RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000404162.2

HOXD12-201, Transcript of homeobox D12, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD12, Length 841 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12-201ENST00000404162 SERPINA7P05543 415 aa18.4■□□□□ 0.54
HOXD12-201ENST00000404162 ACRV1P26436 265 aa18.4■□□□□ 0.54
HOXD12-201ENST00000404162 ZNF140P52738 457 aaPredicted RBP18.4■□□□□ 0.54
HOXD12-201ENST00000404162 ART1P52961 327 aa18.4■□□□□ 0.54
HOXD12-201ENST00000404162 CSNK1G2P78368 415 aa18.4■□□□□ 0.54
HOXD12-201ENST00000404162 GPR33Q49SQ1 333 aa18.4■□□□□ 0.54
HOXD12-201ENST00000404162 TFDP3Q5H9I0 405 aa18.4■□□□□ 0.54
HOXD12-201ENST00000404162 HIBCHQ6NVY1 386 aaPredicted RBP18.4■□□□□ 0.54
HOXD12-201ENST00000404162 NLRP9Q7RTR0 991 aa18.4■□□□□ 0.54
HOXD12-201ENST00000404162 LAPTM4BQ86VI4 370 aa18.4■□□□□ 0.54
HOXD12-201ENST00000404162 TTC29Q8NA56 475 aaPredicted RBP18.4■□□□□ 0.54
HOXD12-201ENST00000404162 LINC01555Q8NAE3 123 aa18.4■□□□□ 0.54
HOXD12-201ENST00000404162 ACBD4Q8NC06 268 aa18.4■□□□□ 0.54
HOXD12-201ENST00000404162 ZNF285Q96NJ3 590 aa18.4■□□□□ 0.54
HOXD12-201ENST00000404162 VAT1Q99536 393 aa18.4■□□□□ 0.54
HOXD12-201ENST00000404162 ZNF304Q9HCX3 659 aa18.4■□□□□ 0.54
HOXD12-201ENST00000404162 ZNF835Q9Y2P0 537 aa18.4■□□□□ 0.54
HOXD12-201ENST00000404162 MEMO1Q9Y316 297 aa18.4■□□□□ 0.54
HOXD12-201ENST00000404162 PRSS21Q9Y6M0 314 aa18.4■□□□□ 0.54
HOXD12-201ENST00000404162 FITM1A5D6W6 292 aa18.39■□□□□ 0.53
HOXD12-201ENST00000404162 BHMG1C9JSJ3 638 aaPredicted RBP18.39■□□□□ 0.53
HOXD12-201ENST00000404162 LIN7AO14910 233 aaPredicted RBP18.39■□□□□ 0.53
HOXD12-201ENST00000404162 PRAMEF2O60811 474 aa18.39■□□□□ 0.53
HOXD12-201ENST00000404162 WFS1O76024 890 aa18.39■□□□□ 0.53
HOXD12-201ENST00000404162 CRTAMO95727 393 aa18.39■□□□□ 0.53
HOXD12-201ENST00000404162 UQCRHP07919 91 aa18.39■□□□□ 0.53
HOXD12-201ENST00000404162 TNNT1P13805 278 aa18.39■□□□□ 0.53
HOXD12-201ENST00000404162 FDXRP22570 491 aa18.39■□□□□ 0.53
HOXD12-201ENST00000404162 ADRA1AP35348 466 aa18.39■□□□□ 0.53
HOXD12-201ENST00000404162 GEMP55040 296 aa18.39■□□□□ 0.53
HOXD12-201ENST00000404162 OCA2Q04671 838 aa18.39■□□□□ 0.53
HOXD12-201ENST00000404162 EEF1A2Q05639 463 aaKnown RBP18.39■□□□□ 0.53
HOXD12-201ENST00000404162 FAM214AQ32MH5 1076 aa18.39■□□□□ 0.53
HOXD12-201ENST00000404162 ZC3H12BQ5HYM0 836 aaKnown RBP18.39■□□□□ 0.53
HOXD12-201ENST00000404162 TCTE1Q5JU00 501 aa18.39■□□□□ 0.53
HOXD12-201ENST00000404162 KAZNQ674X7 775 aa18.39■□□□□ 0.53
HOXD12-201ENST00000404162 FIGLAQ6QHK4 219 aa18.39■□□□□ 0.53
HOXD12-201ENST00000404162 MEX3BQ6ZN04 569 aaKnown RBP18.39■□□□□ 0.53
HOXD12-201ENST00000404162 SUN3Q8TAQ9 357 aa18.39■□□□□ 0.53
HOXD12-201ENST00000404162 ELMO1Q92556 727 aa18.39■□□□□ 0.53
HOXD12-201ENST00000404162 TMUB1Q9BVT8 246 aa18.39■□□□□ 0.53
HOXD12-201ENST00000404162 CAMSAP3Q9P1Y5 1249 aaPredicted RBP18.39■□□□□ 0.53
HOXD12-201ENST00000404162 STOX2Q9P2F5 926 aaPredicted RBP18.39■□□□□ 0.53
HOXD12-201ENST00000404162 ZNF282Q9UDV7 671 aaPredicted RBP18.39■□□□□ 0.53
HOXD12-201ENST00000404162 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP18.39■□□□□ 0.53
HOXD12-201ENST00000404162 A0A1B0GTL3 188 aa18.38■□□□□ 0.53
HOXD12-201ENST00000404162 OR5H15A6NDH6 313 aa18.38■□□□□ 0.53
HOXD12-201ENST00000404162 GSTM1P09488 218 aa18.38■□□□□ 0.53
