RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000323374.8

SPHK1-201, Transcript of sphingosine kinase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SPHK1, Length 2,138 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPHK1-201ENST00000323374 PCDHB14Q9Y5E9 798 aa21.11■□□□□ 0.97
SPHK1-201ENST00000323374 A0A096LPI6 279 aa21.1■□□□□ 0.97
SPHK1-201ENST00000323374 E7EQ34 232 aa21.1■□□□□ 0.97
SPHK1-201ENST00000323374 DLGAP1O14490 977 aa21.1■□□□□ 0.97
SPHK1-201ENST00000323374 TFAP2AP05549 437 aa21.1■□□□□ 0.97
SPHK1-201ENST00000323374 RAP2AP10114 183 aa21.1■□□□□ 0.97
SPHK1-201ENST00000323374 CD22P20273 847 aa21.1■□□□□ 0.97
SPHK1-201ENST00000323374 NPAS3Q8IXF0 933 aa21.1■□□□□ 0.97
SPHK1-201ENST00000323374 SMARCD2Q92925 531 aa21.1■□□□□ 0.97
SPHK1-201ENST00000323374 FOXJ1Q92949 421 aa21.1■□□□□ 0.97
SPHK1-201ENST00000323374 EPB41L1Q9H4G0 881 aa21.1■□□□□ 0.97
SPHK1-201ENST00000323374 ELOVL7A1L3X0 281 aa21.1■□□□□ 0.97
SPHK1-201ENST00000323374 OTOL1A6NHN0 477 aaPredicted RBP21.1■□□□□ 0.97
SPHK1-201ENST00000323374 RECQL5O94762 991 aaPredicted RBP21.1■□□□□ 0.97
SPHK1-201ENST00000323374 SOD1P00441 154 aa21.1■□□□□ 0.97
SPHK1-201ENST00000323374 MT-ND1P03886 318 aa21.1■□□□□ 0.97
SPHK1-201ENST00000323374 EN2P19622 333 aaPredicted RBP21.1■□□□□ 0.97
SPHK1-201ENST00000323374 HNF4AP41235 474 aa21.1■□□□□ 0.97
SPHK1-201ENST00000323374 DOC2AQ14183 400 aa21.1■□□□□ 0.97
SPHK1-201ENST00000323374 ELAVL3Q14576 367 aaKnown RBP21.1■□□□□ 0.97
SPHK1-201ENST00000323374 GAB4Q2WGN9 574 aa21.1■□□□□ 0.97
SPHK1-201ENST00000323374 PGS1Q32NB8 556 aa21.1■□□□□ 0.97
SPHK1-201ENST00000323374 GTDC1Q4AE62 458 aa21.1■□□□□ 0.97
SPHK1-201ENST00000323374 CCSMST1Q4G0I0 132 aa21.1■□□□□ 0.97
SPHK1-201ENST00000323374 ATG9BQ674R7 924 aa21.1■□□□□ 0.97
SPHK1-201ENST00000323374 ZNF765Q7L2R6 523 aa21.1■□□□□ 0.97
SPHK1-201ENST00000323374 TMEM132CQ8N3T6 1108 aa21.1■□□□□ 0.97
SPHK1-201ENST00000323374 WDR20Q8TBZ3 569 aa21.1■□□□□ 0.97
SPHK1-201ENST00000323374 NUS1Q96E22 293 aa21.1■□□□□ 0.97
SPHK1-201ENST00000323374 PPP1R16AQ96I34 528 aa21.1■□□□□ 0.97
SPHK1-201ENST00000323374 PKP4Q99569 1192 aa21.1■□□□□ 0.97
SPHK1-201ENST00000323374 UGT2B28Q9BY64 529 aa21.1■□□□□ 0.97
SPHK1-201ENST00000323374 SERHLQ9NQF3 203 aa21.1■□□□□ 0.97
SPHK1-201ENST00000323374 PPT2Q9UMR5 302 aa21.1■□□□□ 0.97
SPHK1-201ENST00000323374 LAMA3Q16787 3333 aa21.09■□□□□ 0.97
SPHK1-201ENST00000323374 MYOCOSA0A1B0GUC4 107 aa21.09■□□□□ 0.97
SPHK1-201ENST00000323374 H3BM21 787 aa21.09■□□□□ 0.97
SPHK1-201ENST00000323374 SLC16A8O95907 504 aa21.09■□□□□ 0.97
SPHK1-201ENST00000323374 CA3P07451 260 aa21.09■□□□□ 0.97
SPHK1-201ENST00000323374 ATP6V1B1P15313 513 aa21.09■□□□□ 0.97
SPHK1-201ENST00000323374 IMPA1P29218 277 aa21.09■□□□□ 0.97
SPHK1-201ENST00000323374 PDHA2P29803 388 aa21.09■□□□□ 0.97
SPHK1-201ENST00000323374 CHRNB3Q05901 458 aa21.09■□□□□ 0.97
SPHK1-201ENST00000323374 MERTKQ12866 999 aa21.09■□□□□ 0.97
SPHK1-201ENST00000323374 APOFQ13790 326 aa21.09■□□□□ 0.97
SPHK1-201ENST00000323374 BCL7AQ4VC05 210 aa21.09■□□□□ 0.97
SPHK1-201ENST00000323374 GRHL2Q6ISB3 625 aa21.09■□□□□ 0.97
SPHK1-201ENST00000323374 GPR180Q86V85 440 aa21.09■□□□□ 0.97
SPHK1-201ENST00000323374 VPS50Q96JG6 964 aa21.09■□□□□ 0.97
