RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000360982.2

NCKAP1-201, Transcript of NCK associated protein 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene NCKAP1, Length 4,989 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCKAP1-201ENST00000360982 EMC10Q5UCC4 262 aa20.09■□□□□ 0.81
NCKAP1-201ENST00000360982 FRG2Q64ET8 278 aa20.09■□□□□ 0.81
NCKAP1-201ENST00000360982 ANKRD46Q86W74 232 aa20.09■□□□□ 0.81
NCKAP1-201ENST00000360982 DCUN1D3Q8IWE4 304 aa20.09■□□□□ 0.81
NCKAP1-201ENST00000360982 LMX1AQ8TE12 382 aa20.09■□□□□ 0.81
NCKAP1-201ENST00000360982 FRG2BQ96QU4 278 aa20.09■□□□□ 0.81
NCKAP1-201ENST00000360982 TMEM59LQ9UK28 342 aa20.09■□□□□ 0.81
NCKAP1-201ENST00000360982 A6NHS1 94 aa20.09■□□□□ 0.81
NCKAP1-201ENST00000360982 TCEA3O75764 348 aa20.09■□□□□ 0.81
NCKAP1-201ENST00000360982 AP2A2O94973 939 aa20.09■□□□□ 0.81
NCKAP1-201ENST00000360982 ARFIP1P53367 373 aa20.09■□□□□ 0.81
NCKAP1-201ENST00000360982 NFKB2Q00653 900 aa20.09■□□□□ 0.81
NCKAP1-201ENST00000360982 KCTD8Q6ZWB6 473 aa20.09■□□□□ 0.81
NCKAP1-201ENST00000360982 SLC51AQ86UW1 340 aa20.09■□□□□ 0.81
NCKAP1-201ENST00000360982 TRPV3Q8NET8 790 aa20.09■□□□□ 0.81
NCKAP1-201ENST00000360982 GRPEL2Q8TAA5 225 aa20.09■□□□□ 0.81
NCKAP1-201ENST00000360982 LRTOMTQ8WZ04 291 aa20.09■□□□□ 0.81
NCKAP1-201ENST00000360982 SMARCD2Q92925 531 aa20.09■□□□□ 0.81
NCKAP1-201ENST00000360982 RFKQ969G6 155 aa20.09■□□□□ 0.81
NCKAP1-201ENST00000360982 CCDC59Q9P031 241 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
NCKAP1-201ENST00000360982 B4GALT6Q9UBX8 382 aa20.09■□□□□ 0.81
NCKAP1-201ENST00000360982 PHF11Q9UIL8 331 aa20.09■□□□□ 0.81
NCKAP1-201ENST00000360982 HAT1O14929 419 aa20.08■□□□□ 0.81
NCKAP1-201ENST00000360982 COCHO43405 550 aa20.08■□□□□ 0.81
NCKAP1-201ENST00000360982 CYP4F3Q08477 520 aa20.08■□□□□ 0.81
NCKAP1-201ENST00000360982 BANPQ8N9N5 519 aa20.08■□□□□ 0.81
NCKAP1-201ENST00000360982 PYCR2Q96C36 320 aa20.08■□□□□ 0.81
NCKAP1-201ENST00000360982 GPER1Q99527 375 aa20.08■□□□□ 0.81
NCKAP1-201ENST00000360982 SLC29A3Q9BZD2 475 aa20.08■□□□□ 0.81
NCKAP1-201ENST00000360982 GPR62Q9BZJ7 368 aa20.08■□□□□ 0.81
NCKAP1-201ENST00000360982 COQ10BQ9H8M1 238 aa20.08■□□□□ 0.81
NCKAP1-201ENST00000360982 ACSS2Q9NR19 701 aa20.08■□□□□ 0.81
NCKAP1-201ENST00000360982 ING3Q9NXR8 418 aa20.08■□□□□ 0.81
NCKAP1-201ENST00000360982 SERTAD3Q9UJW9 196 aa20.08■□□□□ 0.81
NCKAP1-201ENST00000360982 ZNF487B1APH4 448 aa20.08■□□□□ 0.81
NCKAP1-201ENST00000360982 LOC110117498-PIK3R3F6TDL0 507 aa20.08■□□□□ 0.81
NCKAP1-201ENST00000360982 MPZL2O60487 215 aa20.08■□□□□ 0.81
NCKAP1-201ENST00000360982 ABATP80404 500 aa20.08■□□□□ 0.81
NCKAP1-201ENST00000360982 VWA5B1Q5TIE3 1220 aa20.08■□□□□ 0.81
NCKAP1-201ENST00000360982 ING4Q9UNL4 249 aa20.08■□□□□ 0.81
NCKAP1-201ENST00000360982 PSMD11O00231 422 aa20.08■□□□□ 0.8
NCKAP1-201ENST00000360982 CYP4B1P13584 511 aa20.08■□□□□ 0.8
NCKAP1-201ENST00000360982 KCNA5P22460 613 aa20.08■□□□□ 0.8
NCKAP1-201ENST00000360982 SLC7A1P30825 629 aa20.08■□□□□ 0.8
NCKAP1-201ENST00000360982 BMPR1AP36894 532 aa20.08■□□□□ 0.8
NCKAP1-201ENST00000360982 NCBP2P52298 156 aaKnown RBP eCLIP20.08■□□□□ 0.87e-15■□□□□ 9.5
NCKAP1-201ENST00000360982 PCDH1Q08174 1060 aa20.08■□□□□ 0.8
NCKAP1-201ENST00000360982 ERN2Q76MJ5 926 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.8
NCKAP1-201ENST00000360982 ADGRG6Q86SQ4 1221 aa20.08■□□□□ 0.8
