RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000255476.2

RFXAP-201, Transcript of regulatory factor X associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RFXAP, Length 2,304 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFXAP-201ENST00000255476 JUPP14923 745 aa20.48■□□□□ 0.87
RFXAP-201ENST00000255476 VARSP26640 1264 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
RFXAP-201ENST00000255476 DGKEP52429 567 aa20.48■□□□□ 0.87
RFXAP-201ENST00000255476 EMX2Q04743 252 aa20.48■□□□□ 0.87
RFXAP-201ENST00000255476 STX5Q13190 355 aa20.48■□□□□ 0.87
RFXAP-201ENST00000255476 LRRC56Q8IYG6 542 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
RFXAP-201ENST00000255476 CCDC124Q96CT7 223 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
RFXAP-201ENST00000255476 PDXPQ96GD0 296 aa20.48■□□□□ 0.87
RFXAP-201ENST00000255476 HHIPQ96QV1 700 aa20.48■□□□□ 0.87
RFXAP-201ENST00000255476 BRINP2Q9C0B6 783 aa20.48■□□□□ 0.87
RFXAP-201ENST00000255476 CAAP1Q9H8G2 361 aa20.48■□□□□ 0.87
RFXAP-201ENST00000255476 WDR41Q9HAD4 459 aa20.48■□□□□ 0.87
RFXAP-201ENST00000255476 SNX6Q9UNH7 406 aa20.48■□□□□ 0.87
RFXAP-201ENST00000255476 SLC28A1O00337 649 aa20.48■□□□□ 0.87
RFXAP-201ENST00000255476 IFRD1O00458 451 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
RFXAP-201ENST00000255476 FPGTO14772 594 aa20.48■□□□□ 0.87
RFXAP-201ENST00000255476 NRP2O60462 931 aa20.48■□□□□ 0.87
RFXAP-201ENST00000255476 NPPBP16860 134 aa20.48■□□□□ 0.87
RFXAP-201ENST00000255476 ADNP2Q6IQ32 1131 aa20.48■□□□□ 0.87
RFXAP-201ENST00000255476 CAPN13Q6MZZ7 669 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
RFXAP-201ENST00000255476 ENPP7Q6UWV6 458 aa20.48■□□□□ 0.87
RFXAP-201ENST00000255476 RETREG3Q86VR2 466 aa20.48■□□□□ 0.87
RFXAP-201ENST00000255476 HPS6Q86YV9 775 aa20.48■□□□□ 0.87
RFXAP-201ENST00000255476 KLHDC8AQ8IYD2 350 aa20.48■□□□□ 0.87
RFXAP-201ENST00000255476 PPP3R2Q96LZ3 170 aa20.48■□□□□ 0.87
RFXAP-201ENST00000255476 CARS2Q9HA77 564 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
RFXAP-201ENST00000255476 SEC22BO75396 215 aa20.47■□□□□ 0.87
RFXAP-201ENST00000255476 HNRNPA2B1P22626 353 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
RFXAP-201ENST00000255476 ZFP36L2P47974 494 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
RFXAP-201ENST00000255476 PNLIPRP1P54315 467 aa20.47■□□□□ 0.87
RFXAP-201ENST00000255476 FZD5Q13467 585 aa20.47■□□□□ 0.87
RFXAP-201ENST00000255476 LRP8Q14114 963 aa20.47■□□□□ 0.87
RFXAP-201ENST00000255476 CATSPEREQ5SY80 951 aa20.47■□□□□ 0.87
RFXAP-201ENST00000255476 FRG2Q64ET8 278 aa20.47■□□□□ 0.87
RFXAP-201ENST00000255476 PGM2L1Q6PCE3 622 aa20.47■□□□□ 0.87
RFXAP-201ENST00000255476 SLC30A9Q6PML9 568 aa20.47■□□□□ 0.87
RFXAP-201ENST00000255476 C16orf89Q6UX73 402 aa20.47■□□□□ 0.87
RFXAP-201ENST00000255476 SYT13Q7L8C5 426 aa20.47■□□□□ 0.87
RFXAP-201ENST00000255476 RD3Q7Z3Z2 195 aa20.47■□□□□ 0.87
RFXAP-201ENST00000255476 DCUN1D3Q8IWE4 304 aa20.47■□□□□ 0.87
RFXAP-201ENST00000255476 OR5K2Q8NHB8 316 aa20.47■□□□□ 0.87
RFXAP-201ENST00000255476 RAD51AP1Q96B01 352 aa20.47■□□□□ 0.87
RFXAP-201ENST00000255476 FRG2BQ96QU4 278 aa20.47■□□□□ 0.87
RFXAP-201ENST00000255476 CDRT15Q96T59 188 aa20.47■□□□□ 0.87
RFXAP-201ENST00000255476 INSM2Q96T92 566 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
RFXAP-201ENST00000255476 PRSS38A1L453 326 aa20.47■□□□□ 0.87
RFXAP-201ENST00000255476 MRASO14807 208 aa20.47■□□□□ 0.87
RFXAP-201ENST00000255476 IL12AP29459 219 aa20.47■□□□□ 0.87
RFXAP-201ENST00000255476 DMPKQ09013 629 aa20.47■□□□□ 0.87
RFXAP-201ENST00000255476 LIPJQ5W064 366 aa20.47■□□□□ 0.87
