RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000425989.5

HDLBP-211, Transcript of high density lipoprotein binding protein, humanhuman

TSL 5

Gene HDLBP, Length 530 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDLBP-211ENST00000425989 LRRC56Q8IYG6 542 aaPredicted RBP9.32□□□□□ -0.92
HDLBP-211ENST00000425989 KRT78Q8N1N4 520 aa9.32□□□□□ -0.92
HDLBP-211ENST00000425989 OR13H1Q8NG92 308 aa9.32□□□□□ -0.92
HDLBP-211ENST00000425989 OR2L8Q8NGY9 312 aa9.32□□□□□ -0.92
HDLBP-211ENST00000425989 RP9Q8TA86 221 aaKnown RBP9.32□□□□□ -0.92
HDLBP-211ENST00000425989 MAPK15Q8TD08 544 aa9.32□□□□□ -0.92
HDLBP-211ENST00000425989 USP7Q93009 1102 aa9.32□□□□□ -0.92
HDLBP-211ENST00000425989 ESAMQ96AP7 390 aa9.32□□□□□ -0.92
HDLBP-211ENST00000425989 TUBGCP3Q96CW5 907 aa9.32□□□□□ -0.92
HDLBP-211ENST00000425989 MOCOSQ96EN8 888 aa9.32□□□□□ -0.92
HDLBP-211ENST00000425989 PTCD3Q96EY7 689 aaKnown RBP9.32□□□□□ -0.92
HDLBP-211ENST00000425989 C12orf66Q96MD2 445 aa9.32□□□□□ -0.92
HDLBP-211ENST00000425989 INSM2Q96T92 566 aaPredicted RBP9.32□□□□□ -0.92
HDLBP-211ENST00000425989 ORAI3Q9BRQ5 295 aa9.32□□□□□ -0.92
HDLBP-211ENST00000425989 TPSD1Q9BZJ3 242 aa9.32□□□□□ -0.92
HDLBP-211ENST00000425989 SHCBP1LQ9BZQ2 653 aa9.32□□□□□ -0.92
HDLBP-211ENST00000425989 ATG10Q9H0Y0 220 aa9.32□□□□□ -0.92
HDLBP-211ENST00000425989 OSGEPL1Q9H4B0 414 aa9.32□□□□□ -0.92
HDLBP-211ENST00000425989 ERVMER34-1Q9H9K5 563 aa9.32□□□□□ -0.92
HDLBP-211ENST00000425989 BRF2Q9HAW0 419 aa9.32□□□□□ -0.92
HDLBP-211ENST00000425989 CCDC177Q9NQR7 707 aaPredicted RBP9.32□□□□□ -0.92
HDLBP-211ENST00000425989 ABCF3Q9NUQ8 709 aa9.32□□□□□ -0.92
HDLBP-211ENST00000425989 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP9.32□□□□□ -0.92
HDLBP-211ENST00000425989 OR6C2Q9NZP2 312 aa9.32□□□□□ -0.92
HDLBP-211ENST00000425989 FAM8A1Q9UBU6 413 aa9.32□□□□□ -0.92
HDLBP-211ENST00000425989 TAGLN3Q9UI15 199 aa9.32□□□□□ -0.92
HDLBP-211ENST00000425989 ZNF225Q9UK10 706 aa9.32□□□□□ -0.92
HDLBP-211ENST00000425989 FBXO4Q9UKT5 387 aa9.32□□□□□ -0.92
HDLBP-211ENST00000425989 PPT2Q9UMR5 302 aa9.32□□□□□ -0.92
HDLBP-211ENST00000425989 TMED5Q9Y3A6 229 aa9.32□□□□□ -0.92
HDLBP-211ENST00000425989 PRKAB1Q9Y478 270 aa9.32□□□□□ -0.92
