RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000236273.8

SYF2-201, Transcript of SYF2 pre-mRNA splicing factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SYF2, Length 1,345 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2-201ENST00000236273 LRRC69Q6ZNQ3 347 aa21.45■■□□□ 1.02
SYF2-201ENST00000236273 NKAPQ8N5F7 415 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
SYF2-201ENST00000236273 OR2L3Q8NG85 312 aa21.45■■□□□ 1.02
SYF2-201ENST00000236273 MCOLN3Q8TDD5 553 aa21.45■■□□□ 1.02
SYF2-201ENST00000236273 ANKRD7Q92527 254 aa21.45■■□□□ 1.02
SYF2-201ENST00000236273 CRELD1Q96HD1 420 aa21.45■■□□□ 1.02
SYF2-201ENST00000236273 CCDC138Q96M89 665 aa21.45■■□□□ 1.02
SYF2-201ENST00000236273 CYTH2Q99418 400 aa21.45■■□□□ 1.02
SYF2-201ENST00000236273 SYTL2Q9HCH5 934 aa21.45■■□□□ 1.02
SYF2-201ENST00000236273 GPAMQ9HCL2 828 aa21.45■■□□□ 1.02
SYF2-201ENST00000236273 STOX2Q9P2F5 926 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
SYF2-201ENST00000236273 HEATR5BQ9P2D3 2071 aa21.45■■□□□ 1.02
SYF2-201ENST00000236273 SEC16AO15027 2179 aa21.44■■□□□ 1.02
SYF2-201ENST00000236273 IGKV1-8A0A0C4DH67 115 aa21.44■■□□□ 1.02
SYF2-201ENST00000236273 PHGDHO43175 533 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
SYF2-201ENST00000236273 NRP2O60462 931 aa21.44■■□□□ 1.02
SYF2-201ENST00000236273 CYP2A7P20853 494 aa21.44■■□□□ 1.02
SYF2-201ENST00000236273 SLMAPQ14BN4 828 aa21.44■■□□□ 1.02
SYF2-201ENST00000236273 FIGLAQ6QHK4 219 aa21.44■■□□□ 1.02
SYF2-201ENST00000236273 C19orf48Q6RUI8 117 aa21.44■■□□□ 1.02
SYF2-201ENST00000236273 SLC38A9Q8NBW4 561 aa21.44■■□□□ 1.02
SYF2-201ENST00000236273 UBXN10Q96LJ8 280 aa21.44■■□□□ 1.02
SYF2-201ENST00000236273 MIPEPQ99797 713 aa21.44■■□□□ 1.02
SYF2-201ENST00000236273 ANKZF1Q9H8Y5 726 aa21.44■■□□□ 1.02
SYF2-201ENST00000236273 TMEM150CB9EJG8 249 aa21.43■■□□□ 1.02
SYF2-201ENST00000236273 RAD1O60671 282 aa21.43■■□□□ 1.02
SYF2-201ENST00000236273 KIAA0754O94854 1291 aa21.43■■□□□ 1.02
SYF2-201ENST00000236273 FKBP9O95302 570 aa21.43■■□□□ 1.02
SYF2-201ENST00000236273 PHBP35232 272 aa21.43■■□□□ 1.02
SYF2-201ENST00000236273 DEFB110Q30KQ9 67 aa21.43■■□□□ 1.02
SYF2-201ENST00000236273 GSPT2Q8IYD1 628 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
SYF2-201ENST00000236273 SPATA6LQ8N4H0 392 aa21.43■■□□□ 1.02
SYF2-201ENST00000236273 EIF1ADQ8N9N8 165 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
SYF2-201ENST00000236273 OR8K5Q8NH50 307 aa21.43■■□□□ 1.02
SYF2-201ENST00000236273 ZUFSPQ96AP4 578 aa21.43■■□□□ 1.02
SYF2-201ENST00000236273 MRRFQ96E11 262 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
SYF2-201ENST00000236273 ACAT2Q9BWD1 397 aa21.43■■□□□ 1.02
SYF2-201ENST00000236273 ULBP3Q9BZM4 244 aa21.43■■□□□ 1.02
SYF2-201ENST00000236273 EPB41L4BQ9H329 900 aa21.43■■□□□ 1.02
SYF2-201ENST00000236273 AKIRIN1Q9H9L7 192 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
SYF2-201ENST00000236273 SLC6A20Q9NP91 592 aa21.43■■□□□ 1.02
SYF2-201ENST00000236273 CAMSAP3Q9P1Y5 1249 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
SYF2-201ENST00000236273 NOVA2Q9UNW9 492 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
SYF2-201ENST00000236273 MGAQ8IWI9 3026 aa21.43■■□□□ 1.02
SYF2-201ENST00000236273 TARM1B6A8C7 271 aa21.42■■□□□ 1.02
SYF2-201ENST00000236273 STMN1P16949 149 aa21.42■■□□□ 1.02
SYF2-201ENST00000236273 WT1P19544 449 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
SYF2-201ENST00000236273 RAB10P61026 200 aa21.42■■□□□ 1.02
