RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000505941.5

SH3BP2-210, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP2, Length 917 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-210ENST00000505941 NSMCE4AQ9NXX6 385 aa20.32■□□□□ 0.84
SH3BP2-210ENST00000505941 PLCL2Q9UPR0 1127 aa20.32■□□□□ 0.84
SH3BP2-210ENST00000505941 EIF3HO15372 352 aaKnown RBP eCLIP20.31■□□□□ 0.84
SH3BP2-210ENST00000505941 MCM3P25205 808 aa20.31■□□□□ 0.84
SH3BP2-210ENST00000505941 PEBP1P30086 187 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
SH3BP2-210ENST00000505941 RPA3P35244 121 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
SH3BP2-210ENST00000505941 ILF2Q12905 390 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
SH3BP2-210ENST00000505941 PDAP1Q13442 181 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
SH3BP2-210ENST00000505941 DNASE1L3Q13609 305 aa20.31■□□□□ 0.84
SH3BP2-210ENST00000505941 TSTA3Q13630 321 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
SH3BP2-210ENST00000505941 CYP2A13Q16696 494 aa20.31■□□□□ 0.84
SH3BP2-210ENST00000505941 CCSMST1Q4G0I0 132 aa20.31■□□□□ 0.84
SH3BP2-210ENST00000505941 C16orf46Q6P387 395 aa20.31■□□□□ 0.84
SH3BP2-210ENST00000505941 CPNE9Q8IYJ1 553 aa20.31■□□□□ 0.84
SH3BP2-210ENST00000505941 MYO1HQ8N1T3 1032 aa20.31■□□□□ 0.84
SH3BP2-210ENST00000505941 GPATCH11Q8N954 259 aa20.31■□□□□ 0.84
SH3BP2-210ENST00000505941 CD200R1Q8TD46 325 aa20.31■□□□□ 0.84
SH3BP2-210ENST00000505941 DENND1AQ8TEH3 1009 aa20.31■□□□□ 0.84
SH3BP2-210ENST00000505941 ASB11Q8WXH4 323 aa20.31■□□□□ 0.84
SH3BP2-210ENST00000505941 SMPDL3AQ92484 453 aa20.31■□□□□ 0.84
SH3BP2-210ENST00000505941 TTC9Q92623 222 aa20.31■□□□□ 0.84
SH3BP2-210ENST00000505941 SLC30A3Q99726 388 aa20.31■□□□□ 0.84
SH3BP2-210ENST00000505941 FAM117AQ9C073 453 aa20.31■□□□□ 0.84
SH3BP2-210ENST00000505941 FAM60AQ9NP50 221 aa20.31■□□□□ 0.84
SH3BP2-210ENST00000505941 UTP6Q9NYH9 597 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
SH3BP2-210ENST00000505941 IL17BQ9UHF5 180 aa20.31■□□□□ 0.84
SH3BP2-210ENST00000505941 ZFYVE26Q68DK2 2539 aa20.3■□□□□ 0.84
SH3BP2-210ENST00000505941 ARHGEF33A8MVX0 844 aa20.3■□□□□ 0.84
SH3BP2-210ENST00000505941 TARM1B6A8C7 271 aa20.3■□□□□ 0.84
SH3BP2-210ENST00000505941 E7ESA3 106 aa20.3■□□□□ 0.84
SH3BP2-210ENST00000505941 KIF2AO00139 706 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
SH3BP2-210ENST00000505941 MYO1CO00159 1063 aa20.3■□□□□ 0.84
SH3BP2-210ENST00000505941 MEN1O00255 615 aa20.3■□□□□ 0.84
SH3BP2-210ENST00000505941 NKX2-8O15522 239 aa20.3■□□□□ 0.84
SH3BP2-210ENST00000505941 ZNF749O43361 778 aa20.3■□□□□ 0.84
SH3BP2-210ENST00000505941 PRKAR1AP10644 381 aa20.3■□□□□ 0.84
SH3BP2-210ENST00000505941 SFTPCP11686 197 aa20.3■□□□□ 0.84
SH3BP2-210ENST00000505941 MAGP20916 626 aa20.3■□□□□ 0.84
SH3BP2-210ENST00000505941 CMPK1P30085 196 aa20.3■□□□□ 0.84
SH3BP2-210ENST00000505941 WHAMMP3Q1A5X7 153 aa20.3■□□□□ 0.84
SH3BP2-210ENST00000505941 CRTC2Q53ET0 693 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
SH3BP2-210ENST00000505941 DUPD1Q68J44 220 aa20.3■□□□□ 0.84
SH3BP2-210ENST00000505941 TLDC1Q6P9B6 456 aa20.3■□□□□ 0.84
SH3BP2-210ENST00000505941 BORAQ6PGQ7 559 aa20.3■□□□□ 0.84
SH3BP2-210ENST00000505941 FIGLAQ6QHK4 219 aa20.3■□□□□ 0.84
SH3BP2-210ENST00000505941 UBE2R2Q712K3 238 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
SH3BP2-210ENST00000505941 LMNTD1Q8N9Z9 388 aa20.3■□□□□ 0.84
SH3BP2-210ENST00000505941 MCOLN3Q8TDD5 553 aa20.3■□□□□ 0.84
SH3BP2-210ENST00000505941 CT55Q8WUE5 264 aa20.3■□□□□ 0.84