HDLBP-211ENST00000425989 ARHGEF17Q96PE2 2063 aaPredicted RBP9.32□□□□□ -0.92
HDLBP-211ENST00000425989 FAM221BA6H8Z2 402 aa9.31□□□□□ -0.92
HDLBP-211ENST00000425989 CFAP73A6NFT4 308 aa9.31□□□□□ -0.92
HDLBP-211ENST00000425989 MEI4A8MW99 385 aa9.31□□□□□ -0.92
HDLBP-211ENST00000425989 FOXE1O00358 373 aaPredicted RBP9.31□□□□□ -0.92
HDLBP-211ENST00000425989 DFNA5O60443 496 aa9.31□□□□□ -0.92
HDLBP-211ENST00000425989 UBOX5O94941 541 aa9.31□□□□□ -0.92
HDLBP-211ENST00000425989 CCNDBP1O95273 360 aa9.31□□□□□ -0.92
HDLBP-211ENST00000425989 CSF2P04141 144 aa9.31□□□□□ -0.92
HDLBP-211ENST00000425989 F3P13726 295 aa9.31□□□□□ -0.92
HDLBP-211ENST00000425989 ACPPP15309 386 aa9.31□□□□□ -0.92
HDLBP-211ENST00000425989 GNSP15586 552 aa9.31□□□□□ -0.92
HDLBP-211ENST00000425989 TSPAN8P19075 237 aa9.31□□□□□ -0.92
HDLBP-211ENST00000425989 RPL10P27635 214 aaKnown RBP9.31□□□□□ -0.92
HDLBP-211ENST00000425989 GSTM2P28161 218 aa9.31□□□□□ -0.92
HDLBP-211ENST00000425989 SHMT2P34897 504 aa9.31□□□□□ -0.92
HDLBP-211ENST00000425989 STX1BP61266 288 aa9.31□□□□□ -0.92
HDLBP-211ENST00000425989 ERVK-8P63133 956 aa9.31□□□□□ -0.92
HDLBP-211ENST00000425989 PHEXP78562 749 aa9.31□□□□□ -0.92
HDLBP-211ENST00000425989 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP9.31□□□□□ -0.925e-6■■■□□ 16.9
HDLBP-211ENST00000425989 CSTF3Q12996 717 aaKnown RBP9.31□□□□□ -0.92
HDLBP-211ENST00000425989 CHIT1Q13231 466 aa9.31□□□□□ -0.92
HDLBP-211ENST00000425989 SIM2Q14190 667 aaPredicted RBP9.31□□□□□ -0.92
HDLBP-211ENST00000425989 FZD2Q14332 565 aa9.31□□□□□ -0.92
HDLBP-211ENST00000425989 SQLEQ14534 574 aa9.31□□□□□ -0.92
HDLBP-211ENST00000425989 HERC3Q15034 1050 aa9.31□□□□□ -0.92
HDLBP-211ENST00000425989 RPS6KA2Q15349 733 aa9.31□□□□□ -0.92
HDLBP-211ENST00000425989 ALG11Q2TAA5 492 aa9.31□□□□□ -0.92
HDLBP-211ENST00000425989 PLA2G4EQ3MJ16 856 aa9.31□□□□□ -0.92
HDLBP-211ENST00000425989 ATP6AP1LQ52LC2 224 aa9.31□□□□□ -0.92
HDLBP-211ENST00000425989 XKR7Q5GH72 579 aa9.31□□□□□ -0.92
HDLBP-211ENST00000425989 XKR6Q5GH73 641 aa9.31□□□□□ -0.92
HDLBP-211ENST00000425989 TJAP1Q5JTD0 557 aa9.31□□□□□ -0.92
HDLBP-211ENST00000425989 VWA5B1Q5TIE3 1220 aa9.31□□□□□ -0.92
