RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000300057.4

MESP1-201, Transcript of mesoderm posterior bHLH transcription factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene MESP1, Length 2,369 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MESP1-201ENST00000300057 ANKRD26P1Q6NSI1 321 aa20.93■□□□□ 0.94
MESP1-201ENST00000300057 DHFR2Q86XF0 187 aa20.93■□□□□ 0.94
MESP1-201ENST00000300057 TRAM1L1Q8N609 369 aa20.93■□□□□ 0.94
MESP1-201ENST00000300057 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa20.93■□□□□ 0.94
MESP1-201ENST00000300057 DNAJB14Q8TBM8 379 aa20.93■□□□□ 0.94
MESP1-201ENST00000300057 WFIKKN2Q8TEU8 576 aa20.93■□□□□ 0.94
MESP1-201ENST00000300057 STARD8Q92502 1023 aa20.93■□□□□ 0.94
MESP1-201ENST00000300057 WRAP53Q9BUR4 548 aaKnown RBP20.93■□□□□ 0.94
MESP1-201ENST00000300057 HEBP1Q9NRV9 189 aa20.93■□□□□ 0.94
MESP1-201ENST00000300057 FAM234BA2RU67 622 aa20.92■□□□□ 0.94
MESP1-201ENST00000300057 OTOL1A6NHN0 477 aaPredicted RBP20.92■□□□□ 0.94
MESP1-201ENST00000300057 EIF3FO00303 357 aaPredicted RBP20.92■□□□□ 0.94
MESP1-201ENST00000300057 EEDO75530 441 aaKnown RBP20.92■□□□□ 0.94
MESP1-201ENST00000300057 C8GP07360 202 aa20.92■□□□□ 0.94
MESP1-201ENST00000300057 SLC2A4P14672 509 aa20.92■□□□□ 0.94
MESP1-201ENST00000300057 MMP12P39900 470 aa20.92■□□□□ 0.94
MESP1-201ENST00000300057 HMGCS1Q01581 520 aa20.92■□□□□ 0.94
MESP1-201ENST00000300057 GPR107Q5VW38 600 aa20.92■□□□□ 0.94
MESP1-201ENST00000300057 CYP20A1Q6UW02 462 aa20.92■□□□□ 0.94
MESP1-201ENST00000300057 TSPEARQ8WU66 669 aa20.92■□□□□ 0.94
MESP1-201ENST00000300057 NUDT8Q8WV74 236 aa20.92■□□□□ 0.94
MESP1-201ENST00000300057 ASB11Q8WXH4 323 aa20.92■□□□□ 0.94
MESP1-201ENST00000300057 ZSCAN5AQ9BUG6 496 aa20.92■□□□□ 0.94
MESP1-201ENST00000300057 SLC12A9Q9BXP2 914 aa20.92■□□□□ 0.94
MESP1-201ENST00000300057 TRIM54Q9BYV2 358 aa20.92■□□□□ 0.94
MESP1-201ENST00000300057 TRPV5Q9NQA5 729 aa20.92■□□□□ 0.94
MESP1-201ENST00000300057 PABPN1LA6NDY0 278 aaKnown RBP20.92■□□□□ 0.94
MESP1-201ENST00000300057 AKAP10O43572 662 aa20.92■□□□□ 0.94
MESP1-201ENST00000300057 SGTAO43765 313 aa20.92■□□□□ 0.94
MESP1-201ENST00000300057 NOL3O60936 208 aaKnown RBP20.92■□□□□ 0.94
MESP1-201ENST00000300057 EIF2S1P05198 315 aaKnown RBP20.92■□□□□ 0.94
MESP1-201ENST00000300057 HIST1H2AGP0C0S8 130 aaPredicted RBP20.92■□□□□ 0.94
MESP1-201ENST00000300057 EBLN1P0CF75 366 aa20.92■□□□□ 0.94
MESP1-201ENST00000300057 HIST1H2ADP20671 130 aa20.92■□□□□ 0.94
MESP1-201ENST00000300057 MYF6P23409 242 aa20.92■□□□□ 0.94
MESP1-201ENST00000300057 NRIP1P48552 1158 aa20.92■□□□□ 0.94
MESP1-201ENST00000300057 BNIP3Q12983 259 aa20.92■□□□□ 0.94
MESP1-201ENST00000300057 PLEKHS1Q5SXH7 462 aa20.92■□□□□ 0.94
MESP1-201ENST00000300057 C9orf50Q5SZB4 431 aa20.92■□□□□ 0.94
MESP1-201ENST00000300057 ERAP2Q6P179 960 aa20.92■□□□□ 0.94
MESP1-201ENST00000300057 NPAS3Q8IXF0 933 aa20.92■□□□□ 0.94
MESP1-201ENST00000300057 ANKFN1Q8N957 763 aa20.92■□□□□ 0.94
MESP1-201ENST00000300057 BPIFB1Q8TDL5 484 aa20.92■□□□□ 0.94
MESP1-201ENST00000300057 EFHD2Q96C19 240 aaPredicted RBP20.92■□□□□ 0.94
MESP1-201ENST00000300057 PYCR2Q96C36 320 aa20.92■□□□□ 0.94
MESP1-201ENST00000300057 MTFMTQ96DP5 389 aaKnown RBP20.92■□□□□ 0.94
MESP1-201ENST00000300057 HIST1H2AHQ96KK5 128 aa20.92■□□□□ 0.94
MESP1-201ENST00000300057 HIST1H2AJQ99878 128 aa20.92■□□□□ 0.94
