RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552222.5

CS-231, Transcript of citrate synthase, human

TSL 4

Gene CS, Length 555 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CS-231	ENST00000552222	ANKMY2	Q8IV38	441 aa		13.37	□□□□□ -0.27
CS-231	ENST00000552222	ZNF547	Q8IVP9	402 aa		13.37	□□□□□ -0.27
CS-231	ENST00000552222	ZBED8	Q8IZ13	594 aa		13.37	□□□□□ -0.27
CS-231	ENST00000552222	SIDT2	Q8NBJ9	832 aa	Known RBP	13.37	□□□□□ -0.27
CS-231	ENST00000552222	PYROXD1	Q8WU10	500 aa		13.37	□□□□□ -0.27
CS-231	ENST00000552222	DCUN1D1	Q96GG9	259 aa		13.37	□□□□□ -0.27
CS-231	ENST00000552222	FMO2	Q99518	471 aa		13.37	□□□□□ -0.27
CS-231	ENST00000552222	TTC1	Q99614	292 aa		13.37	□□□□□ -0.27
CS-231	ENST00000552222	MAP3K3	Q99759	626 aa		13.37	□□□□□ -0.27
CS-231	ENST00000552222	C20orf96	Q9NUD7	363 aa	Predicted RBP	13.37	□□□□□ -0.27
CS-231	ENST00000552222	IL1RAPL1	Q9NZN1	696 aa		13.37	□□□□□ -0.27
CS-231	ENST00000552222	COPG2	Q9UBF2	871 aa		13.37	□□□□□ -0.27
CS-231	ENST00000552222	TCFL5	Q9UL49	500 aa		13.37	□□□□□ -0.27
CS-231	ENST00000552222	PCDHGB7	Q9Y5F8	929 aa		13.37	□□□□□ -0.27
CS-231	ENST00000552222	PCDHGA10	Q9Y5H3	936 aa		13.37	□□□□□ -0.27
CS-231	ENST00000552222	POLE	Q07864	2286 aa		13.36	□□□□□ -0.27
CS-231	ENST00000552222	KIR2DS5	A0A0G2JLQ3	304 aa		13.36	□□□□□ -0.27
CS-231	ENST00000552222		A0A0G2JNG1	304 aa		13.36	□□□□□ -0.27
CS-231	ENST00000552222	CFAP99	D6REC4	459 aa		13.36	□□□□□ -0.27
CS-231	ENST00000552222	KIR2DS3	K7RE56	304 aa		13.36	□□□□□ -0.27
CS-231	ENST00000552222	SGTA	O43765	313 aa		13.36	□□□□□ -0.27
CS-231	ENST00000552222	ALOX12B	O75342	701 aa		13.36	□□□□□ -0.27
CS-231	ENST00000552222	SCRG1	O75711	98 aa		13.36	□□□□□ -0.27
CS-231	ENST00000552222	RALB	P11234	206 aa		13.36	□□□□□ -0.27
CS-231	ENST00000552222	ATP1B2	P14415	290 aa	Predicted RBP	13.36	□□□□□ -0.27
CS-231	ENST00000552222	OTX2	P32243	289 aa		13.36	□□□□□ -0.27
CS-231	ENST00000552222	PPARG	P37231	505 aa	Predicted RBP	13.36	□□□□□ -0.27
CS-231	ENST00000552222	CAPZB	P47756	277 aa		13.36	□□□□□ -0.27
CS-231	ENST00000552222	TTPA	P49638	278 aa		13.36	□□□□□ -0.27
CS-231	ENST00000552222	CTSC	P53634	463 aa		13.36	□□□□□ -0.27
CS-231	ENST00000552222	GTF2H3	Q13889	308 aa		13.36	□□□□□ -0.27
CS-231	ENST00000552222	FRG1	Q14331	258 aa	Known RBP	13.36	□□□□□ -0.27
