RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000390392.3

TRBV4-2-201, Transcript of T cell receptor beta variable 4-2, humanhuman

APPRIS P1 BASIC

Gene TRBV4-2, Length 455 nt, Biotype TR V gene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV4-2-201ENST00000390392 BIRC8Q96P09 236 aa13.07□□□□□ -0.32
TRBV4-2-201ENST00000390392 WDR54Q9H977 334 aa13.07□□□□□ -0.32
TRBV4-2-201ENST00000390392 UTP6Q9NYH9 597 aaKnown RBP13.07□□□□□ -0.32
TRBV4-2-201ENST00000390392 SAMD15Q9P1V8 674 aa13.07□□□□□ -0.32
TRBV4-2-201ENST00000390392 MARCH4Q9P2E8 410 aaPredicted RBP13.07□□□□□ -0.32
TRBV4-2-201ENST00000390392 PLAGL1Q9UM63 463 aa13.07□□□□□ -0.32
TRBV4-2-201ENST00000390392 PPP2R2CQ9Y2T4 447 aa13.07□□□□□ -0.32
TRBV4-2-201ENST00000390392 PTRH2Q9Y3E5 179 aaKnown RBP13.07□□□□□ -0.32
TRBV4-2-201ENST00000390392 SNRNP200O75643 2136 aaKnown RBP13.06□□□□□ -0.32
TRBV4-2-201ENST00000390392 FAM237BA0A1B0GVD1 139 aa13.06□□□□□ -0.32
TRBV4-2-201ENST00000390392 A0A1B0GX78 115 aa13.06□□□□□ -0.32
TRBV4-2-201ENST00000390392 ZNF839A8K0R7 811 aa13.06□□□□□ -0.32
TRBV4-2-201ENST00000390392 PHF2O75151 1096 aa13.06□□□□□ -0.32
TRBV4-2-201ENST00000390392 KRT14P02533 472 aa13.06□□□□□ -0.32
TRBV4-2-201ENST00000390392 PDGFAP04085 211 aa13.06□□□□□ -0.32
TRBV4-2-201ENST00000390392 ALPPP05187 535 aa13.06□□□□□ -0.32
TRBV4-2-201ENST00000390392 FMO4P31512 558 aa13.06□□□□□ -0.32
TRBV4-2-201ENST00000390392 CRADDP78560 199 aa13.06□□□□□ -0.32
TRBV4-2-201ENST00000390392 ARHGAP19Q14CB8 494 aa13.06□□□□□ -0.32
TRBV4-2-201ENST00000390392 TTLL9Q3SXZ7 439 aa13.06□□□□□ -0.32
TRBV4-2-201ENST00000390392 ANKRD20A4Q4UJ75 823 aa13.06□□□□□ -0.32
TRBV4-2-201ENST00000390392 CPZQ66K79 652 aa13.06□□□□□ -0.32
TRBV4-2-201ENST00000390392 NEPROQ6NW34 567 aa13.06□□□□□ -0.32
TRBV4-2-201ENST00000390392 MICALCLQ6ZW33 695 aa13.06□□□□□ -0.32
TRBV4-2-201ENST00000390392 NEK10Q6ZWH5 1172 aa13.06□□□□□ -0.32
TRBV4-2-201ENST00000390392 FAM26EQ8N5C1 309 aa13.06□□□□□ -0.32
TRBV4-2-201ENST00000390392 PRELID2Q8N945 189 aa13.06□□□□□ -0.32
TRBV4-2-201ENST00000390392 GALNT11Q8NCW6 608 aa13.06□□□□□ -0.32
TRBV4-2-201ENST00000390392 GABPB2Q8TAK5 448 aaPredicted RBP13.06□□□□□ -0.32
TRBV4-2-201ENST00000390392 LKAAEAR1Q8TD35 194 aa13.06□□□□□ -0.32
TRBV4-2-201ENST00000390392 CALML6Q8TD86 181 aa13.06□□□□□ -0.32
