RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000609366.5

LINC00635-221, long intergenic non-protein coding RNA 635, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene LINC00635, Length 784 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00635-221ENST00000609366 MAPK9P45984 424 aa7.57□□□□□ -1.2
LINC00635-221ENST00000609366 CSNK1EP49674 416 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
LINC00635-221ENST00000609366 ATP1A2P50993 1020 aa7.57□□□□□ -1.2
LINC00635-221ENST00000609366 C21orf59P57076 290 aa7.57□□□□□ -1.2
LINC00635-221ENST00000609366 OR4D1Q15615 310 aa7.57□□□□□ -1.2
LINC00635-221ENST00000609366 TSNQ15631 228 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
LINC00635-221ENST00000609366 PPP1R3AQ16821 1122 aa7.57□□□□□ -1.2
LINC00635-221ENST00000609366 SBSNQ6UWP8 590 aa7.57□□□□□ -1.2
LINC00635-221ENST00000609366 ZYG11AQ6WRX3 759 aa7.57□□□□□ -1.2
LINC00635-221ENST00000609366 LRRC69Q6ZNQ3 347 aa7.57□□□□□ -1.2
LINC00635-221ENST00000609366 STAG3L4Q8TBR4 150 aa7.57□□□□□ -1.2
LINC00635-221ENST00000609366 RDH11Q8TC12 318 aa7.57□□□□□ -1.2
LINC00635-221ENST00000609366 SETD7Q8WTS6 366 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
LINC00635-221ENST00000609366 SCYL1Q96KG9 808 aa7.57□□□□□ -1.2
LINC00635-221ENST00000609366 ATOH8Q96SQ7 321 aa7.57□□□□□ -1.2
LINC00635-221ENST00000609366 GSDMCQ9BYG8 508 aa7.57□□□□□ -1.2
LINC00635-221ENST00000609366 ZDHHC5Q9C0B5 715 aa7.57□□□□□ -1.2
LINC00635-221ENST00000609366 TMEM168Q9H0V1 697 aa7.57□□□□□ -1.2
LINC00635-221ENST00000609366 MRPL46Q9H2W6 279 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
LINC00635-221ENST00000609366 TCEAL2Q9H3H9 227 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
LINC00635-221ENST00000609366 OSGEPL1Q9H4B0 414 aa7.57□□□□□ -1.2
LINC00635-221ENST00000609366 ALG9Q9H6U8 611 aa7.57□□□□□ -1.2
LINC00635-221ENST00000609366 ERVMER34-1Q9H9K5 563 aa7.57□□□□□ -1.2
LINC00635-221ENST00000609366 KLC4Q9NSK0 619 aa7.57□□□□□ -1.2
LINC00635-221ENST00000609366 COPG2Q9UBF2 871 aa7.57□□□□□ -1.2
LINC00635-221ENST00000609366 APOBEC3BQ9UH17 382 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
LINC00635-221ENST00000609366 ACSL5Q9ULC5 683 aa7.57□□□□□ -1.2
LINC00635-221ENST00000609366 PLEKHM1Q9Y4G2 1056 aa7.57□□□□□ -1.2
LINC00635-221ENST00000609366 TMEM131Q92545 1883 aa7.57□□□□□ -1.2
LINC00635-221ENST00000609366 A0A1B0GVT2 93 aa7.56□□□□□ -1.2
LINC00635-221ENST00000609366 A6NCN8 305 aa7.56□□□□□ -1.2
LINC00635-221ENST00000609366 SYCE1LA8MT33 242 aa7.56□□□□□ -1.2
LINC00635-221ENST00000609366 B8ZZF3 427 aa7.56□□□□□ -1.2
LINC00635-221ENST00000609366 G3V2L1 256 aa7.56□□□□□ -1.2
LINC00635-221ENST00000609366 GFYI3L273 518 aa7.56□□□□□ -1.2
LINC00635-221ENST00000609366 IFRD1O00458 451 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
LINC00635-221ENST00000609366 RRP8O43159 456 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
LINC00635-221ENST00000609366 EFSO43281 561 aa7.56□□□□□ -1.2
LINC00635-221ENST00000609366 KLK8O60259 260 aa7.56□□□□□ -1.2
LINC00635-221ENST00000609366 ENO2P09104 434 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
LINC00635-221ENST00000609366 SLC35G4P0C7Q5 338 aa7.56□□□□□ -1.2
LINC00635-221ENST00000609366 ZNF883P0CG24 379 aa7.56□□□□□ -1.2
LINC00635-221ENST00000609366 MTHFD2P13995 350 aa7.56□□□□□ -1.2
LINC00635-221ENST00000609366 IDSP22304 550 aa7.56□□□□□ -1.2
LINC00635-221ENST00000609366 AK4P27144 223 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
LINC00635-221ENST00000609366 ACTR1BP42025 376 aa7.56□□□□□ -1.2
LINC00635-221ENST00000609366 CTSKP43235 329 aa7.56□□□□□ -1.2
LINC00635-221ENST00000609366 KCNC1P48547 511 aa7.56□□□□□ -1.2