CS-231	ENST00000552222	KIR2DS5	Q14953	304 aa		13.36	□□□□□ -0.27
CS-231	ENST00000552222	TYSND1	Q2T9J0	566 aa		13.36	□□□□□ -0.27
CS-231	ENST00000552222	PTCHD3	Q3KNS1	767 aa		13.36	□□□□□ -0.27
CS-231	ENST00000552222	PLEKHS1	Q5SXH7	462 aa		13.36	□□□□□ -0.27
CS-231	ENST00000552222	MRNIP	Q6NTE8	343 aa		13.36	□□□□□ -0.27
CS-231	ENST00000552222	C11orf96	Q7Z7L8	435 aa		13.36	□□□□□ -0.27
CS-231	ENST00000552222	LDB1	Q86U70	411 aa	Predicted RBP	13.36	□□□□□ -0.27
CS-231	ENST00000552222	LRRTM4	Q86VH4	590 aa		13.36	□□□□□ -0.27
CS-231	ENST00000552222	CCDC25	Q86WR0	208 aa		13.36	□□□□□ -0.27
CS-231	ENST00000552222	ST6GALNAC3	Q8NDV1	305 aa		13.36	□□□□□ -0.27
CS-231	ENST00000552222	GRHL3	Q8TE85	626 aa		13.36	□□□□□ -0.27
CS-231	ENST00000552222	CFAP36	Q96G28	342 aa		13.36	□□□□□ -0.27
CS-231	ENST00000552222	ZNF514	Q96K75	400 aa	Predicted RBP	13.36	□□□□□ -0.27
CS-231	ENST00000552222	TCF12	Q99081	682 aa		13.36	□□□□□ -0.27
CS-231	ENST00000552222	TRIM8	Q9BZR9	551 aa		13.36	□□□□□ -0.27
CS-231	ENST00000552222	TSPYL1	Q9H0U9	437 aa		13.36	□□□□□ -0.27
CS-231	ENST00000552222	ZNF552	Q9H707	407 aa	Predicted RBP	13.36	□□□□□ -0.27
CS-231	ENST00000552222	PDE7B	Q9NP56	450 aa		13.36	□□□□□ -0.27
CS-231	ENST00000552222	FGF21	Q9NSA1	209 aa		13.36	□□□□□ -0.27
CS-231	ENST00000552222	MTRF1L	Q9UGC7	380 aa	Known RBP	13.36	□□□□□ -0.27
CS-231	ENST00000552222	WDR37	Q9Y2I8	494 aa		13.36	□□□□□ -0.27
CS-231	ENST00000552222	KMO	O15229	486 aa		13.35	□□□□□ -0.27
CS-231	ENST00000552222	OR1I1	O60431	355 aa		13.35	□□□□□ -0.27
CS-231	ENST00000552222	XRCC1	P18887	633 aa	Predicted RBP	13.35	□□□□□ -0.27
CS-231	ENST00000552222	OGN	P20774	298 aa	Known RBP	13.35	□□□□□ -0.27
CS-231	ENST00000552222	NSG1	P42857	185 aa		13.35	□□□□□ -0.27
CS-231	ENST00000552222	MAGEA4	P43358	317 aa		13.35	□□□□□ -0.27
CS-231	ENST00000552222	ABR	Q12979	859 aa		13.35	□□□□□ -0.27
CS-231	ENST00000552222	THOC5	Q13769	683 aa	Known RBP	13.35	□□□□□ -0.27
CS-231	ENST00000552222	BCL7A	Q4VC05	210 aa		13.35	□□□□□ -0.27
CS-231	ENST00000552222	HSP90AA5P	Q58FG0	334 aa		13.35	□□□□□ -0.27
CS-231	ENST00000552222	TRMT10B	Q6PF06	316 aa	Known RBP	13.35	□□□□□ -0.27
CS-231	ENST00000552222	TMEM220	Q6QAJ8	160 aa		13.35	□□□□□ -0.27
CS-231	ENST00000552222	FAM198B	Q6UWH4	519 aa		13.35	□□□□□ -0.27
