RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361543.3

SGMS1-201, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SGMS1, Length 1,096 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-201ENST00000361543 LINC01555Q8NAE3 123 aa7.39□□□□□ -1.23
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SGMS1-201ENST00000361543 CALML6Q8TD86 181 aa7.39□□□□□ -1.23
SGMS1-201ENST00000361543 SEC14L1Q92503 715 aa7.39□□□□□ -1.23
SGMS1-201ENST00000361543 FAM136AQ96C01 138 aa7.39□□□□□ -1.23
SGMS1-201ENST00000361543 LRFN5Q96NI6 719 aa7.39□□□□□ -1.23
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SGMS1-201ENST00000361543 CHST8Q9H2A9 424 aa7.39□□□□□ -1.23
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SGMS1-201ENST00000361543 IL17FQ96PD4 163 aa7.38□□□□□ -1.23
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SGMS1-201ENST00000361543 MKRN2OSH3BPM6 223 aa7.37□□□□□ -1.23
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SGMS1-201ENST00000361543 USP1O94782 785 aa7.37□□□□□ -1.23
SGMS1-201ENST00000361543 MATN4O95460 622 aa7.37□□□□□ -1.23
SGMS1-201ENST00000361543 C1orf105O95561 183 aa7.37□□□□□ -1.23
SGMS1-201ENST00000361543 S1PR4O95977 384 aa7.37□□□□□ -1.23
SGMS1-201ENST00000361543 F7P08709 466 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
SGMS1-201ENST00000361543 RAB40ALP0C0E4 278 aa7.37□□□□□ -1.23
SGMS1-201ENST00000361543 PKMP14618 531 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
SGMS1-201ENST00000361543 HOXB1P14653 301 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
SGMS1-201ENST00000361543 CHRM3P20309 590 aa7.37□□□□□ -1.23
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