TRBV4-2-201ENST00000390392 TM9SF4Q92544 642 aa13.06□□□□□ -0.32
TRBV4-2-201ENST00000390392 MAGOHBQ96A72 148 aaKnown RBP13.06□□□□□ -0.32
TRBV4-2-201ENST00000390392 SLC26A1Q9H2B4 701 aa13.06□□□□□ -0.32
TRBV4-2-201ENST00000390392 XAB2Q9HCS7 855 aaKnown RBP13.06□□□□□ -0.32
TRBV4-2-201ENST00000390392 ATP13A2Q9NQ11 1180 aa13.06□□□□□ -0.32
TRBV4-2-201ENST00000390392 FAM114A2Q9NRY5 505 aa13.06□□□□□ -0.32
TRBV4-2-201ENST00000390392 SYBUQ9NX95 663 aa13.06□□□□□ -0.32
TRBV4-2-201ENST00000390392 ANKMY1Q9P2S6 941 aa13.06□□□□□ -0.32
TRBV4-2-201ENST00000390392 DHCR7Q9UBM7 475 aaKnown RBP13.06□□□□□ -0.32
TRBV4-2-201ENST00000390392 NXT1Q9UKK6 140 aaKnown RBP13.06□□□□□ -0.32
TRBV4-2-201ENST00000390392 COMMD10Q9Y6G5 202 aa13.06□□□□□ -0.32
TRBV4-2-201ENST00000390392 BSNQ9UPA5 3926 aa13.06□□□□□ -0.32
TRBV4-2-201ENST00000390392 ASH1LQ9NR48 2969 aaKnown RBP13.05□□□□□ -0.32
TRBV4-2-201ENST00000390392 TNRC6AQ8NDV7 1962 aaKnown RBP13.05□□□□□ -0.32
TRBV4-2-201ENST00000390392 FITM1A5D6W6 292 aa13.05□□□□□ -0.32
TRBV4-2-201ENST00000390392 CLEC18AA5D8T8 446 aa13.05□□□□□ -0.32
TRBV4-2-201ENST00000390392 E5RI56 91 aa13.05□□□□□ -0.32
TRBV4-2-201ENST00000390392 DSCR3O14972 297 aa13.05□□□□□ -0.32
TRBV4-2-201ENST00000390392 HCRTR1O43613 425 aa13.05□□□□□ -0.32
TRBV4-2-201ENST00000390392 PKMP14618 531 aaKnown RBP13.05□□□□□ -0.32
TRBV4-2-201ENST00000390392 OTX2P32243 289 aa13.05□□□□□ -0.32
TRBV4-2-201ENST00000390392 CXCR5P32302 372 aa13.05□□□□□ -0.32
TRBV4-2-201ENST00000390392 GRIA3P42263 894 aa13.05□□□□□ -0.32
TRBV4-2-201ENST00000390392 GCGRP47871 477 aa13.05□□□□□ -0.32
TRBV4-2-201ENST00000390392 EMP3P54852 163 aa13.05□□□□□ -0.32
TRBV4-2-201ENST00000390392 MLLT10P55197 1068 aa13.05□□□□□ -0.32
TRBV4-2-201ENST00000390392 CCZ1BP86790 482 aa13.05□□□□□ -0.32
TRBV4-2-201ENST00000390392 CCZ1P86791 482 aaPredicted RBP13.05□□□□□ -0.32
TRBV4-2-201ENST00000390392 RELAQ04206 551 aa13.05□□□□□ -0.32
TRBV4-2-201ENST00000390392 GPS1Q13098 491 aa13.05□□□□□ -0.32
TRBV4-2-201ENST00000390392 THOC5Q13769 683 aaKnown RBP13.05□□□□□ -0.32
TRBV4-2-201ENST00000390392 GBX1Q14549 363 aa13.05□□□□□ -0.32
TRBV4-2-201ENST00000390392 KCNJ11Q14654 390 aa13.05□□□□□ -0.32
TRBV4-2-201ENST00000390392 CYP2A13Q16696 494 aa13.05□□□□□ -0.32
TRBV4-2-201ENST00000390392 DEFB110Q30KQ9 67 aa13.05□□□□□ -0.32
