RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000613122.4

CTDP1-208, Transcript of CTD phosphatase subunit 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDP1, Length 5,866 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDP1-208ENST00000613122 SLC51AQ86UW1 340 aa19.77■□□□□ 0.75
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CTDP1-208ENST00000613122 KLHDC7BQ96G42 594 aa19.77■□□□□ 0.75
CTDP1-208ENST00000613122 VPS29Q9UBQ0 182 aa19.77■□□□□ 0.75
CTDP1-208ENST00000613122 hCG_2039718K7EN88 272 aa19.76■□□□□ 0.75
CTDP1-208ENST00000613122 GALTP07902 379 aa19.76■□□□□ 0.75
CTDP1-208ENST00000613122 BDKRB1P46663 353 aa19.76■□□□□ 0.75
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CTDP1-208ENST00000613122 HLA-EP13747 358 aa19.76■□□□□ 0.75
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CTDP1-208ENST00000613122 SMARCD3Q6STE5 483 aa19.76■□□□□ 0.75
CTDP1-208ENST00000613122 THAP5Q7Z6K1 395 aa19.76■□□□□ 0.75
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CTDP1-208ENST00000613122 IFT27Q9BW83 186 aa19.76■□□□□ 0.75
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CTDP1-208ENST00000613122 PITRM1Q5JRX3 1037 aa19.76■□□□□ 0.75
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CTDP1-208ENST00000613122 RELTQ969Z4 430 aa19.76■□□□□ 0.75
CTDP1-208ENST00000613122 OTUB2Q96DC9 234 aa19.76■□□□□ 0.75
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CTDP1-208ENST00000613122 TMEM156Q8N614 296 aa19.75■□□□□ 0.75
CTDP1-208ENST00000613122 OR5T3Q8NGG3 340 aa19.75■□□□□ 0.75
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CTDP1-208ENST00000613122 UBAP2Q5T6F2 1119 aaKnown RBP19.75■□□□□ 0.75
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CTDP1-208ENST00000613122 CDK15Q96Q40 435 aa19.75■□□□□ 0.75
CTDP1-208ENST00000613122 TMEM109Q9BVC6 243 aa19.75■□□□□ 0.75
CTDP1-208ENST00000613122 FAM234BA2RU67 622 aa19.74■□□□□ 0.75
CTDP1-208ENST00000613122 ZNF726A6NNF4 738 aa19.74■□□□□ 0.75
CTDP1-208ENST00000613122 TAF4O00268 1085 aa19.74■□□□□ 0.75
CTDP1-208ENST00000613122 CDC7O00311 574 aa19.74■□□□□ 0.75
CTDP1-208ENST00000613122 ECI2O75521 394 aa19.74■□□□□ 0.75
CTDP1-208ENST00000613122 RAB25P57735 213 aa19.74■□□□□ 0.75
CTDP1-208ENST00000613122 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa19.74■□□□□ 0.75
CTDP1-208ENST00000613122 TMEM248Q9NWD8 314 aa19.74■□□□□ 0.75
CTDP1-208ENST00000613122 RSL24D1Q9UHA3 163 aaKnown RBP19.74■□□□□ 0.75
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