RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524325.5

TSNARE1-208, Transcript of t-SNARE domain containing 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene TSNARE1, Length 1,963 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNARE1-208ENST00000524325 ATG14Q6ZNE5 492 aa22■■□□□ 1.11
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TSNARE1-208ENST00000524325 CD244Q9BZW8 370 aa22■■□□□ 1.11
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TSNARE1-208ENST00000524325 CHRNGP07510 517 aa21.96■■□□□ 1.11
TSNARE1-208ENST00000524325 RPS17P08708 135 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
TSNARE1-208ENST00000524325 CKMT1AP12532 417 aa21.96■■□□□ 1.11
TSNARE1-208ENST00000524325 NPPBP16860 134 aa21.96■■□□□ 1.11
TSNARE1-208ENST00000524325 MPSTP25325 297 aa21.96■■□□□ 1.11
TSNARE1-208ENST00000524325 DNAJB13P59910 316 aa21.96■■□□□ 1.11
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TSNARE1-208ENST00000524325 PCBP2Q15366 365 aaKnown RBP eCLIP21.96■■□□□ 1.113e-16■■■■■ 55.9
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