RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486357.1

APOBEC3G-206, Transcript of apolipoprotein B mRNA editing enzyme catalytic subunit 3G, humanhuman

TSL 4

Gene APOBEC3G, Length 543 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3G-206ENST00000486357 DCAF7P61962 342 aa7□□□□□ -1.29
APOBEC3G-206ENST00000486357 POLR2LP62875 67 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
APOBEC3G-206ENST00000486357 VAMP2P63027 116 aa7□□□□□ -1.29
APOBEC3G-206ENST00000486357 BCL2L1Q07817 233 aa7□□□□□ -1.29
APOBEC3G-206ENST00000486357 ABHD18Q0P651 414 aa7□□□□□ -1.29
APOBEC3G-206ENST00000486357 ERV3-1Q14264 604 aa7□□□□□ -1.29
APOBEC3G-206ENST00000486357 CYTH1Q15438 398 aa7□□□□□ -1.29
APOBEC3G-206ENST00000486357 CCDC14Q49A88 953 aa7□□□□□ -1.29
APOBEC3G-206ENST00000486357 PRR31Q5SQ13 230 aa7□□□□□ -1.29
APOBEC3G-206ENST00000486357 ARTNQ5T4W7 220 aa7□□□□□ -1.29
APOBEC3G-206ENST00000486357 MANEALQ5VSG8 457 aa7□□□□□ -1.29
APOBEC3G-206ENST00000486357 PLAG1Q6DJT9 500 aa7□□□□□ -1.29
APOBEC3G-206ENST00000486357 DOK6Q6PKX4 331 aa7□□□□□ -1.29
APOBEC3G-206ENST00000486357 SLFN11Q7Z7L1 901 aa7□□□□□ -1.29
APOBEC3G-206ENST00000486357 KRT73Q86Y46 540 aa7□□□□□ -1.29
APOBEC3G-206ENST00000486357 NRROSQ86YC3 692 aa7□□□□□ -1.29
APOBEC3G-206ENST00000486357 SLC44A2Q8IWA5 706 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
APOBEC3G-206ENST00000486357 CCDC13Q8IYE1 715 aa7□□□□□ -1.29
APOBEC3G-206ENST00000486357 FAM71AQ8IYT1 594 aa7□□□□□ -1.29
APOBEC3G-206ENST00000486357 CCDC185Q8N715 623 aa7□□□□□ -1.29
APOBEC3G-206ENST00000486357 RTL3Q8N8U3 475 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
APOBEC3G-206ENST00000486357 SLC35B2Q8TB61 432 aa7□□□□□ -1.29
APOBEC3G-206ENST00000486357 SSC4DQ8WTU2 575 aa7□□□□□ -1.29
APOBEC3G-206ENST00000486357 PDCD6IPQ8WUM4 868 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
APOBEC3G-206ENST00000486357 NCSTNQ92542 709 aa7□□□□□ -1.29
APOBEC3G-206ENST00000486357 VOPP1Q96AW1 172 aa7□□□□□ -1.29
APOBEC3G-206ENST00000486357 RNF31Q96EP0 1072 aa7□□□□□ -1.29
APOBEC3G-206ENST00000486357 TIGD1Q96MW7 591 aa7□□□□□ -1.29
APOBEC3G-206ENST00000486357 MRI1Q9BV20 369 aa7□□□□□ -1.29
APOBEC3G-206ENST00000486357 TINAGL1Q9GZM7 467 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
APOBEC3G-206ENST00000486357 MS4A7Q9GZW8 240 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
APOBEC3G-206ENST00000486357 TP63Q9H3D4 680 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
APOBEC3G-206ENST00000486357 ZNF552Q9H707 407 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
APOBEC3G-206ENST00000486357 CATSPERBQ9H7T0 1116 aa7□□□□□ -1.29
APOBEC3G-206ENST00000486357 TRNAU1APQ9NX07 287 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
APOBEC3G-206ENST00000486357 XPR1Q9UBH6 696 aa7□□□□□ -1.29
APOBEC3G-206ENST00000486357 LHX3Q9UBR4 397 aa7□□□□□ -1.29
APOBEC3G-206ENST00000486357 SUFUQ9UMX1 484 aa7□□□□□ -1.29
APOBEC3G-206ENST00000486357 KCTD3Q9Y597 815 aa7□□□□□ -1.29
APOBEC3G-206ENST00000486357 BOD1L1Q8NFC6 3051 aa6.99□□□□□ -1.29
APOBEC3G-206ENST00000486357 SPTAN1Q13813 2472 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
APOBEC3G-206ENST00000486357 TSPAN11A1L157 253 aa6.99□□□□□ -1.29
APOBEC3G-206ENST00000486357 GTPBP10A4D1E9 387 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
APOBEC3G-206ENST00000486357 ZNF785A8K8V0 405 aa6.99□□□□□ -1.29
APOBEC3G-206ENST00000486357 CXorf49A8MYA2 514 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
APOBEC3G-206ENST00000486357 J3KR12 359 aa6.99□□□□□ -1.29
APOBEC3G-206ENST00000486357 K7EM74 188 aa6.99□□□□□ -1.29
APOBEC3G-206ENST00000486357 RAB27BO00194 218 aa6.99□□□□□ -1.29
APOBEC3G-206ENST00000486357 POLR1CO15160 346 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
APOBEC3G-206ENST00000486357 INPP4BO15327 924 aa6.99□□□□□ -1.29
