI6 508 aa7.27□□□□□ -1.25
RNU1-38P-201ENST00000362817 CD244Q9BZW8 370 aa7.27□□□□□ -1.25
RNU1-38P-201ENST00000362817 UCK1Q9HA47 277 aa7.27□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.7 ms