HDLBP-211ENST00000425989 CLEC6AQ6EIG7 209 aa9.31□□□□□ -0.92
HDLBP-211ENST00000425989 GRHL2Q6ISB3 625 aa9.31□□□□□ -0.92
HDLBP-211ENST00000425989 LETMD1Q6P1Q0 360 aa9.31□□□□□ -0.92
HDLBP-211ENST00000425989 IYDQ6PHW0 289 aa9.31□□□□□ -0.92
HDLBP-211ENST00000425989 IL27RAQ6UWB1 636 aa9.31□□□□□ -0.92
HDLBP-211ENST00000425989 RD3Q7Z3Z2 195 aa9.31□□□□□ -0.92
HDLBP-211ENST00000425989 BMP8AQ7Z5Y6 402 aa9.31□□□□□ -0.92
HDLBP-211ENST00000425989 RABEPKQ7Z6M1 372 aa9.31□□□□□ -0.92
HDLBP-211ENST00000425989 GKN2Q86XP6 184 aa9.31□□□□□ -0.92
HDLBP-211ENST00000425989 TBC1D19Q8N5T2 526 aa9.31□□□□□ -0.92
HDLBP-211ENST00000425989 CDYL2Q8N8U2 506 aa9.31□□□□□ -0.92
HDLBP-211ENST00000425989 OR52B6Q8NGF0 335 aa9.31□□□□□ -0.92
HDLBP-211ENST00000425989 OR5AR1Q8NGP9 310 aa9.31□□□□□ -0.92
HDLBP-211ENST00000425989 AGR3Q8TD06 166 aa9.31□□□□□ -0.92
HDLBP-211ENST00000425989 RLN3Q8WXF3 142 aa9.31□□□□□ -0.92
HDLBP-211ENST00000425989 TSACCQ96A04 125 aaPredicted RBP9.31□□□□□ -0.92
HDLBP-211ENST00000425989 SH3KBP1Q96B97 665 aa9.31□□□□□ -0.92
HDLBP-211ENST00000425989 MED8Q96G25 268 aa9.31□□□□□ -0.92
HDLBP-211ENST00000425989 OR52B2Q96RD2 323 aa9.31□□□□□ -0.92
HDLBP-211ENST00000425989 MYOCQ99972 504 aa9.31□□□□□ -0.92
HDLBP-211ENST00000425989 NMUR2Q9GZQ4 415 aa9.31□□□□□ -0.92
HDLBP-211ENST00000425989 MMADHCQ9H3L0 296 aaPredicted RBP9.31□□□□□ -0.92
HDLBP-211ENST00000425989 ELOVL6Q9H5J4 265 aa9.31□□□□□ -0.92
HDLBP-211ENST00000425989 WDR55Q9H6Y2 383 aaPredicted RBP9.31□□□□□ -0.92
HDLBP-211ENST00000425989 AKTIPQ9H8T0 292 aa9.31□□□□□ -0.92
HDLBP-211ENST00000425989 PELI2Q9HAT8 420 aa9.31□□□□□ -0.92
HDLBP-211ENST00000425989 CD93Q9NPY3 652 aa9.31□□□□□ -0.92
HDLBP-211ENST00000425989 MRPL40Q9NQ50 206 aaKnown RBP9.31□□□□□ -0.92
HDLBP-211ENST00000425989 PRMT8Q9NR22 394 aaPredicted RBP9.31□□□□□ -0.92
HDLBP-211ENST00000425989 TM7SF3Q9NS93 570 aa9.31□□□□□ -0.92
HDLBP-211ENST00000425989 POT1Q9NUX5 634 aa9.31□□□□□ -0.92
HDLBP-211ENST00000425989 C2orf42Q9NWW7 574 aa9.31□□□□□ -0.92
HDLBP-211ENST00000425989 NDE1Q9NXR1 346 aa9.31□□□□□ -0.92
HDLBP-211ENST00000425989 SPASTQ9UBP0 616 aa9.31□□□□□ -0.92
HDLBP-211ENST00000425989 SUSD2Q9UGT4 822 aa9.31□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.1 ms