RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000298454.3

VSTM4-201, Transcript of V-set and transmembrane domain containing 4, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene VSTM4, Length 2,170 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM4-201ENST00000298454 COL19A1Q14993 1142 aa22.09■■□□□ 1.13
VSTM4-201ENST00000298454 IER5LQ5T953 404 aa22.09■■□□□ 1.13
VSTM4-201ENST00000298454 LRRTM4Q86VH4 590 aa22.09■■□□□ 1.13
VSTM4-201ENST00000298454 AMZ2Q86W34 360 aa22.09■■□□□ 1.13
VSTM4-201ENST00000298454 HOMEZQ8IX15 550 aa22.09■■□□□ 1.13
VSTM4-201ENST00000298454 TP53I13Q8NBR0 393 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
VSTM4-201ENST00000298454 OR52A5Q9H2C5 316 aa22.09■■□□□ 1.13
VSTM4-201ENST00000298454 TTYH1Q9H313 450 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
VSTM4-201ENST00000298454 CMTM6Q9NX76 183 aa22.09■■□□□ 1.13
VSTM4-201ENST00000298454 LRRC42Q9Y546 428 aa22.09■■□□□ 1.13
VSTM4-201ENST00000298454 C2CD4DB7Z1M9 353 aa22.08■■□□□ 1.13
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VSTM4-201ENST00000298454 CACHD1Q5VU97 1274 aa22.08■■□□□ 1.13
VSTM4-201ENST00000298454 PRMT9Q6P2P2 845 aa22.08■■□□□ 1.13
VSTM4-201ENST00000298454 DHDDSQ86SQ9 333 aa22.08■■□□□ 1.13
VSTM4-201ENST00000298454 SYTL1Q8IYJ3 562 aa22.08■■□□□ 1.13
VSTM4-201ENST00000298454 DNAJB14Q8TBM8 379 aa22.08■■□□□ 1.13
VSTM4-201ENST00000298454 WDR26Q9H7D7 661 aa22.08■■□□□ 1.13
VSTM4-201ENST00000298454 BCAP29Q9UHQ4 241 aa22.08■■□□□ 1.13
VSTM4-201ENST00000298454 PLRG1O43660 514 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.12
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VSTM4-201ENST00000298454 DNAJA2O60884 412 aa22.08■■□□□ 1.12
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VSTM4-201ENST00000298454 RPS21P63220 83 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.12
VSTM4-201ENST00000298454 MUM1Q2TAK8 710 aa22.08■■□□□ 1.12
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VSTM4-201ENST00000298454 C6orf10Q5SRN2 563 aa22.08■■□□□ 1.12
VSTM4-201ENST00000298454 ICE2Q659A1 982 aa22.08■■□□□ 1.12
VSTM4-201ENST00000298454 OR9A1PQ8NGU1 263 aa22.08■■□□□ 1.12
VSTM4-201ENST00000298454 CD207Q9UJ71 328 aa22.08■■□□□ 1.12
VSTM4-201ENST00000298454 F5P12259 2224 aa22.07■■□□□ 1.12
VSTM4-201ENST00000298454 BRWD1Q9NSI6 2320 aa22.07■■□□□ 1.12
VSTM4-201ENST00000298454 A0A1W2PQU0 124 aa22.07■■□□□ 1.12
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VSTM4-201ENST00000298454 TRIM23P36406 574 aa22.07■■□□□ 1.12
VSTM4-201ENST00000298454 TBPL1P62380 186 aa22.07■■□□□ 1.12
VSTM4-201ENST00000298454 TAF11Q15544 211 aa22.07■■□□□ 1.12
VSTM4-201ENST00000298454 MAP7D1Q3KQU3 841 aa22.07■■□□□ 1.12
VSTM4-201ENST00000298454 SWT1Q5T5J6 900 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
VSTM4-201ENST00000298454 SPATA24Q86W54 205 aa22.07■■□□□ 1.12
VSTM4-201ENST00000298454 CLHC1Q8NHS4 586 aa22.07■■□□□ 1.12
VSTM4-201ENST00000298454 FAM131CQ96AQ9 280 aa22.07■■□□□ 1.12
VSTM4-201ENST00000298454 APIPQ96GX9 242 aa22.07■■□□□ 1.12
VSTM4-201ENST00000298454 MAGEB10Q96LZ2 347 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
