RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000378302.6

RCBTB1-202, Transcript of RCC1 and BTB domain containing protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RCBTB1, Length 4,033 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCBTB1-202ENST00000378302 DSC3Q14574 896 aa9.5□□□□□ -0.89
RCBTB1-202ENST00000378302 TATDN3Q17R31 274 aa9.5□□□□□ -0.89
RCBTB1-202ENST00000378302 PTCHD3Q3KNS1 767 aa9.5□□□□□ -0.89
RCBTB1-202ENST00000378302 SPDYE7PQ495Y7 208 aa9.5□□□□□ -0.89
RCBTB1-202ENST00000378302 SETMARQ53H47 684 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
RCBTB1-202ENST00000378302 TIGD7Q6NT04 549 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
RCBTB1-202ENST00000378302 VWA5B2Q8N398 1253 aa9.5□□□□□ -0.89
RCBTB1-202ENST00000378302 SLC37A3Q8NCC5 494 aa9.5□□□□□ -0.89
RCBTB1-202ENST00000378302 OR2T11Q8NH01 316 aa9.5□□□□□ -0.89
RCBTB1-202ENST00000378302 PEX13Q92968 403 aa9.5□□□□□ -0.89
RCBTB1-202ENST00000378302 L3HYPDHQ96EM0 354 aa9.5□□□□□ -0.89
RCBTB1-202ENST00000378302 VNN3Q9NY84 501 aa9.5□□□□□ -0.89
RCBTB1-202ENST00000378302 ZIM2Q9NZV7 527 aa9.5□□□□□ -0.89
RCBTB1-202ENST00000378302 NUP50Q9UKX7 468 aa9.5□□□□□ -0.89
RCBTB1-202ENST00000378302 PCDHGA12O60330 932 aa9.5□□□□□ -0.89
RCBTB1-202ENST00000378302 MTRF1O75570 445 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
RCBTB1-202ENST00000378302 FABP3P05413 133 aa9.5□□□□□ -0.89
RCBTB1-202ENST00000378302 HLA-DQB2P05538 268 aa9.5□□□□□ -0.89
RCBTB1-202ENST00000378302 FCER2P06734 321 aa9.5□□□□□ -0.89
RCBTB1-202ENST00000378302 ZNF250P15622 560 aa9.5□□□□□ -0.89
RCBTB1-202ENST00000378302 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
RCBTB1-202ENST00000378302 CD72P21854 359 aa9.5□□□□□ -0.89
RCBTB1-202ENST00000378302 FAM189BP81408 668 aa9.5□□□□□ -0.89
RCBTB1-202ENST00000378302 C19orf57Q0VDD7 668 aa9.5□□□□□ -0.89
RCBTB1-202ENST00000378302 GALNT1Q10472 559 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
RCBTB1-202ENST00000378302 SNAPC1Q16533 368 aa9.5□□□□□ -0.89
RCBTB1-202ENST00000378302 SPATS1Q496A3 300 aa9.5□□□□□ -0.89
RCBTB1-202ENST00000378302 RUNDC3AQ59EK9 446 aa9.5□□□□□ -0.89
RCBTB1-202ENST00000378302 CARD16Q5EG05 197 aa9.5□□□□□ -0.89
RCBTB1-202ENST00000378302 CHMP1BQ7LBR1 199 aa9.5□□□□□ -0.89
RCBTB1-202ENST00000378302 COMMD7Q86VX2 200 aa9.5□□□□□ -0.89
RCBTB1-202ENST00000378302 OR52B6Q8NGF0 335 aa9.5□□□□□ -0.89
RCBTB1-202ENST00000378302 CHAC2Q8WUX2 184 aa9.5□□□□□ -0.89
RCBTB1-202ENST00000378302 CENPIQ92674 756 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
RCBTB1-202ENST00000378302 C8orf48Q96LL4 319 aa9.5□□□□□ -0.89
RCBTB1-202ENST00000378302 BTBD2Q9BX70 525 aa9.5□□□□□ -0.89
RCBTB1-202ENST00000378302 C11orf54Q9H0W9 315 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
RCBTB1-202ENST00000378302 SP110Q9HB58 689 aa9.5□□□□□ -0.89
RCBTB1-202ENST00000378302 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa9.5□□□□□ -0.89
RCBTB1-202ENST00000378302 TMEFF2Q9UIK5 374 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
RCBTB1-202ENST00000378302 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
RCBTB1-202ENST00000378302 YJEFN3A6XGL0 299 aa9.49□□□□□ -0.89
RCBTB1-202ENST00000378302 PDHXO00330 501 aa9.49□□□□□ -0.89
RCBTB1-202ENST00000378302 TLR5O60602 858 aa9.49□□□□□ -0.89
RCBTB1-202ENST00000378302 CKMT1AP12532 417 aa9.49□□□□□ -0.89
RCBTB1-202ENST00000378302 CRISP3P54108 245 aa9.49□□□□□ -0.89
RCBTB1-202ENST00000378302 OLR1P78380 273 aa9.49□□□□□ -0.89
RCBTB1-202ENST00000378302 NPRL3Q12980 569 aa9.49□□□□□ -0.89
RCBTB1-202ENST00000378302 MAB21L1Q13394 359 aa9.49□□□□□ -0.89
