RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000317868.8

ATG4C-201, Transcript of autophagy related 4C cysteine peptidase, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ATG4C, Length 2,938 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4C-201ENST00000317868 TRIM17Q9Y577 477 aa13.4□□□□□ -0.26
ATG4C-201ENST00000317868 PRMT3O60678 531 aa13.4□□□□□ -0.27
ATG4C-201ENST00000317868 PSIP1O75475 530 aaKnown RBP13.4□□□□□ -0.27
ATG4C-201ENST00000317868 FGF18O76093 207 aa13.4□□□□□ -0.27
ATG4C-201ENST00000317868 ATE1O95260 518 aa13.4□□□□□ -0.27
ATG4C-201ENST00000317868 CCL5P13501 91 aa13.4□□□□□ -0.27
ATG4C-201ENST00000317868 CYP2A7P20853 494 aa13.4□□□□□ -0.27
ATG4C-201ENST00000317868 VIPR1P32241 457 aa13.4□□□□□ -0.27
ATG4C-201ENST00000317868 DCTP40126 519 aa13.4□□□□□ -0.27
ATG4C-201ENST00000317868 NEK2P51955 445 aa13.4□□□□□ -0.27
ATG4C-201ENST00000317868 GABARAPL2P60520 117 aa13.4□□□□□ -0.27
ATG4C-201ENST00000317868 DMC1Q14565 340 aa13.4□□□□□ -0.27
ATG4C-201ENST00000317868 DPY19L1Q2PZI1 675 aa13.4□□□□□ -0.27
ATG4C-201ENST00000317868 ZC3H12BQ5HYM0 836 aaKnown RBP13.4□□□□□ -0.27
ATG4C-201ENST00000317868 LIPJQ5W064 366 aa13.4□□□□□ -0.27
ATG4C-201ENST00000317868 TTC23Q5W5X9 447 aa13.4□□□□□ -0.27
ATG4C-201ENST00000317868 TMEM215Q68D42 235 aa13.4□□□□□ -0.27
ATG4C-201ENST00000317868 GCNT7Q6ZNI0 430 aa13.4□□□□□ -0.27
ATG4C-201ENST00000317868 Q6ZVU0 165 aa13.4□□□□□ -0.27
ATG4C-201ENST00000317868 HSD11B1LQ7Z5J1 315 aa13.4□□□□□ -0.27
ATG4C-201ENST00000317868 MRGPRX3Q96LB0 322 aa13.4□□□□□ -0.27
ATG4C-201ENST00000317868 TBCDQ9BTW9 1192 aa13.4□□□□□ -0.27
ATG4C-201ENST00000317868 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP13.4□□□□□ -0.27
ATG4C-201ENST00000317868 SLC22A14Q9Y267 594 aa13.4□□□□□ -0.27
ATG4C-201ENST00000317868 NUP214P35658 2090 aaPredicted RBP13.39□□□□□ -0.27
ATG4C-201ENST00000317868 YAP1P46937 504 aaKnown RBP13.39□□□□□ -0.27
ATG4C-201ENST00000317868 NUP107P57740 925 aa13.39□□□□□ -0.27
ATG4C-201ENST00000317868 ZIK1Q3SY52 487 aaPredicted RBP13.39□□□□□ -0.27
ATG4C-201ENST00000317868 ZNF658BQ4V348 819 aaPredicted RBP13.39□□□□□ -0.27
ATG4C-201ENST00000317868 CLEC4FQ8N1N0 589 aa13.39□□□□□ -0.27
ATG4C-201ENST00000317868 PAF1Q8N7H5 531 aa13.39□□□□□ -0.27
ATG4C-201ENST00000317868 CSGALNACT1Q8TDX6 532 aa13.39□□□□□ -0.27
