RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000562866.1

VPS9D1-AS1-202, VPS9D1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene VPS9D1-AS1, Length 1,753 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 HNRNPA1L2Q32P51 320 aaKnown RBP20.78■□□□□ 0.92
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 FAM78AQ5JUQ0 283 aa20.78■□□□□ 0.92
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ZNF648Q5T619 568 aaPredicted RBP20.78■□□□□ 0.92
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 FRG2Q64ET8 278 aa20.78■□□□□ 0.92
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 GTF2H4Q92759 462 aa20.78■□□□□ 0.92
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 SMARCD2Q92925 531 aa20.78■□□□□ 0.92
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 PYCR2Q96C36 320 aa20.78■□□□□ 0.92
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 PPP1R16AQ96I34 528 aa20.78■□□□□ 0.92
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 FRG2BQ96QU4 278 aa20.78■□□□□ 0.92
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 C9orf16Q9BUW7 83 aa20.78■□□□□ 0.92
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 OSBPL6Q9BZF3 934 aa20.78■□□□□ 0.92
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 SLC5A10A0PJK1 596 aa20.77■□□□□ 0.92
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 FAM58BPP0C7Q3 252 aa20.77■□□□□ 0.92
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 NCK1P16333 377 aa20.77■□□□□ 0.92
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 PSMC3P17980 439 aa20.77■□□□□ 0.92
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 CTSCP53634 463 aa20.77■□□□□ 0.92
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 CHIT1Q13231 466 aa20.77■□□□□ 0.92
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 SPANXN4Q5MJ08 99 aa20.77■□□□□ 0.92
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 GLYATQ6IB77 296 aa20.77■□□□□ 0.92
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 SUSD1Q6UWL2 747 aa20.77■□□□□ 0.92
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 C12orf76Q8N812 135 aaPredicted RBP20.77■□□□□ 0.92
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 NXPE3Q969Y0 559 aa20.77■□□□□ 0.92
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ASB16Q96NS5 453 aa20.77■□□□□ 0.92
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 OR52E6Q96RD3 313 aa20.77■□□□□ 0.92
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 WRAP53Q9BUR4 548 aaKnown RBP20.77■□□□□ 0.92
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 SFXN1Q9H9B4 322 aa20.77■□□□□ 0.92
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 UBAP1Q9NZ09 502 aa20.77■□□□□ 0.92
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 NIPSNAP3AQ9UFN0 247 aaPredicted RBP20.77■□□□□ 0.92
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ARHGEF33A8MVX0 844 aa20.77■□□□□ 0.91
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 EN2P19622 333 aaPredicted RBP20.77■□□□□ 0.91
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 OXTRP30559 389 aa20.77■□□□□ 0.91
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 OR4D2P58180 307 aa20.77■□□□□ 0.91
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 MTPNP58546 118 aa20.77■□□□□ 0.91
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 IRF8Q02556 426 aa20.77■□□□□ 0.91
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 CSTF3Q12996 717 aaKnown RBP20.77■□□□□ 0.91
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 PDGFRLQ15198 375 aa20.77■□□□□ 0.91
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 C9orf64Q5T6V5 341 aa20.77■□□□□ 0.91
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 RNF220Q5VTB9 566 aa20.77■□□□□ 0.91
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 TMEM220Q6QAJ8 160 aa20.77■□□□□ 0.91
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 TMC5Q6UXY8 1006 aa20.77■□□□□ 0.91
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 RALGPS2Q86X27 583 aaPredicted RBP20.77■□□□□ 0.91
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 SLC22A15Q8IZD6 547 aa20.77■□□□□ 0.91
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa20.77■□□□□ 0.91
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 CCDC115Q96NT0 180 aa20.77■□□□□ 0.91
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ATG10Q9H0Y0 220 aa20.77■□□□□ 0.91
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 RMND5AQ9H871 391 aa20.77■□□□□ 0.91
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 THG1LQ9NWX6 298 aaKnown RBP20.77■□□□□ 0.91
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 OBP2AQ9NY56 170 aa20.77■□□□□ 0.91
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ITM2BQ9Y287 266 aa20.77■□□□□ 0.91
