RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000239461.10

PRRX1-201, Transcript of paired related homeobox 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PRRX1, Length 4,284 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRX1-201ENST00000239461 ZNF77Q15935 545 aa10.36□□□□□ -0.75
PRRX1-201ENST00000239461 FAM98BQ52LJ0 330 aaKnown RBP10.36□□□□□ -0.75
PRRX1-201ENST00000239461 USP39Q53GS9 565 aaKnown RBP10.36□□□□□ -0.75
PRRX1-201ENST00000239461 ZC3H14Q6PJT7 736 aaKnown RBP10.36□□□□□ -0.75
PRRX1-201ENST00000239461 CYP20A1Q6UW02 462 aa10.36□□□□□ -0.75
PRRX1-201ENST00000239461 ZNF554Q86TJ5 538 aa10.36□□□□□ -0.75
PRRX1-201ENST00000239461 PROSER1Q86XN7 944 aa10.36□□□□□ -0.75
PRRX1-201ENST00000239461 GLYATL1Q969I3 302 aa10.36□□□□□ -0.75
PRRX1-201ENST00000239461 VPS33AQ96AX1 596 aa10.36□□□□□ -0.75
PRRX1-201ENST00000239461 SIPA1Q96FS4 1042 aa10.36□□□□□ -0.75
PRRX1-201ENST00000239461 CCDC138Q96M89 665 aa10.36□□□□□ -0.75
PRRX1-201ENST00000239461 UHRF1Q96T88 793 aaPredicted RBP10.36□□□□□ -0.75
PRRX1-201ENST00000239461 HAUS8Q9BT25 410 aa10.36□□□□□ -0.75
PRRX1-201ENST00000239461 GIMAP2Q9UG22 337 aa10.36□□□□□ -0.75
PRRX1-201ENST00000239461 ZW10O43264 779 aa10.36□□□□□ -0.75
PRRX1-201ENST00000239461 BCAS2O75934 225 aaPredicted RBP10.36□□□□□ -0.75
PRRX1-201ENST00000239461 TUBA3CQ13748 450 aa10.36□□□□□ -0.75
PRRX1-201ENST00000239461 TEAD4Q15561 434 aa10.36□□□□□ -0.75
PRRX1-201ENST00000239461 CYP2A13Q16696 494 aa10.36□□□□□ -0.75
PRRX1-201ENST00000239461 SPATS1Q496A3 300 aa10.36□□□□□ -0.75
PRRX1-201ENST00000239461 CFAP206Q8IYR0 622 aa10.36□□□□□ -0.75
PRRX1-201ENST00000239461 GALNT15Q8N3T1 639 aa10.36□□□□□ -0.75
PRRX1-201ENST00000239461 SDR16C5Q8N3Y7 309 aa10.36□□□□□ -0.75
PRRX1-201ENST00000239461 TRIML2Q8N7C3 387 aa10.36□□□□□ -0.75
PRRX1-201ENST00000239461 OR2A12Q8NGT7 310 aa10.36□□□□□ -0.75
PRRX1-201ENST00000239461 ADAMTS19Q8TE59 1207 aa10.36□□□□□ -0.75
PRRX1-201ENST00000239461 OR52E6Q96RD3 313 aa10.36□□□□□ -0.75
PRRX1-201ENST00000239461 P2RY12Q9H244 342 aa10.36□□□□□ -0.75
PRRX1-201ENST00000239461 RDH14Q9HBH5 336 aa10.36□□□□□ -0.75
PRRX1-201ENST00000239461 AHSPQ9NZD4 102 aa10.36□□□□□ -0.75
PRRX1-201ENST00000239461 SPASTQ9UBP0 616 aa10.36□□□□□ -0.75
PRRX1-201ENST00000239461 V9GYQ6 96 aa10.36□□□□□ -0.75
PRRX1-201ENST00000239461 SCN8AQ9UQD0 1980 aa10.36□□□□□ -0.75
PRRX1-201ENST00000239461 LOC730098B7Z3J9 87 aa10.36□□□□□ -0.75
PRRX1-201ENST00000239461 PNLIPRP1P54315 467 aa10.36□□□□□ -0.75
PRRX1-201ENST00000239461 KCNC3Q14003 757 aa10.36□□□□□ -0.75
PRRX1-201ENST00000239461 HSF5Q4G112 596 aaPredicted RBP10.36□□□□□ -0.75
PRRX1-201ENST00000239461 LPCAT4Q643R3 524 aa10.36□□□□□ -0.75
PRRX1-201ENST00000239461 CRTC3Q6UUV7 619 aa10.36□□□□□ -0.75
PRRX1-201ENST00000239461 GPR180Q86V85 440 aa10.36□□□□□ -0.75
PRRX1-201ENST00000239461 TMEM151AQ8N4L1 468 aa10.36□□□□□ -0.75
PRRX1-201ENST00000239461 ZBTB8BQ8NAP8 495 aaPredicted RBP10.36□□□□□ -0.75
PRRX1-201ENST00000239461 FAM156AQ8NDB6 213 aa10.36□□□□□ -0.75
PRRX1-201ENST00000239461 NAT14Q8WUY8 206 aa10.36□□□□□ -0.75
PRRX1-201ENST00000239461 LRRC58Q96CX6 371 aa10.36□□□□□ -0.75
PRRX1-201ENST00000239461 LMAN2LQ9H0V9 348 aa10.36□□□□□ -0.75
PRRX1-201ENST00000239461 AIG1Q9NVV5 245 aa10.36□□□□□ -0.75
PRRX1-201ENST00000239461 GPSM3Q9Y4H4 160 aa10.36□□□□□ -0.75
