RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000355530.6

SPNS3-201, Transcript of sphingolipid transporter 3 (putative), humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene SPNS3, Length 2,133 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS3-201ENST00000355530 PTPN5P54829 565 aa17.75■□□□□ 0.43
SPNS3-201ENST00000355530 CXCR4P61073 352 aa17.75■□□□□ 0.43
SPNS3-201ENST00000355530 CYP4Z1Q86W10 505 aa17.75■□□□□ 0.43
SPNS3-201ENST00000355530 ZBTB8BQ8NAP8 495 aaPredicted RBP17.75■□□□□ 0.43
SPNS3-201ENST00000355530 ZNF641Q96N77 438 aaPredicted RBP17.75■□□□□ 0.43
SPNS3-201ENST00000355530 IL1RAPQ9NPH3 570 aa17.75■□□□□ 0.43
SPNS3-201ENST00000355530 SELENONQ9NZV5 590 aa17.75■□□□□ 0.43
SPNS3-201ENST00000355530 YIPF1Q9Y548 306 aa17.75■□□□□ 0.43
SPNS3-201ENST00000355530 EVPLLA8MZ36 301 aa17.75■□□□□ 0.43
SPNS3-201ENST00000355530 GFRA2O00451 464 aa17.75■□□□□ 0.43
SPNS3-201ENST00000355530 KPNA4O00629 521 aaPredicted RBP17.75■□□□□ 0.43
SPNS3-201ENST00000355530 MITFO75030 526 aaPredicted RBP17.75■□□□□ 0.43
SPNS3-201ENST00000355530 TACR1P25103 407 aa17.75■□□□□ 0.43
SPNS3-201ENST00000355530 CCR3P51677 355 aa17.75■□□□□ 0.43
SPNS3-201ENST00000355530 LDLRAP1Q5SW96 308 aa17.75■□□□□ 0.43
SPNS3-201ENST00000355530 KDM4DQ6B0I6 523 aa17.75■□□□□ 0.43
SPNS3-201ENST00000355530 DOK6Q6PKX4 331 aa17.75■□□□□ 0.43
SPNS3-201ENST00000355530 B3GNT8Q7Z7M8 397 aa17.75■□□□□ 0.43
SPNS3-201ENST00000355530 GALNT5Q7Z7M9 940 aa17.75■□□□□ 0.43
SPNS3-201ENST00000355530 PGBD3Q8N328 593 aa17.75■□□□□ 0.43
SPNS3-201ENST00000355530 S100ZQ8WXG8 99 aa17.75■□□□□ 0.43
SPNS3-201ENST00000355530 RIBC2Q9H4K1 309 aa17.75■□□□□ 0.43
SPNS3-201ENST00000355530 DUSP21Q9H596 190 aa17.75■□□□□ 0.43
SPNS3-201ENST00000355530 NECTIN3Q9NQS3 549 aa17.75■□□□□ 0.43
SPNS3-201ENST00000355530 ZDHHC3Q9NYG2 299 aa17.75■□□□□ 0.43
SPNS3-201ENST00000355530 FBXO10Q9UK96 956 aa17.75■□□□□ 0.43
SPNS3-201ENST00000355530 ABCG2Q9UNQ0 655 aa17.75■□□□□ 0.43
SPNS3-201ENST00000355530 KIAA1671Q9BY89 1806 aa17.74■□□□□ 0.43
SPNS3-201ENST00000355530 A0A1W2PQ45 241 aaPredicted RBP17.74■□□□□ 0.43
SPNS3-201ENST00000355530 A0A1W2PQY0 241 aa17.74■□□□□ 0.43
SPNS3-201ENST00000355530 IGSF6O95976 241 aa17.74■□□□□ 0.43
SPNS3-201ENST00000355530 C8GP07360 202 aa17.74■□□□□ 0.43
SPNS3-201ENST00000355530 BMP1P13497 986 aa17.74■□□□□ 0.43
SPNS3-201ENST00000355530 CDH3P22223 829 aa17.74■□□□□ 0.43
SPNS3-201ENST00000355530 KIR3DL1P43629 444 aa17.74■□□□□ 0.43
SPNS3-201ENST00000355530 SLC35A2P78381 396 aa17.74■□□□□ 0.43
SPNS3-201ENST00000355530 CBX3Q13185 183 aa17.74■□□□□ 0.43
SPNS3-201ENST00000355530 VEPH1Q14D04 833 aa17.74■□□□□ 0.43
SPNS3-201ENST00000355530 CARD16Q5EG05 197 aa17.74■□□□□ 0.43
SPNS3-201ENST00000355530 EGFLAMQ63HQ2 1017 aa17.74■□□□□ 0.43
SPNS3-201ENST00000355530 UBE2R2Q712K3 238 aaPredicted RBP17.74■□□□□ 0.43
SPNS3-201ENST00000355530 APCDD1Q8J025 514 aa17.74■□□□□ 0.43
SPNS3-201ENST00000355530 NAT16Q8N8M0 369 aa17.74■□□□□ 0.43
SPNS3-201ENST00000355530 OR10Q1Q8NGQ4 319 aa17.74■□□□□ 0.43
SPNS3-201ENST00000355530 CSGALNACT1Q8TDX6 532 aa17.74■□□□□ 0.43
SPNS3-201ENST00000355530 VMP1Q96GC9 406 aa17.74■□□□□ 0.43
SPNS3-201ENST00000355530 LYSMD1Q96S90 227 aa17.74■□□□□ 0.43
SPNS3-201ENST00000355530 APOL4Q9BPW4 351 aa17.74■□□□□ 0.43
SPNS3-201ENST00000355530 AKIP1Q9NQ31 210 aa17.74■□□□□ 0.43
