RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511747.5

SH3BP2-221, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP2, Length 2,351 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-221ENST00000511747 CDKN3Q16667 212 aa26.39■■□□□ 1.82
SH3BP2-221ENST00000511747 WFDC5Q8TCV5 224 aa26.39■■□□□ 1.82
SH3BP2-221ENST00000511747 POP5Q969H6 163 aaKnown RBP26.39■■□□□ 1.82
SH3BP2-221ENST00000511747 TMEM88BA6NKF7 163 aa26.39■■□□□ 1.81
SH3BP2-221ENST00000511747 WNT9AO14904 365 aa26.39■■□□□ 1.81
SH3BP2-221ENST00000511747 SEC24AO95486 1093 aa26.39■■□□□ 1.81
SH3BP2-221ENST00000511747 ITGAMP11215 1152 aa26.39■■□□□ 1.81
SH3BP2-221ENST00000511747 BCL2L1Q07817 233 aa26.39■■□□□ 1.81
SH3BP2-221ENST00000511747 CBX3Q13185 183 aa26.39■■□□□ 1.81
SH3BP2-221ENST00000511747 CARD16Q5EG05 197 aa26.39■■□□□ 1.81
SH3BP2-221ENST00000511747 LYPLAL1Q5VWZ2 237 aa26.39■■□□□ 1.81
SH3BP2-221ENST00000511747 NIPAL1Q6NVV3 410 aa26.39■■□□□ 1.81
SH3BP2-221ENST00000511747 ZNF551Q7Z340 670 aaPredicted RBP26.39■■□□□ 1.81
SH3BP2-221ENST00000511747 SLC22A15Q8IZD6 547 aa26.39■■□□□ 1.81
SH3BP2-221ENST00000511747 PARP8Q8N3A8 854 aa26.39■■□□□ 1.81
SH3BP2-221ENST00000511747 SLC32A1Q9H598 525 aa26.39■■□□□ 1.81
SH3BP2-221ENST00000511747 ARL15Q9NXU5 204 aa26.39■■□□□ 1.81
SH3BP2-221ENST00000511747 ATP6V1G1O75348 118 aa26.38■■□□□ 1.81
SH3BP2-221ENST00000511747 ARHGEF15O94989 841 aa26.38■■□□□ 1.81
SH3BP2-221ENST00000511747 ZNF682O95780 498 aa26.38■■□□□ 1.81
SH3BP2-221ENST00000511747 HOXB9P17482 250 aaPredicted RBP26.38■■□□□ 1.81
SH3BP2-221ENST00000511747 CYP2A13Q16696 494 aa26.38■■□□□ 1.81
SH3BP2-221ENST00000511747 TTLL9Q3SXZ7 439 aa26.38■■□□□ 1.81
SH3BP2-221ENST00000511747 DOK6Q6PKX4 331 aa26.38■■□□□ 1.81
SH3BP2-221ENST00000511747 MCOLN3Q8TDD5 553 aa26.38■■□□□ 1.81
SH3BP2-221ENST00000511747 ALG14Q96F25 216 aa26.38■■□□□ 1.81
SH3BP2-221ENST00000511747 DNMT3BQ9UBC3 853 aaKnown RBP26.38■■□□□ 1.81
SH3BP2-221ENST00000511747 AASSQ9UDR5 926 aa26.38■■□□□ 1.81
SH3BP2-221ENST00000511747 STOML2Q9UJZ1 356 aa26.38■■□□□ 1.81
SH3BP2-221ENST00000511747 PPT2Q9UMR5 302 aa26.38■■□□□ 1.81
SH3BP2-221ENST00000511747 PIKFYVEQ9Y2I7 2098 aa26.38■■□□□ 1.81
SH3BP2-221ENST00000511747 BEND7Q8N7W2 519 aaPredicted RBP26.38■■□□□ 1.81
SH3BP2-221ENST00000511747 RORBQ92753 470 aa26.38■■□□□ 1.81
SH3BP2-221ENST00000511747 CCNDBP1O95273 360 aa26.37■■□□□ 1.81
SH3BP2-221ENST00000511747 SLC14A1Q13336 389 aa26.37■■□□□ 1.81
SH3BP2-221ENST00000511747 CDH18Q13634 790 aa26.37■■□□□ 1.81
SH3BP2-221ENST00000511747 CEP68Q76N32 757 aa26.37■■□□□ 1.81
SH3BP2-221ENST00000511747 NXPE1Q8N323 547 aa26.37■■□□□ 1.81
SH3BP2-221ENST00000511747 EGLN2Q96KS0 407 aa26.37■■□□□ 1.81
SH3BP2-221ENST00000511747 NEURL2Q9BR09 285 aa26.37■■□□□ 1.81
SH3BP2-221ENST00000511747 ELOVL6Q9H5J4 265 aa26.37■■□□□ 1.81
SH3BP2-221ENST00000511747 ERVK-18Q9QC07 812 aa26.37■■□□□ 1.81
SH3BP2-221ENST00000511747 INTS6Q9UL03 887 aaKnown RBP26.37■■□□□ 1.81
SH3BP2-221ENST00000511747 LRFN2Q9ULH4 789 aa26.37■■□□□ 1.81
SH3BP2-221ENST00000511747 ABCG2Q9UNQ0 655 aa26.37■■□□□ 1.81
SH3BP2-221ENST00000511747 SAMD4AQ9UPU9 718 aaKnown RBP26.37■■□□□ 1.81
SH3BP2-221ENST00000511747 LRATO95237 230 aa26.36■■□□□ 1.81
SH3BP2-221ENST00000511747 UGT2B4P06133 528 aa26.36■■□□□ 1.81
SH3BP2-221ENST00000511747 PRPS2P11908 318 aa26.36■■□□□ 1.81