RCBTB1-202ENST00000378302 CAMK2GQ13555 558 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
RCBTB1-202ENST00000378302 GALNT3Q14435 633 aa9.49□□□□□ -0.89
RCBTB1-202ENST00000378302 FGFBP1Q14512 234 aa9.49□□□□□ -0.89
RCBTB1-202ENST00000378302 PDE12Q6L8Q7 609 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
RCBTB1-202ENST00000378302 GPSM1Q86YR5 675 aa9.49□□□□□ -0.89
RCBTB1-202ENST00000378302 CILP2Q8IUL8 1156 aa9.49□□□□□ -0.89
RCBTB1-202ENST00000378302 KRTCAP2Q8N6L1 136 aa9.49□□□□□ -0.89
RCBTB1-202ENST00000378302 ZFAND1Q8TCF1 268 aa9.49□□□□□ -0.89
RCBTB1-202ENST00000378302 ST8SIA2Q92186 375 aa9.49□□□□□ -0.89
RCBTB1-202ENST00000378302 SMAD5Q99717 465 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
RCBTB1-202ENST00000378302 SPATA9Q9BWV2 254 aa9.49□□□□□ -0.89
RCBTB1-202ENST00000378302 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
RCBTB1-202ENST00000378302 IKZF5Q9H5V7 419 aa9.49□□□□□ -0.89
RCBTB1-202ENST00000378302 ZNF556Q9HAH1 456 aa9.49□□□□□ -0.89
RCBTB1-202ENST00000378302 C1orf109Q9NX04 203 aa9.49□□□□□ -0.89
RCBTB1-202ENST00000378302 MPP6Q9NZW5 540 aa9.49□□□□□ -0.89
RCBTB1-202ENST00000378302 COMMD3Q9UBI1 195 aa9.49□□□□□ -0.89
RCBTB1-202ENST00000378302 SPASTQ9UBP0 616 aa9.49□□□□□ -0.89
RCBTB1-202ENST00000378302 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
RCBTB1-202ENST00000378302 ZNF112Q9UJU3 913 aa9.49□□□□□ -0.89
RCBTB1-202ENST00000378302 STOML2Q9UJZ1 356 aa9.49□□□□□ -0.89
RCBTB1-202ENST00000378302 SCAMP3O14828 347 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
RCBTB1-202ENST00000378302 ANKRD28O15084 1053 aa9.49□□□□□ -0.89
RCBTB1-202ENST00000378302 SLC16A6O15403 523 aa9.49□□□□□ -0.89
RCBTB1-202ENST00000378302 GSTM1P09488 218 aa9.49□□□□□ -0.89
RCBTB1-202ENST00000378302 PRSS56P0CW18 603 aa9.49□□□□□ -0.89
RCBTB1-202ENST00000378302 POU3F3P20264 500 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
RCBTB1-202ENST00000378302 RGS6P49758 472 aa9.49□□□□□ -0.89
RCBTB1-202ENST00000378302 RPA4Q13156 261 aa9.49□□□□□ -0.89
RCBTB1-202ENST00000378302 FADDQ13158 208 aa9.49□□□□□ -0.89
RCBTB1-202ENST00000378302 LCN1P1Q5VSP4 162 aa9.49□□□□□ -0.89
RCBTB1-202ENST00000378302 NADSYN1Q6IA69 706 aa9.49□□□□□ -0.89
RCBTB1-202ENST00000378302 OVOS1Q6IE37 1185 aa9.49□□□□□ -0.89
RCBTB1-202ENST00000378302 SLC46A3Q7Z3Q1 461 aa9.49□□□□□ -0.89
RCBTB1-202ENST00000378302 GLRX5Q86SX6 157 aa9.49□□□□□ -0.89
RCBTB1-202ENST00000378302 LUZP2Q86TE4 346 aa9.49□□□□□ -0.89
RCBTB1-202ENST00000378302 FBXL6Q8N531 539 aa9.49□□□□□ -0.89
RCBTB1-202ENST00000378302 LPCAT1Q8NF37 534 aa9.49□□□□□ -0.89
RCBTB1-202ENST00000378302 PJA1Q8NG27 643 aa9.49□□□□□ -0.89
RCBTB1-202ENST00000378302 ZNF431Q8TF32 576 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
RCBTB1-202ENST00000378302 TSSK3Q96PN8 268 aa9.49□□□□□ -0.89
RCBTB1-202ENST00000378302 DPCDQ9BVM2 203 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
RCBTB1-202ENST00000378302 THUMPD1Q9NXG2 353 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
RCBTB1-202ENST00000378302 RDH8Q9NYR8 311 aa9.49□□□□□ -0.89
RCBTB1-202ENST00000378302 TAS2R13Q9NYV9 303 aa9.49□□□□□ -0.89
RCBTB1-202ENST00000378302 SLC23A1Q9UHI7 598 aa9.49□□□□□ -0.89
RCBTB1-202ENST00000378302 TSPAN1O60635 241 aa9.49□□□□□ -0.89
RCBTB1-202ENST00000378302 MLYCDO95822 493 aa9.49□□□□□ -0.89
RCBTB1-202ENST00000378302 SCNN1GP51170 649 aa9.49□□□□□ -0.89
RCBTB1-202ENST00000378302 GALEQ14376 348 aa9.49□□□□□ -0.89
RCBTB1-202ENST00000378302 PARP15Q460N3 678 aa9.49□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.4 ms