RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590061.1

SMAD4-210, Transcript of SMAD family member 4, humanhuman

TSL 4

Gene SMAD4, Length 544 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4-210ENST00000590061 SUPT3HO75486 399 aa7.13□□□□□ -1.27
SMAD4-210ENST00000590061 CER1O95813 267 aa7.13□□□□□ -1.27
SMAD4-210ENST00000590061 TSPAN12O95859 305 aa7.13□□□□□ -1.27
SMAD4-210ENST00000590061 OTCP00480 354 aa7.13□□□□□ -1.27
SMAD4-210ENST00000590061 CSF2P04141 144 aa7.13□□□□□ -1.27
SMAD4-210ENST00000590061 VIMP08670 466 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
SMAD4-210ENST00000590061 TDGF1P13385 188 aa7.13□□□□□ -1.27
SMAD4-210ENST00000590061 ACP5P13686 325 aa7.13□□□□□ -1.27
SMAD4-210ENST00000590061 NME1P15531 152 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
SMAD4-210ENST00000590061 CXCR2P25025 360 aa7.13□□□□□ -1.27
SMAD4-210ENST00000590061 GGT5P36269 586 aa7.13□□□□□ -1.27
SMAD4-210ENST00000590061 GNPDA1P46926 289 aa7.13□□□□□ -1.27
SMAD4-210ENST00000590061 RXRGP48443 463 aa7.13□□□□□ -1.27
SMAD4-210ENST00000590061 DHPSP49366 369 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
SMAD4-210ENST00000590061 CTSCP53634 463 aa7.13□□□□□ -1.27
SMAD4-210ENST00000590061 PNLIPRP1P54315 467 aa7.13□□□□□ -1.27
SMAD4-210ENST00000590061 PKNOX1P55347 436 aa7.13□□□□□ -1.27
SMAD4-210ENST00000590061 NXPH1P58417 271 aa7.13□□□□□ -1.27
SMAD4-210ENST00000590061 PRKAA1Q13131 559 aa7.13□□□□□ -1.27
SMAD4-210ENST00000590061 SIM2Q14190 667 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
SMAD4-210ENST00000590061 TGFBIQ15582 683 aa7.13□□□□□ -1.27
SMAD4-210ENST00000590061 ACSBG2Q5FVE4 666 aa7.13□□□□□ -1.27
SMAD4-210ENST00000590061 UBAP2Q5T6F2 1119 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
SMAD4-210ENST00000590061 CRTC3Q6UUV7 619 aa7.13□□□□□ -1.27
SMAD4-210ENST00000590061 CHST15Q7LFX5 561 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
SMAD4-210ENST00000590061 LRRC70Q7Z2Q7 622 aa7.13□□□□□ -1.27
SMAD4-210ENST00000590061 SLC9B2Q86UD5 537 aa7.13□□□□□ -1.27
SMAD4-210ENST00000590061 HID1Q8IV36 788 aa7.13□□□□□ -1.27
SMAD4-210ENST00000590061 TRIM48Q8IWZ4 208 aa7.13□□□□□ -1.27
SMAD4-210ENST00000590061 GALNT12Q8IXK2 581 aa7.13□□□□□ -1.27
SMAD4-210ENST00000590061 ZBTB44Q8NCP5 570 aa7.13□□□□□ -1.27
SMAD4-210ENST00000590061 OR5K2Q8NHB8 316 aa7.13□□□□□ -1.27
SMAD4-210ENST00000590061 GPBAR1Q8TDU6 330 aa7.13□□□□□ -1.27
SMAD4-210ENST00000590061 UBTD2Q8WUN7 234 aa7.13□□□□□ -1.27
SMAD4-210ENST00000590061 STON2Q8WXE9 905 aa7.13□□□□□ -1.27
SMAD4-210ENST00000590061 RLN3Q8WXF3 142 aa7.13□□□□□ -1.27
SMAD4-210ENST00000590061 CCT6BQ92526 530 aa7.13□□□□□ -1.27
SMAD4-210ENST00000590061 UBE2E3Q969T4 207 aa7.13□□□□□ -1.27
SMAD4-210ENST00000590061 FBXL8Q96CD0 374 aa7.13□□□□□ -1.27
SMAD4-210ENST00000590061 REPS1Q96D71 796 aa7.13□□□□□ -1.27
SMAD4-210ENST00000590061 CXorf40BQ96DE9 158 aa7.13□□□□□ -1.27
SMAD4-210ENST00000590061 ERLEC1Q96DZ1 483 aa7.13□□□□□ -1.27
SMAD4-210ENST00000590061 L3HYPDHQ96EM0 354 aa7.13□□□□□ -1.27
SMAD4-210ENST00000590061 CHMP6Q96FZ7 201 aa7.13□□□□□ -1.27
SMAD4-210ENST00000590061 SEC16BQ96JE7 1060 aa7.13□□□□□ -1.27
SMAD4-210ENST00000590061 C7orf26Q96N11 449 aa7.13□□□□□ -1.27
SMAD4-210ENST00000590061 HAUS8Q9BT25 410 aa7.13□□□□□ -1.27
SMAD4-210ENST00000590061 C1QTNF3Q9BXJ4 246 aa7.13□□□□□ -1.27
SMAD4-210ENST00000590061 PITPNM3Q9BZ71 974 aa7.13□□□□□ -1.27
SMAD4-210ENST00000590061 DRC3Q9H069 523 aa7.13□□□□□ -1.27