NCKAP1-201ENST00000360982 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.8
NCKAP1-201ENST00000360982 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.8
NCKAP1-201ENST00000360982 SLC22A2O15244 555 aa20.08■□□□□ 0.8
NCKAP1-201ENST00000360982 SERPINA1P01009 418 aa20.08■□□□□ 0.8
NCKAP1-201ENST00000360982 PDX1P52945 283 aa20.08■□□□□ 0.8
NCKAP1-201ENST00000360982 SLC8B1Q6J4K2 584 aa20.08■□□□□ 0.8
NCKAP1-201ENST00000360982 RAB2BQ8WUD1 216 aa20.08■□□□□ 0.8
NCKAP1-201ENST00000360982 SMPD3Q9NY59 655 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.8
NCKAP1-201ENST00000360982 FAM234BA2RU67 622 aa20.07■□□□□ 0.8
NCKAP1-201ENST00000360982 E7ENX8 843 aa20.07■□□□□ 0.8
NCKAP1-201ENST00000360982 DCLK1O15075 740 aa20.07■□□□□ 0.8
NCKAP1-201ENST00000360982 ZNF527Q8NB42 609 aa20.07■□□□□ 0.8
NCKAP1-201ENST00000360982 CEP295NLQ96MC4 621 aa20.07■□□□□ 0.8
NCKAP1-201ENST00000360982 MCCC2Q9HCC0 563 aa20.07■□□□□ 0.8
NCKAP1-201ENST00000360982 SPATA7Q9P0W8 599 aa20.07■□□□□ 0.8
NCKAP1-201ENST00000360982 MBD2Q9UBB5 411 aa20.07■□□□□ 0.8
NCKAP1-201ENST00000360982 C19orf25Q9UFG5 118 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
NCKAP1-201ENST00000360982 ACSL5Q9ULC5 683 aa20.07■□□□□ 0.8
NCKAP1-201ENST00000360982 FAM92AA1XBS5 289 aa20.07■□□□□ 0.8
NCKAP1-201ENST00000360982 NME6O75414 186 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
NCKAP1-201ENST00000360982 PIK3R6Q5UE93 754 aa20.07■□□□□ 0.8
NCKAP1-201ENST00000360982 THAP5Q7Z6K1 395 aa20.07■□□□□ 0.8
NCKAP1-201ENST00000360982 RAB43Q86YS6 212 aa20.07■□□□□ 0.8
NCKAP1-201ENST00000360982 KIAA1143Q96AT1 154 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
NCKAP1-201ENST00000360982 DGAT2Q96PD7 388 aa20.07■□□□□ 0.8
NCKAP1-201ENST00000360982 KIFC1Q9BW19 673 aa20.07■□□□□ 0.8
NCKAP1-201ENST00000360982 ADAMTS10Q9H324 1103 aa20.07■□□□□ 0.8
NCKAP1-201ENST00000360982 PAPSS2O95340 614 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
NCKAP1-201ENST00000360982 CYBAP13498 195 aa20.07■□□□□ 0.8
NCKAP1-201ENST00000360982 HLA-EP13747 358 aa20.07■□□□□ 0.8
NCKAP1-201ENST00000360982 PRKCHP24723 683 aa20.07■□□□□ 0.8
NCKAP1-201ENST00000360982 MNDAP41218 407 aa20.07■□□□□ 0.8
NCKAP1-201ENST00000360982 CASP9P55211 416 aa20.07■□□□□ 0.8
NCKAP1-201ENST00000360982 BNIP3Q12983 259 aa20.07■□□□□ 0.8
NCKAP1-201ENST00000360982 DDI2Q5TDH0 399 aa20.07■□□□□ 0.8
NCKAP1-201ENST00000360982 TAC3Q9UHF0 121 aa20.07■□□□□ 0.8
NCKAP1-201ENST00000360982 KCNK6Q9Y257 313 aa20.07■□□□□ 0.8
NCKAP1-201ENST00000360982 PLK4O00444 970 aa20.07■□□□□ 0.8
NCKAP1-201ENST00000360982 LSAMPQ13449 338 aa20.07■□□□□ 0.8
NCKAP1-201ENST00000360982 TMEM53Q6P2H8 277 aa20.07■□□□□ 0.8
NCKAP1-201ENST00000360982 BTN2A1Q7KYR7 527 aa20.07■□□□□ 0.8
NCKAP1-201ENST00000360982 SLC29A4Q7RTT9 530 aa20.07■□□□□ 0.8
NCKAP1-201ENST00000360982 PDSS2Q86YH6 399 aa20.07■□□□□ 0.8
NCKAP1-201ENST00000360982 SNX33Q8WV41 574 aa20.07■□□□□ 0.8
NCKAP1-201ENST00000360982 ALPPP05187 535 aa20.06■□□□□ 0.8
NCKAP1-201ENST00000360982 SRP54P61011 504 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
NCKAP1-201ENST00000360982 ELOCQ15369 112 aa20.06■□□□□ 0.8
NCKAP1-201ENST00000360982 GPRC6AQ5T6X5 926 aa20.06■□□□□ 0.8
NCKAP1-201ENST00000360982 MLIPQ5VWP3 458 aa20.06■□□□□ 0.8
NCKAP1-201ENST00000360982 REP15Q6BDI9 236 aa20.06■□□□□ 0.8
NCKAP1-201ENST00000360982 OR4C6Q8NH72 309 aa20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.2 ms