RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524313.1

IGKV1-22-201, Transcript of immunoglobulin kappa variable 1-22 (pseudogene), humanhuman

BASIC

Gene IGKV1-22, Length 326 nt, Biotype IG V pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGKV1-22-201ENST00000524313 PPP1R16AQ96I34 528 aa0.51□□□□□ -2.33
IGKV1-22-201ENST00000524313 DGAT2Q96PD7 388 aa0.51□□□□□ -2.33
IGKV1-22-201ENST00000524313 FAM167BQ9BTA0 163 aa0.51□□□□□ -2.33
IGKV1-22-201ENST00000524313 ABHD6Q9BV23 337 aa0.51□□□□□ -2.33
IGKV1-22-201ENST00000524313 DEFB126Q9BYW3 111 aa0.51□□□□□ -2.33
IGKV1-22-201ENST00000524313 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP0.51□□□□□ -2.33
IGKV1-22-201ENST00000524313 SLA2Q9H6Q3 261 aa0.51□□□□□ -2.33
IGKV1-22-201ENST00000524313 RASSF1Q9NS23 344 aa0.51□□□□□ -2.33
IGKV1-22-201ENST00000524313 SMC4Q9NTJ3 1288 aa0.51□□□□□ -2.33
IGKV1-22-201ENST00000524313 NLGN3Q9NZ94 848 aa0.51□□□□□ -2.33
IGKV1-22-201ENST00000524313 MPP6Q9NZW5 540 aa0.51□□□□□ -2.33
IGKV1-22-201ENST00000524313 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP0.51□□□□□ -2.33
IGKV1-22-201ENST00000524313 Q9UF83 564 aa0.51□□□□□ -2.33
IGKV1-22-201ENST00000524313 SELENOKQ9Y6D0 94 aa0.51□□□□□ -2.33
IGKV1-22-201ENST00000524313 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP0.5□□□□□ -2.33
IGKV1-22-201ENST00000524313 VILLO15195 856 aa0.5□□□□□ -2.33
IGKV1-22-201ENST00000524313 PRDM1O75626 825 aa0.5□□□□□ -2.33
IGKV1-22-201ENST00000524313 FAM155BO75949 473 aa0.5□□□□□ -2.33
IGKV1-22-201ENST00000524313 BAIAP3O94812 1187 aa0.5□□□□□ -2.33
IGKV1-22-201ENST00000524313 SEC31AO94979 1220 aaKnown RBP0.5□□□□□ -2.33
IGKV1-22-201ENST00000524313 ACSL3O95573 720 aa0.5□□□□□ -2.33
IGKV1-22-201ENST00000524313 CNPP09543 421 aaKnown RBP0.5□□□□□ -2.33
IGKV1-22-201ENST00000524313 GIG44P09565 113 aaPredicted RBP0.5□□□□□ -2.33
IGKV1-22-201ENST00000524313 ADORA3P0DMS8 318 aa0.5□□□□□ -2.33
IGKV1-22-201ENST00000524313 PTGER4P35408 488 aa0.5□□□□□ -2.33
IGKV1-22-201ENST00000524313 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP0.5□□□□□ -2.33
IGKV1-22-201ENST00000524313 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP0.5□□□□□ -2.33
IGKV1-22-201ENST00000524313 PAPOLAP51003 745 aaKnown RBP0.5□□□□□ -2.33
IGKV1-22-201ENST00000524313 ERVK-16P61578 105 aa0.5□□□□□ -2.33
IGKV1-22-201ENST00000524313 SRPXP78539 464 aa0.5□□□□□ -2.33
