RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490322.1

SMYD3-215, Transcript of SET and MYND domain containing 3, humanhuman

TSL 3

Gene SMYD3, Length 368 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMYD3-215ENST00000490322 MTA1Q13330 715 aa2.83□□□□□ -1.96
SMYD3-215ENST00000490322 NAB1Q13506 487 aa2.83□□□□□ -1.96
SMYD3-215ENST00000490322 EIF4EBP2Q13542 120 aaPredicted RBP2.83□□□□□ -1.96
SMYD3-215ENST00000490322 DCTN2Q13561 401 aaKnown RBP2.83□□□□□ -1.96
SMYD3-215ENST00000490322 PRPSAP1Q14558 356 aa2.83□□□□□ -1.96
SMYD3-215ENST00000490322 NAA25Q14CX7 972 aa2.83□□□□□ -1.96
SMYD3-215ENST00000490322 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP2.83□□□□□ -1.96
SMYD3-215ENST00000490322 ELAVL1Q15717 326 aaKnown RBP2.83□□□□□ -1.96
SMYD3-215ENST00000490322 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP2.83□□□□□ -1.96
SMYD3-215ENST00000490322 PARP6Q2NL67 630 aa2.83□□□□□ -1.96
SMYD3-215ENST00000490322 PTCHD3Q3KNS1 767 aa2.83□□□□□ -1.96
SMYD3-215ENST00000490322 ZNF766Q5HY98 468 aa2.83□□□□□ -1.96
SMYD3-215ENST00000490322 SPANXN3Q5MJ09 141 aa2.83□□□□□ -1.96
SMYD3-215ENST00000490322 C10orf120Q5SQS8 335 aa2.83□□□□□ -1.96
SMYD3-215ENST00000490322 RBM20Q5T481 1227 aaKnown RBP2.83□□□□□ -1.96
SMYD3-215ENST00000490322 LGSNQ5TDP6 509 aa2.83□□□□□ -1.96
SMYD3-215ENST00000490322 HHATQ5VTY9 493 aa2.83□□□□□ -1.96
SMYD3-215ENST00000490322 SDHAF4Q5VUM1 108 aa2.83□□□□□ -1.96
SMYD3-215ENST00000490322 NUGGCQ68CJ6 796 aa2.83□□□□□ -1.96
SMYD3-215ENST00000490322 TPGS2Q68CL5 300 aa2.83□□□□□ -1.96
SMYD3-215ENST00000490322 SLC8B1Q6J4K2 584 aa2.83□□□□□ -1.96
SMYD3-215ENST00000490322 ARMC6Q6NXE6 501 aa2.83□□□□□ -1.96
SMYD3-215ENST00000490322 CASC4Q6P4E1 433 aa2.83□□□□□ -1.96
SMYD3-215ENST00000490322 TMEM88Q6PEY1 159 aa2.83□□□□□ -1.96
SMYD3-215ENST00000490322 NCEH1Q6PIU2 408 aa2.83□□□□□ -1.96
SMYD3-215ENST00000490322 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP2.83□□□□□ -1.96
SMYD3-215ENST00000490322 PRSS55Q6UWB4 352 aaPredicted RBP2.83□□□□□ -1.96
SMYD3-215ENST00000490322 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP2.83□□□□□ -1.964e-6■□□□□ 8.6
SMYD3-215ENST00000490322 C3orf62Q6ZUJ4 267 aa2.83□□□□□ -1.96
SMYD3-215ENST00000490322 MICALCLQ6ZW33 695 aa2.83□□□□□ -1.96
