RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592385.5

HDAC5-211, Transcript of histone deacetylase 5, humanhuman

TSL 5

Gene HDAC5, Length 2,601 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC5-211ENST00000592385 B4GALNT1Q00973 533 aa14.9□□□□□ -0.02
HDAC5-211ENST00000592385 GTDC1Q4AE62 458 aa14.9□□□□□ -0.02
HDAC5-211ENST00000592385 MSANTD1Q6ZTZ1 278 aa14.9□□□□□ -0.02
HDAC5-211ENST00000592385 UBE2R2Q712K3 238 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
HDAC5-211ENST00000592385 BBS7Q8IWZ6 715 aa14.9□□□□□ -0.02
HDAC5-211ENST00000592385 EID3Q8N140 333 aa14.9□□□□□ -0.02
HDAC5-211ENST00000592385 OR5K1Q8NHB7 308 aa14.9□□□□□ -0.02
HDAC5-211ENST00000592385 CLHC1Q8NHS4 586 aa14.9□□□□□ -0.02
HDAC5-211ENST00000592385 FAM120BQ96EK7 910 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
HDAC5-211ENST00000592385 NRBF2Q96F24 287 aa14.9□□□□□ -0.02
HDAC5-211ENST00000592385 CMTM7Q96FZ5 175 aa14.9□□□□□ -0.02
HDAC5-211ENST00000592385 MBOAT4Q96T53 435 aa14.9□□□□□ -0.02
HDAC5-211ENST00000592385 PREBQ9HCU5 417 aa14.9□□□□□ -0.02
HDAC5-211ENST00000592385 INTS6Q9UL03 887 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
HDAC5-211ENST00000592385 DLGAP4Q9Y2H0 992 aa14.9□□□□□ -0.02
HDAC5-211ENST00000592385 WNT9AO14904 365 aa14.9□□□□□ -0.02
HDAC5-211ENST00000592385 NUAK1O60285 661 aa14.9□□□□□ -0.02
HDAC5-211ENST00000592385 SEC14L2O76054 403 aa14.9□□□□□ -0.02
HDAC5-211ENST00000592385 SRCP12931 536 aa14.9□□□□□ -0.02
HDAC5-211ENST00000592385 POLR2IP36954 125 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
HDAC5-211ENST00000592385 SLC6A12P48065 614 aa14.9□□□□□ -0.02
HDAC5-211ENST00000592385 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
HDAC5-211ENST00000592385 ATP13A5Q4VNC0 1218 aa14.9□□□□□ -0.02
HDAC5-211ENST00000592385 CHST15Q7LFX5 561 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
HDAC5-211ENST00000592385 DEFB128Q7Z7B8 93 aa14.9□□□□□ -0.02
HDAC5-211ENST00000592385 BEND7Q8N7W2 519 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
HDAC5-211ENST00000592385 L3MBTL4Q8NA19 623 aa14.9□□□□□ -0.02
HDAC5-211ENST00000592385 MRPS31Q92665 395 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
HDAC5-211ENST00000592385 NCLNQ969V3 563 aa14.9□□□□□ -0.02
HDAC5-211ENST00000592385 REXO5Q96IC2 774 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
HDAC5-211ENST00000592385 PHF12Q96QT6 1004 aa14.9□□□□□ -0.02
HDAC5-211ENST00000592385 SUV39H2Q9H5I1 410 aa14.9□□□□□ -0.02
HDAC5-211ENST00000592385 ELOVL6Q9H5J4 265 aa14.9□□□□□ -0.02
HDAC5-211ENST00000592385 SMURF2Q9HAU4 748 aa14.9□□□□□ -0.02
HDAC5-211ENST00000592385 GALNT8Q9NY28 637 aa14.9□□□□□ -0.02
HDAC5-211ENST00000592385 CFAP97Q9P2B7 532 aa14.9□□□□□ -0.02
HDAC5-211ENST00000592385 FAF1Q9UNN5 650 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
HDAC5-211ENST00000592385 SERTM1A2A2V5 107 aa14.89□□□□□ -0.03
HDAC5-211ENST00000592385 CKMP06732 381 aa14.89□□□□□ -0.03
HDAC5-211ENST00000592385 HIST1H2AGP0C0S8 130 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
HDAC5-211ENST00000592385 MPC1LP0DKB6 136 aa14.89□□□□□ -0.03
HDAC5-211ENST00000592385 HIST1H2ADP20671 130 aa14.89□□□□□ -0.03
HDAC5-211ENST00000592385 GABARAPL2P60520 117 aa14.89□□□□□ -0.03
HDAC5-211ENST00000592385 PTSQ03393 145 aa14.89□□□□□ -0.03
HDAC5-211ENST00000592385 ABHD18Q0P651 414 aa14.89□□□□□ -0.03
HDAC5-211ENST00000592385 SP140Q13342 867 aa14.89□□□□□ -0.03
HDAC5-211ENST00000592385 PHACTR4Q8IZ21 702 aa14.89□□□□□ -0.03
HDAC5-211ENST00000592385 MTFMTQ96DP5 389 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
