RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556288.5

ATXN3-238, Transcript of ataxin 3, human

TSL 1 (best)

Gene ATXN3, Length 901 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATXN3-238	ENST00000556288	LDAH	Q9H6V9	325 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	WDR26	Q9H7D7	661 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	ERVMER34-1	Q9H9K5	563 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	KCTD5	Q9NXV2	234 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	SPAST	Q9UBP0	616 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	APOBEC3B	Q9UH17	382 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	TUBD1	Q9UJT1	453 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	GPR34	Q9UPC5	381 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	AAR2	Q9Y312	384 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	PKP3	Q9Y446	797 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	ZNF711	Q9Y462	761 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	JRKL	Q9Y4A0	524 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	PIEZO1	Q92508	2521 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	MED19	A0JLT2	244 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	CFAP69	A5D8W1	941 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	FAM149A	A5PLN7	773 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	C5orf60	A6NFR6	353 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	TMEM202	A6NGA9	273 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	CAPN8	A6NHC0	703 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	C2orf81	A6NN90	581 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	USP27X	A6NNY8	438 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	FAM171A2	A8MVW0	826 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288		B4DGG1	531 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	ZNF185	O15231	689 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	YY2	O15391	372 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	YKT6	O15498	198 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	TNFSF14	O43557	240 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	LIAS	O43766	372 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	UGT1A9	O60656	530 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	GCAT	O75600	419 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	PIAS2	O75928	621 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	METTL18	O95568	372 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	TOP3B	O95985	862 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	CSF2	P04141	144 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	FTH1P19	P0C7X4	201 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	ZSCAN5DP	P0CG00	497 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	ZNF883	P0CG24	379 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	JUP	P14923	745 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	TSHR	P16473	764 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	ZNF30	P17039	623 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	UGT1A6	P19224	532 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	HK1	P19367	917 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	CSRP1	P21291	193 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	LPO	P22079	712 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	UGT1A1	P22309	533 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	UGT1A4	P22310	534 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	LHCGR	P22888	699 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	CASQ1	P31415	396 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	STIP1	P31948	543 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	UGT1A3	P35503	534 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	UGT1A5	P35504	534 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	SPINT3	P49223	89 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	DUSP3	P51452	185 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	NEK2	P51955	445 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	HK3	P52790	923 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	RPL26	P61254	145 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	BASP1	P80723	227 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	GTF2H3	Q13889	308 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	NFATC4	Q14934	902 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	ELOC	Q15369	112 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	SHB	Q15464	509 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	SLC1A5	Q15758	541 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	PARP6	Q2NL67	630 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	NRN1L	Q496H8	165 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	ZRANB3	Q5FWF4	1079 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	SPDYA	Q5MJ70	313 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	TPRG1L	Q5T0D9	272 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	SLC30A9	Q6PML9	568 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	KDELC1	Q6UW63	502 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	FAM151B	Q6UXP7	276 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	KYAT3	Q6YP21	454 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288		Q6ZRM9	215 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	CHST15	Q7LFX5	561 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	GVINP1	Q7Z2Y8	2422 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	GLT6D1	Q7Z4J2	308 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	TECPR1	Q7Z6L1	1165 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	PARG	Q86W56	976 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	GKN2	Q86XP6	184 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	MARCH9	Q86YJ5	346 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	NRSN1	Q8IZ57	195 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	SLC22A18AS	Q8N1D0	253 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	PELI3	Q8N2H9	469 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	SLC25A45	Q8N413	288 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	GPR26	Q8NDV2	337 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	DENND6B	Q8NEG7	585 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	OR56A4	Q8NGH8	313 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	SAP25	Q8TEE9	199 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	OR1E3	Q8WZA6	343 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	HOXB13	Q92826	284 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	EXTL1	Q92935	676 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	FAM131C	Q96AQ9	280 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	VOPP1	Q96AW1	172 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	TRIM44	Q96DX7	344 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	DTD2	Q96FN9	168 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	OXNAD1	Q96HP4	312 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	APOLD1	Q96LR9	279 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	SPATA13	Q96N96	652 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	TLR10	Q9BXR5	811 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	OR2AG1	Q9H205	316 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	GBA3	Q9H227	469 aa		4.59	□□□□□ -1.67

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