RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000233025.11

SPCS1-201, Transcript of signal peptidase complex subunit 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SPCS1, Length 1,082 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPCS1-201ENST00000233025 NLRP9Q7RTR0 991 aa15.67■□□□□ 0.1
SPCS1-201ENST00000233025 MARVELD2Q8N4S9 558 aa15.67■□□□□ 0.1
SPCS1-201ENST00000233025 PQLC3Q8N755 202 aa15.67■□□□□ 0.1
SPCS1-201ENST00000233025 LILRB4Q8NHJ6 448 aa15.67■□□□□ 0.1
SPCS1-201ENST00000233025 TADA1Q96BN2 335 aa15.67■□□□□ 0.1
SPCS1-201ENST00000233025 MBD6Q96DN6 1003 aa15.67■□□□□ 0.1
SPCS1-201ENST00000233025 EURLQ9NYK6 297 aa15.67■□□□□ 0.1
SPCS1-201ENST00000233025 MPDZO75970 2070 aa15.66■□□□□ 0.1
SPCS1-201ENST00000233025 ASPDHA6ND91 283 aa15.66■□□□□ 0.1
SPCS1-201ENST00000233025 FAM90A27PA6NNH2 459 aa15.66■□□□□ 0.1
SPCS1-201ENST00000233025 NPIPA5E9PKD4 350 aa15.66■□□□□ 0.1
SPCS1-201ENST00000233025 PROSCO94903 275 aa15.66■□□□□ 0.1
SPCS1-201ENST00000233025 TSPAN12O95859 305 aa15.66■□□□□ 0.1
SPCS1-201ENST00000233025 MYBL2P10244 700 aa15.66■□□□□ 0.1
SPCS1-201ENST00000233025 AKT1P31749 480 aa15.66■□□□□ 0.1
SPCS1-201ENST00000233025 HSF1Q00613 529 aa15.66■□□□□ 0.1
SPCS1-201ENST00000233025 ALDH6A1Q02252 535 aaKnown RBP15.66■□□□□ 0.1
SPCS1-201ENST00000233025 GBE1Q04446 702 aa15.66■□□□□ 0.1
SPCS1-201ENST00000233025 SLC10A2Q12908 348 aaPredicted RBP15.66■□□□□ 0.1
SPCS1-201ENST00000233025 OLIG2Q13516 323 aa15.66■□□□□ 0.1
SPCS1-201ENST00000233025 PPP2R5EQ16537 467 aa15.66■□□□□ 0.1
SPCS1-201ENST00000233025 HADHQ16836 314 aaKnown RBP15.66■□□□□ 0.1
SPCS1-201ENST00000233025 CCDC122Q5T0U0 273 aa15.66■□□□□ 0.1
SPCS1-201ENST00000233025 FAM182AQ5T1J6 154 aa15.66■□□□□ 0.1
SPCS1-201ENST00000233025 CNSTQ6PJW8 725 aa15.66■□□□□ 0.1
SPCS1-201ENST00000233025 RIPOR1Q6ZS17 1223 aa15.66■□□□□ 0.1
SPCS1-201ENST00000233025 FGD2Q7Z6J4 655 aa15.66■□□□□ 0.1
SPCS1-201ENST00000233025 NT5DC3Q86UY8 548 aa15.66■□□□□ 0.1
SPCS1-201ENST00000233025 CFAP206Q8IYR0 622 aa15.66■□□□□ 0.1
SPCS1-201ENST00000233025 EID3Q8N140 333 aa15.66■□□□□ 0.1
SPCS1-201ENST00000233025 DTWD1Q8N5C7 304 aa15.66■□□□□ 0.1
SPCS1-201ENST00000233025 HM13Q8TCT9 377 aa15.66■□□□□ 0.1
SPCS1-201ENST00000233025 IQCDQ96DY2 449 aa15.66■□□□□ 0.1
SPCS1-201ENST00000233025 IMP4Q96G21 291 aaKnown RBP15.66■□□□□ 0.1
SPCS1-201ENST00000233025 FRMD6Q96NE9 622 aa15.66■□□□□ 0.1
SPCS1-201ENST00000233025 HGH1Q9BTY7 390 aa15.66■□□□□ 0.1
SPCS1-201ENST00000233025 PACSIN1Q9BY11 444 aa15.66■□□□□ 0.1
SPCS1-201ENST00000233025 UCK2Q9BZX2 261 aa15.66■□□□□ 0.1
SPCS1-201ENST00000233025 OR52A5Q9H2C5 316 aa15.66■□□□□ 0.1
SPCS1-201ENST00000233025 CUTCQ9NTM9 273 aa15.66■□□□□ 0.1
SPCS1-201ENST00000233025 SPHK1Q9NYA1 384 aa15.66■□□□□ 0.1
SPCS1-201ENST00000233025 NPIPA1Q9UND3 350 aa15.66■□□□□ 0.1
SPCS1-201ENST00000233025 ASB1Q9Y576 335 aa15.66■□□□□ 0.1
SPCS1-201ENST00000233025 ARID1AO14497 2285 aa15.65■□□□□ 0.1
SPCS1-201ENST00000233025 KCNK1O00180 336 aa15.65■□□□□ 0.1
SPCS1-201ENST00000233025 ITGAMP11215 1152 aa15.65■□□□□ 0.1
SPCS1-201ENST00000233025 MSH3P20585 1137 aa15.65■□□□□ 0.1
SPCS1-201ENST00000233025 SSR1P43307 286 aaKnown RBP15.65■□□□□ 0.1
SPCS1-201ENST00000233025 OR1D4P47884 311 aa15.65■□□□□ 0.1
SPCS1-201ENST00000233025 ITGA9Q13797 1035 aa15.65■□□□□ 0.1
