RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551137.5

CS-223, Transcript of citrate synthase, human

TSL 3

Gene CS, Length 903 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CS-223	ENST00000551137	DNALI1	O14645	258 aa	Predicted RBP	11.04	□□□□□ -0.64
CS-223	ENST00000551137	ZSCAN9	O15535	394 aa	Predicted RBP	11.04	□□□□□ -0.64
CS-223	ENST00000551137	SRPX2	O60687	465 aa	Predicted RBP	11.04	□□□□□ -0.64
CS-223	ENST00000551137	KLF7	O75840	302 aa	Predicted RBP	11.04	□□□□□ -0.64
CS-223	ENST00000551137	TTC4	O95801	387 aa		11.04	□□□□□ -0.64
CS-223	ENST00000551137	PGAM1	P18669	254 aa		11.04	□□□□□ -0.64
CS-223	ENST00000551137	CHRM3	P20309	590 aa		11.04	□□□□□ -0.64
CS-223	ENST00000551137	HSD17B2	P37059	387 aa		11.04	□□□□□ -0.64
CS-223	ENST00000551137	PTGIR	P43119	386 aa		11.04	□□□□□ -0.64
CS-223	ENST00000551137	RPS18	P62269	152 aa	Known RBP	11.04	□□□□□ -0.64
CS-223	ENST00000551137	CBLB	Q13191	982 aa		11.04	□□□□□ -0.64
CS-223	ENST00000551137	IL10RA	Q13651	578 aa		11.04	□□□□□ -0.64
CS-223	ENST00000551137	THOC5	Q13769	683 aa	Known RBP	11.04	□□□□□ -0.64
CS-223	ENST00000551137	SF1	Q15637	639 aa	Known RBP	11.04	□□□□□ -0.64
CS-223	ENST00000551137	ZC3H12B	Q5HYM0	836 aa	Known RBP	11.04	□□□□□ -0.64
CS-223	ENST00000551137	YOD1	Q5VVQ6	348 aa	Predicted RBP	11.04	□□□□□ -0.64
CS-223	ENST00000551137	FCRL6	Q6DN72	434 aa		11.04	□□□□□ -0.64
CS-223	ENST00000551137	ZNF549	Q6P9A3	640 aa		11.04	□□□□□ -0.64
CS-223	ENST00000551137	SYDE1	Q6ZW31	735 aa	Predicted RBP	11.04	□□□□□ -0.64
CS-223	ENST00000551137	CREG2	Q8IUH2	290 aa		11.04	□□□□□ -0.64
CS-223	ENST00000551137	MCAT	Q8IVS2	390 aa	Known RBP	11.04	□□□□□ -0.64
CS-223	ENST00000551137	ENDOV	Q8N8Q3	282 aa	Known RBP	11.04	□□□□□ -0.64
CS-223	ENST00000551137	NACC2	Q96BF6	587 aa		11.04	□□□□□ -0.64
CS-223	ENST00000551137	RUNDC3B	Q96NL0	473 aa		11.04	□□□□□ -0.64
CS-223	ENST00000551137	IL17F	Q96PD4	163 aa		11.04	□□□□□ -0.64
CS-223	ENST00000551137	DDX47	Q9H0S4	455 aa	Known RBP	11.04	□□□□□ -0.64
CS-223	ENST00000551137	GALP	Q9UBC7	116 aa		11.04	□□□□□ -0.64
CS-223	ENST00000551137	DHRS7	Q9Y394	339 aa		11.04	□□□□□ -0.64
CS-223	ENST00000551137	PCDHGA9	Q9Y5G4	932 aa	Known RBP	11.04	□□□□□ -0.64
CS-223	ENST00000551137		A0A1W2PPV9	198 aa		11.03	□□□□□ -0.64
CS-223	ENST00000551137	CTAGE9	A4FU28	777 aa		11.03	□□□□□ -0.64