ATG4C-201ENST00000317868 METTL2AQ96IZ6 378 aaKnown RBP13.39□□□□□ -0.27
ATG4C-201ENST00000317868 POLR1BQ9H9Y6 1135 aa13.39□□□□□ -0.27
ATG4C-201ENST00000317868 SMURF2Q9HAU4 748 aa13.39□□□□□ -0.27
ATG4C-201ENST00000317868 THG1LQ9NWX6 298 aaKnown RBP13.39□□□□□ -0.27
ATG4C-201ENST00000317868 CD84Q9UIB8 345 aa13.39□□□□□ -0.27
ATG4C-201ENST00000317868 PCDHGA8Q9Y5G5 932 aa13.39□□□□□ -0.27
ATG4C-201ENST00000317868 HEMK1Q9Y5R4 338 aaPredicted RBP13.39□□□□□ -0.27
ATG4C-201ENST00000317868 SLC16A6O15403 523 aa13.39□□□□□ -0.27
ATG4C-201ENST00000317868 ABCB7O75027 752 aa13.39□□□□□ -0.27
ATG4C-201ENST00000317868 SERPINA1P01009 418 aa13.39□□□□□ -0.27
ATG4C-201ENST00000317868 HTR1AP08908 422 aa13.39□□□□□ -0.27
ATG4C-201ENST00000317868 HIST1H2AGP0C0S8 130 aaPredicted RBP13.39□□□□□ -0.27
ATG4C-201ENST00000317868 HIST1H2ADP20671 130 aa13.39□□□□□ -0.27
ATG4C-201ENST00000317868 ITGB8P26012 769 aa13.39□□□□□ -0.27
ATG4C-201ENST00000317868 POLR2LP62875 67 aaKnown RBP13.39□□□□□ -0.27
ATG4C-201ENST00000317868 DCTN2Q13561 401 aaKnown RBP13.39□□□□□ -0.27
ATG4C-201ENST00000317868 UGT8Q16880 541 aa13.39□□□□□ -0.27
ATG4C-201ENST00000317868 EEF1AKMT2Q5JPI9 291 aaKnown RBP13.39□□□□□ -0.27
ATG4C-201ENST00000317868 LRRC73Q5JTD7 316 aa13.39□□□□□ -0.27
ATG4C-201ENST00000317868 GTF2IRD2BQ6EKJ0 949 aa13.39□□□□□ -0.27
ATG4C-201ENST00000317868 NOXRED1Q6NXP6 359 aa13.39□□□□□ -0.27
ATG4C-201ENST00000317868 CYP2U1Q7Z449 544 aa13.39□□□□□ -0.27
ATG4C-201ENST00000317868 RBM23Q86U06 439 aaKnown RBP13.39□□□□□ -0.27
ATG4C-201ENST00000317868 GTF2IRD2Q86UP8 949 aa13.39□□□□□ -0.27
ATG4C-201ENST00000317868 HS3ST5Q8IZT8 346 aa13.39□□□□□ -0.27
ATG4C-201ENST00000317868 TRAM1L1Q8N609 369 aa13.39□□□□□ -0.27
ATG4C-201ENST00000317868 CHDHQ8NE62 594 aaPredicted RBP13.39□□□□□ -0.27
ATG4C-201ENST00000317868 PYCR2Q96C36 320 aa13.39□□□□□ -0.27
ATG4C-201ENST00000317868 PYURFQ96I23 114 aa13.39□□□□□ -0.27
ATG4C-201ENST00000317868 HIST1H2AHQ96KK5 128 aa13.39□□□□□ -0.27
ATG4C-201ENST00000317868 EGLN2Q96KS0 407 aa13.39□□□□□ -0.27
ATG4C-201ENST00000317868 TSSK3Q96PN8 268 aa13.39□□□□□ -0.27
ATG4C-201ENST00000317868 HIST1H2AJQ99878 128 aa13.39□□□□□ -0.27
ATG4C-201ENST00000317868 H2AFJQ9BTM1 129 aa13.39□□□□□ -0.27