SMAD4-210ENST00000590061 SOX17Q9H6I2 414 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
SMAD4-210ENST00000590061 UCK1Q9HA47 277 aa7.13□□□□□ -1.27
SMAD4-210ENST00000590061 TM9SF3Q9HD45 589 aa7.13□□□□□ -1.27
SMAD4-210ENST00000590061 KLC4Q9NSK0 619 aa7.13□□□□□ -1.27
SMAD4-210ENST00000590061 POT1Q9NUX5 634 aa7.13□□□□□ -1.27
SMAD4-210ENST00000590061 GEMIN8Q9NWZ8 242 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
SMAD4-210ENST00000590061 GPRC5BQ9NZH0 403 aa7.13□□□□□ -1.27
SMAD4-210ENST00000590061 OR6C2Q9NZP2 312 aa7.13□□□□□ -1.27
SMAD4-210ENST00000590061 TMEM216Q9P0N5 145 aa7.13□□□□□ -1.27
SMAD4-210ENST00000590061 SLC17A6Q9P2U8 582 aa7.13□□□□□ -1.27
SMAD4-210ENST00000590061 XPR1Q9UBH6 696 aa7.13□□□□□ -1.27
SMAD4-210ENST00000590061 MBD1Q9UIS9 605 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
SMAD4-210ENST00000590061 APOBEC2Q9Y235 224 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
SMAD4-210ENST00000590061 ASF1AQ9Y294 204 aa7.13□□□□□ -1.27
SMAD4-210ENST00000590061 MED16Q9Y2X0 877 aa7.13□□□□□ -1.27
SMAD4-210ENST00000590061 TMEM98Q9Y2Y6 226 aa7.13□□□□□ -1.27
SMAD4-210ENST00000590061 ENTPD2Q9Y5L3 495 aa7.13□□□□□ -1.27
SMAD4-210ENST00000590061 THADAQ6YHU6 1953 aa7.13□□□□□ -1.27
SMAD4-210ENST00000590061 GOLGA4Q13439 2230 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
SMAD4-210ENST00000590061 SDK1Q7Z5N4 2213 aa7.12□□□□□ -1.27
SMAD4-210ENST00000590061 PLXNB3Q9ULL4 1909 aa7.12□□□□□ -1.27
SMAD4-210ENST00000590061 MSANTD3-TMEFF1A0A0A6YYJ0 341 aa7.12□□□□□ -1.27
SMAD4-210ENST00000590061 A0A1W2PR77 199 aa7.12□□□□□ -1.27
SMAD4-210ENST00000590061 TMEM202A6NGA9 273 aa7.12□□□□□ -1.27
SMAD4-210ENST00000590061 TRPC5OSA6NMA1 111 aa7.12□□□□□ -1.27
SMAD4-210ENST00000590061 IQCF5A8MTL0 148 aa7.12□□□□□ -1.27
SMAD4-210ENST00000590061 TARM1B6A8C7 271 aa7.12□□□□□ -1.27
SMAD4-210ENST00000590061 LMO7DNF2Z398 122 aa7.12□□□□□ -1.27
SMAD4-210ENST00000590061 MYO1CO00159 1063 aa7.12□□□□□ -1.27
SMAD4-210ENST00000590061 SGTAO43765 313 aa7.12□□□□□ -1.27
SMAD4-210ENST00000590061 SHOX2O60902 331 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
SMAD4-210ENST00000590061 MTX2O75431 263 aa7.12□□□□□ -1.27
SMAD4-210ENST00000590061 CRCPO75575 148 aa7.12□□□□□ -1.27
SMAD4-210ENST00000590061 STK16O75716 305 aa7.12□□□□□ -1.27
SMAD4-210ENST00000590061 HSPA4LO95757 839 aa7.12□□□□□ -1.27
SMAD4-210ENST00000590061 ENO1P06733 434 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
SMAD4-210ENST00000590061 ANXA6P08133 673 aa7.12□□□□□ -1.27
SMAD4-210ENST00000590061 SP9P0CG40 484 aa7.12□□□□□ -1.27
SMAD4-210ENST00000590061 PRSS56P0CW18 603 aa7.12□□□□□ -1.27
SMAD4-210ENST00000590061 ESRRAP11474 423 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
SMAD4-210ENST00000590061 F3P13726 295 aa7.12□□□□□ -1.27
SMAD4-210ENST00000590061 ITGB6P18564 788 aa7.12□□□□□ -1.27
SMAD4-210ENST00000590061 XRCC1P18887 633 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
SMAD4-210ENST00000590061 GSTM2P28161 218 aa7.12□□□□□ -1.27
SMAD4-210ENST00000590061 SERPINB1P30740 379 aa7.12□□□□□ -1.27
SMAD4-210ENST00000590061 LSP1P33241 339 aa7.12□□□□□ -1.27
SMAD4-210ENST00000590061 SHMT2P34897 504 aa7.12□□□□□ -1.27
SMAD4-210ENST00000590061 ABCG1P45844 678 aa7.12□□□□□ -1.27
SMAD4-210ENST00000590061 PREPP48147 710 aa7.12□□□□□ -1.27
SMAD4-210ENST00000590061 CLDN2P57739 230 aa7.12□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.5 ms