RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000285679.10

USP25-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 25, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP25, Length 3,973 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP25-201ENST00000285679 GOLM1Q8NBJ4 401 aa14.95□□□□□ -0.02
USP25-201ENST00000285679 DUS3LQ96G46 650 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
USP25-201ENST00000285679 CDK5RAP1Q96SZ6 601 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
USP25-201ENST00000285679 INPP5KQ9BT40 448 aa14.95□□□□□ -0.02
USP25-201ENST00000285679 DYRK4Q9NR20 520 aa14.95□□□□□ -0.02
USP25-201ENST00000285679 THUMPD1Q9NXG2 353 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
USP25-201ENST00000285679 ARIH1Q9Y4X5 557 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
USP25-201ENST00000285679 RAI2Q9Y5P3 530 aa14.95□□□□□ -0.02
USP25-201ENST00000285679 CEP350Q5VT06 3117 aa14.95□□□□□ -0.02
USP25-201ENST00000285679 ASPDHA6ND91 283 aa14.95□□□□□ -0.02
USP25-201ENST00000285679 CCDC182A6NF36 153 aa14.95□□□□□ -0.02
USP25-201ENST00000285679 UPK1BO75841 260 aa14.95□□□□□ -0.02
USP25-201ENST00000285679 XPAP23025 273 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
USP25-201ENST00000285679 CD52P31358 61 aa14.95□□□□□ -0.02
USP25-201ENST00000285679 KIR3DL1P43629 444 aa14.95□□□□□ -0.02
USP25-201ENST00000285679 TAF10Q12962 218 aa14.95□□□□□ -0.02
USP25-201ENST00000285679 BEND5Q7L4P6 421 aa14.95□□□□□ -0.02
USP25-201ENST00000285679 LRRTM3Q86VH5 581 aa14.95□□□□□ -0.02
USP25-201ENST00000285679 BPIFB1Q8TDL5 484 aa14.95□□□□□ -0.02
USP25-201ENST00000285679 BARD1Q99728 777 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
USP25-201ENST00000285679 CARS2Q9HA77 564 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
USP25-201ENST00000285679 NECTIN3Q9NQS3 549 aa14.95□□□□□ -0.02
USP25-201ENST00000285679 RNF181Q9P0P0 153 aa14.95□□□□□ -0.02
USP25-201ENST00000285679 AGO1Q9UL18 857 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
USP25-201ENST00000285679 ABCG2Q9UNQ0 655 aa14.95□□□□□ -0.02
USP25-201ENST00000285679 SPO11Q9Y5K1 396 aa14.95□□□□□ -0.02
USP25-201ENST00000285679 SERPIND1P05546 499 aa14.94□□□□□ -0.02
USP25-201ENST00000285679 PBX3P40426 434 aa14.94□□□□□ -0.02
USP25-201ENST00000285679 NKG7Q16617 165 aa14.94□□□□□ -0.02
USP25-201ENST00000285679 TBRG1Q3YBR2 411 aa14.94□□□□□ -0.02
USP25-201ENST00000285679 LRRC73Q5JTD7 316 aa14.94□□□□□ -0.02
USP25-201ENST00000285679 SNAP47Q5SQN1 464 aa14.94□□□□□ -0.02
USP25-201ENST00000285679 RHOXF1Q8NHV9 184 aa14.94□□□□□ -0.02
USP25-201ENST00000285679 RHEBL1Q8TAI7 183 aa14.94□□□□□ -0.02
USP25-201ENST00000285679 ADAM2Q99965 735 aa14.94□□□□□ -0.02
USP25-201ENST00000285679 MOV10Q9HCE1 1003 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
USP25-201ENST00000285679 GPR83Q9NYM4 423 aa14.94□□□□□ -0.02
USP25-201ENST00000285679 FAM92AA1XBS5 289 aa14.94□□□□□ -0.02
USP25-201ENST00000285679 MGAT4DA6NG13 374 aa14.94□□□□□ -0.02
USP25-201ENST00000285679 ITGB1P05556 798 aa14.94□□□□□ -0.02
USP25-201ENST00000285679 PBLDP30039 288 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
USP25-201ENST00000285679 GANABQ14697 944 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
USP25-201ENST00000285679 KLHL17Q6TDP4 642 aa14.94□□□□□ -0.02
USP25-201ENST00000285679 RGL4Q8IZJ4 473 aa14.94□□□□□ -0.02
USP25-201ENST00000285679 ADAMTS16Q8TE57 1224 aa14.94□□□□□ -0.02
USP25-201ENST00000285679 RPS6KA6Q9UK32 745 aa14.94□□□□□ -0.02
USP25-201ENST00000285679 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa14.94□□□□□ -0.02
USP25-201ENST00000285679 JRKO75564 520 aa14.94□□□□□ -0.02
