RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489475.5

HOXB3-210, Transcript of homeobox B3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HOXB3, Length 1,845 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3-210ENST00000489475 ABRAXAS2Q15018 415 aa25.99■■□□□ 1.75
HOXB3-210ENST00000489475 XKR6Q5GH73 641 aa25.99■■□□□ 1.75
HOXB3-210ENST00000489475 LIPJQ5W064 366 aa25.99■■□□□ 1.75
HOXB3-210ENST00000489475 SLC36A4Q6YBV0 504 aa25.99■■□□□ 1.75
HOXB3-210ENST00000489475 RAB42Q8N4Z0 105 aa25.99■■□□□ 1.75
HOXB3-210ENST00000489475 MVB12BQ9H7P6 319 aa25.99■■□□□ 1.75
HOXB3-210ENST00000489475 GPRC5BQ9NZH0 403 aa25.99■■□□□ 1.75
HOXB3-210ENST00000489475 SNX6Q9UNH7 406 aa25.99■■□□□ 1.75
HOXB3-210ENST00000489475 ZNF839A8K0R7 811 aa25.98■■□□□ 1.75
HOXB3-210ENST00000489475 MANBAO00462 879 aa25.98■■□□□ 1.75
HOXB3-210ENST00000489475 GNAZP19086 355 aa25.98■■□□□ 1.75
HOXB3-210ENST00000489475 AK4P27144 223 aaPredicted RBP25.98■■□□□ 1.75
HOXB3-210ENST00000489475 ACTR1BP42025 376 aa25.98■■□□□ 1.75
HOXB3-210ENST00000489475 CORO7P57737 925 aa25.98■■□□□ 1.75
HOXB3-210ENST00000489475 ACTR1AP61163 376 aa25.98■■□□□ 1.75
HOXB3-210ENST00000489475 TCEA2Q15560 299 aa25.98■■□□□ 1.75
HOXB3-210ENST00000489475 MAMSTRQ6ZN01 415 aa25.98■■□□□ 1.75
HOXB3-210ENST00000489475 RNF165Q6ZSG1 346 aa25.98■■□□□ 1.75
HOXB3-210ENST00000489475 LRRC56Q8IYG6 542 aaPredicted RBP25.98■■□□□ 1.75
HOXB3-210ENST00000489475 KLHL29Q96CT2 875 aa25.98■■□□□ 1.75
HOXB3-210ENST00000489475 CMTM5Q96DZ9 223 aa25.98■■□□□ 1.75
HOXB3-210ENST00000489475 IL17FQ96PD4 163 aa25.98■■□□□ 1.75
HOXB3-210ENST00000489475 MIPEPQ99797 713 aa25.98■■□□□ 1.75
HOXB3-210ENST00000489475 GPR27Q9NS67 375 aa25.98■■□□□ 1.75
HOXB3-210ENST00000489475 SPATA7Q9P0W8 599 aa25.98■■□□□ 1.75
HOXB3-210ENST00000489475 TBC1D29Q9UFV1 150 aa25.98■■□□□ 1.75
HOXB3-210ENST00000489475 HEBP2Q9Y5Z4 205 aa25.98■■□□□ 1.75
HOXB3-210ENST00000489475 OR52A4PA6NMU1 304 aa25.98■■□□□ 1.75
HOXB3-210ENST00000489475 MAP3K13O43283 966 aa25.98■■□□□ 1.75
HOXB3-210ENST00000489475 PI15O43692 258 aa25.98■■□□□ 1.75
HOXB3-210ENST00000489475 PEX11AO75192 247 aa25.98■■□□□ 1.75
HOXB3-210ENST00000489475 WFS1O76024 890 aa25.98■■□□□ 1.75
HOXB3-210ENST00000489475 SIGLEC14Q08ET2 396 aa25.98■■□□□ 1.75
HOXB3-210ENST00000489475 FASTKQ14296 549 aaKnown RBP25.98■■□□□ 1.75
HOXB3-210ENST00000489475 WASH2PQ6VEQ5 465 aa25.98■■□□□ 1.75
HOXB3-210ENST00000489475 HBEGFQ99075 208 aa25.98■■□□□ 1.75
HOXB3-210ENST00000489475 WASH6PQ9NQA3 447 aa25.98■■□□□ 1.75
HOXB3-210ENST00000489475 GIMAP2Q9UG22 337 aa25.98■■□□□ 1.75
HOXB3-210ENST00000489475 ZNF490Q9ULM2 529 aaPredicted RBP25.98■■□□□ 1.75
HOXB3-210ENST00000489475 DYRK1BQ9Y463 629 aa25.98■■□□□ 1.75
HOXB3-210ENST00000489475 KCNE1BA0A087WTH5 132 aa25.97■■□□□ 1.75
HOXB3-210ENST00000489475 MEI4A8MW99 385 aa25.97■■□□□ 1.75
HOXB3-210ENST00000489475 E7EQ34 232 aa25.97■■□□□ 1.75
HOXB3-210ENST00000489475 PRAMEF4O60810 478 aa25.97■■□□□ 1.75
HOXB3-210ENST00000489475 ERGP11308 486 aa25.97■■□□□ 1.75
HOXB3-210ENST00000489475 PCDH1Q08174 1060 aa25.97■■□□□ 1.75
HOXB3-210ENST00000489475 ILF3Q12906 894 aaKnown RBP eCLIP25.97■■□□□ 1.75
HOXB3-210ENST00000489475 SQLEQ14534 574 aa25.97■■□□□ 1.75
HOXB3-210ENST00000489475 RPE65Q16518 533 aa25.97■■□□□ 1.75