TRBV4-2-201ENST00000390392 DCAF10Q5QP82 559 aa13.05□□□□□ -0.32
TRBV4-2-201ENST00000390392 VWA5B1Q5TIE3 1220 aa13.05□□□□□ -0.32
TRBV4-2-201ENST00000390392 C1orf189Q5VU69 101 aa13.05□□□□□ -0.32
TRBV4-2-201ENST00000390392 FCRL6Q6DN72 434 aa13.05□□□□□ -0.32
TRBV4-2-201ENST00000390392 PRMT9Q6P2P2 845 aa13.05□□□□□ -0.32
TRBV4-2-201ENST00000390392 CASC4Q6P4E1 433 aa13.05□□□□□ -0.32
TRBV4-2-201ENST00000390392 IGFL3Q6UXB1 125 aa13.05□□□□□ -0.32
TRBV4-2-201ENST00000390392 CLEC18BQ6UXF7 455 aa13.05□□□□□ -0.32
TRBV4-2-201ENST00000390392 CILP2Q8IUL8 1156 aa13.05□□□□□ -0.32
TRBV4-2-201ENST00000390392 CLEC18CQ8NCF0 446 aa13.05□□□□□ -0.32
TRBV4-2-201ENST00000390392 OR9A1PQ8NGU1 263 aa13.05□□□□□ -0.32
TRBV4-2-201ENST00000390392 CPT1CQ8TCG5 803 aa13.05□□□□□ -0.32
TRBV4-2-201ENST00000390392 GRK7Q8WTQ7 553 aa13.05□□□□□ -0.32
TRBV4-2-201ENST00000390392 LPGAT1Q92604 370 aa13.05□□□□□ -0.32
TRBV4-2-201ENST00000390392 PNPLA2Q96AD5 504 aa13.05□□□□□ -0.32
TRBV4-2-201ENST00000390392 ZNF285Q96NJ3 590 aa13.05□□□□□ -0.32
TRBV4-2-201ENST00000390392 SELENOSQ9BQE4 189 aa13.05□□□□□ -0.32
TRBV4-2-201ENST00000390392 SLAMF7Q9NQ25 335 aa13.05□□□□□ -0.32
TRBV4-2-201ENST00000390392 MAP4K5Q9Y4K4 846 aa13.05□□□□□ -0.32
TRBV4-2-201ENST00000390392 FAM169AQ9Y6X4 670 aa13.05□□□□□ -0.32
TRBV4-2-201ENST00000390392 AGPSO00116 658 aa13.04□□□□□ -0.32
TRBV4-2-201ENST00000390392 TXNDC9O14530 226 aa13.04□□□□□ -0.32
TRBV4-2-201ENST00000390392 CATP04040 527 aaKnown RBP13.04□□□□□ -0.32
TRBV4-2-201ENST00000390392 MMP11P24347 488 aa13.04□□□□□ -0.32
TRBV4-2-201ENST00000390392 ARNTP27540 789 aa13.04□□□□□ -0.32
TRBV4-2-201ENST00000390392 CMPK1P30085 196 aa13.04□□□□□ -0.32
TRBV4-2-201ENST00000390392 CHAF1BQ13112 559 aa13.04□□□□□ -0.32
TRBV4-2-201ENST00000390392 AIMP2Q13155 320 aaKnown RBP13.04□□□□□ -0.32
TRBV4-2-201ENST00000390392 ATP1A4Q13733 1029 aa13.04□□□□□ -0.32
TRBV4-2-201ENST00000390392 DHX34Q14147 1143 aaKnown RBP13.04□□□□□ -0.32
TRBV4-2-201ENST00000390392 MYBPC3Q14896 1274 aa13.04□□□□□ -0.32
TRBV4-2-201ENST00000390392 CYP1B1Q16678 543 aa13.04□□□□□ -0.32
TRBV4-2-201ENST00000390392 CTSL3PQ5NE16 218 aa13.04□□□□□ -0.32
TRBV4-2-201ENST00000390392 JMJD6Q6NYC1 403 aaPredicted RBP13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23 ms