USP25-201ENST00000285679 ALPIP09923 528 aa14.94□□□□□ -0.02
USP25-201ENST00000285679 KCNE1P15382 129 aa14.94□□□□□ -0.02
USP25-201ENST00000285679 RACK1P63244 317 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
USP25-201ENST00000285679 IL18R1Q13478 541 aa14.94□□□□□ -0.02
USP25-201ENST00000285679 CTF1Q16619 201 aa14.94□□□□□ -0.02
USP25-201ENST00000285679 TSTQ16762 297 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
USP25-201ENST00000285679 POM121L1PQ3SYA9 428 aa14.94□□□□□ -0.02
USP25-201ENST00000285679 PYDC2Q56P42 97 aa14.94□□□□□ -0.02
USP25-201ENST00000285679 MS4A13Q5J8X5 152 aa14.94□□□□□ -0.02
USP25-201ENST00000285679 TAPT1Q6NXT6 567 aa14.94□□□□□ -0.02
USP25-201ENST00000285679 EIF3MQ7L2H7 374 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
USP25-201ENST00000285679 ASCC1Q8N9N2 400 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
USP25-201ENST00000285679 VPS37AQ8NEZ2 397 aa14.94□□□□□ -0.02
USP25-201ENST00000285679 SUN5Q8TC36 379 aa14.94□□□□□ -0.02
USP25-201ENST00000285679 MTERF1Q99551 399 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
USP25-201ENST00000285679 DOK1Q99704 481 aa14.94□□□□□ -0.02
USP25-201ENST00000285679 DKK3Q9UBP4 350 aa14.94□□□□□ -0.02
USP25-201ENST00000285679 PCDHGA10Q9Y5H3 936 aa14.94□□□□□ -0.02
USP25-201ENST00000285679 TNFRSF11BO00300 401 aa14.93□□□□□ -0.02
USP25-201ENST00000285679 SUV39H1O43463 412 aa14.93□□□□□ -0.02
USP25-201ENST00000285679 NUAK1O60285 661 aa14.93□□□□□ -0.02
USP25-201ENST00000285679 OGNP20774 298 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
USP25-201ENST00000285679 RRM2P31350 389 aa14.93□□□□□ -0.02
USP25-201ENST00000285679 ISL1P61371 349 aa14.93□□□□□ -0.02
USP25-201ENST00000285679 CREMQ03060 361 aa14.93□□□□□ -0.02
USP25-201ENST00000285679 ZNF544Q6NX49 715 aa14.93□□□□□ -0.02
USP25-201ENST00000285679 ZNF517Q6ZMY9 492 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
USP25-201ENST00000285679 USP43Q70EL4 1123 aa14.93□□□□□ -0.02
USP25-201ENST00000285679 CYP2U1Q7Z449 544 aa14.93□□□□□ -0.02
USP25-201ENST00000285679 OR10T2Q8NGX3 314 aa14.93□□□□□ -0.02
USP25-201ENST00000285679 HSH2DQ96JZ2 352 aa14.93□□□□□ -0.02
USP25-201ENST00000285679 MBOAT4Q96T53 435 aa14.93□□□□□ -0.02
USP25-201ENST00000285679 TTPALQ9BTX7 342 aa14.93□□□□□ -0.02
USP25-201ENST00000285679 ALOXE3Q9BYJ1 711 aa14.93□□□□□ -0.02
USP25-201ENST00000285679 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa14.93□□□□□ -0.02
USP25-201ENST00000285679 TBKBP1A7MCY6 615 aa14.93□□□□□ -0.02
USP25-201ENST00000285679 GPR32O75388 356 aa14.93□□□□□ -0.02
USP25-201ENST00000285679 ENGP17813 658 aa14.93□□□□□ -0.02
USP25-201ENST00000285679 ITGALP20701 1170 aa14.93□□□□□ -0.02
USP25-201ENST00000285679 CEP68Q76N32 757 aa14.93□□□□□ -0.02
USP25-201ENST00000285679 MON1AQ86VX9 555 aa14.93□□□□□ -0.02
USP25-201ENST00000285679 MMAAQ8IVH4 418 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
USP25-201ENST00000285679 PHOX2BQ99453 314 aa14.93□□□□□ -0.02
USP25-201ENST00000285679 COL1A2P08123 1366 aa14.93□□□□□ -0.02
USP25-201ENST00000285679 CLIC1O00299 241 aa14.93□□□□□ -0.02
USP25-201ENST00000285679 CTDSP2O14595 271 aa14.93□□□□□ -0.02
USP25-201ENST00000285679 TLL1O43897 1013 aa14.93□□□□□ -0.02
USP25-201ENST00000285679 LZTS3O60299 673 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
USP25-201ENST00000285679 IL6P05231 212 aa14.93□□□□□ -0.02
USP25-201ENST00000285679 MZF1P28698 734 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
USP25-201ENST00000285679 KRT20P35900 424 aa14.93□□□□□ -0.02
USP25-201ENST00000285679 KCNQ1P51787 676 aa14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 62.1 ms