RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587718.5

CAPNS1-204, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,558 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-204ENST00000587718 SARS2Q9NP81 518 aaKnown RBP24.84■■□□□ 1.57
CAPNS1-204ENST00000587718 RAD18Q9NS91 495 aa24.84■■□□□ 1.57
CAPNS1-204ENST00000587718 MAP10Q9P2G4 905 aa24.84■■□□□ 1.57
CAPNS1-204ENST00000587718 CEP192Q8TEP8 1941 aa24.83■■□□□ 1.57
CAPNS1-204ENST00000587718 ACACBO00763 2458 aa24.83■■□□□ 1.57
CAPNS1-204ENST00000587718 FAM234BA2RU67 622 aa24.83■■□□□ 1.57
CAPNS1-204ENST00000587718 PRORSD1PA6NEY8 169 aa24.83■■□□□ 1.57
CAPNS1-204ENST00000587718 NR5A2O00482 541 aa24.83■■□□□ 1.57
CAPNS1-204ENST00000587718 AP1G1O43747 822 aa24.83■■□□□ 1.57
CAPNS1-204ENST00000587718 EEDO75530 441 aaKnown RBP24.83■■□□□ 1.57
CAPNS1-204ENST00000587718 CEACAM1P13688 526 aa24.83■■□□□ 1.57
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CAPNS1-204ENST00000587718 ERFP50548 548 aa24.83■■□□□ 1.57
CAPNS1-204ENST00000587718 KCNK10P57789 538 aa24.83■■□□□ 1.57
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CAPNS1-204ENST00000587718 EMX2Q04743 252 aa24.83■■□□□ 1.57
CAPNS1-204ENST00000587718 GTF2H2Q13888 395 aa24.83■■□□□ 1.57
CAPNS1-204ENST00000587718 CHRNA6Q15825 494 aa24.83■■□□□ 1.57
CAPNS1-204ENST00000587718 UAP1L1Q3KQV9 507 aa24.83■■□□□ 1.57
CAPNS1-204ENST00000587718 GTF2H2CQ6P1K8 395 aa24.83■■□□□ 1.57
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CAPNS1-204ENST00000587718 AHI1Q8N157 1196 aa24.83■■□□□ 1.57
CAPNS1-204ENST00000587718 CYB5D2Q8WUJ1 264 aa24.83■■□□□ 1.57
CAPNS1-204ENST00000587718 FOXJ1Q92949 421 aa24.83■■□□□ 1.57
CAPNS1-204ENST00000587718 VOPP1Q96AW1 172 aa24.83■■□□□ 1.57
CAPNS1-204ENST00000587718 SPDL1Q96EA4 605 aa24.83■■□□□ 1.57
CAPNS1-204ENST00000587718 NFKBIL1Q9UBC1 381 aaPredicted RBP24.83■■□□□ 1.57
CAPNS1-204ENST00000587718 LEF1Q9UJU2 399 aaPredicted RBP24.83■■□□□ 1.57
CAPNS1-204ENST00000587718 BTRCQ9Y297 605 aa24.83■■□□□ 1.57
CAPNS1-204ENST00000587718 SLC25A14O95258 325 aaPredicted RBP24.82■■□□□ 1.56
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CAPNS1-204ENST00000587718 ENO2P09104 434 aaPredicted RBP24.82■■□□□ 1.56
CAPNS1-204ENST00000587718 ZNF30P17039 623 aa24.82■■□□□ 1.56
CAPNS1-204ENST00000587718 VCLP18206 1134 aa24.82■■□□□ 1.56
CAPNS1-204ENST00000587718 CAPN3P20807 821 aa24.82■■□□□ 1.56
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CAPNS1-204ENST00000587718 GRAMD1BQ3KR37 738 aa24.82■■□□□ 1.56
CAPNS1-204ENST00000587718 GOLGA7Q7Z5G4 137 aa24.82■■□□□ 1.56
CAPNS1-204ENST00000587718 RETREG3Q86VR2 466 aa24.82■■□□□ 1.56
CAPNS1-204ENST00000587718 TCAIMQ8N3R3 496 aa24.82■■□□□ 1.56
CAPNS1-204ENST00000587718 CADM4Q8NFZ8 388 aa24.82■■□□□ 1.56
CAPNS1-204ENST00000587718 DNASE2BQ8WZ79 361 aa24.82■■□□□ 1.56
CAPNS1-204ENST00000587718 AP4S1Q9Y587 144 aa24.82■■□□□ 1.56
CAPNS1-204ENST00000587718 CKAP5Q14008 2032 aa24.82■■□□□ 1.56
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CAPNS1-204ENST00000587718 SLC22A3O75751 556 aa24.81■■□□□ 1.56
CAPNS1-204ENST00000587718 SLC7A2P52569 658 aa24.81■■□□□ 1.56