ATG4C-201ENST00000317868 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP13.39□□□□□ -0.27
ATG4C-201ENST00000317868 ASAH2Q9NR71 780 aa13.39□□□□□ -0.27
ATG4C-201ENST00000317868 ERVK-11Q9UQG0 969 aa13.39□□□□□ -0.27
ATG4C-201ENST00000317868 TCF20Q9UGU0 1960 aaKnown RBP13.38□□□□□ -0.27
ATG4C-201ENST00000317868 KRT87PA6NCN2 255 aa13.38□□□□□ -0.27
ATG4C-201ENST00000317868 FADS2P1A8MWK0 482 aa13.38□□□□□ -0.27
ATG4C-201ENST00000317868 TRPC1P48995 793 aa13.38□□□□□ -0.27
ATG4C-201ENST00000317868 VASPP50552 380 aaPredicted RBP13.38□□□□□ -0.27
ATG4C-201ENST00000317868 LAPTM5Q13571 262 aa13.38□□□□□ -0.27
ATG4C-201ENST00000317868 CTU2Q2VPK5 515 aaKnown RBP13.38□□□□□ -0.27
ATG4C-201ENST00000317868 ADHFE1Q8IWW8 467 aa13.38□□□□□ -0.27
ATG4C-201ENST00000317868 C8orf59Q8N0T1 100 aaPredicted RBP13.38□□□□□ -0.27
ATG4C-201ENST00000317868 EID3Q8N140 333 aa13.38□□□□□ -0.27
ATG4C-201ENST00000317868 ELMOD1Q8N336 334 aa13.38□□□□□ -0.27
ATG4C-201ENST00000317868 TTC16Q8NEE8 873 aa13.38□□□□□ -0.27
ATG4C-201ENST00000317868 OR8J2Q8NGG1 315 aa13.38□□□□□ -0.27
ATG4C-201ENST00000317868 FAM120BQ96EK7 910 aaKnown RBP13.38□□□□□ -0.27
ATG4C-201ENST00000317868 VPS35Q96QK1 796 aa13.38□□□□□ -0.27
ATG4C-201ENST00000317868 BEGAINQ9BUH8 593 aa13.38□□□□□ -0.27
ATG4C-201ENST00000317868 B4GAT1O43505 415 aa13.38□□□□□ -0.27
ATG4C-201ENST00000317868 RECQL5O94762 991 aaPredicted RBP13.38□□□□□ -0.27
ATG4C-201ENST00000317868 ITGAMP11215 1152 aa13.38□□□□□ -0.27
ATG4C-201ENST00000317868 CYP2A6P11509 494 aaPredicted RBP13.38□□□□□ -0.27
ATG4C-201ENST00000317868 GPX2P18283 190 aa13.38□□□□□ -0.27
ATG4C-201ENST00000317868 PRPS1L1P21108 318 aa13.38□□□□□ -0.27
ATG4C-201ENST00000317868 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP13.38□□□□□ -0.27
ATG4C-201ENST00000317868 ISL1P61371 349 aa13.38□□□□□ -0.27
ATG4C-201ENST00000317868 TUBA3CQ13748 450 aa13.38□□□□□ -0.27
ATG4C-201ENST00000317868 ZNF691Q5VV52 312 aa13.38□□□□□ -0.27
ATG4C-201ENST00000317868 ANKRD34AQ69YU3 496 aa13.38□□□□□ -0.27
ATG4C-201ENST00000317868 ZNF557Q8N988 423 aaPredicted RBP13.38□□□□□ -0.27
ATG4C-201ENST00000317868 KREMEN2Q8NCW0 462 aa13.38□□□□□ -0.27
ATG4C-201ENST00000317868 ZNF566Q969W8 418 aa13.38□□□□□ -0.27
ATG4C-201ENST00000317868 SAGE1Q9NXZ1 904 aa13.38□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.6 ms