RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000609525.1

CSNK2A1-208, Transcript of casein kinase 2 alpha 1, human

TSL 5

Gene CSNK2A1, Length 581 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CSNK2A1-208	ENST00000609525	CACHD1	Q5VU97	1274 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	SLC39A4	Q6P5W5	647 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	B3GNT6	Q6ZMB0	384 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	LINC00299	Q6ZSB3	139 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	NEK10	Q6ZWH5	1172 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	PRUNE1	Q86TP1	453 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	KBTBD6	Q86V97	674 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	PNPLA1	Q8N8W4	532 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	RBM15B	Q8NDT2	890 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	PRSS33	Q8NF86	280 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	SPATA18	Q8TC71	538 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	TRAF3IP1	Q8TDR0	691 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	PDCD6IP	Q8WUM4	868 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	TRIB2	Q92519	343 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	FAF2	Q96CS3	445 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	WBP1	Q96G27	269 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	DUS3L	Q96G46	650 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	MED30	Q96HR3	178 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	CNDP2	Q96KP4	475 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	C12orf42	Q96LP6	360 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	RILP	Q96NA2	401 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	CATSPER2	Q96P56	530 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	RNF157	Q96PX1	679 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	FAM111A	Q96PZ2	611 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	FAM167B	Q9BTA0	163 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	TMEM121	Q9BTD3	319 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	MRPS26	Q9BYN8	205 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	NMUR2	Q9GZQ4	415 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	SNX25	Q9H3E2	840 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	TDRD3	Q9H7E2	651 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	ZNF696	Q9H7X3	374 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	XPNPEP3	Q9NQH7	507 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	CISH	Q9NSE2	258 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	CHCHD3	Q9NX63	227 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	HOXC10	Q9NYD6	342 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	MSRB1	Q9NZV6	116 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	STK39	Q9UEW8	545 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	FBXO40	Q9UH90	709 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	SLC7A8	Q9UHI5	535 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	FZD4	Q9ULV1	537 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	ANKRD6	Q9Y2G4	727 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	SIRT4	Q9Y6E7	314 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	PIEZO1	Q92508	2521 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	CDK5RAP2	Q96SN8	1893 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525		A0A088AWK7	358 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	GOLGA8IP	A6NC78	632 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	TRIM43B	A6NCK2	446 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	GOLGA8J	A6NMD2	632 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	TMEM233	B4DJY2	109 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	TRIM49D1	C9J1S8	452 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525		F8VP50	259 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525		F8W810	466 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	RRH	O14718	337 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	APOL1	O14791	398 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	CD3EAP	O15446	510 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	AKAP10	O43572	662 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	TIMM44	O43615	452 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	BUD23	O43709	281 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	LRCH4	O75427	683 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	TADA2A	O75478	443 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	RFPL1	O75677	317 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	KRT36	O76013	467 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	CLPTM1	O96005	669 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	HOXC6	P09630	235 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	IDO1	P14902	403 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	SSTR1	P30872	391 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	SPR	P35270	261 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	CPOX	P36551	454 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	MAGEA8	P43361	318 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	PTPN9	P43378	593 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	ACADSB	P45954	432 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	GATM	P50440	423 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	CSE1L	P55060	971 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	AQP5	P55064	265 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	MTTP	P55157	894 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	POLE2	P56282	527 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	HDAC4	P56524	1084 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	NUP107	P57740	925 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	YWHAG	P61981	247 aa	Known RBP eCLIP	4.54	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	IGBP1	P78318	339 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	BASP1	P80723	227 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	BST1	Q10588	318 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	TCP10	Q12799	353 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	TRAP1	Q12931	704 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	CDC16	Q13042	620 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	SLC13A2	Q13183	592 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	SEMA5A	Q13591	1074 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	PTGR1	Q14914	329 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	EMC2	Q15006	297 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	STXBP2	Q15833	593 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	UGP2	Q16851	508 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	TEX44	Q53QW1	395 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	ZNF667	Q5HYK9	610 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	FNBP1L	Q5T0N5	605 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	RWDD4	Q6NW29	188 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	LRRC8B	Q6P9F7	803 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	LCLAT1	Q6UWP7	414 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	IZUMO2	Q6UXV1	221 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	PLPPR4	Q7Z2D5	763 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	PRPF39	Q86UA1	669 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68

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