MESP1-201ENST00000300057 H2AFJQ9BTM1 129 aa20.92■□□□□ 0.94
MESP1-201ENST00000300057 NTMT1Q9BV86 223 aa20.92■□□□□ 0.94
MESP1-201ENST00000300057 ACTR8Q9H981 624 aa20.92■□□□□ 0.94
MESP1-201ENST00000300057 SLAMF8Q9P0V8 285 aa20.92■□□□□ 0.94
MESP1-201ENST00000300057 DKK3Q9UBP4 350 aa20.92■□□□□ 0.94
MESP1-201ENST00000300057 LEF1Q9UJU2 399 aaPredicted RBP20.92■□□□□ 0.94
MESP1-201ENST00000300057 ZNF490Q9ULM2 529 aaPredicted RBP20.92■□□□□ 0.94
MESP1-201ENST00000300057 TMX2-CTNND1H3BSU7 103 aa20.91■□□□□ 0.94
MESP1-201ENST00000300057 KPNA4O00629 521 aaPredicted RBP20.91■□□□□ 0.94
MESP1-201ENST00000300057 ULK1O75385 1050 aa20.91■□□□□ 0.94
MESP1-201ENST00000300057 POU2F2P09086 479 aa20.91■□□□□ 0.94
MESP1-201ENST00000300057 AAK1Q2M2I8 961 aa20.91■□□□□ 0.94
MESP1-201ENST00000300057 ZXDCQ2QGD7 858 aaPredicted RBP20.91■□□□□ 0.94
MESP1-201ENST00000300057 FNDC3BQ53EP0 1204 aaKnown RBP20.91■□□□□ 0.94
MESP1-201ENST00000300057 PACRGLQ8N7B6 248 aa20.91■□□□□ 0.94
MESP1-201ENST00000300057 LRIG1Q96JA1 1093 aa20.91■□□□□ 0.94
MESP1-201ENST00000300057 CNDP2Q96KP4 475 aaKnown RBP20.91■□□□□ 0.94
MESP1-201ENST00000300057 CCDC138Q96M89 665 aa20.91■□□□□ 0.94
MESP1-201ENST00000300057 SLC32A1Q9H598 525 aa20.91■□□□□ 0.94
MESP1-201ENST00000300057 EGFL7Q9UHF1 273 aa20.91■□□□□ 0.94
MESP1-201ENST00000300057 TRPS1Q9UHF7 1281 aa20.91■□□□□ 0.94
MESP1-201ENST00000300057 CCL27Q9Y4X3 112 aa20.91■□□□□ 0.94
MESP1-201ENST00000300057 TMEM202A6NGA9 273 aa20.9■□□□□ 0.94
MESP1-201ENST00000300057 RGS14O43566 566 aa20.9■□□□□ 0.94
MESP1-201ENST00000300057 ENO2P09104 434 aaPredicted RBP20.9■□□□□ 0.94
MESP1-201ENST00000300057 MPC1LP0DKB6 136 aa20.9■□□□□ 0.94
MESP1-201ENST00000300057 ATP6V1B2P21281 511 aa20.9■□□□□ 0.94
MESP1-201ENST00000300057 PRKG2Q13237 762 aa20.9■□□□□ 0.94
MESP1-201ENST00000300057 PMS2P3Q13401 168 aa20.9■□□□□ 0.94
MESP1-201ENST00000300057 CLPPQ16740 277 aaPredicted RBP20.9■□□□□ 0.94
MESP1-201ENST00000300057 RABL3Q5HYI8 236 aa20.9■□□□□ 0.94
MESP1-201ENST00000300057 IRAK1BP1Q5VVH5 260 aa20.9■□□□□ 0.94
MESP1-201ENST00000300057 PDE12Q6L8Q7 609 aaKnown RBP20.9■□□□□ 0.94
MESP1-201ENST00000300057 METTL2BQ6P1Q9 378 aaKnown RBP20.9■□□□□ 0.94
MESP1-201ENST00000300057 LIPIQ6XZB0 460 aa20.9■□□□□ 0.94
MESP1-201ENST00000300057 NANOGNBQ7Z5D8 188 aa20.9■□□□□ 0.94
MESP1-201ENST00000300057 TECPR1Q7Z6L1 1165 aa20.9■□□□□ 0.94
MESP1-201ENST00000300057 ZFAND4Q86XD8 727 aa20.9■□□□□ 0.94
MESP1-201ENST00000300057 PPP3R2Q96LZ3 170 aa20.9■□□□□ 0.94
MESP1-201ENST00000300057 P2RY13Q9BPV8 354 aa20.9■□□□□ 0.94
MESP1-201ENST00000300057 ACTL8Q9H568 366 aa20.9■□□□□ 0.94
MESP1-201ENST00000300057 SLC27A6Q9Y2P4 619 aa20.9■□□□□ 0.94
MESP1-201ENST00000300057 MANBAO00462 879 aa20.9■□□□□ 0.94
MESP1-201ENST00000300057 INPP4BO15327 924 aa20.9■□□□□ 0.94
MESP1-201ENST00000300057 WDR47O94967 919 aa20.9■□□□□ 0.94
MESP1-201ENST00000300057 EPORP19235 508 aa20.9■□□□□ 0.94
MESP1-201ENST00000300057 CD247P20963 164 aa20.9■□□□□ 0.94
MESP1-201ENST00000300057 GRIA3P42263 894 aa20.9■□□□□ 0.94
MESP1-201ENST00000300057 RAB39AQ14964 217 aa20.9■□□□□ 0.94
MESP1-201ENST00000300057 CPSF6Q16630 551 aaKnown RBP eCLIP20.9■□□□□ 0.94
MESP1-201ENST00000300057 IMPG1Q17R60 797 aa20.9■□□□□ 0.94
MESP1-201ENST00000300057 TRIM16LQ309B1 348 aa20.9■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.4 ms