RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000577827.5

PTPRM-205, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRM, Length 4,640 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-205ENST00000577827 GEMIN6Q8WXD5 167 aaKnown RBP10.16□□□□□ -0.78
PTPRM-205ENST00000577827 TMEM181Q9P2C4 612 aa10.16□□□□□ -0.78
PTPRM-205ENST00000577827 PFDN2Q9UHV9 154 aa10.16□□□□□ -0.78
PTPRM-205ENST00000577827 A0A1W2PQ72 361 aa10.15□□□□□ -0.78
PTPRM-205ENST00000577827 TCRBV3S1A0A5B6 114 aa10.15□□□□□ -0.78
PTPRM-205ENST00000577827 DYRK3O43781 588 aa10.15□□□□□ -0.78
PTPRM-205ENST00000577827 PGK1P00558 417 aa10.15□□□□□ -0.78
PTPRM-205ENST00000577827 MYCP01106 439 aaPredicted RBP10.15□□□□□ -0.78
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PTPRM-205ENST00000577827 IL1RAPQ9NPH3 570 aa10.14□□□□□ -0.79
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PTPRM-205ENST00000577827 IGKV6-21A0A0C4DH24 114 aa10.14□□□□□ -0.79
PTPRM-205ENST00000577827 H3BM21 787 aa10.14□□□□□ -0.79
PTPRM-205ENST00000577827 MANBAO00462 879 aa10.14□□□□□ -0.79
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