SMYD3-215ENST00000490322 IKBIPQ70UQ0 350 aa2.83□□□□□ -1.96
SMYD3-215ENST00000490322 ZNF534Q76KX8 674 aa2.83□□□□□ -1.96
SMYD3-215ENST00000490322 PID1Q7Z2X4 250 aa2.83□□□□□ -1.96
SMYD3-215ENST00000490322 KDELC2Q7Z4H8 507 aa2.83□□□□□ -1.96
SMYD3-215ENST00000490322 TAX1BP1Q86VP1 789 aa2.83□□□□□ -1.96
SMYD3-215ENST00000490322 CAND1Q86VP6 1230 aaKnown RBP2.83□□□□□ -1.96
SMYD3-215ENST00000490322 CTAGE3PQ8IX95 158 aa2.83□□□□□ -1.96
SMYD3-215ENST00000490322 IZUMO1Q8IYV9 350 aa2.83□□□□□ -1.96
SMYD3-215ENST00000490322 OR4N4Q8N0Y3 316 aa2.83□□□□□ -1.96
SMYD3-215ENST00000490322 CNPY4Q8N129 248 aa2.83□□□□□ -1.96
SMYD3-215ENST00000490322 ZNF567Q8N184 647 aa2.83□□□□□ -1.96
SMYD3-215ENST00000490322 CARFQ8N187 725 aa2.83□□□□□ -1.96
SMYD3-215ENST00000490322 TTC30BQ8N4P2 665 aa2.83□□□□□ -1.96
SMYD3-215ENST00000490322 ATPAF2Q8N5M1 289 aa2.83□□□□□ -1.96
SMYD3-215ENST00000490322 TTC9BQ8N6N2 239 aa2.83□□□□□ -1.96
SMYD3-215ENST00000490322 NPWQ8N729 165 aa2.83□□□□□ -1.96
SMYD3-215ENST00000490322 DDX51Q8N8A6 666 aaKnown RBP eCLIP2.83□□□□□ -1.96
SMYD3-215ENST00000490322 RTL3Q8N8U3 475 aaKnown RBP2.83□□□□□ -1.96
SMYD3-215ENST00000490322 POMGNT2Q8NAT1 580 aa2.83□□□□□ -1.96
SMYD3-215ENST00000490322 ATAD1Q8NBU5 361 aa2.83□□□□□ -1.96
SMYD3-215ENST00000490322 ADPRHL1Q8NDY3 354 aa2.83□□□□□ -1.96
SMYD3-215ENST00000490322 STKLD1Q8NE28 680 aa2.83□□□□□ -1.96
SMYD3-215ENST00000490322 TOR1AIP2Q8NFQ8 470 aa2.83□□□□□ -1.96
SMYD3-215ENST00000490322 OR56A1Q8NGH5 318 aa2.83□□□□□ -1.96
SMYD3-215ENST00000490322 GSDMBQ8TAX9 411 aa2.83□□□□□ -1.96
SMYD3-215ENST00000490322 MGARPQ8TDB4 240 aa2.83□□□□□ -1.96
SMYD3-215ENST00000490322 DEPDC1BQ8WUY9 529 aa2.83□□□□□ -1.96
SMYD3-215ENST00000490322 DCAKDQ8WVC6 231 aa2.83□□□□□ -1.96
SMYD3-215ENST00000490322 SLC44A1Q8WWI5 657 aa2.83□□□□□ -1.96
SMYD3-215ENST00000490322 CDKL2Q92772 493 aa2.83□□□□□ -1.96
SMYD3-215ENST00000490322 NELL1Q92832 810 aa2.83□□□□□ -1.96
SMYD3-215ENST00000490322 ARRDC3Q96B67 414 aa2.83□□□□□ -1.96
SMYD3-215ENST00000490322 FAM136AQ96C01 138 aa2.83□□□□□ -1.96
SMYD3-215ENST00000490322 KLHL29Q96CT2 875 aa2.83□□□□□ -1.96
SMYD3-215ENST00000490322 MBD6Q96DN6 1003 aa2.83□□□□□ -1.96
SMYD3-215ENST00000490322 RSPRY1Q96DX4 576 aa2.83□□□□□ -1.96
