RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000345425.6

GIPC1-201, Transcript of GIPC PDZ domain containing family member 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GIPC1, Length 1,782 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC1-201ENST00000345425 IGHV1OR21-1A0A087WYE8 117 aa26.88■■□□□ 1.89
GIPC1-201ENST00000345425 OR5K3A6NET4 321 aa26.88■■□□□ 1.89
GIPC1-201ENST00000345425 MATN2O00339 956 aa26.88■■□□□ 1.89
GIPC1-201ENST00000345425 TAPBPO15533 448 aa26.88■■□□□ 1.89
GIPC1-201ENST00000345425 GP1BAP07359 652 aa26.88■■□□□ 1.89
GIPC1-201ENST00000345425 CHRM5P08912 532 aaPredicted RBP26.88■■□□□ 1.89
GIPC1-201ENST00000345425 CAPZBP47756 277 aa26.88■■□□□ 1.89
GIPC1-201ENST00000345425 OR1D5P58170 312 aa26.88■■□□□ 1.89
GIPC1-201ENST00000345425 TBPL1P62380 186 aa26.88■■□□□ 1.89
GIPC1-201ENST00000345425 FASTKQ14296 549 aaKnown RBP26.88■■□□□ 1.89
GIPC1-201ENST00000345425 PCLAFQ15004 111 aa26.88■■□□□ 1.89
GIPC1-201ENST00000345425 PTCHD3Q3KNS1 767 aa26.88■■□□□ 1.89
GIPC1-201ENST00000345425 HHATQ5VTY9 493 aa26.88■■□□□ 1.89
GIPC1-201ENST00000345425 CAPN13Q6MZZ7 669 aaPredicted RBP26.88■■□□□ 1.89
GIPC1-201ENST00000345425 ARMC6Q6NXE6 501 aa26.88■■□□□ 1.89
GIPC1-201ENST00000345425 LRRC56Q8IYG6 542 aaPredicted RBP26.88■■□□□ 1.89
GIPC1-201ENST00000345425 ADGRF3Q8IZF5 1079 aa26.88■■□□□ 1.89
GIPC1-201ENST00000345425 Q8N9G6 341 aaPredicted RBP26.88■■□□□ 1.89
GIPC1-201ENST00000345425 SREK1Q8WXA9 508 aaKnown RBP26.88■■□□□ 1.89
GIPC1-201ENST00000345425 SLC22A18Q96BI1 424 aa26.88■■□□□ 1.89
GIPC1-201ENST00000345425 TMEM79Q9BSE2 394 aa26.88■■□□□ 1.89
GIPC1-201ENST00000345425 HRASLS2Q9NWW9 162 aa26.88■■□□□ 1.89
GIPC1-201ENST00000345425 ZNF292O60281 2723 aa26.88■■□□□ 1.89
GIPC1-201ENST00000345425 PIPSLA2A3N6 862 aa26.87■■□□□ 1.89
GIPC1-201ENST00000345425 BTN3A3O00478 584 aa26.87■■□□□ 1.89
GIPC1-201ENST00000345425 DUX1O43812 170 aa26.87■■□□□ 1.89
GIPC1-201ENST00000345425 STK16O75716 305 aa26.87■■□□□ 1.89
GIPC1-201ENST00000345425 TYRP1P17643 537 aa26.87■■□□□ 1.89
GIPC1-201ENST00000345425 TSTA3Q13630 321 aaPredicted RBP26.87■■□□□ 1.89
GIPC1-201ENST00000345425 METTL2BQ6P1Q9 378 aaKnown RBP26.87■■□□□ 1.89
