RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000419445.5

PGGT1B-203, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PGGT1B, Length 9,545 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-203ENST00000419445 TRIM32Q13049 653 aa3.53□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 GALNT3Q14435 633 aa3.53□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 IMPG1Q17R60 797 aa3.53□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 DSG4Q86SJ6 1040 aa3.53□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 GLB1L3Q8NCI6 653 aaPredicted RBP3.53□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 LGALS12Q96DT0 336 aa3.53□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 NSMCE2Q96MF7 247 aa3.53□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 OR4K3Q96R72 315 aa3.53□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 BDH2Q9BUT1 245 aa3.53□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 CDCA4Q9BXL8 241 aa3.53□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 RLIMQ9NVW2 624 aa3.53□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 TAS2R13Q9NYV9 303 aa3.53□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 NFKBIL1Q9UBC1 381 aaPredicted RBP3.53□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 TRPS1Q9UHF7 1281 aa3.53□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 PSORS1C1Q9UIG5 152 aa3.53□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 TMEM98Q9Y2Y6 226 aa3.53□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 MANBAO00462 879 aa3.53□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 FFAR1O14842 300 aa3.53□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 RAMP2O60895 175 aa3.53□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 ERN1O75460 977 aaKnown RBP3.53□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 EPPINO95925 133 aa3.53□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 SPNP16150 400 aa3.53□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 SEPT6Q14141 434 aa3.53□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 VMACQ2NL98 169 aa3.53□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 LDLRAP1Q5SW96 308 aa3.53□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 VTCN1Q7Z7D3 282 aa3.53□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 COMTD1Q86VU5 262 aa3.53□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 GALNT6Q8NCL4 622 aa3.53□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 ACTR8Q9H981 624 aa3.53□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 SYTL2Q9HCH5 934 aa3.53□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 POLMQ9NP87 494 aaPredicted RBP3.53□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 TRNAU1APQ9NX07 287 aaKnown RBP3.53□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 NUDT4Q9NZJ9 180 aa3.53□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 MTRRQ9UBK8 725 aa3.53□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 ACAD8Q9UKU7 415 aa3.53□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 NINQ8N4C6 2090 aa3.53□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 HEATR5BQ9P2D3 2071 aa3.53□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 TTC36A6NLP5 189 aa3.53□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 A8MVJ9 347 aa3.53□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 ARHGEF15O94989 841 aa3.53□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 SLC10A3P09131 477 aa3.53□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP3.53□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 FPR1P21462 350 aa3.53□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 IRS1P35568 1242 aa3.53□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 SLC19A1P41440 591 aa3.53□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 MAP2K4P45985 399 aa3.53□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 CLCA4Q14CN2 919 aa3.53□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 LAPTM4AQ15012 233 aa3.53□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 RGMBQ6NW40 437 aa3.53□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 NCEH1Q6PIU2 408 aa3.53□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 CXCL17Q6UXB2 119 aa3.53□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP3.53□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 STK32CQ86UX6 486 aa3.53□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 SVOPLQ8N434 492 aa3.53□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 OR10Q1Q8NGQ4 319 aa3.53□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 PPWD1Q96BP3 646 aaKnown RBP3.53□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 SNX18Q96RF0 628 aa3.53□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 WFDC6Q9BQY6 131 aa3.53□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 FSD1LQ9BXM9 530 aa3.53□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 RNF167Q9H6Y7 350 aa3.53□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 IPPKQ9H8X2 491 aa3.53□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 ASAH2Q9NR71 780 aa3.53□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 GID8Q9NWU2 228 aa3.53□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 FTSJ1Q9UET6 329 aa3.53□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 OBSL1O75147 1896 aa3.53□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 CACNA1IQ9P0X4 2223 aa3.53□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 NOBOXO60393 691 aa3.53□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 STC2O76061 302 aa3.53□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 SERPINF2P08697 491 aa3.53□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 KDELR2P33947 212 aa3.53□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 PPP5CP53041 499 aa3.53□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 MAPK10P53779 464 aa3.53□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 PDE7AQ13946 482 aa3.53□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 SPESP1Q6UW49 350 aa3.53□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 PHACTR4Q8IZ21 702 aa3.53□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 WDR20Q8TBZ3 569 aa3.53□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 ASB11Q8WXH4 323 aa3.53□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 EFHD2Q96C19 240 aaPredicted RBP3.53□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 WBP1Q96G27 269 aa3.53□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 DHRS1Q96LJ7 313 aa3.53□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 PADI2Q9Y2J8 665 aa3.53□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 FIS1Q9Y3D6 152 aa3.53□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 CXCR6O00574 342 aa3.52□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 PFDN1O60925 122 aa3.52□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 SOAT2O75908 522 aa3.52□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 GJB5O95377 273 aa3.52□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 TGFB1P01137 390 aa3.52□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 CNPP09543 421 aaKnown RBP3.52□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 IL10P22301 178 aa3.52□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 CBLP22681 906 aa3.52□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 CXCR2P25025 360 aa3.52□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 TBX4P57082 545 aa3.52□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 CREMQ03060 361 aa3.52□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 VEZF1Q14119 521 aa3.52□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP3.52□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 TMEM201Q5SNT2 666 aa3.52□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 CRTC3Q6UUV7 619 aa3.52□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 MACC1Q6ZN28 852 aa3.52□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 FAM126BQ8IXS8 530 aa3.52□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 EID3Q8N140 333 aa3.52□□□□□ -1.85
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