RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000318988.10

CTDNEP1-201, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDNEP1, Length 1,549 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-201ENST00000318988 RAP2CQ9Y3L5 183 aa26.58■■□□□ 1.85
CTDNEP1-201ENST00000318988 ZNF318Q5VUA4 2279 aa26.57■■□□□ 1.84
CTDNEP1-201ENST00000318988 OTCP00480 354 aa26.57■■□□□ 1.84
CTDNEP1-201ENST00000318988 RETP07949 1114 aa26.57■■□□□ 1.84
CTDNEP1-201ENST00000318988 CCNG1P51959 295 aa26.57■■□□□ 1.84
CTDNEP1-201ENST00000318988 FASTKQ14296 549 aaKnown RBP26.57■■□□□ 1.84
CTDNEP1-201ENST00000318988 GPR18Q14330 331 aa26.57■■□□□ 1.84
CTDNEP1-201ENST00000318988 ZXDCQ2QGD7 858 aaPredicted RBP26.57■■□□□ 1.84
CTDNEP1-201ENST00000318988 C6orf132Q5T0Z8 1188 aa26.57■■□□□ 1.84
CTDNEP1-201ENST00000318988 OGFOD3Q6PK18 319 aa26.57■■□□□ 1.84
CTDNEP1-201ENST00000318988 AMIGO1Q86WK6 493 aa26.57■■□□□ 1.84
CTDNEP1-201ENST00000318988 SFTPA2Q8IWL1 248 aa26.57■■□□□ 1.84
CTDNEP1-201ENST00000318988 KIRREL3Q8IZU9 778 aa26.57■■□□□ 1.84
CTDNEP1-201ENST00000318988 LSMEM2Q8N112 164 aa26.57■■□□□ 1.84
CTDNEP1-201ENST00000318988 ARL14Q8N4G2 192 aa26.57■■□□□ 1.84
CTDNEP1-201ENST00000318988 OR4E2Q8NGC2 313 aa26.57■■□□□ 1.84
CTDNEP1-201ENST00000318988 MIPEPQ99797 713 aa26.57■■□□□ 1.84
CTDNEP1-201ENST00000318988 DUSP23Q9BVJ7 150 aa26.57■■□□□ 1.84
CTDNEP1-201ENST00000318988 PCBD2Q9H0N5 130 aa26.57■■□□□ 1.84
CTDNEP1-201ENST00000318988 SMOC1Q9H4F8 434 aa26.57■■□□□ 1.84
CTDNEP1-201ENST00000318988 IL21RQ9HBE5 538 aa26.57■■□□□ 1.84
CTDNEP1-201ENST00000318988 MID1IP1Q9NPA3 183 aa26.57■■□□□ 1.84
CTDNEP1-201ENST00000318988 INTS7Q9NVH2 962 aaKnown RBP26.57■■□□□ 1.84
CTDNEP1-201ENST00000318988 EPB41L3Q9Y2J2 1087 aaPredicted RBP26.57■■□□□ 1.84
CTDNEP1-201ENST00000318988 DYRK1BQ9Y463 629 aa26.57■■□□□ 1.84
CTDNEP1-201ENST00000318988 CRCPO75575 148 aa26.56■■□□□ 1.84
CTDNEP1-201ENST00000318988 MAZP56270 477 aaKnown RBP26.56■■□□□ 1.84
CTDNEP1-201ENST00000318988 CDC16Q13042 620 aa26.56■■□□□ 1.84
CTDNEP1-201ENST00000318988 SUSD1Q6UWL2 747 aa26.56■■□□□ 1.84
CTDNEP1-201ENST00000318988 CUZD1Q86UP6 607 aa26.56■■□□□ 1.84
CTDNEP1-201ENST00000318988 AFAP1L2Q8N4X5 818 aa26.56■■□□□ 1.84
CTDNEP1-201ENST00000318988 PRSS33Q8NF86 280 aa26.56■■□□□ 1.84
CTDNEP1-201ENST00000318988 SETD7Q8WTS6 366 aaKnown RBP26.56■■□□□ 1.84
CTDNEP1-201ENST00000318988 SORT1Q99523 831 aa26.56■■□□□ 1.84
CTDNEP1-201ENST00000318988 MENTQ9BUN1 341 aa26.56■■□□□ 1.84
CTDNEP1-201ENST00000318988 SGPP1Q9BX95 441 aa26.56■■□□□ 1.84
CTDNEP1-201ENST00000318988 ZBTB26Q9HCK0 441 aa26.56■■□□□ 1.84
CTDNEP1-201ENST00000318988 NLGN3Q9NZ94 848 aa26.56■■□□□ 1.84
CTDNEP1-201ENST00000318988 OR6C2Q9NZP2 312 aa26.56■■□□□ 1.84
CTDNEP1-201ENST00000318988 KCNE2Q9Y6J6 123 aa26.56■■□□□ 1.84
CTDNEP1-201ENST00000318988 TP53BP1Q12888 1972 aaPredicted RBP26.56■■□□□ 1.84
CTDNEP1-201ENST00000318988 NOBOXO60393 691 aa26.55■■□□□ 1.84
CTDNEP1-201ENST00000318988 ENGP17813 658 aa26.55■■□□□ 1.84
CTDNEP1-201ENST00000318988 ARRB2P32121 409 aa26.55■■□□□ 1.84
CTDNEP1-201ENST00000318988 PKNOX1P55347 436 aa26.55■■□□□ 1.84
CTDNEP1-201ENST00000318988 TCF15Q12870 199 aa26.55■■□□□ 1.84
CTDNEP1-201ENST00000318988 C14orf28Q4W4Y0 310 aa26.55■■□□□ 1.84
CTDNEP1-201ENST00000318988 GPRIN3Q6ZVF9 776 aa26.55■■□□□ 1.84
