RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000379599.6

NHLRC3-201, Transcript of NHL repeat containing 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene NHLRC3, Length 3,275 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLRC3-201ENST00000379599 OR8D4Q8NGM9 314 aa8.32□□□□□ -1.08
NHLRC3-201ENST00000379599 ASZ1Q8WWH4 475 aa8.32□□□□□ -1.08
NHLRC3-201ENST00000379599 NSMAFQ92636 917 aa8.32□□□□□ -1.08
NHLRC3-201ENST00000379599 TRMT2BQ96GJ1 504 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
NHLRC3-201ENST00000379599 GPR78Q96P69 363 aa8.32□□□□□ -1.08
NHLRC3-201ENST00000379599 AGAP2Q99490 1192 aa8.32□□□□□ -1.08
NHLRC3-201ENST00000379599 CPNE1Q99829 537 aa8.32□□□□□ -1.08
NHLRC3-201ENST00000379599 CRB3Q9BUF7 120 aa8.32□□□□□ -1.08
NHLRC3-201ENST00000379599 SRRQ9GZT4 340 aa8.32□□□□□ -1.08
NHLRC3-201ENST00000379599 MED28Q9H204 178 aa8.32□□□□□ -1.08
NHLRC3-201ENST00000379599 BABAM2Q9NXR7 383 aa8.32□□□□□ -1.08
NHLRC3-201ENST00000379599 NSMCE4AQ9NXX6 385 aa8.32□□□□□ -1.08
NHLRC3-201ENST00000379599 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
NHLRC3-201ENST00000379599 TAF1LQ8IZX4 1826 aa8.32□□□□□ -1.08
NHLRC3-201ENST00000379599 BBIP1A8MTZ0 92 aa8.32□□□□□ -1.08
NHLRC3-201ENST00000379599 FXYD1O00168 92 aa8.32□□□□□ -1.08
NHLRC3-201ENST00000379599 ABCD4O14678 606 aa8.32□□□□□ -1.08
NHLRC3-201ENST00000379599 PDCD5O14737 125 aa8.32□□□□□ -1.08
NHLRC3-201ENST00000379599 ZBTB24O43167 697 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
NHLRC3-201ENST00000379599 MPC2O95563 127 aa8.32□□□□□ -1.08
NHLRC3-201ENST00000379599 LY86O95711 162 aa8.32□□□□□ -1.08
NHLRC3-201ENST00000379599 TSPAN12O95859 305 aa8.32□□□□□ -1.08
NHLRC3-201ENST00000379599 POMCP01189 267 aa8.32□□□□□ -1.08
NHLRC3-201ENST00000379599 ERCC2P18074 760 aa8.32□□□□□ -1.08
NHLRC3-201ENST00000379599 PTGER2P43116 358 aa8.32□□□□□ -1.08
NHLRC3-201ENST00000379599 CASP6P55212 293 aa8.32□□□□□ -1.08
NHLRC3-201ENST00000379599 LAPTM4AQ15012 233 aa8.32□□□□□ -1.08
NHLRC3-201ENST00000379599 FCN2Q15485 313 aa8.32□□□□□ -1.08
NHLRC3-201ENST00000379599 LCN1P1Q5VSP4 162 aa8.32□□□□□ -1.08
NHLRC3-201ENST00000379599 CLEC6AQ6EIG7 209 aa8.32□□□□□ -1.08
NHLRC3-201ENST00000379599 OTOP2Q7RTS6 562 aa8.32□□□□□ -1.08
NHLRC3-201ENST00000379599 FAM160B2Q86V87 743 aa8.32□□□□□ -1.08
NHLRC3-201ENST00000379599 TMEM132CQ8N3T6 1108 aa8.32□□□□□ -1.08
NHLRC3-201ENST00000379599 CDYL2Q8N8U2 506 aa8.32□□□□□ -1.08
NHLRC3-201ENST00000379599 ACVR1CQ8NER5 493 aa8.32□□□□□ -1.08
NHLRC3-201ENST00000379599 UBE2FQ969M7 185 aa8.32□□□□□ -1.08
NHLRC3-201ENST00000379599 TMEM125Q96AQ2 219 aa8.32□□□□□ -1.08
NHLRC3-201ENST00000379599 RAD51AP1Q96B01 352 aa8.32□□□□□ -1.08
NHLRC3-201ENST00000379599 DCAF5Q96JK2 942 aa8.32□□□□□ -1.08
NHLRC3-201ENST00000379599 SENP8Q96LD8 212 aa8.32□□□□□ -1.08
NHLRC3-201ENST00000379599 COQ10AQ96MF6 247 aa8.32□□□□□ -1.08
NHLRC3-201ENST00000379599 TMEM68Q96MH6 324 aa8.32□□□□□ -1.08
NHLRC3-201ENST00000379599 GMLQ99445 158 aa8.32□□□□□ -1.08
NHLRC3-201ENST00000379599 PARK7Q99497 189 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
NHLRC3-201ENST00000379599 DPYSL5Q9BPU6 564 aa8.32□□□□□ -1.08
NHLRC3-201ENST00000379599 CNPPD1Q9BV87 410 aa8.32□□□□□ -1.08
NHLRC3-201ENST00000379599 CARS2Q9HA77 564 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
NHLRC3-201ENST00000379599 ABCB9Q9NP78 766 aa8.32□□□□□ -1.08
NHLRC3-201ENST00000379599 ASAH2Q9NR71 780 aa8.32□□□□□ -1.08
