RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550376.5

PRDM4-205, Transcript of PR/SET domain 4, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PRDM4, Length 2,591 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM4-205ENST00000550376 WSCD2Q2TBF2 565 aa20.35■□□□□ 0.85
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PRDM4-205ENST00000550376 SYTL1Q8IYJ3 562 aa20.35■□□□□ 0.85
PRDM4-205ENST00000550376 IL17FQ96PD4 163 aa20.35■□□□□ 0.85
PRDM4-205ENST00000550376 OSBPL6Q9BZF3 934 aa20.35■□□□□ 0.85
PRDM4-205ENST00000550376 S1PR5Q9H228 398 aa20.35■□□□□ 0.85
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PRDM4-205ENST00000550376 LRCH1Q9Y2L9 728 aa20.35■□□□□ 0.85
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PRDM4-205ENST00000550376 C1orf105O95561 183 aa20.34■□□□□ 0.85
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PRDM4-205ENST00000550376 TMEM184AQ6ZMB5 413 aa20.34■□□□□ 0.85
PRDM4-205ENST00000550376 ZNF480Q8WV37 535 aa20.34■□□□□ 0.85
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PRDM4-205ENST00000550376 ADAM15Q13444 863 aa20.33■□□□□ 0.84
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PRDM4-205ENST00000550376 C11orf96Q7Z7L8 435 aa20.33■□□□□ 0.84
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PRDM4-205ENST00000550376 MAT2AP31153 395 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
PRDM4-205ENST00000550376 GTF2H3Q13889 308 aa20.32■□□□□ 0.84
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PRDM4-205ENST00000550376 TCEA2Q15560 299 aa20.32■□□□□ 0.84
PRDM4-205ENST00000550376 NRF1Q16656 503 aa20.32■□□□□ 0.84
PRDM4-205ENST00000550376 PGS1Q32NB8 556 aa20.32■□□□□ 0.84
PRDM4-205ENST00000550376 OR2T34Q8NGX1 318 aa20.32■□□□□ 0.84
PRDM4-205ENST00000550376 OR2T3Q8NH03 318 aa20.32■□□□□ 0.84
PRDM4-205ENST00000550376 SLC13A3Q8WWT9 602 aa20.32■□□□□ 0.84
PRDM4-205ENST00000550376 AURKBQ96GD4 344 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
PRDM4-205ENST00000550376 NEUROG3Q9Y4Z2 214 aa20.32■□□□□ 0.84
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