CTDNEP1-201ENST00000318988 GATAD2AQ86YP4 633 aa26.55■■□□□ 1.84
CTDNEP1-201ENST00000318988 HMGCLL1Q8TB92 370 aa26.55■■□□□ 1.84
CTDNEP1-201ENST00000318988 SAP25Q8TEE9 199 aa26.55■■□□□ 1.84
CTDNEP1-201ENST00000318988 JPH3Q8WXH2 748 aaPredicted RBP26.55■■□□□ 1.84
CTDNEP1-201ENST00000318988 ATOH1Q92858 354 aaPredicted RBP26.55■■□□□ 1.84
CTDNEP1-201ENST00000318988 ZNF382Q96SR6 550 aa26.55■■□□□ 1.84
CTDNEP1-201ENST00000318988 HAUS8Q9BT25 410 aa26.55■■□□□ 1.84
CTDNEP1-201ENST00000318988 CACNA1EQ15878 2313 aa26.55■■□□□ 1.84
CTDNEP1-201ENST00000318988 CLGNO14967 610 aa26.55■■□□□ 1.84
CTDNEP1-201ENST00000318988 TROVE2P10155 538 aaKnown RBP eCLIP26.55■■□□□ 1.84
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CTDNEP1-201ENST00000318988 FASLGP48023 281 aa26.55■■□□□ 1.84
CTDNEP1-201ENST00000318988 SH2D4BQ5SQS7 431 aa26.55■■□□□ 1.84
CTDNEP1-201ENST00000318988 PRAMEF13Q5VWM6 474 aa26.55■■□□□ 1.84
CTDNEP1-201ENST00000318988 TMEM26Q6ZUK4 368 aa26.55■■□□□ 1.84
CTDNEP1-201ENST00000318988 LRRC56Q8IYG6 542 aaPredicted RBP26.55■■□□□ 1.84
CTDNEP1-201ENST00000318988 ARL10Q8N8L6 244 aa26.55■■□□□ 1.84
CTDNEP1-201ENST00000318988 LMNTD1Q8N9Z9 388 aa26.55■■□□□ 1.84
CTDNEP1-201ENST00000318988 AGR3Q8TD06 166 aa26.55■■□□□ 1.84
CTDNEP1-201ENST00000318988 LDHAL6BQ9BYZ2 381 aaPredicted RBP26.55■■□□□ 1.84
CTDNEP1-201ENST00000318988 PI4KAP42356 2102 aa26.54■■□□□ 1.84
CTDNEP1-201ENST00000318988 KITP10721 976 aa26.54■■□□□ 1.84
CTDNEP1-201ENST00000318988 RPL14P50914 215 aaKnown RBP26.54■■□□□ 1.84
CTDNEP1-201ENST00000318988 PLA2G2CQ5R387 149 aa26.54■■□□□ 1.84
CTDNEP1-201ENST00000318988 MILR1Q7Z6M3 343 aa26.54■■□□□ 1.84
CTDNEP1-201ENST00000318988 ZNF781Q8N8C0 355 aa26.54■■□□□ 1.84
CTDNEP1-201ENST00000318988 KYQ8NBH2 561 aa26.54■■□□□ 1.84
CTDNEP1-201ENST00000318988 GPR156Q8NFN8 814 aa26.54■■□□□ 1.84
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CTDNEP1-201ENST00000318988 ACTR8Q9H981 624 aa26.54■■□□□ 1.84
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CTDNEP1-201ENST00000318988 RHPN2P1A8MT19 583 aa26.53■■□□□ 1.84
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CTDNEP1-201ENST00000318988 OR7A17O14581 309 aa26.53■■□□□ 1.84
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CTDNEP1-201ENST00000318988 SH3BP2P78314 561 aa26.53■■□□□ 1.84
CTDNEP1-201ENST00000318988 ZCCHC8Q6NZY4 707 aaKnown RBP26.53■■□□□ 1.84
CTDNEP1-201ENST00000318988 LCTLQ6UWM7 567 aa26.53■■□□□ 1.84
CTDNEP1-201ENST00000318988 WDR75Q8IWA0 830 aaKnown RBP26.53■■□□□ 1.84
CTDNEP1-201ENST00000318988 LINC01555Q8NAE3 123 aa26.53■■□□□ 1.84
CTDNEP1-201ENST00000318988 OR2I1PQ8NGU4 316 aa26.53■■□□□ 1.84
CTDNEP1-201ENST00000318988 PIWIL2Q8TC59 973 aaKnown RBP26.53■■□□□ 1.84
CTDNEP1-201ENST00000318988 AGAP11Q8TF27 550 aa26.53■■□□□ 1.84
CTDNEP1-201ENST00000318988 SLC38A3Q99624 504 aa26.53■■□□□ 1.84
CTDNEP1-201ENST00000318988 NRTNQ99748 197 aa26.53■■□□□ 1.84
CTDNEP1-201ENST00000318988 RABEP2Q9H5N1 569 aa26.53■■□□□ 1.84
CTDNEP1-201ENST00000318988 PSD3Q9NYI0 1048 aa26.53■■□□□ 1.84
CTDNEP1-201ENST00000318988 MARCOQ9UEW3 520 aaPredicted RBP26.53■■□□□ 1.84
CTDNEP1-201ENST00000318988 ZDHHC2Q9UIJ5 367 aa26.53■■□□□ 1.84
CTDNEP1-201ENST00000318988 FAM221BA6H8Z2 402 aa26.52■■□□□ 1.84
CTDNEP1-201ENST00000318988 UBFD1O14562 309 aaKnown RBP26.52■■□□□ 1.84
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