RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000474025.1

SNRNP40-204, Transcript of small nuclear ribonucleoprotein U5 subunit 40, human

TSL 3

Gene SNRNP40, Length 581 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNRNP40-204	ENST00000474025	PBX1	P40424	430 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNRNP40-204	ENST00000474025	CDKN2B	P42772	138 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNRNP40-204	ENST00000474025	CDKN1C	P49918	316 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SNRNP40-204	ENST00000474025	ARSF	P54793	590 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNRNP40-204	ENST00000474025	ARG2	P78540	354 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNRNP40-204	ENST00000474025	ADORA2A-AS1	P86434	159 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNRNP40-204	ENST00000474025	FANCC	Q00597	558 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNRNP40-204	ENST00000474025	TYRO3	Q06418	890 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNRNP40-204	ENST00000474025	OLIG2	Q13516	323 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNRNP40-204	ENST00000474025	MESD	Q14696	234 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNRNP40-204	ENST00000474025	NR1I3	Q14994	352 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNRNP40-204	ENST00000474025	CDSN	Q15517	529 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNRNP40-204	ENST00000474025	RBBP7	Q16576	425 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNRNP40-204	ENST00000474025	TAZ	Q16635	292 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNRNP40-204	ENST00000474025	VWA2	Q5GFL6	755 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNRNP40-204	ENST00000474025	LRRC38	Q5VT99	294 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNRNP40-204	ENST00000474025	XKRX	Q6PP77	449 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNRNP40-204	ENST00000474025	CLEC17A	Q6ZS10	378 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNRNP40-204	ENST00000474025	MICALCL	Q6ZW33	695 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNRNP40-204	ENST00000474025	H2AFV	Q71UI9	128 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNRNP40-204	ENST00000474025	SNX20	Q7Z614	316 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNRNP40-204	ENST00000474025	CDH24	Q86UP0	819 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNRNP40-204	ENST00000474025	MCAT	Q8IVS2	390 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SNRNP40-204	ENST00000474025	TBC1D21	Q8IYX1	336 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNRNP40-204	ENST00000474025	DTWD1	Q8N5C7	304 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNRNP40-204	ENST00000474025	CLDN19	Q8N6F1	224 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNRNP40-204	ENST00000474025	OR1N1	Q8NGS0	311 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNRNP40-204	ENST00000474025	OR5K2	Q8NHB8	316 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNRNP40-204	ENST00000474025	HEXDC	Q8WVB3	486 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNRNP40-204	ENST00000474025	CPLX3	Q8WVH0	158 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNRNP40-204	ENST00000474025	ZDHHC19	Q8WVZ1	309 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SNRNP40-204	ENST00000474025	CTNNBL1	Q8WYA6	563 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SNRNP40-204	ENST00000474025	PSMF1	Q92530	271 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNRNP40-204	ENST00000474025	ZNF285	Q96NJ3	590 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNRNP40-204	ENST00000474025	QKI	Q96PU8	341 aa	Known RBP eCLIP	4.91	□□□□□ -1.62
SNRNP40-204	ENST00000474025	VAT1	Q99536	393 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNRNP40-204	ENST00000474025	BPIFA3	Q9BQP9	254 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNRNP40-204	ENST00000474025	FICD	Q9BVA6	458 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNRNP40-204	ENST00000474025	FSD1L	Q9BXM9	530 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNRNP40-204	ENST00000474025	MAK16	Q9BXY0	300 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SNRNP40-204	ENST00000474025	GBA3	Q9H227	469 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNRNP40-204	ENST00000474025	FAM96A	Q9H5X1	160 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNRNP40-204	ENST00000474025	ZNF160	Q9HCG1	818 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNRNP40-204	ENST00000474025	ENAM	Q9NRM1	1142 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNRNP40-204	ENST00000474025	SEMA3G	Q9NS98	782 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNRNP40-204	ENST00000474025	CUTC	Q9NTM9	273 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNRNP40-204	ENST00000474025	ZDHHC3	Q9NYG2	299 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNRNP40-204	ENST00000474025	ABI3	Q9P2A4	366 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNRNP40-204	ENST00000474025	NXT1	Q9UKK6	140 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SNRNP40-204	ENST00000474025	TRHDE	Q9UKU6	1024 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNRNP40-204	ENST00000474025	PLAGL1	Q9UM63	463 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNRNP40-204	ENST00000474025	ASF1A	Q9Y294	204 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNRNP40-204	ENST00000474025	AKAP6	Q13023	2319 aa		4.9	□□□□□ -1.62