HOXD12-201ENST00000404162 ITGAMP11215 1152 aa18.38■□□□□ 0.53
HOXD12-201ENST00000404162 CD99P14209 185 aa18.38■□□□□ 0.53
HOXD12-201ENST00000404162 PKLRP30613 574 aa18.38■□□□□ 0.53
HOXD12-201ENST00000404162 CDKN2BP42772 138 aa18.38■□□□□ 0.53
HOXD12-201ENST00000404162 RAB28P51157 221 aa18.38■□□□□ 0.53
HOXD12-201ENST00000404162 GSTM4Q03013 218 aa18.38■□□□□ 0.53
HOXD12-201ENST00000404162 ODF2Q5BJF6 829 aa18.38■□□□□ 0.53
HOXD12-201ENST00000404162 CNSTQ6PJW8 725 aa18.38■□□□□ 0.53
HOXD12-201ENST00000404162 Q6ZPB1 254 aaPredicted RBP18.38■□□□□ 0.53
HOXD12-201ENST00000404162 TAS2R42Q7RTR8 314 aa18.38■□□□□ 0.53
HOXD12-201ENST00000404162 TAX1BP1Q86VP1 789 aa18.38■□□□□ 0.53
HOXD12-201ENST00000404162 SPPL2CQ8IUH8 684 aa18.38■□□□□ 0.53
HOXD12-201ENST00000404162 HAUS1Q96CS2 278 aa18.38■□□□□ 0.53
HOXD12-201ENST00000404162 SELENOSQ9BQE4 189 aa18.38■□□□□ 0.53
HOXD12-201ENST00000404162 RNF32Q9H0A6 362 aa18.38■□□□□ 0.53
HOXD12-201ENST00000404162 C10orf88Q9H8K7 445 aa18.38■□□□□ 0.53
HOXD12-201ENST00000404162 ENAMQ9NRM1 1142 aa18.38■□□□□ 0.53
HOXD12-201ENST00000404162 CIDEBQ9UHD4 219 aa18.38■□□□□ 0.53
HOXD12-201ENST00000404162 TRHDEQ9UKU6 1024 aa18.38■□□□□ 0.53
HOXD12-201ENST00000404162 IGHV1-45A0A0A0MS14 117 aa18.37■□□□□ 0.53
HOXD12-201ENST00000404162 SLC5A10A0PJK1 596 aa18.37■□□□□ 0.53
HOXD12-201ENST00000404162 HYKKA2RU49 373 aa18.37■□□□□ 0.53
HOXD12-201ENST00000404162 EMP2P54851 167 aa18.37■□□□□ 0.53
HOXD12-201ENST00000404162 VSX2P58304 361 aaPredicted RBP18.37■□□□□ 0.53
HOXD12-201ENST00000404162 CACNG1Q06432 222 aa18.37■□□□□ 0.53
HOXD12-201ENST00000404162 TFDP2Q14188 446 aa18.37■□□□□ 0.53
HOXD12-201ENST00000404162 TAZQ16635 292 aa18.37■□□□□ 0.53
HOXD12-201ENST00000404162 DBN1Q16643 649 aa18.37■□□□□ 0.53
HOXD12-201ENST00000404162 WASHC2DQ5SRD0 308 aa18.37■□□□□ 0.53
HOXD12-201ENST00000404162 LRRC38Q5VT99 294 aa18.37■□□□□ 0.53
HOXD12-201ENST00000404162 PIANPQ8IYJ0 282 aa18.37■□□□□ 0.53
HOXD12-201ENST00000404162 SLC35G2Q8TBE7 412 aa18.37■□□□□ 0.53
HOXD12-201ENST00000404162 P3H4Q92791 437 aa18.37■□□□□ 0.53
HOXD12-201ENST00000404162 MAGED4Q96JG8 741 aa18.37■□□□□ 0.53
HOXD12-201ENST00000404162 DNAJC1Q96KC8 554 aaKnown RBP18.37■□□□□ 0.53
HOXD12-201ENST00000404162 IL17FQ96PD4 163 aa18.37■□□□□ 0.53
HOXD12-201ENST00000404162 TREX2Q9BQ50 279 aaPredicted RBP18.37■□□□□ 0.53
HOXD12-201ENST00000404162 TMEM121Q9BTD3 319 aa18.37■□□□□ 0.53
HOXD12-201ENST00000404162 MENTQ9BUN1 341 aa18.37■□□□□ 0.53
HOXD12-201ENST00000404162 GBA3Q9H227 469 aa18.37■□□□□ 0.53
HOXD12-201ENST00000404162 GPAMQ9HCL2 828 aa18.37■□□□□ 0.53
HOXD12-201ENST00000404162 LUC7LQ9NQ29 371 aaKnown RBP18.37■□□□□ 0.53
HOXD12-201ENST00000404162 SMARCAL1Q9NZC9 954 aa18.37■□□□□ 0.53
HOXD12-201ENST00000404162 HYOU1Q9Y4L1 999 aa18.37■□□□□ 0.53
HOXD12-201ENST00000404162 ZNHIT1O43257 154 aa18.36■□□□□ 0.53
HOXD12-201ENST00000404162 CTSVO60911 334 aa18.36■□□□□ 0.53
HOXD12-201ENST00000404162 ANXA9O76027 345 aa18.36■□□□□ 0.53
HOXD12-201ENST00000404162 AP2A2O94973 939 aa18.36■□□□□ 0.53
HOXD12-201ENST00000404162 ZBED6P86452 979 aa18.36■□□□□ 0.53
HOXD12-201ENST00000404162 TYRO3Q06418 890 aa18.36■□□□□ 0.53
HOXD12-201ENST00000404162 FRMPD2BQ6IN97 320 aa18.36■□□□□ 0.53
HOXD12-201ENST00000404162 GPR137Q96N19 417 aa18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.3 ms