RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000344528.8

SH3BP4-201, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP4, Length 5,044 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-201ENST00000344528 WDTC1Q8N5D0 677 aa15.94■□□□□ 0.14
SH3BP4-201ENST00000344528 POC5Q8NA72 575 aa15.94■□□□□ 0.14
SH3BP4-201ENST00000344528 ATP6V1C2Q8NEY4 427 aa15.94■□□□□ 0.14
SH3BP4-201ENST00000344528 CGREF1Q99674 301 aa15.94■□□□□ 0.14
SH3BP4-201ENST00000344528 P2RY13Q9BPV8 354 aa15.94■□□□□ 0.14
SH3BP4-201ENST00000344528 MKL2Q9ULH7 1088 aa15.94■□□□□ 0.14
SH3BP4-201ENST00000344528 PCDHB11Q9Y5F2 797 aa15.94■□□□□ 0.14
SH3BP4-201ENST00000344528 CPED1A4D0V7 1026 aa15.94■□□□□ 0.14
SH3BP4-201ENST00000344528 LOC730098B7Z3J9 87 aa15.94■□□□□ 0.14
SH3BP4-201ENST00000344528 TEX28O15482 410 aa15.94■□□□□ 0.14
SH3BP4-201ENST00000344528 GSRP00390 522 aa15.94■□□□□ 0.14
SH3BP4-201ENST00000344528 ANXA8P13928 327 aa15.94■□□□□ 0.14
SH3BP4-201ENST00000344528 KLF1Q13351 362 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
SH3BP4-201ENST00000344528 KCNC3Q14003 757 aa15.94■□□□□ 0.14
SH3BP4-201ENST00000344528 COX4I2Q96KJ9 171 aa15.94■□□□□ 0.14
SH3BP4-201ENST00000344528 SMURF2Q9HAU4 748 aa15.94■□□□□ 0.14
SH3BP4-201ENST00000344528 PHF11Q9UIL8 331 aa15.94■□□□□ 0.14
SH3BP4-201ENST00000344528 KIF13AQ9H1H9 1805 aa15.94■□□□□ 0.14
SH3BP4-201ENST00000344528 AGXTP21549 392 aa15.93■□□□□ 0.14
SH3BP4-201ENST00000344528 NRG3P56975 720 aa15.93■□□□□ 0.14
SH3BP4-201ENST00000344528 SCARB2Q14108 478 aa15.93■□□□□ 0.14
SH3BP4-201ENST00000344528 GOLGA7Q7Z5G4 137 aa15.93■□□□□ 0.14
SH3BP4-201ENST00000344528 PSMA8Q8TAA3 256 aa15.93■□□□□ 0.14
SH3BP4-201ENST00000344528 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
SH3BP4-201ENST00000344528 ATXN10Q9UBB4 475 aa15.93■□□□□ 0.14
SH3BP4-201ENST00000344528 P2RX2Q9UBL9 471 aa15.93■□□□□ 0.14
SH3BP4-201ENST00000344528 PTGESO14684 152 aa15.93■□□□□ 0.14
SH3BP4-201ENST00000344528 RPL10P27635 214 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
SH3BP4-201ENST00000344528 ARFIP1P53367 373 aa15.93■□□□□ 0.14
SH3BP4-201ENST00000344528 LMAN2Q12907 356 aa15.93■□□□□ 0.14
SH3BP4-201ENST00000344528 TGFBIQ15582 683 aa15.93■□□□□ 0.14
SH3BP4-201ENST00000344528 RTP2Q5QGT7 225 aa15.93■□□□□ 0.14
SH3BP4-201ENST00000344528 TMEM214Q6NUQ4 689 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
SH3BP4-201ENST00000344528 NUP54Q7Z3B4 507 aa15.93■□□□□ 0.14
SH3BP4-201ENST00000344528 GKN2Q86XP6 184 aa15.93■□□□□ 0.14
SH3BP4-201ENST00000344528 OR9A1PQ8NGU1 263 aa15.93■□□□□ 0.14
SH3BP4-201ENST00000344528 MCFD2Q8NI22 146 aa15.93■□□□□ 0.14
SH3BP4-201ENST00000344528 SLC5A11Q8WWX8 675 aa15.93■□□□□ 0.14
SH3BP4-201ENST00000344528 GTPBP3Q969Y2 492 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
SH3BP4-201ENST00000344528 FAM83CQ9BQN1 747 aa15.93■□□□□ 0.14
SH3BP4-201ENST00000344528 CFAP20Q9Y6A4 193 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
SH3BP4-201ENST00000344528 KDM3BQ7LBC6 1761 aa15.93■□□□□ 0.14
SH3BP4-201ENST00000344528 FAM92AA1XBS5 289 aa15.93■□□□□ 0.14
SH3BP4-201ENST00000344528 FAM72CH0Y354 149 aa15.93■□□□□ 0.14
SH3BP4-201ENST00000344528 MANBAO00462 879 aa15.93■□□□□ 0.14
SH3BP4-201ENST00000344528 DSTNP60981 165 aa15.93■□□□□ 0.14
SH3BP4-201ENST00000344528 KHDC1Q4VXA5 237 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
SH3BP4-201ENST00000344528 WDR45BQ5MNZ6 344 aa15.93■□□□□ 0.14
SH3BP4-201ENST00000344528 FAM72AQ5TYM5 149 aa15.93■□□□□ 0.14
SH3BP4-201ENST00000344528 ANO7Q6IWH7 933 aa15.93■□□□□ 0.14