HDAC5-211ENST00000592385 THAP11Q96EK4 314 aa14.89□□□□□ -0.03
HDAC5-211ENST00000592385 MAGED4Q96JG8 741 aa14.89□□□□□ -0.03
HDAC5-211ENST00000592385 HIST1H2AHQ96KK5 128 aa14.89□□□□□ -0.03
HDAC5-211ENST00000592385 MAGEB10Q96LZ2 347 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
HDAC5-211ENST00000592385 HHIPQ96QV1 700 aa14.89□□□□□ -0.03
HDAC5-211ENST00000592385 HIST1H2AJQ99878 128 aa14.89□□□□□ -0.03
HDAC5-211ENST00000592385 H2AFJQ9BTM1 129 aa14.89□□□□□ -0.03
HDAC5-211ENST00000592385 SLC6A13Q9NSD5 602 aa14.89□□□□□ -0.03
HDAC5-211ENST00000592385 HECAQ9UBI9 543 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
HDAC5-211ENST00000592385 C3orf18Q9UK00 162 aa14.89□□□□□ -0.03
HDAC5-211ENST00000592385 BLOC1S6Q9UL45 172 aa14.89□□□□□ -0.03
HDAC5-211ENST00000592385 HS3ST2Q9Y278 367 aa14.89□□□□□ -0.03
HDAC5-211ENST00000592385 PER2O15055 1255 aa14.89□□□□□ -0.03
HDAC5-211ENST00000592385 SLC16A5O15375 505 aa14.89□□□□□ -0.03
HDAC5-211ENST00000592385 GSTM2P28161 218 aa14.89□□□□□ -0.03
HDAC5-211ENST00000592385 GABRR2P28476 465 aa14.89□□□□□ -0.03
HDAC5-211ENST00000592385 PTPN6P29350 595 aa14.89□□□□□ -0.03
HDAC5-211ENST00000592385 IST1P53990 364 aa14.89□□□□□ -0.03
HDAC5-211ENST00000592385 RFX4Q33E94 735 aa14.89□□□□□ -0.03
HDAC5-211ENST00000592385 ASB11Q8WXH4 323 aa14.89□□□□□ -0.03
HDAC5-211ENST00000592385 CPEB1Q9BZB8 566 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
HDAC5-211ENST00000592385 AMBRA1Q9C0C7 1298 aa14.89□□□□□ -0.03
HDAC5-211ENST00000592385 PCDHGA8Q9Y5G5 932 aa14.89□□□□□ -0.03
HDAC5-211ENST00000592385 B4GAT1O43505 415 aa14.88□□□□□ -0.03
HDAC5-211ENST00000592385 DCTP40126 519 aa14.88□□□□□ -0.03
HDAC5-211ENST00000592385 CYP4F8P98187 520 aa14.88□□□□□ -0.03
HDAC5-211ENST00000592385 TOP3AQ13472 1001 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
HDAC5-211ENST00000592385 C6orf141Q5SZD1 244 aa14.88□□□□□ -0.03
HDAC5-211ENST00000592385 XAF1Q6GPH4 301 aa14.88□□□□□ -0.03
HDAC5-211ENST00000592385 C22orf39Q6P5X5 142 aa14.88□□□□□ -0.03
HDAC5-211ENST00000592385 SPESP1Q6UW49 350 aa14.88□□□□□ -0.03
HDAC5-211ENST00000592385 GAREM2Q75VX8 874 aa14.88□□□□□ -0.03
HDAC5-211ENST00000592385 R3HCC1LQ7Z5L2 792 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
HDAC5-211ENST00000592385 LMLNQ96KR4 655 aa14.88□□□□□ -0.03
HDAC5-211ENST00000592385 FANCEQ9HB96 536 aa14.88□□□□□ -0.03
HDAC5-211ENST00000592385 A0A1W2PPW3 197 aa14.88□□□□□ -0.03
HDAC5-211ENST00000592385 PABPN1LA6NDY0 278 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
HDAC5-211ENST00000592385 SERPINA1P01009 418 aa14.88□□□□□ -0.03
HDAC5-211ENST00000592385 SDC1P18827 310 aa14.88□□□□□ -0.03
HDAC5-211ENST00000592385 LHCGRP22888 699 aa14.88□□□□□ -0.03
HDAC5-211ENST00000592385 ENTPD1P49961 510 aa14.88□□□□□ -0.03
HDAC5-211ENST00000592385 GALK1P51570 392 aa14.88□□□□□ -0.03
HDAC5-211ENST00000592385 KCNAB2Q13303 367 aa14.88□□□□□ -0.03
HDAC5-211ENST00000592385 IL18R1Q13478 541 aa14.88□□□□□ -0.03
HDAC5-211ENST00000592385 ZXDCQ2QGD7 858 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
HDAC5-211ENST00000592385 ZC3H12BQ5HYM0 836 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
HDAC5-211ENST00000592385 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
HDAC5-211ENST00000592385 HIPK1Q86Z02 1210 aa14.88□□□□□ -0.03
HDAC5-211ENST00000592385 CHDHQ8NE62 594 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
HDAC5-211ENST00000592385 FNDC8Q8TC99 324 aa14.88□□□□□ -0.03
HDAC5-211ENST00000592385 NETO1Q8TDF5 533 aa14.88□□□□□ -0.03
HDAC5-211ENST00000592385 PYURFQ96I23 114 aa14.88□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.9 ms