RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486161.5

PTPRD-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRD, Length 5,039 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-211ENST00000486161 SPATA5L1Q9BVQ7 753 aa8.06□□□□□ -1.12
PTPRD-211ENST00000486161 ANKHQ9HCJ1 492 aa8.06□□□□□ -1.12
PTPRD-211ENST00000486161 C6orf203Q9P0P8 240 aaPredicted RBP8.06□□□□□ -1.12
PTPRD-211ENST00000486161 MTCH2Q9Y6C9 303 aa8.06□□□□□ -1.12
PTPRD-211ENST00000486161 DGKBQ9Y6T7 804 aa8.06□□□□□ -1.12
PTPRD-211ENST00000486161 HNRNPRO43390 633 aaKnown RBP8.06□□□□□ -1.12
PTPRD-211ENST00000486161 MBTPS2O43462 519 aa8.06□□□□□ -1.12
PTPRD-211ENST00000486161 TOP3BO95985 862 aaKnown RBP8.06□□□□□ -1.12
PTPRD-211ENST00000486161 CR2P20023 1033 aa8.06□□□□□ -1.12
PTPRD-211ENST00000486161 RRM2P31350 389 aa8.06□□□□□ -1.12
PTPRD-211ENST00000486161 CCT8P50990 548 aa8.06□□□□□ -1.12
PTPRD-211ENST00000486161 FCHO2Q0JRZ9 810 aa8.06□□□□□ -1.12
PTPRD-211ENST00000486161 C9orf64Q5T6V5 341 aa8.06□□□□□ -1.12
PTPRD-211ENST00000486161 ABHD13Q7L211 337 aa8.06□□□□□ -1.12
PTPRD-211ENST00000486161 TMEM150AQ86TG1 271 aa8.06□□□□□ -1.12
PTPRD-211ENST00000486161 DENND6BQ8NEG7 585 aa8.06□□□□□ -1.12
PTPRD-211ENST00000486161 DDHD1Q8NEL9 900 aa8.06□□□□□ -1.12
PTPRD-211ENST00000486161 METTL21AQ8WXB1 218 aa8.06□□□□□ -1.12
PTPRD-211ENST00000486161 RGMAQ96B86 450 aa8.06□□□□□ -1.12
PTPRD-211ENST00000486161 PTCD3Q96EY7 689 aaKnown RBP8.06□□□□□ -1.12
PTPRD-211ENST00000486161 ZNF382Q96SR6 550 aa8.06□□□□□ -1.12
PTPRD-211ENST00000486161 RTKNQ9BST9 563 aa8.06□□□□□ -1.12
PTPRD-211ENST00000486161 ZNF232Q9UNY5 417 aa8.06□□□□□ -1.12
PTPRD-211ENST00000486161 OR10H1Q9Y4A9 318 aa8.06□□□□□ -1.12
PTPRD-211ENST00000486161 OAS3Q9Y6K5 1087 aaKnown RBP8.06□□□□□ -1.12
PTPRD-211ENST00000486161 GON4LQ3T8J9 2241 aa8.06□□□□□ -1.12
PTPRD-211ENST00000486161 VARSP26640 1264 aaKnown RBP8.06□□□□□ -1.12
PTPRD-211ENST00000486161 SRP54P61011 504 aaKnown RBP8.06□□□□□ -1.12
PTPRD-211ENST00000486161 SRSF11Q05519 484 aaKnown RBP8.06□□□□□ -1.12
PTPRD-211ENST00000486161 TMEM52BQ4KMG9 183 aa8.06□□□□□ -1.12
PTPRD-211ENST00000486161 ZNF542PQ5EBM4 170 aa8.06□□□□□ -1.12
PTPRD-211ENST00000486161 ZNF789Q5FWF6 425 aa8.06□□□□□ -1.12
PTPRD-211ENST00000486161 SUSD1Q6UWL2 747 aa8.06□□□□□ -1.12
PTPRD-211ENST00000486161 GCNT7Q6ZNI0 430 aa8.06□□□□□ -1.12
PTPRD-211ENST00000486161 BNIPLQ7Z465 357 aa8.06□□□□□ -1.12
PTPRD-211ENST00000486161 LIX1Q8N485 282 aa8.06□□□□□ -1.12
PTPRD-211ENST00000486161 CD200R1Q8TD46 325 aa8.06□□□□□ -1.12
PTPRD-211ENST00000486161 CLIP3Q96DZ5 547 aa8.06□□□□□ -1.12
PTPRD-211ENST00000486161 SMIM14Q96QK8 99 aa8.06□□□□□ -1.12
PTPRD-211ENST00000486161 CDX2Q99626 313 aaPredicted RBP8.06□□□□□ -1.12
PTPRD-211ENST00000486161 DCLRE1BQ9H816 532 aa8.06□□□□□ -1.12
PTPRD-211ENST00000486161 ATXN10Q9UBB4 475 aa8.06□□□□□ -1.12
PTPRD-211ENST00000486161 ANGPT4Q9Y264 503 aa8.06□□□□□ -1.12
PTPRD-211ENST00000486161 A0A0J9YVX5 310 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRD-211ENST00000486161 H7C0S8 307 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRD-211ENST00000486161 I6L893 689 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
PTPRD-211ENST00000486161 SLC22A2O15244 555 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRD-211ENST00000486161 TYRP1P17643 537 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRD-211ENST00000486161 CD38P28907 300 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRD-211ENST00000486161 SLC25A3Q00325 362 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRD-211ENST00000486161 CDKL4Q5MAI5 379 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRD-211ENST00000486161 TCHHL1Q5QJ38 904 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
PTPRD-211ENST00000486161 C16orf62Q7Z3J2 963 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRD-211ENST00000486161 OR4A15Q8NGL6 344 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRD-211ENST00000486161 DENND1AQ8TEH3 1009 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRD-211ENST00000486161 PROX1Q92786 737 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRD-211ENST00000486161 SLC12A9Q9BXP2 914 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRD-211ENST00000486161 DNAAF2Q9NVR5 837 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