NHLRC3-201ENST00000379599 UFSP2Q9NUQ7 469 aa8.32□□□□□ -1.08
NHLRC3-201ENST00000379599 XPR1Q9UBH6 696 aa8.32□□□□□ -1.08
NHLRC3-201ENST00000379599 AFF4Q9UHB7 1163 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
NHLRC3-201ENST00000379599 FBXO10Q9UK96 956 aa8.32□□□□□ -1.08
NHLRC3-201ENST00000379599 TBX20Q9UMR3 447 aa8.32□□□□□ -1.08
NHLRC3-201ENST00000379599 CITO14578 2027 aa8.31□□□□□ -1.08
NHLRC3-201ENST00000379599 MFSD2BA6NFX1 497 aa8.31□□□□□ -1.08
NHLRC3-201ENST00000379599 NEMP2A6NFY4 417 aa8.31□□□□□ -1.08
NHLRC3-201ENST00000379599 HRO43593 1189 aa8.31□□□□□ -1.08
NHLRC3-201ENST00000379599 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
NHLRC3-201ENST00000379599 ITGB1P05556 798 aa8.31□□□□□ -1.08
NHLRC3-201ENST00000379599 ACAA1P09110 424 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
NHLRC3-201ENST00000379599 CSF3P09919 207 aa8.31□□□□□ -1.08
NHLRC3-201ENST00000379599 CKMT1AP12532 417 aa8.31□□□□□ -1.08
NHLRC3-201ENST00000379599 CBR1P16152 277 aa8.31□□□□□ -1.08
NHLRC3-201ENST00000379599 TPH1P17752 444 aa8.31□□□□□ -1.08
NHLRC3-201ENST00000379599 CHMP24386 653 aa8.31□□□□□ -1.08
NHLRC3-201ENST00000379599 S100PP25815 95 aa8.31□□□□□ -1.08
NHLRC3-201ENST00000379599 SLC25A11Q02978 314 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
NHLRC3-201ENST00000379599 HSF2Q03933 536 aa8.31□□□□□ -1.08
NHLRC3-201ENST00000379599 CAMK1Q14012 370 aa8.31□□□□□ -1.08
NHLRC3-201ENST00000379599 USP10Q14694 798 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
NHLRC3-201ENST00000379599 HFEQ30201 348 aa8.31□□□□□ -1.08
NHLRC3-201ENST00000379599 ZNF792Q3KQV3 632 aa8.31□□□□□ -1.08
NHLRC3-201ENST00000379599 TRIQKQ629K1 86 aa8.31□□□□□ -1.08
NHLRC3-201ENST00000379599 NAPEPLDQ6IQ20 393 aa8.31□□□□□ -1.08
NHLRC3-201ENST00000379599 MZT2BQ6NZ67 158 aa8.31□□□□□ -1.08
NHLRC3-201ENST00000379599 XRRA1Q6P2D8 792 aa8.31□□□□□ -1.08
NHLRC3-201ENST00000379599 BRINP3Q76B58 766 aa8.31□□□□□ -1.08
NHLRC3-201ENST00000379599 KANSL1Q7Z3B3 1105 aa8.31□□□□□ -1.08
NHLRC3-201ENST00000379599 SLC46A3Q7Z3Q1 461 aa8.31□□□□□ -1.08
NHLRC3-201ENST00000379599 FSTL5Q8N475 847 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
NHLRC3-201ENST00000379599 JOSD2Q8TAC2 188 aa8.31□□□□□ -1.08
NHLRC3-201ENST00000379599 CYP2W1Q8TAV3 490 aa8.31□□□□□ -1.08
NHLRC3-201ENST00000379599 SFT2D1Q8WV19 159 aa8.31□□□□□ -1.08
NHLRC3-201ENST00000379599 ZNF566Q969W8 418 aa8.31□□□□□ -1.08
NHLRC3-201ENST00000379599 ISL2Q96A47 359 aa8.31□□□□□ -1.08
NHLRC3-201ENST00000379599 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
NHLRC3-201ENST00000379599 DIRAS2Q96HU8 199 aa8.31□□□□□ -1.08
NHLRC3-201ENST00000379599 C10orf90Q96M02 699 aa8.31□□□□□ -1.08
NHLRC3-201ENST00000379599 PFDN5Q99471 154 aa8.31□□□□□ -1.08
NHLRC3-201ENST00000379599 RBBP8Q99708 897 aa8.31□□□□□ -1.08
NHLRC3-201ENST00000379599 MED18Q9BUE0 208 aa8.31□□□□□ -1.08
NHLRC3-201ENST00000379599 MSTO1Q9BUK6 570 aa8.31□□□□□ -1.08
NHLRC3-201ENST00000379599 POMKQ9H5K3 350 aa8.31□□□□□ -1.08
NHLRC3-201ENST00000379599 CASS4Q9NQ75 786 aa8.31□□□□□ -1.08
NHLRC3-201ENST00000379599 SNTG1Q9NSN8 517 aa8.31□□□□□ -1.08
NHLRC3-201ENST00000379599 V9GYH0 126 aa8.31□□□□□ -1.08
NHLRC3-201ENST00000379599 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
NHLRC3-201ENST00000379599 RREB1Q92766 1687 aa8.31□□□□□ -1.08
NHLRC3-201ENST00000379599 IRS2Q9Y4H2 1338 aa8.31□□□□□ -1.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.8 ms