CS-223	ENST00000551137	FITM1	A5D6W6	292 aa		11.03	□□□□□ -0.64
CS-223	ENST00000551137	USP27X	A6NNY8	438 aa		11.03	□□□□□ -0.64
CS-223	ENST00000551137		C9J4A7	227 aa		11.03	□□□□□ -0.64
CS-223	ENST00000551137		E5RI56	91 aa		11.03	□□□□□ -0.64
CS-223	ENST00000551137	GFY	I3L273	518 aa		11.03	□□□□□ -0.64
CS-223	ENST00000551137	CEACAM4	O75871	244 aa		11.03	□□□□□ -0.64
CS-223	ENST00000551137	MPC1L	P0DKB6	136 aa		11.03	□□□□□ -0.64
CS-223	ENST00000551137	CBSL	P0DN79	551 aa		11.03	□□□□□ -0.64
CS-223	ENST00000551137	ENO3	P13929	434 aa	Predicted RBP	11.03	□□□□□ -0.64
CS-223	ENST00000551137	CBS	P35520	551 aa		11.03	□□□□□ -0.64
CS-223	ENST00000551137	CASR	P41180	1078 aa		11.03	□□□□□ -0.64
CS-223	ENST00000551137	GRIA3	P42263	894 aa		11.03	□□□□□ -0.64
CS-223	ENST00000551137	TERF1	P54274	439 aa		11.03	□□□□□ -0.64
CS-223	ENST00000551137	ARSF	P54793	590 aa		11.03	□□□□□ -0.64
CS-223	ENST00000551137	DCD	P81605	110 aa	Known RBP	11.03	□□□□□ -0.64
CS-223	ENST00000551137	RELA	Q04206	551 aa		11.03	□□□□□ -0.64
CS-223	ENST00000551137	CTBP1	Q13363	440 aa		11.03	□□□□□ -0.64
CS-223	ENST00000551137	NAA25	Q14CX7	972 aa		11.03	□□□□□ -0.64
CS-223	ENST00000551137	PPP1R7	Q15435	360 aa		11.03	□□□□□ -0.64
CS-223	ENST00000551137	KLHL38	Q2WGJ6	581 aa		11.03	□□□□□ -0.64
CS-223	ENST00000551137	DEFB110	Q30KQ9	67 aa		11.03	□□□□□ -0.64
CS-223	ENST00000551137	PTCHD3	Q3KNS1	767 aa		11.03	□□□□□ -0.64
CS-223	ENST00000551137	TTLL9	Q3SXZ7	439 aa		11.03	□□□□□ -0.64
CS-223	ENST00000551137	CCSMST1	Q4G0I0	132 aa		11.03	□□□□□ -0.64
CS-223	ENST00000551137	LACTB2	Q53H82	288 aa	Predicted RBP	11.03	□□□□□ -0.64
CS-223	ENST00000551137	ACSBG2	Q5FVE4	666 aa		11.03	□□□□□ -0.64
CS-223	ENST00000551137	TCTE1	Q5JU00	501 aa		11.03	□□□□□ -0.64
CS-223	ENST00000551137	MRPL14	Q6P1L8	145 aa	Known RBP	11.03	□□□□□ -0.64
CS-223	ENST00000551137	FIGLA	Q6QHK4	219 aa		11.03	□□□□□ -0.64
CS-223	ENST00000551137	GALNT7	Q86SF2	657 aa		11.03	□□□□□ -0.64
CS-223	ENST00000551137	DENND6A	Q8IWF6	608 aa		11.03	□□□□□ -0.64
CS-223	ENST00000551137	CNTN4	Q8IWV2	1026 aa		11.03	□□□□□ -0.64
CS-223	ENST00000551137	SERBP1	Q8NC51	408 aa	Known RBP eCLIP	11.03	□□□□□ -0.64
CS-223	ENST00000551137	OR2L3	Q8NG85	312 aa		11.03	□□□□□ -0.64
CS-223	ENST00000551137	OR9A1P	Q8NGU1	263 aa		11.03	□□□□□ -0.64