GIPC1-201ENST00000345425 C2orf73Q8N5S3 287 aaPredicted RBP26.87■■□□□ 1.89
GIPC1-201ENST00000345425 CD244Q9BZW8 370 aa26.87■■□□□ 1.89
GIPC1-201ENST00000345425 SLC32A1Q9H598 525 aa26.87■■□□□ 1.89
GIPC1-201ENST00000345425 OXSMQ9NWU1 459 aa26.87■■□□□ 1.89
GIPC1-201ENST00000345425 DHRS4L1P0CG22 281 aa26.86■■□□□ 1.89
GIPC1-201ENST00000345425 SLC6A12P48065 614 aa26.86■■□□□ 1.89
GIPC1-201ENST00000345425 SERPINB4P48594 390 aa26.86■■□□□ 1.89
GIPC1-201ENST00000345425 HSPA7P48741 367 aa26.86■■□□□ 1.89
GIPC1-201ENST00000345425 PRKAA2P54646 552 aa26.86■■□□□ 1.89
GIPC1-201ENST00000345425 ASPHQ12797 758 aa26.86■■□□□ 1.89
GIPC1-201ENST00000345425 KIR2DS3Q14952 304 aa26.86■■□□□ 1.89
GIPC1-201ENST00000345425 PCBP2Q15366 365 aaKnown RBP eCLIP26.86■■□□□ 1.898e-8■■■□□ 15.4
GIPC1-201ENST00000345425 ZXDCQ2QGD7 858 aaPredicted RBP26.86■■□□□ 1.89
GIPC1-201ENST00000345425 TAX1BP1Q86VP1 789 aa26.86■■□□□ 1.89
GIPC1-201ENST00000345425 RSC1A1Q92681 617 aa26.86■■□□□ 1.89
GIPC1-201ENST00000345425 PCBD2Q9H0N5 130 aa26.86■■□□□ 1.89
GIPC1-201ENST00000345425 C2orf74A8MZ97 194 aa26.86■■□□□ 1.89
GIPC1-201ENST00000345425 B4GAT1O43505 415 aa26.86■■□□□ 1.89
GIPC1-201ENST00000345425 POLR2CP19387 275 aaPredicted RBP26.86■■□□□ 1.89
GIPC1-201ENST00000345425 KCNA4P22459 653 aa26.86■■□□□ 1.89
GIPC1-201ENST00000345425 AGTR2P50052 363 aa26.86■■□□□ 1.89
GIPC1-201ENST00000345425 C18orf21Q32NC0 220 aaPredicted RBP26.86■■□□□ 1.89
GIPC1-201ENST00000345425 FBXO48Q5FWF7 155 aa26.86■■□□□ 1.89
GIPC1-201ENST00000345425 THEMIS2Q5TEJ8 643 aa26.86■■□□□ 1.89
GIPC1-201ENST00000345425 SUSD1Q6UWL2 747 aa26.86■■□□□ 1.89
GIPC1-201ENST00000345425 LRRC70Q7Z2Q7 622 aa26.86■■□□□ 1.89
GIPC1-201ENST00000345425 C10orf107Q8IVU9 208 aa26.86■■□□□ 1.89
GIPC1-201ENST00000345425 KLHDC8AQ8IYD2 350 aa26.86■■□□□ 1.89
GIPC1-201ENST00000345425 ARFGAP2Q8N6H7 521 aa26.86■■□□□ 1.89
GIPC1-201ENST00000345425 MGARPQ8TDB4 240 aa26.86■■□□□ 1.89
GIPC1-201ENST00000345425 PYCR2Q96C36 320 aa26.86■■□□□ 1.89
GIPC1-201ENST00000345425 PAIP2Q9BPZ3 127 aaKnown RBP26.86■■□□□ 1.89
GIPC1-201ENST00000345425 SGPP1Q9BX95 441 aa26.86■■□□□ 1.89
GIPC1-201ENST00000345425 GSAPA4D1B5 854 aa26.85■■□□□ 1.89
GIPC1-201ENST00000345425 BIRC5O15392 142 aa26.85■■□□□ 1.89