SPNS3-201ENST00000355530 SCN3BQ9NY72 215 aa17.74■□□□□ 0.43
SPNS3-201ENST00000355530 GPRC5BQ9NZH0 403 aa17.74■□□□□ 0.43
SPNS3-201ENST00000355530 RPS6KA6Q9UK32 745 aa17.74■□□□□ 0.43
SPNS3-201ENST00000355530 DOLKQ9UPQ8 538 aa17.74■□□□□ 0.43
SPNS3-201ENST00000355530 EFEMP2O95967 443 aa17.74■□□□□ 0.43
SPNS3-201ENST00000355530 SERPINA4P29622 427 aa17.74■□□□□ 0.43
SPNS3-201ENST00000355530 GKP32189 559 aa17.74■□□□□ 0.43
SPNS3-201ENST00000355530 TRPC1P48995 793 aa17.74■□□□□ 0.43
SPNS3-201ENST00000355530 HNMTP50135 292 aa17.74■□□□□ 0.43
SPNS3-201ENST00000355530 ABRQ12979 859 aa17.74■□□□□ 0.43
SPNS3-201ENST00000355530 MTAPQ13126 283 aa17.74■□□□□ 0.43
SPNS3-201ENST00000355530 SLC14A1Q13336 389 aa17.74■□□□□ 0.43
SPNS3-201ENST00000355530 GTF2H3Q13889 308 aa17.74■□□□□ 0.43
SPNS3-201ENST00000355530 TRIM16LQ309B1 348 aa17.74■□□□□ 0.43
SPNS3-201ENST00000355530 SLCO6A1Q86UG4 719 aa17.74■□□□□ 0.43
SPNS3-201ENST00000355530 L3MBTL4Q8NA19 623 aa17.74■□□□□ 0.43
SPNS3-201ENST00000355530 GPR26Q8NDV2 337 aa17.74■□□□□ 0.43
SPNS3-201ENST00000355530 ZNF461Q8TAF7 563 aa17.74■□□□□ 0.43
SPNS3-201ENST00000355530 COPS8Q99627 209 aa17.74■□□□□ 0.43
SPNS3-201ENST00000355530 SLC12A9Q9BXP2 914 aa17.74■□□□□ 0.43
SPNS3-201ENST00000355530 STARD7Q9NQZ5 370 aa17.74■□□□□ 0.43
SPNS3-201ENST00000355530 AASDHPPTQ9NRN7 309 aa17.74■□□□□ 0.43
SPNS3-201ENST00000355530 THG1LQ9NWX6 298 aaKnown RBP17.74■□□□□ 0.43
SPNS3-201ENST00000355530 ERVK-18Q9QC07 812 aa17.74■□□□□ 0.43
SPNS3-201ENST00000355530 PABPN1LA6NDY0 278 aaKnown RBP17.73■□□□□ 0.43
SPNS3-201ENST00000355530 NPIPB15A6NHN6 443 aaPredicted RBP17.73■□□□□ 0.43
SPNS3-201ENST00000355530 B3GALT4O96024 378 aa17.73■□□□□ 0.43
SPNS3-201ENST00000355530 FPR1P21462 350 aa17.73■□□□□ 0.43
SPNS3-201ENST00000355530 ACVR2AP27037 513 aa17.73■□□□□ 0.43
SPNS3-201ENST00000355530 FMO3P31513 532 aa17.73■□□□□ 0.43
SPNS3-201ENST00000355530 DNAJA1P31689 397 aaKnown RBP17.73■□□□□ 0.43
SPNS3-201ENST00000355530 SLC6A12P48065 614 aa17.73■□□□□ 0.43
SPNS3-201ENST00000355530 SERPINB10P48595 397 aa17.73■□□□□ 0.43
SPNS3-201ENST00000355530 NEK2P51955 445 aa17.73■□□□□ 0.43
SPNS3-201ENST00000355530 DUOXA1Q1HG43 343 aa17.73■□□□□ 0.43
SPNS3-201ENST00000355530 ERICH5Q6P6B1 374 aa17.73■□□□□ 0.43
SPNS3-201ENST00000355530 CEP68Q76N32 757 aa17.73■□□□□ 0.43
SPNS3-201ENST00000355530 ZNF551Q7Z340 670 aaPredicted RBP17.73■□□□□ 0.43
SPNS3-201ENST00000355530 PIWIL3Q7Z3Z3 882 aaKnown RBP17.73■□□□□ 0.43
SPNS3-201ENST00000355530 METTL3Q86U44 580 aaKnown RBP17.73■□□□□ 0.43
SPNS3-201ENST00000355530 TSPAN33Q86UF1 283 aa17.73■□□□□ 0.43
SPNS3-201ENST00000355530 CRIPAKQ8N1N5 446 aa17.73■□□□□ 0.43
SPNS3-201ENST00000355530 SVOPQ8N4V2 548 aa17.73■□□□□ 0.43
SPNS3-201ENST00000355530 MAGEB10Q96LZ2 347 aaPredicted RBP17.73■□□□□ 0.43
SPNS3-201ENST00000355530 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP17.73■□□□□ 0.43
SPNS3-201ENST00000355530 CCNB1IP1Q9NPC3 277 aa17.73■□□□□ 0.43
SPNS3-201ENST00000355530 PCDHGA10Q9Y5H3 936 aa17.73■□□□□ 0.43
SPNS3-201ENST00000355530 GMPPBQ9Y5P6 360 aa17.73■□□□□ 0.43
SPNS3-201ENST00000355530 SERTM1A2A2V5 107 aa17.72■□□□□ 0.43
SPNS3-201ENST00000355530 GREM1O60565 184 aa17.72■□□□□ 0.43
SPNS3-201ENST00000355530 MRPS14O60783 128 aaKnown RBP17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.1 ms