PRRX1-201ENST00000239461 CYP17A1P05093 508 aa10.36□□□□□ -0.75
PRRX1-201ENST00000239461 IL6P05231 212 aa10.36□□□□□ -0.75
PRRX1-201ENST00000239461 MTHFD2P13995 350 aa10.36□□□□□ -0.75
PRRX1-201ENST00000239461 PSMC3P17980 439 aa10.36□□□□□ -0.75
PRRX1-201ENST00000239461 IRS1P35568 1242 aa10.36□□□□□ -0.75
PRRX1-201ENST00000239461 CCR2P41597 374 aa10.36□□□□□ -0.75
PRRX1-201ENST00000239461 ESRRGP62508 458 aa10.36□□□□□ -0.75
PRRX1-201ENST00000239461 PRKCQQ04759 706 aa10.36□□□□□ -0.75
PRRX1-201ENST00000239461 IHHQ14623 411 aa10.36□□□□□ -0.75
PRRX1-201ENST00000239461 OGFOD2Q6N063 350 aa10.36□□□□□ -0.75
PRRX1-201ENST00000239461 PDPRQ8NCN5 879 aa10.36□□□□□ -0.75
PRRX1-201ENST00000239461 OR52B6Q8NGF0 335 aa10.36□□□□□ -0.75
PRRX1-201ENST00000239461 POP5Q969H6 163 aaKnown RBP10.36□□□□□ -0.75
PRRX1-201ENST00000239461 CDCA3Q99618 268 aaPredicted RBP10.36□□□□□ -0.75
PRRX1-201ENST00000239461 SLC30A3Q99726 388 aa10.36□□□□□ -0.75
PRRX1-201ENST00000239461 BDH2Q9BUT1 245 aa10.36□□□□□ -0.75
PRRX1-201ENST00000239461 UGT2B28Q9BY64 529 aa10.36□□□□□ -0.75
PRRX1-201ENST00000239461 ALG2Q9H553 416 aa10.36□□□□□ -0.75
PRRX1-201ENST00000239461 GDE1Q9NZC3 331 aa10.36□□□□□ -0.75
PRRX1-201ENST00000239461 EGFL7Q9UHF1 273 aa10.36□□□□□ -0.75
PRRX1-201ENST00000239461 MAGEL2Q9UJ55 1249 aa10.36□□□□□ -0.75
PRRX1-201ENST00000239461 ASF1AQ9Y294 204 aa10.36□□□□□ -0.75
PRRX1-201ENST00000239461 TDRKHQ9Y2W6 561 aaKnown RBP10.36□□□□□ -0.75
PRRX1-201ENST00000239461 MANBAO00462 879 aa10.35□□□□□ -0.75
PRRX1-201ENST00000239461 TPPPO94811 219 aa10.35□□□□□ -0.75
PRRX1-201ENST00000239461 MATN4O95460 622 aa10.35□□□□□ -0.75
PRRX1-201ENST00000239461 LDLRP01130 860 aa10.35□□□□□ -0.75
PRRX1-201ENST00000239461 HLA-EP13747 358 aa10.35□□□□□ -0.75
PRRX1-201ENST00000239461 GNAZP19086 355 aa10.35□□□□□ -0.75
PRRX1-201ENST00000239461 HPCAL1P37235 193 aa10.35□□□□□ -0.75
PRRX1-201ENST00000239461 DIO3P55073 304 aa10.35□□□□□ -0.75
PRRX1-201ENST00000239461 TMEM115Q12893 351 aaPredicted RBP10.35□□□□□ -0.75
PRRX1-201ENST00000239461 PTCHD3Q3KNS1 767 aa10.35□□□□□ -0.75
PRRX1-201ENST00000239461 COQ5Q5HYK3 327 aa10.35□□□□□ -0.75
PRRX1-201ENST00000239461 MMAAQ8IVH4 418 aaKnown RBP10.35□□□□□ -0.75
PRRX1-201ENST00000239461 BTN2A2Q8WVV5 523 aa10.35□□□□□ -0.75
PRRX1-201ENST00000239461 ITCHQ96J02 903 aa10.35□□□□□ -0.75
PRRX1-201ENST00000239461 VPS50Q96JG6 964 aa10.35□□□□□ -0.75
PRRX1-201ENST00000239461 C9orf16Q9BUW7 83 aa10.35□□□□□ -0.75
PRRX1-201ENST00000239461 OR2AG1Q9H205 316 aa10.35□□□□□ -0.75
PRRX1-201ENST00000239461 PTGDR2Q9Y5Y4 395 aa10.35□□□□□ -0.75
PRRX1-201ENST00000239461 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP10.35□□□□□ -0.75
PRRX1-201ENST00000239461 TMEM247A6NEH6 219 aa10.35□□□□□ -0.75
PRRX1-201ENST00000239461 PSMD11O00231 422 aa10.35□□□□□ -0.75
PRRX1-201ENST00000239461 SGTAO43765 313 aa10.35□□□□□ -0.75
PRRX1-201ENST00000239461 DEAF1O75398 565 aaPredicted RBP10.35□□□□□ -0.75
PRRX1-201ENST00000239461 CD160O95971 181 aa10.35□□□□□ -0.75
PRRX1-201ENST00000239461 NPPAP01160 153 aa10.35□□□□□ -0.75
PRRX1-201ENST00000239461 COX7A2P14406 83 aa10.35□□□□□ -0.75
PRRX1-201ENST00000239461 GM2AP17900 193 aa10.35□□□□□ -0.75
PRRX1-201ENST00000239461 GSTT1P30711 240 aa10.35□□□□□ -0.75
PRRX1-201ENST00000239461 EPHA5P54756 1037 aa10.35□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.9 ms