PTPRD-211ENST00000486161 PLAGL1Q9UM63 463 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRD-211ENST00000486161 PRPF19Q9UMS4 504 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
PTPRD-211ENST00000486161 TMED5Q9Y3A6 229 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRD-211ENST00000486161 SNX13Q9Y5W8 968 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRD-211ENST00000486161 SDK1Q7Z5N4 2213 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRD-211ENST00000486161 ITM2AO43736 263 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRD-211ENST00000486161 PCDH7O60245 1069 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRD-211ENST00000486161 IL6P05231 212 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRD-211ENST00000486161 POLR2CP19387 275 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
PTPRD-211ENST00000486161 CLDN2P57739 230 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRD-211ENST00000486161 CYP4F3Q08477 520 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRD-211ENST00000486161 NFATC4Q14934 902 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRD-211ENST00000486161 RFTN2Q52LD8 501 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
PTPRD-211ENST00000486161 TBCELQ5QJ74 424 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRD-211ENST00000486161 WASHC2DQ5SRD0 308 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRD-211ENST00000486161 TMEM164Q5U3C3 297 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRD-211ENST00000486161 LIPJQ5W064 366 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRD-211ENST00000486161 NEK10Q6ZWH5 1172 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRD-211ENST00000486161 AMIGO1Q86WK6 493 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRD-211ENST00000486161 CDH22Q9UJ99 828 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRD-211ENST00000486161 FBXW2Q9UKT8 454 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRD-211ENST00000486161 MANBAO00462 879 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRD-211ENST00000486161 ZSCAN9O15535 394 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
PTPRD-211ENST00000486161 CYP7B1O75881 506 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRD-211ENST00000486161 PDE5AO76074 875 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRD-211ENST00000486161 TGFB1P01137 390 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRD-211ENST00000486161 PRLP01236 227 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRD-211ENST00000486161 CPN2P22792 545 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRD-211ENST00000486161 ARCN1P48444 511 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
PTPRD-211ENST00000486161 RAB28P51157 221 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRD-211ENST00000486161 PTSQ03393 145 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRD-211ENST00000486161 BNIP2Q12982 314 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRD-211ENST00000486161 HTR4Q13639 388 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRD-211ENST00000486161 LRRC36Q1X8D7 754 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRD-211ENST00000486161 MINDY4Q4G0A6 757 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRD-211ENST00000486161 ZFP1Q6P2D0 407 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRD-211ENST00000486161 NATD1Q8N6N6 113 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRD-211ENST00000486161 NRBF2Q96F24 287 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRD-211ENST00000486161 PLEKHA8Q96JA3 519 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRD-211ENST00000486161 TRPV4Q9HBA0 871 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRD-211ENST00000486161 DDX18Q9NVP1 670 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
PTPRD-211ENST00000486161 CHCHD3Q9NX63 227 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.9 ms