SPCS1-201ENST00000233025 PCSK7Q16549 785 aa15.65■□□□□ 0.1
SPCS1-201ENST00000233025 TFDP3Q5H9I0 405 aa15.65■□□□□ 0.1
SPCS1-201ENST00000233025 ZDHHC20Q5W0Z9 365 aa15.65■□□□□ 0.1
SPCS1-201ENST00000233025 SPNS2Q8IVW8 549 aa15.65■□□□□ 0.1
SPCS1-201ENST00000233025 TAB3Q8N5C8 712 aaPredicted RBP15.65■□□□□ 0.1
SPCS1-201ENST00000233025 METTL27Q8N6F8 245 aaPredicted RBP15.65■□□□□ 0.1
SPCS1-201ENST00000233025 DENND1AQ8TEH3 1009 aa15.65■□□□□ 0.1
SPCS1-201ENST00000233025 ASB5Q8WWX0 329 aa15.65■□□□□ 0.1
SPCS1-201ENST00000233025 SRPK1Q96SB4 655 aaKnown RBP15.65■□□□□ 0.1
SPCS1-201ENST00000233025 POLDIP3Q9BY77 421 aaKnown RBP15.65■□□□□ 0.1
SPCS1-201ENST00000233025 MVB12BQ9H7P6 319 aa15.65■□□□□ 0.1
SPCS1-201ENST00000233025 SLC24A3Q9HC58 644 aa15.65■□□□□ 0.1
SPCS1-201ENST00000233025 IL17CQ9P0M4 197 aa15.65■□□□□ 0.1
SPCS1-201ENST00000233025 C3orf18Q9UK00 162 aa15.65■□□□□ 0.1
SPCS1-201ENST00000233025 IGHV1-45A0A0A0MS14 117 aa15.64■□□□□ 0.09
SPCS1-201ENST00000233025 GLYATL1P3A0A0U1RQE8 302 aa15.64■□□□□ 0.09
SPCS1-201ENST00000233025 PRRG2O14669 202 aa15.64■□□□□ 0.09
SPCS1-201ENST00000233025 ASNA1O43681 348 aa15.64■□□□□ 0.09
SPCS1-201ENST00000233025 WFS1O76024 890 aa15.64■□□□□ 0.09
SPCS1-201ENST00000233025 NDST3O95803 873 aa15.64■□□□□ 0.09
SPCS1-201ENST00000233025 UQCRHP07919 91 aa15.64■□□□□ 0.09
SPCS1-201ENST00000233025 CHRNB4P30926 498 aa15.64■□□□□ 0.09
SPCS1-201ENST00000233025 RAB28P51157 221 aa15.64■□□□□ 0.09
SPCS1-201ENST00000233025 IFI35P80217 286 aaPredicted RBP15.64■□□□□ 0.09
SPCS1-201ENST00000233025 ANK2Q01484 3957 aa15.64■□□□□ 0.09
SPCS1-201ENST00000233025 PRKG2Q13237 762 aa15.64■□□□□ 0.09
SPCS1-201ENST00000233025 BOP1Q14137 746 aaKnown RBP15.64■□□□□ 0.09
SPCS1-201ENST00000233025 PDK2Q15119 407 aa15.64■□□□□ 0.09
SPCS1-201ENST00000233025 SLC14A2Q15849 920 aa15.64■□□□□ 0.09
SPCS1-201ENST00000233025 ASTE1Q2TB18 679 aaPredicted RBP15.64■□□□□ 0.09
SPCS1-201ENST00000233025 ABHD17BQ5VST6 288 aa15.64■□□□□ 0.09
SPCS1-201ENST00000233025 NEK10Q6ZWH5 1172 aa15.64■□□□□ 0.09
SPCS1-201ENST00000233025 GHDCQ8N2G8 530 aa15.64■□□□□ 0.09
SPCS1-201ENST00000233025 PHC3Q8NDX5 983 aa15.64■□□□□ 0.09
SPCS1-201ENST00000233025 STT3BQ8TCJ2 826 aa15.64■□□□□ 0.09
SPCS1-201ENST00000233025 HDAC10Q969S8 669 aa15.64■□□□□ 0.09
SPCS1-201ENST00000233025 RMND5BQ96G75 393 aaPredicted RBP15.64■□□□□ 0.09
SPCS1-201ENST00000233025 HES7Q9BYE0 225 aa15.64■□□□□ 0.09
SPCS1-201ENST00000233025 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa15.64■□□□□ 0.09
SPCS1-201ENST00000233025 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa15.64■□□□□ 0.09
SPCS1-201ENST00000233025 IGF2BP1Q9NZI8 577 aaKnown RBP eCLIP15.64■□□□□ 0.092e-6■■■■□ 20.2
SPCS1-201ENST00000233025 IFNKQ9P0W0 207 aa15.64■□□□□ 0.09
SPCS1-201ENST00000233025 UVRAGQ9P2Y5 699 aa15.64■□□□□ 0.09
SPCS1-201ENST00000233025 RNF6Q9Y252 685 aa15.64■□□□□ 0.09
SPCS1-201ENST00000233025 FAM237BA0A1B0GVD1 139 aa15.63■□□□□ 0.09
SPCS1-201ENST00000233025 TTI1O43156 1089 aa15.63■□□□□ 0.09
SPCS1-201ENST00000233025 PTMAP06454 111 aaKnown RBP15.63■□□□□ 0.09
SPCS1-201ENST00000233025 CHRM5P08912 532 aaPredicted RBP15.63■□□□□ 0.09
SPCS1-201ENST00000233025 ZGLP1P0C6A0 271 aa15.63■□□□□ 0.09
SPCS1-201ENST00000233025 MCM3P25205 808 aa15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.9 ms