CS-231	ENST00000552222	CEP128	Q6ZU80	1094 aa		13.35	□□□□□ -0.27
CS-231	ENST00000552222	DET1	Q7L5Y6	550 aa		13.35	□□□□□ -0.27
CS-231	ENST00000552222	SDCCAG8	Q86SQ7	713 aa	Predicted RBP	13.35	□□□□□ -0.27
CS-231	ENST00000552222	CILP2	Q8IUL8	1156 aa		13.35	□□□□□ -0.27
CS-231	ENST00000552222	TRAPPC5	Q8IUR0	188 aa		13.35	□□□□□ -0.27
CS-231	ENST00000552222	RELL1	Q8IUW5	271 aa		13.35	□□□□□ -0.27
CS-231	ENST00000552222	TMEM126B	Q8IUX1	230 aa		13.35	□□□□□ -0.27
CS-231	ENST00000552222	TRIM48	Q8IWZ4	208 aa		13.35	□□□□□ -0.27
CS-231	ENST00000552222	LMNTD2	Q8IXW0	634 aa		13.35	□□□□□ -0.27
CS-231	ENST00000552222	CLDN19	Q8N6F1	224 aa		13.35	□□□□□ -0.27
CS-231	ENST00000552222	CALML6	Q8TD86	181 aa		13.35	□□□□□ -0.27
CS-231	ENST00000552222	NAT14	Q8WUY8	206 aa		13.35	□□□□□ -0.27
CS-231	ENST00000552222	CERS2	Q96G23	380 aa		13.35	□□□□□ -0.27
CS-231	ENST00000552222	SLC41A2	Q96JW4	573 aa		13.35	□□□□□ -0.27
CS-231	ENST00000552222	FAM167B	Q9BTA0	163 aa		13.35	□□□□□ -0.27
CS-231	ENST00000552222	ANKZF1	Q9H8Y5	726 aa		13.35	□□□□□ -0.27
CS-231	ENST00000552222	WASH6P	Q9NQA3	447 aa		13.35	□□□□□ -0.27
CS-231	ENST00000552222	MOCS1	Q9NZB8	636 aa		13.35	□□□□□ -0.27
CS-231	ENST00000552222	NFU1	Q9UMS0	254 aa		13.35	□□□□□ -0.27
CS-231	ENST00000552222	DNMT3A	Q9Y6K1	912 aa	Predicted RBP	13.35	□□□□□ -0.27
CS-231	ENST00000552222	PIKFYVE	Q9Y2I7	2098 aa		13.35	□□□□□ -0.27
CS-231	ENST00000552222	TACC2	O95359	2948 aa		13.34	□□□□□ -0.27
CS-231	ENST00000552222	OR2AG2	A6NM03	316 aa		13.34	□□□□□ -0.27
CS-231	ENST00000552222	PDZK1P1	A8MUH7	402 aa		13.34	□□□□□ -0.27
CS-231	ENST00000552222	C19orf84	I3L1E1	186 aa		13.34	□□□□□ -0.27
CS-231	ENST00000552222	TOX3	O15405	576 aa	Predicted RBP	13.34	□□□□□ -0.27
CS-231	ENST00000552222	PRICKLE3	O43900	615 aa	Predicted RBP	13.34	□□□□□ -0.27
CS-231	ENST00000552222	AP2A2	O94973	939 aa		13.34	□□□□□ -0.27
CS-231	ENST00000552222	GSTA2	P09210	222 aa		13.34	□□□□□ -0.27
CS-231	ENST00000552222	ERVK-10	P10266	1014 aa		13.34	□□□□□ -0.27
CS-231	ENST00000552222	ZNF7	P17097	686 aa	Predicted RBP	13.34	□□□□□ -0.27
CS-231	ENST00000552222	VARS	P26640	1264 aa	Known RBP	13.34	□□□□□ -0.27
CS-231	ENST00000552222	PRLHR	P49683	370 aa		13.34	□□□□□ -0.27
CS-231	ENST00000552222	KCNK10	P57789	538 aa		13.34	□□□□□ -0.27

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