SPHK1-201ENST00000323374 FCRL1Q96LA6 429 aa21.09■□□□□ 0.97
SPHK1-201ENST00000323374 ADI1Q9BV57 179 aa21.09■□□□□ 0.97
SPHK1-201ENST00000323374 KAT8Q9H7Z6 458 aaKnown RBP21.09■□□□□ 0.97
SPHK1-201ENST00000323374 VPS29Q9UBQ0 182 aa21.09■□□□□ 0.97
SPHK1-201ENST00000323374 EI24O14681 340 aa21.08■□□□□ 0.97
SPHK1-201ENST00000323374 CLOCKO15516 846 aa21.08■□□□□ 0.97
SPHK1-201ENST00000323374 H6PDO95479 791 aa21.08■□□□□ 0.97
SPHK1-201ENST00000323374 ADRB3P13945 408 aa21.08■□□□□ 0.97
SPHK1-201ENST00000323374 GPR1P46091 355 aa21.08■□□□□ 0.97
SPHK1-201ENST00000323374 PCDH1Q08174 1060 aa21.08■□□□□ 0.97
SPHK1-201ENST00000323374 CNPY1Q3B7I2 92 aa21.08■□□□□ 0.97
SPHK1-201ENST00000323374 RAET1GQ6H3X3 334 aa21.08■□□□□ 0.97
SPHK1-201ENST00000323374 GCNT7Q6ZNI0 430 aa21.08■□□□□ 0.97
SPHK1-201ENST00000323374 MSANTD1Q6ZTZ1 278 aa21.08■□□□□ 0.97
SPHK1-201ENST00000323374 RNF175Q8N4F7 328 aa21.08■□□□□ 0.97
SPHK1-201ENST00000323374 OR56A3Q8NH54 315 aa21.08■□□□□ 0.97
SPHK1-201ENST00000323374 TBCDQ9BTW9 1192 aa21.08■□□□□ 0.97
SPHK1-201ENST00000323374 SLC6A13Q9NSD5 602 aa21.08■□□□□ 0.97
SPHK1-201ENST00000323374 CIDEBQ9UHD4 219 aa21.08■□□□□ 0.97
SPHK1-201ENST00000323374 ADGRE2Q9UHX3 823 aa21.08■□□□□ 0.97
SPHK1-201ENST00000323374 CHD7Q9P2D1 2997 aa21.08■□□□□ 0.97
SPHK1-201ENST00000323374 HEPACAM2A8MVW5 462 aa21.08■□□□□ 0.96
SPHK1-201ENST00000323374 H0YIV9 168 aa21.08■□□□□ 0.96
SPHK1-201ENST00000323374 PLOD2O00469 737 aa21.08■□□□□ 0.96
SPHK1-201ENST00000323374 NPC1O15118 1278 aa21.08■□□□□ 0.96
SPHK1-201ENST00000323374 SCELO95171 688 aa21.08■□□□□ 0.96
SPHK1-201ENST00000323374 LRATO95237 230 aa21.08■□□□□ 0.96
SPHK1-201ENST00000323374 C6P13671 934 aa21.08■□□□□ 0.96
SPHK1-201ENST00000323374 PRPS1L1P21108 318 aa21.08■□□□□ 0.96
SPHK1-201ENST00000323374 ZNF234Q14588 700 aa21.08■□□□□ 0.96
SPHK1-201ENST00000323374 ZNF658BQ4V348 819 aaPredicted RBP21.08■□□□□ 0.96
SPHK1-201ENST00000323374 OR52E4Q8NGH9 312 aa21.08■□□□□ 0.96
SPHK1-201ENST00000323374 EGLN2Q96KS0 407 aa21.08■□□□□ 0.96
SPHK1-201ENST00000323374 OR4K3Q96R72 315 aa21.08■□□□□ 0.96
SPHK1-201ENST00000323374 FAM129BQ96TA1 746 aa21.08■□□□□ 0.96
SPHK1-201ENST00000323374 CPPED1Q9BRF8 314 aaPredicted RBP21.08■□□□□ 0.96
SPHK1-201ENST00000323374 OR2AG1Q9H205 316 aa21.08■□□□□ 0.96
SPHK1-201ENST00000323374 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP21.08■□□□□ 0.96
SPHK1-201ENST00000323374 ZNF639Q9UID6 485 aa21.08■□□□□ 0.96
SPHK1-201ENST00000323374 MYRFQ9Y2G1 1151 aa21.08■□□□□ 0.96
SPHK1-201ENST00000323374 GRXCR1A8MXD5 290 aa21.07■□□□□ 0.96
SPHK1-201ENST00000323374 CXCR6O00574 342 aa21.07■□□□□ 0.96
SPHK1-201ENST00000323374 LZTS3O60299 673 aaPredicted RBP21.07■□□□□ 0.96
SPHK1-201ENST00000323374 DEAF1O75398 565 aaPredicted RBP21.07■□□□□ 0.96
SPHK1-201ENST00000323374 FESP07332 822 aa21.07■□□□□ 0.96
SPHK1-201ENST00000323374 ZNF23P17027 643 aa21.07■□□□□ 0.96
SPHK1-201ENST00000323374 ADRM1Q16186 407 aa21.07■□□□□ 0.96
SPHK1-201ENST00000323374 DPY19L1Q2PZI1 675 aa21.07■□□□□ 0.96
SPHK1-201ENST00000323374 TRIM74Q86UV6 250 aa21.07■□□□□ 0.96
SPHK1-201ENST00000323374 ANKRD46Q86W74 232 aa21.07■□□□□ 0.96
SPHK1-201ENST00000323374 TRAPPC5Q8IUR0 188 aa21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 65.4 ms