GIPC1-201ENST00000345425 WDR47O94967 919 aa26.85■■□□□ 1.89
GIPC1-201ENST00000345425 BPGMP07738 259 aa26.85■■□□□ 1.89
GIPC1-201ENST00000345425 OAS2P29728 719 aaKnown RBP26.85■■□□□ 1.89
GIPC1-201ENST00000345425 DNAJB13P59910 316 aa26.85■■□□□ 1.89
GIPC1-201ENST00000345425 HERVK_113P63132 956 aa26.85■■□□□ 1.89
GIPC1-201ENST00000345425 LIPMQ5VYY2 423 aa26.85■■□□□ 1.89
GIPC1-201ENST00000345425 LMNTD1Q8N9Z9 388 aa26.85■■□□□ 1.89
GIPC1-201ENST00000345425 ESAMQ96AP7 390 aa26.85■■□□□ 1.89
GIPC1-201ENST00000345425 MIPEPQ99797 713 aa26.85■■□□□ 1.89
GIPC1-201ENST00000345425 ERVK-6Q9BXR3 956 aa26.85■■□□□ 1.89
GIPC1-201ENST00000345425 TWSG1Q9GZX9 223 aa26.85■■□□□ 1.89
GIPC1-201ENST00000345425 ZMYND15Q9H091 742 aa26.85■■□□□ 1.89
GIPC1-201ENST00000345425 MLXIPLQ9NP71 852 aa26.85■■□□□ 1.89
GIPC1-201ENST00000345425 OGFRQ9NZT2 677 aa26.85■■□□□ 1.89
GIPC1-201ENST00000345425 OPTCQ9UBM4 332 aa26.85■■□□□ 1.89
GIPC1-201ENST00000345425 PCDHB11Q9Y5F2 797 aa26.85■■□□□ 1.89
GIPC1-201ENST00000345425 GVINP1Q7Z2Y8 2422 aa26.84■■□□□ 1.89
GIPC1-201ENST00000345425 RP1P56715 2156 aa26.84■■□□□ 1.89
GIPC1-201ENST00000345425 ISM1B1AKI9 464 aa26.84■■□□□ 1.89
GIPC1-201ENST00000345425 CCNT2O60583 730 aaKnown RBP26.84■■□□□ 1.89
GIPC1-201ENST00000345425 IMPDH1P20839 514 aa26.84■■□□□ 1.89
GIPC1-201ENST00000345425 EEF1DP29692 281 aaKnown RBP26.84■■□□□ 1.89
GIPC1-201ENST00000345425 ALDH3A1P30838 453 aa26.84■■□□□ 1.89
GIPC1-201ENST00000345425 ACADVLP49748 655 aa26.84■■□□□ 1.89
GIPC1-201ENST00000345425 AMZ1Q400G9 498 aa26.84■■□□□ 1.89
GIPC1-201ENST00000345425 RAB33BQ9H082 229 aa26.84■■□□□ 1.89
GIPC1-201ENST00000345425 ABCF3Q9NUQ8 709 aa26.84■■□□□ 1.89
GIPC1-201ENST00000345425 INTS7Q9NVH2 962 aaKnown RBP26.84■■□□□ 1.89
GIPC1-201ENST00000345425 ACTR10Q9NZ32 417 aa26.84■■□□□ 1.89
GIPC1-201ENST00000345425 A0A1W2PPV9 198 aa26.84■■□□□ 1.89
GIPC1-201ENST00000345425 TRIM13O60858 407 aa26.84■■□□□ 1.89
GIPC1-201ENST00000345425 SIX3O95343 332 aaPredicted RBP26.84■■□□□ 1.89
GIPC1-201ENST00000345425 GDF5P43026 501 aa26.84■■□□□ 1.89
GIPC1-201ENST00000345425 WDR4P57081 412 aaKnown RBP26.84■■□□□ 1.89
GIPC1-201ENST00000345425 ILKQ13418 452 aa26.84■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.6 ms