SH3BP2-221ENST00000511747 CYP4B1P13584 511 aa26.36■■□□□ 1.81
SH3BP2-221ENST00000511747 FMO3P31513 532 aa26.36■■□□□ 1.81
SH3BP2-221ENST00000511747 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP26.36■■□□□ 1.81
SH3BP2-221ENST00000511747 IL1RL1Q01638 556 aa26.36■■□□□ 1.81
SH3BP2-221ENST00000511747 TAF12Q16514 161 aa26.36■■□□□ 1.81
SH3BP2-221ENST00000511747 ZXDCQ2QGD7 858 aaPredicted RBP26.36■■□□□ 1.81
SH3BP2-221ENST00000511747 GPR33Q49SQ1 333 aa26.36■■□□□ 1.81
SH3BP2-221ENST00000511747 B3GNT8Q7Z7M8 397 aa26.36■■□□□ 1.81
SH3BP2-221ENST00000511747 SAPCD2Q86UD0 394 aa26.36■■□□□ 1.81
SH3BP2-221ENST00000511747 OR7A2PQ8NGA2 310 aa26.36■■□□□ 1.81
SH3BP2-221ENST00000511747 IL1RAPQ9NPH3 570 aa26.36■■□□□ 1.81
SH3BP2-221ENST00000511747 GPRC5BQ9NZH0 403 aa26.36■■□□□ 1.81
SH3BP2-221ENST00000511747 AFF4Q9UHB7 1163 aaKnown RBP26.36■■□□□ 1.81
SH3BP2-221ENST00000511747 RFXANKO14593 260 aa26.36■■□□□ 1.81
SH3BP2-221ENST00000511747 NBNO60934 754 aa26.36■■□□□ 1.81
SH3BP2-221ENST00000511747 TPP2P29144 1249 aaPredicted RBP26.36■■□□□ 1.81
SH3BP2-221ENST00000511747 CD6P30203 668 aa26.36■■□□□ 1.81
SH3BP2-221ENST00000511747 GTF2H3Q13889 308 aa26.36■■□□□ 1.81
SH3BP2-221ENST00000511747 ZNF846Q147U1 533 aa26.36■■□□□ 1.81
SH3BP2-221ENST00000511747 NPTX1Q15818 432 aa26.36■■□□□ 1.81
SH3BP2-221ENST00000511747 SLCO6A1Q86UG4 719 aa26.36■■□□□ 1.81
SH3BP2-221ENST00000511747 APCDD1Q8J025 514 aa26.36■■□□□ 1.81
SH3BP2-221ENST00000511747 SETD9Q8NE22 299 aa26.36■■□□□ 1.81
SH3BP2-221ENST00000511747 TESCQ96BS2 214 aa26.36■■□□□ 1.81
SH3BP2-221ENST00000511747 RIBC2Q9H4K1 309 aa26.36■■□□□ 1.81
SH3BP2-221ENST00000511747 HMG20AQ9NP66 347 aa26.36■■□□□ 1.81
SH3BP2-221ENST00000511747 AASDHPPTQ9NRN7 309 aa26.36■■□□□ 1.81
SH3BP2-221ENST00000511747 MTRRQ9UBK8 725 aa26.36■■□□□ 1.81
SH3BP2-221ENST00000511747 TOR1BO14657 336 aa26.35■■□□□ 1.81
SH3BP2-221ENST00000511747 SERPINB7O75635 380 aa26.35■■□□□ 1.81
SH3BP2-221ENST00000511747 GABARAPO95166 117 aa26.35■■□□□ 1.81
SH3BP2-221ENST00000511747 SDC1P18827 310 aa26.35■■□□□ 1.81
SH3BP2-221ENST00000511747 CDH3P22223 829 aa26.35■■□□□ 1.81
SH3BP2-221ENST00000511747 DAPP51397 102 aa26.35■■□□□ 1.81
SH3BP2-221ENST00000511747 ARHGDIAP52565 204 aa26.35■■□□□ 1.81
SH3BP2-221ENST00000511747 SFSWAPQ12872 951 aaKnown RBP26.35■■□□□ 1.81
SH3BP2-221ENST00000511747 PLD1Q13393 1074 aa26.35■■□□□ 1.81
SH3BP2-221ENST00000511747 OR2T5Q6IEZ7 315 aa26.35■■□□□ 1.81
SH3BP2-221ENST00000511747 HOMEZQ8IX15 550 aa26.35■■□□□ 1.81
SH3BP2-221ENST00000511747 DCAF4L2Q8NA75 395 aa26.35■■□□□ 1.81
SH3BP2-221ENST00000511747 OR2T29Q8NH02 315 aa26.35■■□□□ 1.81
SH3BP2-221ENST00000511747 DUSP21Q9H596 190 aa26.35■■□□□ 1.81
SH3BP2-221ENST00000511747 CA12O43570 354 aa26.35■■□□□ 1.81
SH3BP2-221ENST00000511747 ACVR2AP27037 513 aa26.35■■□□□ 1.81
SH3BP2-221ENST00000511747 SPAM1P38567 509 aa26.35■■□□□ 1.81
SH3BP2-221ENST00000511747 CAP1Q01518 475 aa26.35■■□□□ 1.81
SH3BP2-221ENST00000511747 SEMG2Q02383 582 aa26.35■■□□□ 1.81
SH3BP2-221ENST00000511747 ACOX1Q15067 660 aa26.35■■□□□ 1.81
SH3BP2-221ENST00000511747 TRIM16LQ309B1 348 aa26.35■■□□□ 1.81
SH3BP2-221ENST00000511747 C19orf43Q9BQ61 176 aa26.35■■□□□ 1.81
SH3BP2-221ENST00000511747 ABCG8Q9H221 673 aa26.35■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.8 ms