RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000450873.6

RABGEF1-205, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene RABGEF1, Length 2,281 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-205ENST00000450873 INHBCP55103 352 aa10.26□□□□□ -0.77
RABGEF1-205ENST00000450873 ATP6V0D1P61421 351 aa10.26□□□□□ -0.77
RABGEF1-205ENST00000450873 ZFP36L1Q07352 338 aaKnown RBP10.26□□□□□ -0.77
RABGEF1-205ENST00000450873 TRA2AQ13595 282 aaKnown RBP eCLIP10.26□□□□□ -0.77
RABGEF1-205ENST00000450873 ARHGAP19Q14CB8 494 aa10.26□□□□□ -0.77
RABGEF1-205ENST00000450873 ISXQ2M1V0 245 aa10.26□□□□□ -0.77
RABGEF1-205ENST00000450873 TAF1BQ53T94 588 aaPredicted RBP10.26□□□□□ -0.77
RABGEF1-205ENST00000450873 CMC1Q7Z7K0 106 aa10.26□□□□□ -0.77
RABGEF1-205ENST00000450873 TBC1D1Q86TI0 1168 aaPredicted RBP10.26□□□□□ -0.77
RABGEF1-205ENST00000450873 TDRPQ86YL5 185 aa10.26□□□□□ -0.77
RABGEF1-205ENST00000450873 OR2L8Q8NGY9 312 aa10.26□□□□□ -0.77
RABGEF1-205ENST00000450873 ISL2Q96A47 359 aa10.26□□□□□ -0.77
RABGEF1-205ENST00000450873 CRELD1Q96HD1 420 aa10.26□□□□□ -0.77
RABGEF1-205ENST00000450873 UBXN10Q96LJ8 280 aa10.26□□□□□ -0.77
RABGEF1-205ENST00000450873 UBL7Q96S82 380 aaPredicted RBP10.26□□□□□ -0.77
RABGEF1-205ENST00000450873 RUFY1Q96T51 708 aa10.26□□□□□ -0.77
RABGEF1-205ENST00000450873 CD180Q99467 661 aa10.26□□□□□ -0.77
RABGEF1-205ENST00000450873 STRADBQ9C0K7 418 aa10.26□□□□□ -0.77
RABGEF1-205ENST00000450873 PRORYQ9H606 182 aa10.26□□□□□ -0.77
RABGEF1-205ENST00000450873 SNX15Q9NRS6 342 aa10.26□□□□□ -0.77
RABGEF1-205ENST00000450873 CAMSAP3Q9P1Y5 1249 aaPredicted RBP10.26□□□□□ -0.77
RABGEF1-205ENST00000450873 CTNNAL1Q9UBT7 734 aa10.26□□□□□ -0.77
RABGEF1-205ENST00000450873 PLAGL1Q9UM63 463 aa10.26□□□□□ -0.77
RABGEF1-205ENST00000450873 KNTC1P50748 2209 aa10.26□□□□□ -0.77
RABGEF1-205ENST00000450873 BAHCC1Q9P281 2608 aa10.26□□□□□ -0.77
RABGEF1-205ENST00000450873 ITPR1Q14643 2758 aa10.26□□□□□ -0.77
RABGEF1-205ENST00000450873 UNC13CQ8NB66 2214 aa10.26□□□□□ -0.77
RABGEF1-205ENST00000450873 ZNF839A8K0R7 811 aa10.26□□□□□ -0.77
RABGEF1-205ENST00000450873 C2orf74A8MZ97 194 aa10.26□□□□□ -0.77
RABGEF1-205ENST00000450873 TRIM49D1C9J1S8 452 aa10.26□□□□□ -0.77
RABGEF1-205ENST00000450873 BTN3A3O00478 584 aa10.26□□□□□ -0.77
RABGEF1-205ENST00000450873 C2P06681 752 aa10.26□□□□□ -0.77