APOBEC3G-206ENST00000486357 LSM8O95777 96 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
APOBEC3G-206ENST00000486357 TK1P04183 234 aa6.99□□□□□ -1.29
APOBEC3G-206ENST00000486357 VSIG10L2P0DP72 767 aa6.99□□□□□ -1.29
APOBEC3G-206ENST00000486357 FDXRP22570 491 aa6.99□□□□□ -1.29
APOBEC3G-206ENST00000486357 CSF2RBP32927 897 aa6.99□□□□□ -1.29
APOBEC3G-206ENST00000486357 CDH5P33151 784 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
APOBEC3G-206ENST00000486357 TRIM23P36406 574 aa6.99□□□□□ -1.29
APOBEC3G-206ENST00000486357 DLSTP36957 453 aa6.99□□□□□ -1.29
APOBEC3G-206ENST00000486357 POLD2P49005 469 aa6.99□□□□□ -1.29
APOBEC3G-206ENST00000486357 ZNF135P52742 658 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
APOBEC3G-206ENST00000486357 PTTG1IPP53801 180 aa6.99□□□□□ -1.29
APOBEC3G-206ENST00000486357 MC2RQ01718 297 aa6.99□□□□□ -1.29
APOBEC3G-206ENST00000486357 FOXM1Q08050 763 aa6.99□□□□□ -1.29
APOBEC3G-206ENST00000486357 RALGDSQ12967 914 aa6.99□□□□□ -1.29
APOBEC3G-206ENST00000486357 NFATC2Q13469 925 aa6.99□□□□□ -1.29
APOBEC3G-206ENST00000486357 SLC29A2Q14542 456 aa6.99□□□□□ -1.29
APOBEC3G-206ENST00000486357 PARP15Q460N3 678 aa6.99□□□□□ -1.29
APOBEC3G-206ENST00000486357 EEF1AKMT2Q5JPI9 291 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
APOBEC3G-206ENST00000486357 ICE2Q659A1 982 aa6.99□□□□□ -1.29
APOBEC3G-206ENST00000486357 RAET1GQ6H3X3 334 aa6.99□□□□□ -1.29
APOBEC3G-206ENST00000486357 TCTN3Q6NUS6 607 aa6.99□□□□□ -1.29
APOBEC3G-206ENST00000486357 MARK2Q7KZI7 788 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
APOBEC3G-206ENST00000486357 TIPARPQ7Z3E1 657 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
APOBEC3G-206ENST00000486357 BNIPLQ7Z465 357 aa6.99□□□□□ -1.29
APOBEC3G-206ENST00000486357 C17orf82Q86X59 251 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
APOBEC3G-206ENST00000486357 ZSWIM9Q86XI8 627 aa6.99□□□□□ -1.29
APOBEC3G-206ENST00000486357 FAM114A1Q8IWE2 563 aa6.99□□□□□ -1.29
APOBEC3G-206ENST00000486357 NAGSQ8N159 534 aa6.99□□□□□ -1.29
APOBEC3G-206ENST00000486357 OR8H2Q8N162 312 aa6.99□□□□□ -1.29
APOBEC3G-206ENST00000486357 PYROXD2Q8N2H3 581 aa6.99□□□□□ -1.29
APOBEC3G-206ENST00000486357 PELI3Q8N2H9 469 aa6.99□□□□□ -1.29
APOBEC3G-206ENST00000486357 NUDT10Q8NFP7 164 aa6.99□□□□□ -1.29
APOBEC3G-206ENST00000486357 CPT1CQ8TCG5 803 aa6.99□□□□□ -1.29
APOBEC3G-206ENST00000486357 FAM172AQ8WUF8 416 aa6.99□□□□□ -1.29
APOBEC3G-206ENST00000486357 SLC7A6OSQ96CW6 309 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
APOBEC3G-206ENST00000486357 NUS1Q96E22 293 aa6.99□□□□□ -1.29
APOBEC3G-206ENST00000486357 NEIL1Q96FI4 390 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
APOBEC3G-206ENST00000486357 NUDT11Q96G61 164 aa6.99□□□□□ -1.29
APOBEC3G-206ENST00000486357 RSRC1Q96IZ7 334 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
APOBEC3G-206ENST00000486357 KIRREL1Q96J84 757 aa6.99□□□□□ -1.29
APOBEC3G-206ENST00000486357 CELF6Q96J87 481 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
APOBEC3G-206ENST00000486357 C11orf70Q9BRQ4 267 aa6.99□□□□□ -1.29
APOBEC3G-206ENST00000486357 ZPBPQ9BS86 351 aa6.99□□□□□ -1.29
APOBEC3G-206ENST00000486357 SPATA5L1Q9BVQ7 753 aa6.99□□□□□ -1.29
APOBEC3G-206ENST00000486357 CINPQ9BW66 212 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
APOBEC3G-206ENST00000486357 STN1Q9H668 368 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
APOBEC3G-206ENST00000486357 APMAPQ9HDC9 416 aa6.99□□□□□ -1.29
APOBEC3G-206ENST00000486357 MRPS18AQ9NVS2 196 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
APOBEC3G-206ENST00000486357 MRPS18BQ9Y676 258 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
APOBEC3G-206ENST00000486357 UBR5O95071 2799 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.2 ms