CS-223	ENST00000551137	SKA2	Q8WVK7	121 aa	Predicted RBP	11.03	□□□□□ -0.64
CS-223	ENST00000551137	ASB11	Q8WXH4	323 aa		11.03	□□□□□ -0.64
CS-223	ENST00000551137	ANP32B	Q92688	251 aa	Known RBP	11.03	□□□□□ -0.64
CS-223	ENST00000551137	DLG3	Q92796	817 aa		11.03	□□□□□ -0.64
CS-223	ENST00000551137	INPP5D	Q92835	1189 aa		11.03	□□□□□ -0.64
CS-223	ENST00000551137	IP6K3	Q96PC2	410 aa		11.03	□□□□□ -0.64
CS-223	ENST00000551137	EBNA1BP2	Q99848	306 aa	Known RBP	11.03	□□□□□ -0.64
CS-223	ENST00000551137	FAM167B	Q9BTA0	163 aa		11.03	□□□□□ -0.64
CS-223	ENST00000551137	SLC7A5P2	Q9GIP4	190 aa		11.03	□□□□□ -0.64
CS-223	ENST00000551137	FAM114A2	Q9NRY5	505 aa		11.03	□□□□□ -0.64
CS-223	ENST00000551137	C20orf96	Q9NUD7	363 aa	Predicted RBP	11.03	□□□□□ -0.64
CS-223	ENST00000551137	RNF14	Q9UBS8	474 aa		11.03	□□□□□ -0.64
CS-223	ENST00000551137	TLK1	Q9UKI8	766 aa		11.03	□□□□□ -0.64
CS-223	ENST00000551137	FBXO5	Q9UKT4	447 aa		11.03	□□□□□ -0.64
CS-223	ENST00000551137	SNX7	Q9UNH6	387 aa		11.03	□□□□□ -0.64
CS-223	ENST00000551137	PADI2	Q9Y2J8	665 aa		11.03	□□□□□ -0.64
CS-223	ENST00000551137	PCDHGB7	Q9Y5F8	929 aa		11.03	□□□□□ -0.64
CS-223	ENST00000551137	MAD1L1	Q9Y6D9	718 aa		11.03	□□□□□ -0.64
CS-223	ENST00000551137	HEATR5B	Q9P2D3	2071 aa		11.02	□□□□□ -0.64
CS-223	ENST00000551137	ARHGEF33	A8MVX0	844 aa		11.02	□□□□□ -0.65
CS-223	ENST00000551137	CCDC188	H7C350	402 aa		11.02	□□□□□ -0.65
CS-223	ENST00000551137	WISP1	O95388	367 aa		11.02	□□□□□ -0.65
CS-223	ENST00000551137	ALB	P02768	609 aa		11.02	□□□□□ -0.65
CS-223	ENST00000551137	CAT	P04040	527 aa	Known RBP	11.02	□□□□□ -0.65
CS-223	ENST00000551137	CTSB	P07858	339 aa		11.02	□□□□□ -0.65
CS-223	ENST00000551137	SKIV2L2	P42285	1042 aa	Known RBP	11.02	□□□□□ -0.65
CS-223	ENST00000551137	SLC1A2	P43004	574 aa		11.02	□□□□□ -0.65
CS-223	ENST00000551137	BDKRB1	P46663	353 aa		11.02	□□□□□ -0.65
CS-223	ENST00000551137	CSRP3	P50461	194 aa		11.02	□□□□□ -0.65
CS-223	ENST00000551137	KLRB1	Q12918	225 aa		11.02	□□□□□ -0.65
CS-223	ENST00000551137	SSPN	Q14714	243 aa		11.02	□□□□□ -0.65
CS-223	ENST00000551137	CRYM	Q14894	314 aa		11.02	□□□□□ -0.65
CS-223	ENST00000551137	MORF4L2	Q15014	288 aa		11.02	□□□□□ -0.65
CS-223	ENST00000551137	NKAIN1	Q4KMZ8	207 aa		11.02	□□□□□ -0.65

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