RABGEF1-205ENST00000450873 ENO2P09104 434 aaPredicted RBP10.26□□□□□ -0.77
RABGEF1-205ENST00000450873 HIST1H2AGP0C0S8 130 aaPredicted RBP10.26□□□□□ -0.77
RABGEF1-205ENST00000450873 SLC35E2BP0CK96 405 aa10.26□□□□□ -0.77
RABGEF1-205ENST00000450873 POLR2CP19387 275 aaPredicted RBP10.26□□□□□ -0.77
RABGEF1-205ENST00000450873 HIST1H2ADP20671 130 aa10.26□□□□□ -0.77
RABGEF1-205ENST00000450873 CSRP3P50461 194 aa10.26□□□□□ -0.77
RABGEF1-205ENST00000450873 RASA2Q15283 850 aa10.26□□□□□ -0.77
RABGEF1-205ENST00000450873 CCSMST1Q4G0I0 132 aa10.26□□□□□ -0.77
RABGEF1-205ENST00000450873 EEF1AKMT2Q5JPI9 291 aaKnown RBP10.26□□□□□ -0.77
RABGEF1-205ENST00000450873 ANKS6Q68DC2 871 aa10.26□□□□□ -0.77
RABGEF1-205ENST00000450873 IRGCQ6NXR0 463 aa10.26□□□□□ -0.77
RABGEF1-205ENST00000450873 ZNF574Q6ZN55 896 aaPredicted RBP10.26□□□□□ -0.77
RABGEF1-205ENST00000450873 TIFABQ6ZNK6 161 aa10.26□□□□□ -0.77
RABGEF1-205ENST00000450873 TMPRSS9Q7Z410 1059 aa10.26□□□□□ -0.77
RABGEF1-205ENST00000450873 SLITRK4Q8IW52 837 aa10.26□□□□□ -0.77
RABGEF1-205ENST00000450873 ADGRF3Q8IZF5 1079 aa10.26□□□□□ -0.77
RABGEF1-205ENST00000450873 HMGCLL1Q8TB92 370 aa10.26□□□□□ -0.77
RABGEF1-205ENST00000450873 FGF11Q92914 225 aa10.26□□□□□ -0.77
RABGEF1-205ENST00000450873 HIST1H2AHQ96KK5 128 aa10.26□□□□□ -0.77
RABGEF1-205ENST00000450873 CCDC138Q96M89 665 aa10.26□□□□□ -0.77
RABGEF1-205ENST00000450873 TGM7Q96PF1 710 aa10.26□□□□□ -0.77
RABGEF1-205ENST00000450873 PKP4Q99569 1192 aa10.26□□□□□ -0.77
RABGEF1-205ENST00000450873 HIST1H2AJQ99878 128 aa10.26□□□□□ -0.77
RABGEF1-205ENST00000450873 H2AFJQ9BTM1 129 aa10.26□□□□□ -0.77
RABGEF1-205ENST00000450873 MENTQ9BUN1 341 aa10.26□□□□□ -0.77
RABGEF1-205ENST00000450873 ADAMTS6Q9UKP5 1117 aa10.26□□□□□ -0.77
RABGEF1-205ENST00000450873 PDE10AQ9Y233 779 aa10.26□□□□□ -0.77
RABGEF1-205ENST00000450873 A0A096LPK6 155 aa10.25□□□□□ -0.77
RABGEF1-205ENST00000450873 IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 117 aa10.25□□□□□ -0.77
RABGEF1-205ENST00000450873 PIPSLA2A3N6 862 aa10.25□□□□□ -0.77
RABGEF1-205ENST00000450873 EIF4E1BA6NMX2 242 aaKnown RBP10.25□□□□□ -0.77
RABGEF1-205ENST00000450873 BTN3A1O00481 513 aa10.25□□□□□ -0.77
RABGEF1-205ENST00000450873 TOX3O15405 576 aaPredicted RBP10.25□□□□□ -0.77
RABGEF1-205ENST00000450873 BRINP1O60477 761 aa10.25□□□□□ -0.77