SNRNP40-204	ENST00000474025	ZAN	Q9Y493	2812 aa		4.9	□□□□□ -1.62
SNRNP40-204	ENST00000474025		A0A1W2PQ72	361 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNRNP40-204	ENST00000474025	FAM221A	A4D161	298 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNRNP40-204	ENST00000474025	FITM1	A5D6W6	292 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNRNP40-204	ENST00000474025	CCL22	O00626	93 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNRNP40-204	ENST00000474025	LIN7A	O14910	233 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SNRNP40-204	ENST00000474025	CST8	O60676	142 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNRNP40-204	ENST00000474025	SLC19A2	O60779	497 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNRNP40-204	ENST00000474025	DIAPH2	O60879	1101 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNRNP40-204	ENST00000474025	WISP2	O76076	250 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNRNP40-204	ENST00000474025	MED26	O95402	600 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNRNP40-204	ENST00000474025	AP2A1	O95782	977 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNRNP40-204	ENST00000474025	GYPC	P04921	128 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNRNP40-204	ENST00000474025	GSTM1	P09488	218 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNRNP40-204	ENST00000474025	TMEM253	P0C7T8	217 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNRNP40-204	ENST00000474025	PRR35	P0CG20	571 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNRNP40-204	ENST00000474025	PRSS56	P0CW18	603 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNRNP40-204	ENST00000474025	PIM1	P11309	404 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SNRNP40-204	ENST00000474025	COX6A1	P12074	109 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNRNP40-204	ENST00000474025	DRD2	P14416	443 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNRNP40-204	ENST00000474025	FDXR	P22570	491 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNRNP40-204	ENST00000474025	MC4R	P32245	332 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNRNP40-204	ENST00000474025	KIR3DL1	P43629	444 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNRNP40-204	ENST00000474025	OR1D4	P47884	311 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNRNP40-204	ENST00000474025	ZBED6	P86452	979 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNRNP40-204	ENST00000474025	GSTM4	Q03013	218 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNRNP40-204	ENST00000474025	SRSF11	Q05519	484 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SNRNP40-204	ENST00000474025	KLC1	Q07866	573 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNRNP40-204	ENST00000474025	MSLN	Q13421	630 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SNRNP40-204	ENST00000474025	TFDP2	Q14188	446 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNRNP40-204	ENST00000474025	GRM7	Q14831	915 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNRNP40-204	ENST00000474025	KIR2DS3	Q14952	304 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNRNP40-204	ENST00000474025	SLC18A3	Q16572	532 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNRNP40-204	ENST00000474025	DBN1	Q16643	649 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNRNP40-204	ENST00000474025	GPR33	Q49SQ1	333 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNRNP40-204	ENST00000474025	YOD1	Q5VVQ6	348 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SNRNP40-204	ENST00000474025	ATG9B	Q674R7	924 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNRNP40-204	ENST00000474025	ZNF449	Q6P9G9	518 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNRNP40-204	ENST00000474025	RANBP10	Q6VN20	620 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNRNP40-204	ENST00000474025	BZW1	Q7L1Q6	419 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SNRNP40-204	ENST00000474025	NLRP9	Q7RTR0	991 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNRNP40-204	ENST00000474025	PID1	Q7Z2X4	250 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNRNP40-204	ENST00000474025	SERPINA9	Q86WD7	417 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNRNP40-204	ENST00000474025	KBTBD2	Q8IY47	623 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNRNP40-204	ENST00000474025	PIANP	Q8IYJ0	282 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNRNP40-204	ENST00000474025	METTL27	Q8N6F8	245 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SNRNP40-204	ENST00000474025	SIRT6	Q8N6T7	355 aa		4.9	□□□□□ -1.63

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