LINC00635-221ENST00000609366 SERPINB4P48594 390 aa7.56□□□□□ -1.2
LINC00635-221ENST00000609366 ACTR1AP61163 376 aa7.56□□□□□ -1.2
LINC00635-221ENST00000609366 NFKB2Q00653 900 aa7.56□□□□□ -1.2
LINC00635-221ENST00000609366 BNC1Q01954 994 aa7.56□□□□□ -1.2
LINC00635-221ENST00000609366 ILF3Q12906 894 aaKnown RBP eCLIP7.56□□□□□ -1.2
LINC00635-221ENST00000609366 PCLAFQ15004 111 aa7.56□□□□□ -1.2
LINC00635-221ENST00000609366 TGFBIQ15582 683 aa7.56□□□□□ -1.2
LINC00635-221ENST00000609366 SEPT7Q16181 437 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
LINC00635-221ENST00000609366 PHKG1Q16816 387 aa7.56□□□□□ -1.2
LINC00635-221ENST00000609366 EEF1AKMT2Q5JPI9 291 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
LINC00635-221ENST00000609366 SAMD5Q5TGI4 173 aa7.56□□□□□ -1.2
LINC00635-221ENST00000609366 CAPRIN2Q6IMN6 1127 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
LINC00635-221ENST00000609366 UNC5DQ6UXZ4 953 aa7.56□□□□□ -1.2
LINC00635-221ENST00000609366 WASH2PQ6VEQ5 465 aa7.56□□□□□ -1.2
LINC00635-221ENST00000609366 RD3Q7Z3Z2 195 aa7.56□□□□□ -1.2
LINC00635-221ENST00000609366 NRROSQ86YC3 692 aa7.56□□□□□ -1.2
LINC00635-221ENST00000609366 FBXO15Q8NCQ5 510 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
LINC00635-221ENST00000609366 CCL4L1Q8NHW4 92 aa7.56□□□□□ -1.2
LINC00635-221ENST00000609366 MGARPQ8TDB4 240 aa7.56□□□□□ -1.2
LINC00635-221ENST00000609366 GPBAR1Q8TDU6 330 aa7.56□□□□□ -1.2
LINC00635-221ENST00000609366 SKA2Q8WVK7 121 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
LINC00635-221ENST00000609366 ASB11Q8WXH4 323 aa7.56□□□□□ -1.2
LINC00635-221ENST00000609366 DLG3Q92796 817 aa7.56□□□□□ -1.2
LINC00635-221ENST00000609366 NXPE2Q96DL1 559 aa7.56□□□□□ -1.2
LINC00635-221ENST00000609366 RMDN2Q96LZ7 410 aa7.56□□□□□ -1.2
LINC00635-221ENST00000609366 FOPNLQ96NB1 174 aa7.56□□□□□ -1.2
LINC00635-221ENST00000609366 CDC6Q99741 560 aa7.56□□□□□ -1.2
LINC00635-221ENST00000609366 LRRC61Q9BV99 259 aa7.56□□□□□ -1.2
LINC00635-221ENST00000609366 SLC12A9Q9BXP2 914 aa7.56□□□□□ -1.2
LINC00635-221ENST00000609366 CAAP1Q9H8G2 361 aa7.56□□□□□ -1.2
LINC00635-221ENST00000609366 IL21RQ9HBE5 538 aa7.56□□□□□ -1.2
LINC00635-221ENST00000609366 RDH14Q9HBH5 336 aa7.56□□□□□ -1.2
LINC00635-221ENST00000609366 MLXIPLQ9NP71 852 aa7.56□□□□□ -1.2
LINC00635-221ENST00000609366 WASH6PQ9NQA3 447 aa7.56□□□□□ -1.2
LINC00635-221ENST00000609366 INTS9Q9NV88 658 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
LINC00635-221ENST00000609366 DNAJC28Q9NX36 388 aa7.56□□□□□ -1.2
LINC00635-221ENST00000609366 NUDT4Q9NZJ9 180 aa7.56□□□□□ -1.2
LINC00635-221ENST00000609366 CPSF2Q9P2I0 782 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
LINC00635-221ENST00000609366 SPASTQ9UBP0 616 aa7.56□□□□□ -1.2
LINC00635-221ENST00000609366 ADAMTS6Q9UKP5 1117 aa7.56□□□□□ -1.2
LINC00635-221ENST00000609366 RNF112Q9ULX5 631 aa7.56□□□□□ -1.2
LINC00635-221ENST00000609366 WDR37Q9Y2I8 494 aa7.56□□□□□ -1.2
LINC00635-221ENST00000609366 OARD1Q9Y530 152 aa7.56□□□□□ -1.2
LINC00635-221ENST00000609366 COL5A1P20908 1838 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
LINC00635-221ENST00000609366 GOLGA4Q13439 2230 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
LINC00635-221ENST00000609366 NEMP2A6NFY4 417 aa7.55□□□□□ -1.2
LINC00635-221ENST00000609366 PDZK1P1A8MUH7 402 aa7.55□□□□□ -1.2
LINC00635-221ENST00000609366 ARHGEF33A8MVX0 844 aa7.55□□□□□ -1.2
LINC00635-221ENST00000609366 SUPT3HB4E1H0 165 aa7.55□□□□□ -1.2
LINC00635-221ENST00000609366 STX16-NPEPL1H3BU86 382 aa7.55□□□□□ -1.2
LINC00635-221ENST00000609366 UBXN8O00124 270 aa7.55□□□□□ -1.2
LINC00635-221ENST00000609366 STX16O14662 325 aa7.55□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.2 ms