RABGEF1-205ENST00000450873 ALDOAP04075 364 aaKnown RBP10.25□□□□□ -0.77
RABGEF1-205ENST00000450873 MPOP05164 745 aa10.25□□□□□ -0.77
RABGEF1-205ENST00000450873 CHRM5P08912 532 aaPredicted RBP10.25□□□□□ -0.77
RABGEF1-205ENST00000450873 LTA4HP09960 611 aaKnown RBP10.25□□□□□ -0.77
RABGEF1-205ENST00000450873 THRAP10827 490 aa10.25□□□□□ -0.77
RABGEF1-205ENST00000450873 ITPKBP27987 946 aa10.25□□□□□ -0.77
RABGEF1-205ENST00000450873 MAGEA12P43365 314 aa10.25□□□□□ -0.77
RABGEF1-205ENST00000450873 AP1S2P56377 157 aa10.25□□□□□ -0.77
RABGEF1-205ENST00000450873 IFFO1Q0D2I5 559 aa10.25□□□□□ -0.77
RABGEF1-205ENST00000450873 CSHL1Q14406 222 aa10.25□□□□□ -0.77
RABGEF1-205ENST00000450873 KIR2DS3Q14952 304 aa10.25□□□□□ -0.77
RABGEF1-205ENST00000450873 CYP2A13Q16696 494 aa10.25□□□□□ -0.77
RABGEF1-205ENST00000450873 TBC1D25Q3MII6 688 aa10.25□□□□□ -0.77
RABGEF1-205ENST00000450873 PHF19Q5T6S3 580 aa10.25□□□□□ -0.77
RABGEF1-205ENST00000450873 ADAMTSL2Q86TH1 951 aa10.25□□□□□ -0.77
RABGEF1-205ENST00000450873 DLG3Q92796 817 aa10.25□□□□□ -0.77
RABGEF1-205ENST00000450873 SLC22A18Q96BI1 424 aa10.25□□□□□ -0.77
RABGEF1-205ENST00000450873 ROPN1BQ9BZX4 212 aaPredicted RBP10.25□□□□□ -0.77
RABGEF1-205ENST00000450873 TWSG1Q9GZX9 223 aa10.25□□□□□ -0.77
RABGEF1-205ENST00000450873 SEMA6CQ9H3T2 930 aa10.25□□□□□ -0.77
RABGEF1-205ENST00000450873 ROPN1Q9HAT0 212 aaPredicted RBP10.25□□□□□ -0.77
RABGEF1-205ENST00000450873 NMRAL1Q9HBL8 299 aa10.25□□□□□ -0.77
RABGEF1-205ENST00000450873 ACTR10Q9NZ32 417 aa10.25□□□□□ -0.77
RABGEF1-205ENST00000450873 CIDEBQ9UHD4 219 aa10.25□□□□□ -0.77
RABGEF1-205ENST00000450873 GSAPA4D1B5 854 aa10.24□□□□□ -0.77
RABGEF1-205ENST00000450873 CDC7O00311 574 aa10.24□□□□□ -0.77
RABGEF1-205ENST00000450873 CDH16O75309 829 aa10.24□□□□□ -0.77
RABGEF1-205ENST00000450873 ERGP11308 486 aa10.24□□□□□ -0.77
RABGEF1-205ENST00000450873 CD1DP15813 335 aa10.24□□□□□ -0.77
RABGEF1-205ENST00000450873 PDX1P52945 283 aa10.24□□□□□ -0.77
RABGEF1-205ENST00000450873 GFERP55789 205 aa10.24□□□□□ -0.77
RABGEF1-205ENST00000450873 ACTN3Q08043 901 aaPredicted RBP10.24□□□□□ -0.77
RABGEF1-205ENST00000450873 RBBP5Q15291 538 aaKnown RBP10.24□□□□□ -0.77
RABGEF1-205ENST00000450873 FAM83EQ2M2I3 478 aa10.24□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25 ms