RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000355233.9

PTPRD-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRD, Length 8,251 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-201ENST00000355233 TPRA1Q86W33 373 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 TSEN2Q8NCE0 465 aaKnown RBP4.81□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 ANGPTL6Q8NI99 470 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 STOML3Q8TAV4 291 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 SPPL2BQ8TCT7 592 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 DNAJC19Q96DA6 116 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 ADAM2Q99965 735 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 MCMBPQ9BTE3 642 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 P2RX2Q9UBL9 471 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 TMPRSS11EQ9UL52 423 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 NAALAD2Q9Y3Q0 740 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 NUBP2Q9Y5Y2 271 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 A0A1W2PRB8 838 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 FOXO6A8MYZ6 492 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 E7ESA3 106 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 XKRYO14609 159 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 PRODHO43272 600 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 UBBP0CG47 229 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 UBCP0CG48 685 aaKnown RBP4.81□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 MGAT1P26572 445 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 PPT1P50897 306 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 RPS27AP62979 156 aaKnown RBP4.81□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 UBA52P62987 128 aaKnown RBP4.81□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP4.81□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 MPPE1Q53F39 396 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 C1orf189Q5VU69 101 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 KDELC1Q6UW63 502 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 SLC36A4Q6YBV0 504 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 DEF8Q6ZN54 512 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 PLEKHG7Q6ZR37 379 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 KCNK18Q7Z418 384 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 ANKRD13BQ86YJ7 626 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 LFNGQ8NES3 379 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 OR2W6PQ8NHA6 318 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 DERL2Q9GZP9 239 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 MED17Q9NVC6 651 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 LYARQ9NX58 379 aaKnown RBP4.81□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 QPCTLQ9NXS2 382 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 CPNE7Q9UBL6 633 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 TSTD3H0UI37 97 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 TNFRSF11BO00300 401 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 TNFRSF10BO14763 440 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 POLR1CO15160 346 aaPredicted RBP4.81□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 USP2O75604 605 aaPredicted RBP4.81□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 MT-ND5P03915 603 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 S100A8P05109 93 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 CD63P08962 238 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 CD53P19397 219 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 TYMPP19971 482 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 GLRBP48167 497 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 ALDH3B2P48448 385 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 RPP30P78346 268 aaKnown RBP4.81□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 SRPXP78539 464 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 OCLNQ16625 522 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 ANKDD1AQ495B1 522 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 SLC36A3Q495N2 470 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 ATAT1Q5SQI0 421 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 XYLT1Q86Y38 959 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 ECHDC2Q86YB7 292 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 CEP76Q8TAP6 659 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 FAM174AQ8TBP5 190 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 TMEM80Q96HE8 168 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 HEPHQ9BQS7 1158 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 ANKRD60Q9BZ19 345 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 NIPAL2Q9H841 368 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 CERS4Q9HA82 394 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 BRF2Q9HAW0 419 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 FLRT1Q9NZU1 646 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 SLC17A6Q9P2U8 582 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 ZFC3H1O60293 1989 aaKnown RBP4.81□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 TRAV19A0A0A6YYK7 116 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 PP2D1A8MPX8 630 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 GPR89AB7ZAQ6 455 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 BTN3A1O00481 513 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 ATMINO43313 823 aaPredicted RBP4.81□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 LGR5O75473 907 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 GPR89BP0CG08 455 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 THEGLP0DJG4 465 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 MZF1P28698 734 aaPredicted RBP4.81□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 CD6P30203 668 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 RCAN2Q14206 197 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 SETMARQ53H47 684 aaPredicted RBP4.81□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 GLYATQ6IB77 296 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 SCUBE3Q8IX30 993 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 ATAD1Q8NBU5 361 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 TAS1R2Q8TE23 839 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP4.81□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 FCRL5Q96RD9 977 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 CCNL2Q96S94 520 aaPredicted RBP4.81□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 SPIN2AQ99865 258 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 SPIN2BQ9BPZ2 258 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 SDHAF3Q9NRP4 125 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 KCNIP2Q9NS61 270 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 IMP3Q9NV31 184 aaKnown RBP4.81□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 MARK1Q9P0L2 795 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 FBXO5Q9UKT4 447 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 PARP14Q460N5 1801 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 NFKBIEO00221 500 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 FAAHO00519 579 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 MATN3O15232 486 aa4.81□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 79.7 ms