SMYD3-215ENST00000490322 STAMBPL1Q96FJ0 436 aa2.83□□□□□ -1.96
SMYD3-215ENST00000490322 MARS2Q96GW9 593 aaKnown RBP2.83□□□□□ -1.96
SMYD3-215ENST00000490322 IGSF21Q96ID5 467 aa2.83□□□□□ -1.96
SMYD3-215ENST00000490322 ZNF333Q96JL9 665 aa2.83□□□□□ -1.96
SMYD3-215ENST00000490322 BTN2A3PQ96KV6 586 aa2.83□□□□□ -1.96
SMYD3-215ENST00000490322 CEP295NLQ96MC4 621 aa2.83□□□□□ -1.96
SMYD3-215ENST00000490322 ZNF558Q96NG5 402 aa2.83□□□□□ -1.96
SMYD3-215ENST00000490322 TSGA13Q96PP4 275 aa2.83□□□□□ -1.96
SMYD3-215ENST00000490322 PPP1R2P1Q96PQ5 205 aa2.83□□□□□ -1.96
SMYD3-215ENST00000490322 LENG8Q96PV6 779 aaPredicted RBP2.83□□□□□ -1.96
SMYD3-215ENST00000490322 SMC6Q96SB8 1091 aa2.83□□□□□ -1.96
SMYD3-215ENST00000490322 DCLRE1CQ96SD1 692 aaKnown RBP2.83□□□□□ -1.96
SMYD3-215ENST00000490322 CDK5RAP1Q96SZ6 601 aaKnown RBP2.83□□□□□ -1.96
SMYD3-215ENST00000490322 EBNA1BP2Q99848 306 aaKnown RBP2.83□□□□□ -1.96
SMYD3-215ENST00000490322 WDR83Q9BRX9 315 aaKnown RBP2.83□□□□□ -1.96
SMYD3-215ENST00000490322 NAT9Q9BTE0 207 aa2.83□□□□□ -1.96
SMYD3-215ENST00000490322 MECRQ9BV79 373 aa2.83□□□□□ -1.96
SMYD3-215ENST00000490322 HERC2P3Q9BVR0 1158 aa2.83□□□□□ -1.96
SMYD3-215ENST00000490322 PHF7Q9BWX1 381 aaPredicted RBP2.83□□□□□ -1.96
SMYD3-215ENST00000490322 TEX12Q9BXU0 123 aa2.83□□□□□ -1.96
SMYD3-215ENST00000490322 ZYG11BQ9C0D3 744 aa2.83□□□□□ -1.96
SMYD3-215ENST00000490322 FAM107BQ9H098 131 aa2.83□□□□□ -1.96
SMYD3-215ENST00000490322 GBA3Q9H227 469 aa2.83□□□□□ -1.96
SMYD3-215ENST00000490322 TRABDQ9H4I3 376 aa2.83□□□□□ -1.96
SMYD3-215ENST00000490322 C11orf49Q9H6J7 331 aa2.83□□□□□ -1.96
SMYD3-215ENST00000490322 CWH43Q9H720 699 aa2.83□□□□□ -1.96
SMYD3-215ENST00000490322 LRRC40Q9H9A6 602 aa2.83□□□□□ -1.96
SMYD3-215ENST00000490322 ERVMER34-1Q9H9K5 563 aa2.83□□□□□ -1.96
SMYD3-215ENST00000490322 ARHGEF3Q9NR81 526 aa2.83□□□□□ -1.96
SMYD3-215ENST00000490322 MTPAPQ9NVV4 582 aaKnown RBP eCLIP2.83□□□□□ -1.96
SMYD3-215ENST00000490322 OSER1Q9NX31 292 aa2.83□□□□□ -1.96
SMYD3-215ENST00000490322 EURLQ9NYK6 297 aa2.83□□□□□ -1.96
SMYD3-215ENST00000490322 DONSONQ9NYP3 566 aa2.83□□□□□ -1.96
SMYD3-215ENST00000490322 IL37Q9NZH6 218 aa2.83□□□□□ -1.96
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.2 ms