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 C7orf72A4D263 438 aa20.76■□□□□ 0.91
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 PRRT4C9JH25 899 aa20.76■□□□□ 0.91
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ERN1O75460 977 aaKnown RBP20.76■□□□□ 0.91
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 HRH2P25021 359 aa20.76■□□□□ 0.91
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 S100A3P33764 101 aa20.76■□□□□ 0.91
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 SLC6A11P48066 632 aa20.76■□□□□ 0.91
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 TXNL4AP83876 142 aaKnown RBP20.76■□□□□ 0.91
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ELAVL3Q14576 367 aaKnown RBP20.76■□□□□ 0.91
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 BCL7AQ4VC05 210 aa20.76■□□□□ 0.91
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ADGRD2Q7Z7M1 963 aa20.76■□□□□ 0.91
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 NLRP8Q86W28 1048 aa20.76■□□□□ 0.91
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 THOC6Q86W42 341 aaKnown RBP20.76■□□□□ 0.91
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 NPAS3Q8IXF0 933 aa20.76■□□□□ 0.91
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 CSGALNACT1Q8TDX6 532 aa20.76■□□□□ 0.91
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 BIRC7Q96CA5 298 aa20.76■□□□□ 0.91
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ZNF696Q9H7X3 374 aa20.76■□□□□ 0.91
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 DFNA5O60443 496 aa20.75■□□□□ 0.91
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ANXA6P08133 673 aa20.75■□□□□ 0.91
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 C7P10643 843 aa20.75■□□□□ 0.91
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 CDH1P12830 882 aa20.75■□□□□ 0.91
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 FSHRP23945 695 aa20.75■□□□□ 0.91
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 LBX1P52954 281 aa20.75■□□□□ 0.91
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 CYP4F3Q08477 520 aa20.75■□□□□ 0.91
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 EEF1AKMT2Q5JPI9 291 aaKnown RBP20.75■□□□□ 0.91
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 TMTC4Q5T4D3 741 aa20.75■□□□□ 0.91
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 AGTRAPQ6RW13 159 aa20.75■□□□□ 0.91
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 MSANTD1Q6ZTZ1 278 aa20.75■□□□□ 0.91
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 CHERPQ8IWX8 916 aaKnown RBP20.75■□□□□ 0.91
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 KRTCAP2Q8N6L1 136 aa20.75■□□□□ 0.91
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ARRDC3Q96B67 414 aa20.75■□□□□ 0.91
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 NUS1Q96E22 293 aa20.75■□□□□ 0.91
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ITCHQ96J02 903 aa20.75■□□□□ 0.91
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 SLC29A1Q99808 456 aa20.75■□□□□ 0.91
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 DYRK4Q9NR20 520 aa20.75■□□□□ 0.91
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 FAM8A1Q9UBU6 413 aa20.75■□□□□ 0.91
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 TMEM202A6NGA9 273 aa20.74■□□□□ 0.91
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 SAC3D1A6NKF1 404 aa20.74■□□□□ 0.91
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 CLGNO14967 610 aa20.74■□□□□ 0.91
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 KIF1CO43896 1103 aaKnown RBP20.74■□□□□ 0.91
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 CA3P07451 260 aa20.74■□□□□ 0.91
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 GGT1P19440 569 aa20.74■□□□□ 0.91
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 HNF4AP41235 474 aa20.74■□□□□ 0.91
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 CCT8P50990 548 aa20.74■□□□□ 0.91
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 NEK2P51955 445 aa20.74■□□□□ 0.91
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 POLE2P56282 527 aa20.74■□□□□ 0.91
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ERVK-21P61565 698 aa20.74■□□□□ 0.91
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 PCDH1Q08174 1060 aa20.74■□□□□ 0.91
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 SELPLGQ14242 412 aa20.74■□□□□ 0.91
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ATP6AP1Q15904 470 aa20.74■□□□□ 0.91
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 AAK1Q2M2I8 961 aa20.74■□□□□ 0.91
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 XKR6Q5GH73 641 aa20.74■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.2 ms