RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587718.5

CAPNS1-204, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,558 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-204ENST00000587718 OR2T34Q8NGX1 318 aa24.8■■□□□ 1.56
CAPNS1-204ENST00000587718 METTL6Q8TCB7 284 aa24.8■■□□□ 1.56
CAPNS1-204ENST00000587718 SLC29A3Q9BZD2 475 aa24.8■■□□□ 1.56
CAPNS1-204ENST00000587718 CD244Q9BZW8 370 aa24.8■■□□□ 1.56
CAPNS1-204ENST00000587718 ASIC5Q9NY37 505 aa24.8■■□□□ 1.56
CAPNS1-204ENST00000587718 WASF3Q9UPY6 502 aa24.8■■□□□ 1.56
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CAPNS1-204ENST00000587718 ATXN3P54252 364 aaPredicted RBP24.76■■□□□ 1.55
CAPNS1-204ENST00000587718 DIO3P55073 304 aa24.76■■□□□ 1.55
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CAPNS1-204ENST00000587718 FOLH1Q04609 750 aa24.76■■□□□ 1.55
CAPNS1-204ENST00000587718 FXNQ16595 210 aa24.76■■□□□ 1.55
CAPNS1-204ENST00000587718 GDPD4Q6W3E5 623 aa24.76■■□□□ 1.55
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