SYF2-201ENST00000236273 PRDX1Q06830 199 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
SYF2-201ENST00000236273 MAP7Q14244 749 aa21.42■■□□□ 1.02
SYF2-201ENST00000236273 CYB5D1Q6P9G0 228 aa21.42■■□□□ 1.02
SYF2-201ENST00000236273 CMC1Q7Z7K0 106 aa21.42■■□□□ 1.02
SYF2-201ENST00000236273 SYTL1Q8IYJ3 562 aa21.42■■□□□ 1.02
SYF2-201ENST00000236273 NLGN4XQ8N0W4 816 aa21.42■■□□□ 1.02
SYF2-201ENST00000236273 NLGN4YQ8NFZ3 816 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
SYF2-201ENST00000236273 UHMK1Q8TAS1 419 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
SYF2-201ENST00000236273 SLC44A1Q8WWI5 657 aa21.42■■□□□ 1.02
SYF2-201ENST00000236273 TSPAN17Q96FV3 270 aa21.42■■□□□ 1.02
SYF2-201ENST00000236273 UNKQ9C0B0 810 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
SYF2-201ENST00000236273 DERL2Q9GZP9 239 aa21.42■■□□□ 1.02
SYF2-201ENST00000236273 SPRTNQ9H040 489 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
SYF2-201ENST00000236273 NBEAQ8NFP9 2946 aa21.42■■□□□ 1.02
SYF2-201ENST00000236273 NPEPPSL1A6NEC2 478 aa21.41■■□□□ 1.02
SYF2-201ENST00000236273 CTSVO60911 334 aa21.41■■□□□ 1.02
SYF2-201ENST00000236273 NTRK1P04629 796 aa21.41■■□□□ 1.02
SYF2-201ENST00000236273 SLC35E2BP0CK96 405 aa21.41■■□□□ 1.02
SYF2-201ENST00000236273 SLC12A2P55011 1212 aa21.41■■□□□ 1.02
SYF2-201ENST00000236273 DLG1Q12959 904 aa21.41■■□□□ 1.02
SYF2-201ENST00000236273 BMPR2Q13873 1038 aa21.41■■□□□ 1.02
SYF2-201ENST00000236273 COL28A1Q2UY09 1125 aa21.41■■□□□ 1.02
SYF2-201ENST00000236273 FBXO42Q6P3S6 717 aa21.41■■□□□ 1.02
SYF2-201ENST00000236273 AGTRAPQ6RW13 159 aa21.41■■□□□ 1.02
SYF2-201ENST00000236273 VASH2Q86V25 355 aa21.41■■□□□ 1.02
SYF2-201ENST00000236273 CACNA2D3Q8IZS8 1091 aa21.41■■□□□ 1.02
SYF2-201ENST00000236273 GALNT6Q8NCL4 622 aa21.41■■□□□ 1.02
SYF2-201ENST00000236273 ATG10Q9H0Y0 220 aa21.41■■□□□ 1.02
SYF2-201ENST00000236273 SYNPO2LQ9H987 977 aa21.41■■□□□ 1.02
SYF2-201ENST00000236273 TAC3Q9UHF0 121 aa21.41■■□□□ 1.02
SYF2-201ENST00000236273 LOC101059948A0A1B0GTJ6 334 aa21.4■■□□□ 1.02
SYF2-201ENST00000236273 OR2A25A4D2G3 310 aa21.4■■□□□ 1.02
SYF2-201ENST00000236273 ZNF839A8K0R7 811 aa21.4■■□□□ 1.02
SYF2-201ENST00000236273 ENO2P09104 434 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
SYF2-201ENST00000236273 CCDC166P0CW27 439 aa21.4■■□□□ 1.02
SYF2-201ENST00000236273 CD1DP15813 335 aa21.4■■□□□ 1.02
SYF2-201ENST00000236273 TNFRSF8P28908 595 aa21.4■■□□□ 1.02
SYF2-201ENST00000236273 RPA3P35244 121 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
SYF2-201ENST00000236273 AP1S2P56377 157 aa21.4■■□□□ 1.02
SYF2-201ENST00000236273 TSNQ15631 228 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
SYF2-201ENST00000236273 MROH9Q5TGP6 573 aa21.4■■□□□ 1.02
SYF2-201ENST00000236273 ICE2Q659A1 982 aa21.4■■□□□ 1.02
SYF2-201ENST00000236273 ZNF425Q6IV72 752 aa21.4■■□□□ 1.02
SYF2-201ENST00000236273 C6orf15Q6UXA7 325 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
SYF2-201ENST00000236273 TRMT10CQ7L0Y3 403 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
SYF2-201ENST00000236273 MCATQ8IVS2 390 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
SYF2-201ENST00000236273 ZNF285Q96NJ3 590 aa21.4■■□□□ 1.02
SYF2-201ENST00000236273 CCNL2Q96S94 520 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
SYF2-201ENST00000236273 DPH7Q9BTV6 452 aa21.4■■□□□ 1.02
SYF2-201ENST00000236273 SGPP1Q9BX95 441 aa21.4■■□□□ 1.02
SYF2-201ENST00000236273 ENAMQ9NRM1 1142 aa21.4■■□□□ 1.02
SYF2-201ENST00000236273 EURLQ9NYK6 297 aa21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.7 ms