SH3BP4-201ENST00000344528 FAM72DQ6L9T8 149 aa15.93■□□□□ 0.14
SH3BP4-201ENST00000344528 FAM72BQ86X60 149 aa15.93■□□□□ 0.14
SH3BP4-201ENST00000344528 LRRC58Q96CX6 371 aa15.93■□□□□ 0.14
SH3BP4-201ENST00000344528 SLC35A5Q9BS91 424 aa15.93■□□□□ 0.14
SH3BP4-201ENST00000344528 PDLIM7Q9NR12 457 aa15.93■□□□□ 0.14
SH3BP4-201ENST00000344528 ACSL5Q9ULC5 683 aa15.93■□□□□ 0.14
SH3BP4-201ENST00000344528 CFL2Q9Y281 166 aa15.93■□□□□ 0.14
SH3BP4-201ENST00000344528 MBLAC1A4D2B0 266 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
SH3BP4-201ENST00000344528 LEFTY1O75610 366 aa15.93■□□□□ 0.14
SH3BP4-201ENST00000344528 CLCN4P51793 760 aa15.93■□□□□ 0.14
SH3BP4-201ENST00000344528 PITX1P78337 314 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
SH3BP4-201ENST00000344528 TMEM115Q12893 351 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
SH3BP4-201ENST00000344528 C6orf52Q5T4I8 152 aa15.93■□□□□ 0.14
SH3BP4-201ENST00000344528 C10orf62Q5T681 223 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
SH3BP4-201ENST00000344528 OR5K1Q8NHB7 308 aa15.93■□□□□ 0.14
SH3BP4-201ENST00000344528 TMEM40Q8WWA1 233 aa15.93■□□□□ 0.14
SH3BP4-201ENST00000344528 PMEPA1Q969W9 287 aa15.93■□□□□ 0.14
SH3BP4-201ENST00000344528 NSUN3Q9H649 340 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
SH3BP4-201ENST00000344528 CNMDO75829 334 aa15.92■□□□□ 0.14
SH3BP4-201ENST00000344528 STC2O76061 302 aa15.92■□□□□ 0.14
SH3BP4-201ENST00000344528 KLK1P06870 262 aa15.92■□□□□ 0.14
SH3BP4-201ENST00000344528 MYCLP1P12525 358 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
SH3BP4-201ENST00000344528 SLC7A1P30825 629 aa15.92■□□□□ 0.14
SH3BP4-201ENST00000344528 NFATC2Q13469 925 aa15.92■□□□□ 0.14
SH3BP4-201ENST00000344528 CCNIQ14094 377 aa15.92■□□□□ 0.14
SH3BP4-201ENST00000344528 AHSA2Q719I0 299 aa15.92■□□□□ 0.14
SH3BP4-201ENST00000344528 MRPL10Q7Z7H8 261 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
SH3BP4-201ENST00000344528 SLC9B2Q86UD5 537 aa15.92■□□□□ 0.14
SH3BP4-201ENST00000344528 OR52B2Q96RD2 323 aa15.92■□□□□ 0.14
SH3BP4-201ENST00000344528 HERC2P3Q9BVR0 1158 aa15.92■□□□□ 0.14
SH3BP4-201ENST00000344528 CYP11A1P05108 521 aa15.92■□□□□ 0.14
SH3BP4-201ENST00000344528 QPRTQ15274 297 aa15.92■□□□□ 0.14
SH3BP4-201ENST00000344528 LCN1P1Q5VSP4 162 aa15.92■□□□□ 0.14
SH3BP4-201ENST00000344528 SLC8B1Q6J4K2 584 aa15.92■□□□□ 0.14
SH3BP4-201ENST00000344528 BADQ92934 168 aa15.92■□□□□ 0.14
SH3BP4-201ENST00000344528 PAAF1Q9BRP4 392 aa15.92■□□□□ 0.14
SH3BP4-201ENST00000344528 NEUROD4Q9HD90 331 aa15.92■□□□□ 0.14
SH3BP4-201ENST00000344528 AKAP8LQ9ULX6 646 aaKnown RBP eCLIP15.92■□□□□ 0.14
SH3BP4-201ENST00000344528 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
SH3BP4-201ENST00000344528 CCDC182A6NF36 153 aa15.92■□□□□ 0.14
SH3BP4-201ENST00000344528 SLC30A4O14863 429 aa15.92■□□□□ 0.14
SH3BP4-201ENST00000344528 REM1O75628 298 aa15.92■□□□□ 0.14
SH3BP4-201ENST00000344528 PEX2P28328 305 aa15.92■□□□□ 0.14
SH3BP4-201ENST00000344528 MNDAP41218 407 aa15.92■□□□□ 0.14
SH3BP4-201ENST00000344528 ZNF846Q147U1 533 aa15.92■□□□□ 0.14
SH3BP4-201ENST00000344528 GPRIN1Q7Z2K8 1008 aa15.92■□□□□ 0.14
SH3BP4-201ENST00000344528 CAND1Q86VP6 1230 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
SH3BP4-201ENST00000344528 KAT2AQ92830 837 aa15.92■□□□□ 0.14
SH3BP4-201ENST00000344528 IGSF8Q969P0 613 aa15.92■□□□□ 0.14
SH3BP4-201ENST00000344528 KLHDC7BQ96G42 594 aa15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.2 ms