VSTM4-201ENST00000298454 ZNF570Q96NI8 536 aa22.07■■□□□ 1.12
VSTM4-201ENST00000298454 ASIC5Q9NY37 505 aa22.07■■□□□ 1.12
VSTM4-201ENST00000298454 PSMD13Q9UNM6 376 aa22.07■■□□□ 1.12
VSTM4-201ENST00000298454 DLGAP4Q9Y2H0 992 aa22.07■■□□□ 1.12
VSTM4-201ENST00000298454 BCKDHAP12694 445 aa22.06■■□□□ 1.12
VSTM4-201ENST00000298454 CCR3P51677 355 aa22.06■■□□□ 1.12
VSTM4-201ENST00000298454 FOXM1Q08050 763 aa22.06■■□□□ 1.12
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VSTM4-201ENST00000298454 TSTA3Q13630 321 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
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VSTM4-201ENST00000298454 RALGPS2Q86X27 583 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
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VSTM4-201ENST00000298454 PHC3Q8NDX5 983 aa22.06■■□□□ 1.12
VSTM4-201ENST00000298454 WDR20Q8TBZ3 569 aa22.06■■□□□ 1.12
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VSTM4-201ENST00000298454 PCDHA9Q9Y5H5 950 aa22.06■■□□□ 1.12
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VSTM4-201ENST00000298454 RABL3Q5HYI8 236 aa22.06■■□□□ 1.12
VSTM4-201ENST00000298454 KBTBD2Q8IY47 623 aa22.06■■□□□ 1.12
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VSTM4-201ENST00000298454 NEIL2Q969S2 332 aa22.06■■□□□ 1.12
VSTM4-201ENST00000298454 DPY30Q9C005 99 aa22.06■■□□□ 1.12
VSTM4-201ENST00000298454 LIMD1Q9UGP4 676 aa22.06■■□□□ 1.12
VSTM4-201ENST00000298454 DOCK9Q9BZ29 2069 aa22.06■■□□□ 1.12
VSTM4-201ENST00000298454 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
VSTM4-201ENST00000298454 DYTNA2CJ06 578 aa22.05■■□□□ 1.12
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VSTM4-201ENST00000298454 MAT2AP31153 395 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
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VSTM4-201ENST00000298454 GRHL2Q6ISB3 625 aa22.05■■□□□ 1.12
VSTM4-201ENST00000298454 PDZD3Q86UT5 571 aa22.05■■□□□ 1.12
VSTM4-201ENST00000298454 SLC44A3Q8N4M1 653 aa22.05■■□□□ 1.12
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VSTM4-201ENST00000298454 TMEM125Q96AQ2 219 aa22.05■■□□□ 1.12
VSTM4-201ENST00000298454 MTERF1Q99551 399 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
VSTM4-201ENST00000298454 SLC17A9Q9BYT1 436 aa22.05■■□□□ 1.12
VSTM4-201ENST00000298454 KCNK12Q9HB15 430 aa22.05■■□□□ 1.12
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VSTM4-201ENST00000298454 PLIN5Q00G26 463 aa22.05■■□□□ 1.12
VSTM4-201ENST00000298454 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP22.05■■□□□ 1.12
VSTM4-201ENST00000298454 DDX39BQ13838 428 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
VSTM4-201ENST00000298454 CAPN13Q6MZZ7 669 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
VSTM4-201ENST00000298454 CYP2R1Q6VVX0 501 aa22.05■■□□□ 1.12
VSTM4-201ENST00000298454 CMTM7Q96FZ5 175 aa22.05■■□□□ 1.12
VSTM4-201ENST00000298454 ZBTB18Q99592 522 aa22.05■■□□□ 1.12
VSTM4-201ENST00000298454 FZD3Q9NPG1 666 aa22.05■■□□□ 1.12
VSTM4-201ENST00000298454 PLAGL1Q9UM63 463 aa22.05■■□□□ 1.12
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