IGKV1-22-201ENST00000524313 PRKCEQ02156 737 aa0.5□□□□□ -2.33
IGKV1-22-201ENST00000524313 FOXO1Q12778 655 aa0.5□□□□□ -2.33
IGKV1-22-201ENST00000524313 SGCGQ13326 291 aa0.5□□□□□ -2.33
IGKV1-22-201ENST00000524313 KIAA0141Q14154 515 aaPredicted RBP0.5□□□□□ -2.33
IGKV1-22-201ENST00000524313 KCTD19Q17RG1 926 aaPredicted RBP0.5□□□□□ -2.33
IGKV1-22-201ENST00000524313 GSG1Q2KHT4 349 aa0.5□□□□□ -2.33
IGKV1-22-201ENST00000524313 TMEM44Q2T9K0 475 aa0.5□□□□□ -2.33
IGKV1-22-201ENST00000524313 ALG11Q2TAA5 492 aa0.5□□□□□ -2.33
IGKV1-22-201ENST00000524313 CCDC38Q502W7 563 aa0.5□□□□□ -2.33
IGKV1-22-201ENST00000524313 WDR45BQ5MNZ6 344 aa0.5□□□□□ -2.33
IGKV1-22-201ENST00000524313 GALNT13Q8IUC8 556 aa0.5□□□□□ -2.33
IGKV1-22-201ENST00000524313 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP0.5□□□□□ -2.33
IGKV1-22-201ENST00000524313 TMTC2Q8N394 836 aa0.5□□□□□ -2.33
IGKV1-22-201ENST00000524313 AVL9Q8NBF6 648 aa0.5□□□□□ -2.33
IGKV1-22-201ENST00000524313 OR52N5Q8NH56 324 aa0.5□□□□□ -2.33
IGKV1-22-201ENST00000524313 SETD7Q8WTS6 366 aaKnown RBP0.5□□□□□ -2.33
IGKV1-22-201ENST00000524313 FAM81BQ96LP2 452 aa0.5□□□□□ -2.33
IGKV1-22-201ENST00000524313 GFI1Q99684 422 aa0.5□□□□□ -2.33
IGKV1-22-201ENST00000524313 ZNF670Q9BS34 389 aa0.5□□□□□ -2.33
IGKV1-22-201ENST00000524313 C1QTNF1Q9BXJ1 281 aa0.5□□□□□ -2.33
IGKV1-22-201ENST00000524313 OR2B2Q9GZK3 357 aa0.5□□□□□ -2.33
IGKV1-22-201ENST00000524313 THAP2Q9H0W7 228 aa0.5□□□□□ -2.33
IGKV1-22-201ENST00000524313 MARCH7Q9H992 704 aa0.5□□□□□ -2.33
IGKV1-22-201ENST00000524313 HHATLQ9HCP6 504 aa0.5□□□□□ -2.33
IGKV1-22-201ENST00000524313 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP0.5□□□□□ -2.33
IGKV1-22-201ENST00000524313 FAM207AQ9NSI2 230 aaPredicted RBP0.5□□□□□ -2.33
IGKV1-22-201ENST00000524313 VNN3Q9NY84 501 aa0.5□□□□□ -2.33
IGKV1-22-201ENST00000524313 NPAP1Q9NZP6 1156 aa0.5□□□□□ -2.33
IGKV1-22-201ENST00000524313 PNMA2Q9UL42 364 aa0.5□□□□□ -2.33
IGKV1-22-201ENST00000524313 MTF2Q9Y483 593 aaPredicted RBP0.5□□□□□ -2.33
IGKV1-22-201ENST00000524313 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP0.5□□□□□ -2.33
IGKV1-22-201ENST00000524313 NOTCH1P46531 2555 aa0.49□□□□□ -2.33
IGKV1-22-201ENST00000524313 CHD4Q14839 1912 aa0.49□□□□□ -2.33
IGKV1-22-201ENST00000524313 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP0.49□□□□□ -2.33
IGKV1-22-201ENST00000524313 A0A0U1RQK1 487 aa0.49□□□□□ -2.33