CAPNS1-204ENST00000587718 ERVPABLB-1P60509 514 aa24.81■■□□□ 1.56
CAPNS1-204ENST00000587718 ATP6AP1LQ52LC2 224 aa24.81■■□□□ 1.56
CAPNS1-204ENST00000587718 DHFR2Q86XF0 187 aa24.81■■□□□ 1.56
CAPNS1-204ENST00000587718 MARVELD2Q8N4S9 558 aa24.81■■□□□ 1.56
CAPNS1-204ENST00000587718 TMEM102Q8N9M5 508 aaPredicted RBP24.81■■□□□ 1.56
CAPNS1-204ENST00000587718 OR2T3Q8NH03 318 aa24.81■■□□□ 1.56
CAPNS1-204ENST00000587718 DCUN1D1Q96GG9 259 aa24.81■■□□□ 1.56
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CAPNS1-204ENST00000587718 GPR174Q9BXC1 333 aa24.81■■□□□ 1.56
CAPNS1-204ENST00000587718 ARMC1Q9NVT9 282 aa24.81■■□□□ 1.56
CAPNS1-204ENST00000587718 SMOXQ9NWM0 555 aa24.81■■□□□ 1.56
CAPNS1-204ENST00000587718 SUN2Q9UH99 717 aa24.81■■□□□ 1.56
CAPNS1-204ENST00000587718 PACSIN3Q9UKS6 424 aa24.81■■□□□ 1.56
CAPNS1-204ENST00000587718 FNDC3AQ9Y2H6 1198 aaKnown RBP24.81■■□□□ 1.56
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CAPNS1-204ENST00000587718 PI4KAP42356 2102 aa24.81■■□□□ 1.56
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CAPNS1-204ENST00000587718 NCF1CA8MVU1 366 aaPredicted RBP24.8■■□□□ 1.56
CAPNS1-204ENST00000587718 ARHGAP33O14559 1287 aa24.8■■□□□ 1.56
CAPNS1-204ENST00000587718 OR4F21O95013 312 aa24.8■■□□□ 1.56
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CAPNS1-204ENST00000587718 MAD2L1Q13257 205 aaPredicted RBP24.8■■□□□ 1.56
CAPNS1-204ENST00000587718 C6orf136Q5SQH8 315 aa24.8■■□□□ 1.56
CAPNS1-204ENST00000587718 BRAT1Q6PJG6 821 aa24.8■■□□□ 1.56
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CAPNS1-204ENST00000587718 OR6K2Q8NGY2 324 aa24.8■■□□□ 1.56
CAPNS1-204ENST00000587718 HCAR2Q8TDS4 363 aa24.8■■□□□ 1.56
CAPNS1-204ENST00000587718 LRRC58Q96CX6 371 aa24.8■■□□□ 1.56
CAPNS1-204ENST00000587718 PPP3R2Q96LZ3 170 aa24.8■■□□□ 1.56
CAPNS1-204ENST00000587718 COPS8Q99627 209 aa24.8■■□□□ 1.56
CAPNS1-204ENST00000587718 NTMT1Q9BV86 223 aa24.8■■□□□ 1.56
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CAPNS1-204ENST00000587718 TNKS2Q9H2K2 1166 aa24.8■■□□□ 1.56
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CAPNS1-204ENST00000587718 TRPS1Q9UHF7 1281 aa24.8■■□□□ 1.56
CAPNS1-204ENST00000587718 TIMM22Q9Y584 194 aa24.8■■□□□ 1.56
CAPNS1-204ENST00000587718 MUC22E2RYF6 1773 aaPredicted RBP24.8■■□□□ 1.56
CAPNS1-204ENST00000587718 A0A1B0GTL3 188 aa24.8■■□□□ 1.56
CAPNS1-204ENST00000587718 NPIPB15A6NHN6 443 aaPredicted RBP24.8■■□□□ 1.56
CAPNS1-204ENST00000587718 IQCF5A8MTL0 148 aa24.8■■□□□ 1.56
CAPNS1-204ENST00000587718 UPK3BL1B0FP48 263 aa24.8■■□□□ 1.56
CAPNS1-204ENST00000587718 UPK3BL2E5RIL1 263 aa24.8■■□□□ 1.56
CAPNS1-204ENST00000587718 FXYD1O00168 92 aa24.8■■□□□ 1.56
CAPNS1-204ENST00000587718 C6orf10Q5SRN2 563 aa24.8■■□□□ 1.56
CAPNS1-204ENST00000587718 OR52E8Q6IFG1 317 aa24.8■■□□□ 1.56
CAPNS1-204ENST00000587718 LCN8Q6JVE9 175 aa24.8■■□□□ 1.56
CAPNS1-204ENST00000587718 PIP4P1Q86T03 277 aa24.8■■□□□ 1.56
CAPNS1-204ENST00000587718 ZSWIM9Q86XI8 627 aa24.8■■□□□ 1.56
CAPNS1-204ENST00000587718 RGL4Q8IZJ4 473 aa24.8■■□□□ 1.56
CAPNS1-204ENST00000587718 ZNF366Q8N895 744 aa24.8■■□□□ 1.56
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