RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000444040.6

SHQ1-202, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, humanhuman

TSL 2

Gene SHQ1, Length 2,844 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SHQ1-202ENST00000444040 NOXRED1Q6NXP6 359 aa15.56■□□□□ 0.08
SHQ1-202ENST00000444040 R3HCC1LQ7Z5L2 792 aaKnown RBP15.56■□□□□ 0.08
SHQ1-202ENST00000444040 RNF175Q8N4F7 328 aa15.56■□□□□ 0.08
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SHQ1-202ENST00000444040 SCAMP4Q969E2 229 aa15.56■□□□□ 0.08
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