IGKV1-22-201ENST00000524313 ANKRD62A6NC57 917 aa0.49□□□□□ -2.33
IGKV1-22-201ENST00000524313 PLEKHD1A6NEE1 506 aa0.49□□□□□ -2.33
IGKV1-22-201ENST00000524313 TSPAN4O14817 238 aa0.49□□□□□ -2.33
IGKV1-22-201ENST00000524313 SLC25A12O75746 678 aa0.49□□□□□ -2.33
IGKV1-22-201ENST00000524313 IGLV1-47P01700 117 aa0.49□□□□□ -2.33
IGKV1-22-201ENST00000524313 DARSP14868 501 aaKnown RBP0.49□□□□□ -2.33
IGKV1-22-201ENST00000524313 SLC6A6P31641 620 aa0.49□□□□□ -2.33
IGKV1-22-201ENST00000524313 GGT5P36269 586 aa0.49□□□□□ -2.33
IGKV1-22-201ENST00000524313 CPOXP36551 454 aa0.49□□□□□ -2.33
IGKV1-22-201ENST00000524313 MSH2P43246 934 aa0.49□□□□□ -2.33
IGKV1-22-201ENST00000524313 CCR3P51677 355 aa0.49□□□□□ -2.33
IGKV1-22-201ENST00000524313 PFN3P60673 137 aa0.49□□□□□ -2.33
IGKV1-22-201ENST00000524313 SNRPEP62304 92 aaKnown RBP0.49□□□□□ -2.33
IGKV1-22-201ENST00000524313 NAAAQ02083 359 aa0.49□□□□□ -2.33
IGKV1-22-201ENST00000524313 ZNF33BQ06732 778 aa0.49□□□□□ -2.33
IGKV1-22-201ENST00000524313 PICALMQ13492 652 aa0.49□□□□□ -2.33
IGKV1-22-201ENST00000524313 SLC12A1Q13621 1099 aa0.49□□□□□ -2.33
IGKV1-22-201ENST00000524313 TMEM132DQ14C87 1099 aa0.49□□□□□ -2.33
IGKV1-22-201ENST00000524313 NAB2Q15742 525 aa0.49□□□□□ -2.33
IGKV1-22-201ENST00000524313 ISXQ2M1V0 245 aa0.49□□□□□ -2.33
IGKV1-22-201ENST00000524313 ITPRIPL2Q3MIP1 535 aa0.49□□□□□ -2.33
IGKV1-22-201ENST00000524313 SLC9B1Q4ZJI4 515 aa0.49□□□□□ -2.33
IGKV1-22-201ENST00000524313 ZNF691Q5VV52 312 aa0.49□□□□□ -2.33
IGKV1-22-201ENST00000524313 NAA35Q5VZE5 725 aa0.49□□□□□ -2.33
IGKV1-22-201ENST00000524313 FAM109BQ6ICB4 259 aaPredicted RBP0.49□□□□□ -2.33
IGKV1-22-201ENST00000524313 EMBQ6PCB8 327 aa0.49□□□□□ -2.33
IGKV1-22-201ENST00000524313 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP0.49□□□□□ -2.33
IGKV1-22-201ENST00000524313 COMMD2Q86X83 199 aa0.49□□□□□ -2.33
IGKV1-22-201ENST00000524313 TPRX1Q8N7U7 411 aa0.49□□□□□ -2.33
IGKV1-22-201ENST00000524313 IRGQQ8WZA9 623 aa0.49□□□□□ -2.33
IGKV1-22-201ENST00000524313 LPAR4Q99677 370 aa0.49□□□□□ -2.33
IGKV1-22-201ENST00000524313 CCDC28BQ9BUN5 200 aa0.49□□□□□ -2.33
IGKV1-22-201ENST00000524313 RSPO3Q9BXY4 272 aaPredicted RBP0.49□□□□□ -2.33
IGKV1-22-201ENST00000524313 SLC25A39Q9BZJ4 359 aaPredicted RBP0.49□□□□□ -2.33
IGKV1-22-201ENST00000524313 VN1R1Q9GZP7 353 aa0.49□□□□□ -2.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.6 ms