HOXB3-210ENST00000489475 SGO1Q5FBB7 561 aa25.97■■□□□ 1.75
HOXB3-210ENST00000489475 THEMIS2Q5TEJ8 643 aa25.97■■□□□ 1.75
HOXB3-210ENST00000489475 PRAMEF9Q5VWM5 478 aa25.97■■□□□ 1.75
HOXB3-210ENST00000489475 SLC30A9Q6PML9 568 aa25.97■■□□□ 1.75
HOXB3-210ENST00000489475 SUSD1Q6UWL2 747 aa25.97■■□□□ 1.75
HOXB3-210ENST00000489475 ABRAXAS1Q6UWZ7 409 aa25.97■■□□□ 1.75
HOXB3-210ENST00000489475 DCP2Q8IU60 420 aaKnown RBP25.97■■□□□ 1.75
HOXB3-210ENST00000489475 RGL4Q8IZJ4 473 aa25.97■■□□□ 1.75
HOXB3-210ENST00000489475 OR2T11Q8NH01 316 aa25.97■■□□□ 1.75
HOXB3-210ENST00000489475 CAMK1GQ96NX5 476 aa25.97■■□□□ 1.75
HOXB3-210ENST00000489475 ELOVL6Q9H5J4 265 aa25.97■■□□□ 1.75
HOXB3-210ENST00000489475 DLGAP2Q9P1A6 1054 aa25.97■■□□□ 1.75
HOXB3-210ENST00000489475 SLCO1B1Q9Y6L6 691 aa25.97■■□□□ 1.75
HOXB3-210ENST00000489475 MTHFD1P11586 935 aaKnown RBP25.96■■□□□ 1.75
HOXB3-210ENST00000489475 JUPP14923 745 aa25.96■■□□□ 1.75
HOXB3-210ENST00000489475 NPPBP16860 134 aa25.96■■□□□ 1.75
HOXB3-210ENST00000489475 FZD2Q14332 565 aa25.96■■□□□ 1.75
HOXB3-210ENST00000489475 NAA25Q14CX7 972 aa25.96■■□□□ 1.75
HOXB3-210ENST00000489475 ZRSR2Q15696 482 aaKnown RBP25.96■■□□□ 1.75
HOXB3-210ENST00000489475 CYP2A13Q16696 494 aa25.96■■□□□ 1.75
HOXB3-210ENST00000489475 ATP6AP1LQ52LC2 224 aa25.96■■□□□ 1.75
HOXB3-210ENST00000489475 OGFOD2Q6N063 350 aa25.96■■□□□ 1.75
HOXB3-210ENST00000489475 SPATA19Q7Z5L4 167 aa25.96■■□□□ 1.75
HOXB3-210ENST00000489475 CCL4L1Q8NHW4 92 aa25.96■■□□□ 1.75
HOXB3-210ENST00000489475 SETD7Q8WTS6 366 aaKnown RBP25.96■■□□□ 1.75
HOXB3-210ENST00000489475 USP7Q93009 1102 aa25.96■■□□□ 1.75
HOXB3-210ENST00000489475 PCOLCE2Q9UKZ9 415 aa25.96■■□□□ 1.75
HOXB3-210ENST00000489475 SLC28A1O00337 649 aa25.95■■□□□ 1.75
HOXB3-210ENST00000489475 RGS14O43566 566 aa25.95■■□□□ 1.75
HOXB3-210ENST00000489475 DNAJC8O75937 253 aaPredicted RBP25.95■■□□□ 1.75
HOXB3-210ENST00000489475 PRR35P0CG20 571 aa25.95■■□□□ 1.75
HOXB3-210ENST00000489475 PIK3R1P27986 724 aa25.95■■□□□ 1.75
HOXB3-210ENST00000489475 PRDX6P30041 224 aa25.95■■□□□ 1.75
HOXB3-210ENST00000489475 MNAT1P51948 309 aa25.95■■□□□ 1.75
HOXB3-210ENST00000489475 STX1BP61266 288 aa25.95■■□□□ 1.75
HOXB3-210ENST00000489475 EIF2B5Q13144 721 aaKnown RBP25.95■■□□□ 1.75
HOXB3-210ENST00000489475 DOC2AQ14183 400 aa25.95■■□□□ 1.75
HOXB3-210ENST00000489475 CWF19L1Q69YN2 538 aaKnown RBP25.95■■□□□ 1.75
HOXB3-210ENST00000489475 Q6ZSR9 355 aa25.95■■□□□ 1.75
HOXB3-210ENST00000489475 LMNTD1Q8N9Z9 388 aa25.95■■□□□ 1.75
HOXB3-210ENST00000489475 MFSD2AQ8NA29 543 aa25.95■■□□□ 1.75
HOXB3-210ENST00000489475 NEIL2Q969S2 332 aa25.95■■□□□ 1.75
HOXB3-210ENST00000489475 SLC7A6OSQ96CW6 309 aaPredicted RBP25.95■■□□□ 1.75
HOXB3-210ENST00000489475 LRMDAQ9H2I8 198 aa25.95■■□□□ 1.75
HOXB3-210ENST00000489475 FARSBQ9NSD9 589 aaKnown RBP25.95■■□□□ 1.75
HOXB3-210ENST00000489475 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP25.95■■□□□ 1.75
HOXB3-210ENST00000489475 COLEC10Q9Y6Z7 277 aa25.95■■□□□ 1.75
HOXB3-210ENST00000489475 PDGFBP01127 241 aaPredicted RBP25.95■■□□□ 1.74
HOXB3-210ENST00000489475 HNF4AP41235 474 aa25.95■■□□□ 1.74
HOXB3-210ENST00000489475 NR6A1Q15406 480 aa25.95■■□□□ 1.74
HOXB3-210ENST00000489475 ASRGL1Q7L266 308 aa25.95■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 64.8 ms