SH3BP2-210ENST00000505941 CDKL2Q92772 493 aa20.3■□□□□ 0.84
SH3BP2-210ENST00000505941 EXTL1Q92935 676 aa20.3■□□□□ 0.84
SH3BP2-210ENST00000505941 DPH2Q9BQC3 489 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
SH3BP2-210ENST00000505941 TWSG1Q9GZX9 223 aa20.3■□□□□ 0.84
SH3BP2-210ENST00000505941 SAYSD1Q9NPB0 183 aa20.3■□□□□ 0.84
SH3BP2-210ENST00000505941 VWA7Q9Y334 891 aa20.3■□□□□ 0.84
SH3BP2-210ENST00000505941 CCNDBP1O95273 360 aa20.29■□□□□ 0.84
SH3BP2-210ENST00000505941 HIST1H2AGP0C0S8 130 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
SH3BP2-210ENST00000505941 HIST1H2ADP20671 130 aa20.29■□□□□ 0.84
SH3BP2-210ENST00000505941 CCR10P46092 362 aa20.29■□□□□ 0.84
SH3BP2-210ENST00000505941 PLTPP55058 493 aa20.29■□□□□ 0.84
SH3BP2-210ENST00000505941 IL2P60568 153 aa20.29■□□□□ 0.84
SH3BP2-210ENST00000505941 ZIC1Q15915 447 aa20.29■□□□□ 0.84
SH3BP2-210ENST00000505941 TBR1Q16650 682 aa20.29■□□□□ 0.84
SH3BP2-210ENST00000505941 FAM45BPQ6NSW5 357 aa20.29■□□□□ 0.84
SH3BP2-210ENST00000505941 C8orf74Q6P047 294 aa20.29■□□□□ 0.84
SH3BP2-210ENST00000505941 FAM199XQ6PEV8 388 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
SH3BP2-210ENST00000505941 TRMT10BQ6PF06 316 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
SH3BP2-210ENST00000505941 ZNF572Q7Z3I7 529 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
SH3BP2-210ENST00000505941 MCATQ8IVS2 390 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
SH3BP2-210ENST00000505941 FAM20CQ8IXL6 584 aa20.29■□□□□ 0.84
SH3BP2-210ENST00000505941 SYTL1Q8IYJ3 562 aa20.29■□□□□ 0.84
SH3BP2-210ENST00000505941 DNAJC22Q8N4W6 341 aa20.29■□□□□ 0.84
SH3BP2-210ENST00000505941 FBXO15Q8NCQ5 510 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
SH3BP2-210ENST00000505941 MNS1Q8NEH6 495 aa20.29■□□□□ 0.84
SH3BP2-210ENST00000505941 GIMAP7Q8NHV1 300 aa20.29■□□□□ 0.84
SH3BP2-210ENST00000505941 FAM45AQ8TCE6 357 aa20.29■□□□□ 0.84
SH3BP2-210ENST00000505941 HIST1H2AHQ96KK5 128 aa20.29■□□□□ 0.84
SH3BP2-210ENST00000505941 BBC3Q96PG8 261 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
SH3BP2-210ENST00000505941 PKP4Q99569 1192 aa20.29■□□□□ 0.84
SH3BP2-210ENST00000505941 MIPEPQ99797 713 aa20.29■□□□□ 0.84
SH3BP2-210ENST00000505941 HIST1H2AJQ99878 128 aa20.29■□□□□ 0.84
SH3BP2-210ENST00000505941 C17orf62Q9BQA9 187 aa20.29■□□□□ 0.84
SH3BP2-210ENST00000505941 H2AFJQ9BTM1 129 aa20.29■□□□□ 0.84
SH3BP2-210ENST00000505941 NDC1Q9BTX1 674 aa20.29■□□□□ 0.84
SH3BP2-210ENST00000505941 TXLNGQ9NUQ3 528 aa20.29■□□□□ 0.84
SH3BP2-210ENST00000505941 EURLQ9NYK6 297 aa20.29■□□□□ 0.84
SH3BP2-210ENST00000505941 TXNDC16Q9P2K2 825 aa20.29■□□□□ 0.84
SH3BP2-210ENST00000505941 SRPK3Q9UPE1 567 aa20.29■□□□□ 0.84
SH3BP2-210ENST00000505941 FARSAQ9Y285 508 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
SH3BP2-210ENST00000505941 MED16Q9Y2X0 877 aa20.29■□□□□ 0.84
SH3BP2-210ENST00000505941 PCDHGA6Q9Y5G7 932 aa20.29■□□□□ 0.84
SH3BP2-210ENST00000505941 GFYI3L273 518 aa20.28■□□□□ 0.84
SH3BP2-210ENST00000505941 C8GP07360 202 aa20.28■□□□□ 0.84
SH3BP2-210ENST00000505941 GABRB3P28472 473 aa20.28■□□□□ 0.84
SH3BP2-210ENST00000505941 PNLIPRP1P54315 467 aa20.28■□□□□ 0.84
SH3BP2-210ENST00000505941 CDC20Q12834 499 aa20.28■□□□□ 0.84
SH3BP2-210ENST00000505941 CBLBQ13191 982 aa20.28■□□□□ 0.84
SH3BP2-210ENST00000505941 GPS2Q13227 327 aa20.28■□□□□ 0.84
SH3BP2-210ENST00000505941 DEFB110Q30KQ9 67 aa20.28■□□□□ 0.84
SH3BP2-210ENST00000505941 EEF1AKMT2Q5JPI9 291 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.8 ms