RFXAP-201ENST00000255476 BLOC1S3Q6QNY0 202 aa20.47■□□□□ 0.87
RFXAP-201ENST00000255476 TMPRSS11BQ86T26 416 aa20.47■□□□□ 0.87
RFXAP-201ENST00000255476 PROKR1Q8TCW9 393 aa20.47■□□□□ 0.87
RFXAP-201ENST00000255476 RLN3Q8WXF3 142 aa20.47■□□□□ 0.87
RFXAP-201ENST00000255476 OR1E3Q8WZA6 343 aa20.47■□□□□ 0.87
RFXAP-201ENST00000255476 VPS33AQ96AX1 596 aa20.47■□□□□ 0.87
RFXAP-201ENST00000255476 TOE1Q96GM8 510 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
RFXAP-201ENST00000255476 FAM210AQ96ND0 272 aa20.47■□□□□ 0.87
RFXAP-201ENST00000255476 TIMM29Q9BSF4 260 aa20.47■□□□□ 0.87
RFXAP-201ENST00000255476 ACTL8Q9H568 366 aa20.47■□□□□ 0.87
RFXAP-201ENST00000255476 LRTM1Q9HBL6 345 aa20.47■□□□□ 0.87
RFXAP-201ENST00000255476 SGK2Q9HBY8 427 aa20.47■□□□□ 0.87
RFXAP-201ENST00000255476 ACSL5Q9ULC5 683 aa20.47■□□□□ 0.87
RFXAP-201ENST00000255476 PNMA8BQ9ULN7 279 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
RFXAP-201ENST00000255476 KCNE2Q9Y6J6 123 aa20.47■□□□□ 0.87
RFXAP-201ENST00000255476 GNAZP19086 355 aa20.46■□□□□ 0.87
RFXAP-201ENST00000255476 YBX1P67809 324 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
RFXAP-201ENST00000255476 DDX39BQ13838 428 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
RFXAP-201ENST00000255476 WASHC2DQ5SRD0 308 aa20.46■□□□□ 0.87
RFXAP-201ENST00000255476 CYP20A1Q6UW02 462 aa20.46■□□□□ 0.87
RFXAP-201ENST00000255476 RNF165Q6ZSG1 346 aa20.46■□□□□ 0.87
RFXAP-201ENST00000255476 FAM160A2Q8N612 972 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
RFXAP-201ENST00000255476 RNF148Q8N7C7 305 aa20.46■□□□□ 0.87
RFXAP-201ENST00000255476 TSACCQ96A04 125 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
RFXAP-201ENST00000255476 C12orf66Q96MD2 445 aa20.46■□□□□ 0.87
RFXAP-201ENST00000255476 MTERF1Q99551 399 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
RFXAP-201ENST00000255476 SGPP1Q9BX95 441 aa20.46■□□□□ 0.87
RFXAP-201ENST00000255476 TPSD1Q9BZJ3 242 aa20.46■□□□□ 0.87
RFXAP-201ENST00000255476 RMI1Q9H9A7 625 aa20.46■□□□□ 0.87
RFXAP-201ENST00000255476 SLC52A3Q9NQ40 469 aa20.46■□□□□ 0.87
RFXAP-201ENST00000255476 SLC22A3O75751 556 aa20.45■□□□□ 0.87
RFXAP-201ENST00000255476 RSL1D1O76021 490 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.87
RFXAP-201ENST00000255476 PTGR1Q14914 329 aa20.45■□□□□ 0.87
RFXAP-201ENST00000255476 CLCA4Q14CN2 919 aa20.45■□□□□ 0.87
RFXAP-201ENST00000255476 PDCD4Q53EL6 469 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.87
RFXAP-201ENST00000255476 CWF19L1Q69YN2 538 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.87
RFXAP-201ENST00000255476 GCNT7Q6ZNI0 430 aa20.45■□□□□ 0.87
RFXAP-201ENST00000255476 RIPOR1Q6ZS17 1223 aa20.45■□□□□ 0.87
RFXAP-201ENST00000255476 PGAM4Q8N0Y7 254 aa20.45■□□□□ 0.87
RFXAP-201ENST00000255476 DENND6BQ8NEG7 585 aa20.45■□□□□ 0.87
RFXAP-201ENST00000255476 SLC39A3Q9BRY0 314 aa20.45■□□□□ 0.87
RFXAP-201ENST00000255476 ACAT2Q9BWD1 397 aa20.45■□□□□ 0.87
RFXAP-201ENST00000255476 PRDM8Q9NQV8 689 aa20.45■□□□□ 0.87
RFXAP-201ENST00000255476 IMP3Q9NV31 184 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.87
RFXAP-201ENST00000255476 OR52A4PA6NMU1 304 aa20.45■□□□□ 0.86
RFXAP-201ENST00000255476 IGHV4-34P06331 123 aa20.45■□□□□ 0.86
RFXAP-201ENST00000255476 KELP23276 732 aa20.45■□□□□ 0.86
RFXAP-201ENST00000255476 MSX2P35548 267 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.86
RFXAP-201ENST00000255476 C1orf146Q5VVC0 180 aa20.45■□□□□ 0.86
RFXAP-201ENST00000255476 SLCO4C1Q6ZQN7 724 aa20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 133 ms